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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
06/12/2011 |
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Data da última atualização: |
24/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MOURÃO, M. M.; BITAR, M. L.; LOBO, F. P.; GRYNBERG, P.; BORONI, M.; WAISBERG, M.; MACEDO, A. M.; MACHADO, C. R.; FRANCO, G. R. |
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Afiliação: |
MARINA MORAES MOURÃO, FIOCRUZ; MAINÁ LAST BITAR, UFMG, NUBIO; FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; PRISCILA GRYNBERG, UFMG; MARIANA BORONI, UFMG; MICHAEL WAISBERG, NIH; ANDRÉA MARA MACEDO, UFMG; CARLOS RENATO MACHADO, UFMG; GLÓRIA REGINA FRANCO, UFMG. |
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Título: |
Revealing new perspectives on the regulation of gene expression by the trans-splicing mechanism in Schistosoma mansoni. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-MEETING 2011. |
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Conteúdo: |
Schistosomiasis is the second most prevalent neglected tropical disease caused by a Trematode flatworm from the genus Schistosoma. Schistosomes possess a complex life cycle requiring numerous and intricate mechanisms to rule transcriptional and post-transcriptional gene regulation. Thus, it is believed that spliced leader (SL) trans-splicing could play an important role in the parasite biology. The purpose of this study was is to shed light on the function of the trans-splicing mechanism in S. mansoni by searching gene categories that could be target of this process and attempting to silence transcripts harboring the SL sequence. Here, we analyze different life stages cDNA libraries enriched on SL-transcripts of S. mansoni. Our results show that, contrary to previous hypothesis, trans-spliced transcripts are associated to specific gene categories, such as carbohydrate metabolic process, RNA metabolism and DNA repair. Several trans-spliced transcripts were verified in at least two different stages of the S. mansoni life cycle. The marjority of the SL-transcripts are shared among males, females and mixed-sex adults, being followed by SL-transcripts shared by all adults and schistosomula. Among the analyzed life stages, the one presenting the lower number of shared genes is the egg. The results also reveal a set of SL-transcripts that are observed only in one stage of the life cycle and could represent transcripts that undergo stage-specific trans-splicing. Finally, we demonstrated that trans-splicing knockdown in sprocysts caused a reduction on the levels of all tested trans-spliced transcripts, but surprisingly the only phenotypic effect observed was a diminished larvae size. Financial support: CNPq, FAPEMIG MenosSchistosomiasis is the second most prevalent neglected tropical disease caused by a Trematode flatworm from the genus Schistosoma. Schistosomes possess a complex life cycle requiring numerous and intricate mechanisms to rule transcriptional and post-transcriptional gene regulation. Thus, it is believed that spliced leader (SL) trans-splicing could play an important role in the parasite biology. The purpose of this study was is to shed light on the function of the trans-splicing mechanism in S. mansoni by searching gene categories that could be target of this process and attempting to silence transcripts harboring the SL sequence. Here, we analyze different life stages cDNA libraries enriched on SL-transcripts of S. mansoni. Our results show that, contrary to previous hypothesis, trans-spliced transcripts are associated to specific gene categories, such as carbohydrate metabolic process, RNA metabolism and DNA repair. Several trans-spliced transcripts were verified in at least two different stages of the S. mansoni life cycle. The marjority of the SL-transcripts are shared among males, females and mixed-sex adults, being followed by SL-transcripts shared by all adults and schistosomula. Among the analyzed life stages, the one presenting the lower number of shared genes is the egg. The results also reveal a set of SL-transcripts that are observed only in one stage of the life cycle and could represent transcripts that undergo stage-specific trans-splicing. Finally, we demonstr... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Expressão gênica. |
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Thesagro: |
Schistosoma Mansoni. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/bitstream/doc/908752/1/Shistosoma.pdf
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Marc: |
