BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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41.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, B. L.; LIMA, A. O. de; MOKRY, F. B.; BRESSANI, F.; MALAGO JUNIOR, W.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Validação de um SNP associado à área de olho de lombo em uma população de animais Canchim In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. 145 p. Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Lucimara Aparecida Forato, Maria Alice Martins, Ladislau Marcelino Rabello, Rubens Bernardes Filho. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56). p. 43

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42.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M.; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L.; REGITANO, L. C. de A. Allelic and parental-specific expression on the KCNJ11 gene in cattle. In: SUMMER SCHOOL ON CHROMATIN AND SYSTEMS BIOLOGY, 2013, Spetses. Proceedings... Spetese: Chromatin and Systems Biology, 2013. p. 147

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43.Imagem marcado/desmarcadoKASARAPU, P.; PORTO NETO, L. R.; FORTES, M. R. S.; LEHNERT, S. A.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; GEORGE, A.; REVERTER, A. The Bos taurus-Bos indicus balance in fertility and milk related genes. PLOS one, v. 12, n. 8, p. 1-20, 2017.

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44.Imagem marcado/desmarcadoALEXANDRE, P. A.; GOMES, R. da C.; SANTANA, M. H. A.; SILVA, S. L.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; MEIRELLES, F. V.; FERRAZ, J. B. S.; FUKUMASU, H. Bovine NR1I3 gene polymorphisms and its association with feed efficiency traits in Nellore cattle. Meta Gene, v. 2, p. 206-217, 2014

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45.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; MOTA, M. D. S.; ALENCAR, M. M. de; ROSA, A. do N.; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study of weight gain in feedlot Nellore cattle: comparison of single nucleotide polymorphism and haplotype blocks approaches. In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of Knowledge in animal production - Abstracts. Campinas: SBZ, 2013. 1 CD-ROM

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46.Imagem marcado/desmarcadoBUSS, C. E.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MUDADU, M. de A.; CESAR, A. S. M.; VENTURA, R. V.; AFONSO, J.; LIMA, A. O. de; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide efficient mixed-model study for meat quality in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, e-suppl. 5; Journal of Dairy Science, v. 99, e-suppl. 1, p. 159, jul. 2016.

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47.Imagem marcado/desmarcadoBUSS, C. E.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; MUDADU, M. de A.; CESAR, A. S. M.; VENTURA, R. V.; AFONSO, J.; LIMA, A. O. D.; COUTINHO, L. L.; TULLIO, R. R.; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide efficient mixed-model study for meat quality in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, p. 428-429, 2016. Supplement 5. Na publicação: M. A. Mudadu.

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48.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. Animal Genetics, v. 45, n. 6, p. 771-781, 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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49.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SILVA, L. O. C.; TORRES JÚNIOR, R. A. de A.; COUTINHO, L. L.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M.; REGITANO, L. C. A. A genome-wide scan for selection signatures in Nellore cattle. Animal Genetics, Oxford, v. 45, n. 6, p. 771-781, 2014.

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50.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M.; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P. Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. G3: Genes, Genomes, Genetics, v. 7, n. 6, p. 1855-1859, 2017. Na publicação: Luciana C. A. Regitano.

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51.Imagem marcado/desmarcadoCESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; LANNA, D. P. D.; POLETI, M. D.; KOLTES, J. E.; REECY, J. M.; FRITZ-WATERS, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; MUDADU, M. de A.; TULLIO, R. R.; COUTINHO, L. L. Expression quantitative trait loci (eQTL) hotspot regions from whole genome analysis of Nellore steers. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego. Anais... San Diego: PAG, 2016.

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52.Imagem marcado/desmarcadoTIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M.; MALAGO JUNIOR, W.; DONATONI, F. A. B.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A. MyoD1 expression levels affect meat tenderness in Nellore beef cattle. In:WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOK PRODUCTION, 10;. 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: American Society of animal Science, 2014

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53.Imagem marcado/desmarcadoDINIZ, M. R. V.; PAIVA, A. L. B.; GUERRA-DUARTE, C.; NISHIYAMA JÚNIOR, M. Y.; MUDADU, M. de A.; OLIVEIRA, U. de; BORGES, M. H.; YATES, J. R.; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. de. An overview of Phoneutria nigriventer spider venom using combined transcriptomic and proteomic approaches. PLoS ONE, v. 13, n. 8, p. 1-29, 2018. Artigo e0200628. Na publicação: Mauricio A. Mudadu.

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54.Imagem marcado/desmarcadoTIZIOTO, P. C.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; ROSA, A. do N.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A. Calcium and potassium content in beef: In fluences on tenderness and associations with molecular markers in Nellore cattle. Meat Science, v. 96, p. 436-440, 2014.

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55.Imagem marcado/desmarcadoTIZIOTO, P. C.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; ROSA, A. do N.; TULLIO, R. R.; MEDEIROS, S. R. de; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A. Calcium and potassium content in beef: Influences on tenderness and associations with molecular markers in Nellore cattle. Meat Science, v. 96, n. 1, p. 436-440, January 2014

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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56.Imagem marcado/desmarcadoMOKRY, F. B.; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M. Descriptive analysis of haplotypes in a population of Canchim beef cattle. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Anais... Foz do Igauaçu: SBG, 2