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520 $aSchistosomiasis is the second most prevalent neglected tropical disease caused by a Trematode flatworm from the genus Schistosoma. Schistosomes possess a complex life cycle requiring numerous and intricate mechanisms to rule transcriptional and post-transcriptional gene regulation. Thus, it is believed that spliced leader (SL) trans-splicing could play an important role in the parasite biology. The purpose of this study was is to shed light on the function of the trans-splicing mechanism in S. mansoni by searching gene categories that could be target of this process and attempting to silence transcripts harboring the SL sequence. Here, we analyze different life stages cDNA libraries enriched on SL-transcripts of S. mansoni. Our results show that, contrary to previous hypothesis, trans-spliced transcripts are associated to specific gene categories, such as carbohydrate metabolic process, RNA metabolism and DNA repair. Several trans-spliced transcripts were verified in at least two different stages of the S. mansoni life cycle. The marjority of the SL-transcripts are shared among males, females and mixed-sex adults, being followed by SL-transcripts shared by all adults and schistosomula. Among the analyzed life stages, the one presenting the lower number of shared genes is the egg. The results also reveal a set of SL-transcripts that are observed only in one stage of the life cycle and could represent transcripts that undergo stage-specific trans-splicing. Finally, we demonstrated that trans-splicing knockdown in sprocysts caused a reduction on the levels of all tested trans-spliced transcripts, but surprisingly the only phenotypic effect observed was a diminished larvae size. Financial support: CNPq, FAPEMIG
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
27/10/2008 |
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Data da última atualização: |
05/11/2008 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
QUEIROZ, D. C.; ALVES, A. A. C. |
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Afiliação: |
Dyane Coelho Queiroz, UFRB; Alfredo Augusto Cunha Alves, CNPMF. |
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Título: |
Avaliação de variedades de mandioca para tolerância à seca. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 2., 2008, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2008. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
RESUMO_0293. |
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Conteúdo: |
A identificação e a compreensão dos mecanismos de tolerância à seca são fundamentais no desenvolvimento de novas cultivares tolerantes ao déficit hídrico. O objetivo deste trabalho foi avaliar o germoplasma de mandioca para a identificação de genótipos com
fonte de resistência à seca e avaliação do efeito do déficit hídrico sobre diversos processos fisiológicos. O experimento foi executado em telado do CNPMF, foram utilizadas 10 variedades de mandioca, consideradas contrastantes para tolerância à seca, submetidas a dois tratamentos: controle (tratamento irrigado) e estresse hídrico (4
plantas/tratamento/variedade). Dois meses após o plantio (MAP), a irrigação de um bloco foi suspensa (tratamento de estresse) até a colheita final, mantendo-se o outro bloco sob irrigação (controle). A partir do estabelecimento dos tratamentos (2 MAP), foram realizadas
avaliações de crescimento vegetativo, utilizando os seguintes parâmetros: condutância foliar, crescimento vegetativo, retenção foliar, comprimento e largura do lóbulo central da última folha expandida. De um modo geral, o déficit hídrico causou redução significativa dos parâmetros relacionados à produção, com diferenças entre as variedades. Observou-se reduções mais pronunciadas na qualidade das raízes, causando redução de matéria seca. O mesmo ocorreu com a capacidade de translocação de fotoassimilados para as raízes. |
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Palavras-Chave: |
Crescimento vegetativo; Déficit hídrico; Variedades de mandioca. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aA identificação e a compreensão dos mecanismos de tolerância à seca são fundamentais no desenvolvimento de novas cultivares tolerantes ao déficit hídrico. O objetivo deste trabalho foi avaliar o germoplasma de mandioca para a identificação de genótipos com fonte de resistência à seca e avaliação do efeito do déficit hídrico sobre diversos processos fisiológicos. O experimento foi executado em telado do CNPMF, foram utilizadas 10 variedades de mandioca, consideradas contrastantes para tolerância à seca, submetidas a dois tratamentos: controle (tratamento irrigado) e estresse hídrico (4 plantas/tratamento/variedade). Dois meses após o plantio (MAP), a irrigação de um bloco foi suspensa (tratamento de estresse) até a colheita final, mantendo-se o outro bloco sob irrigação (controle). A partir do estabelecimento dos tratamentos (2 MAP), foram realizadas avaliações de crescimento vegetativo, utilizando os seguintes parâmetros: condutância foliar, crescimento vegetativo, retenção foliar, comprimento e largura do lóbulo central da última folha expandida. De um modo geral, o déficit hídrico causou redução significativa dos parâmetros relacionados à produção, com diferenças entre as variedades. Observou-se reduções mais pronunciadas na qualidade das raízes, causando redução de matéria seca. O mesmo ocorreu com a capacidade de translocação de fotoassimilados para as raízes.
653 $aCrescimento vegetativo
653 $aDéficit hídrico
653 $aVariedades de mandioca
700 1 $aALVES, A. A. C.
773 $tIn: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 2., 2008, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2008.
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Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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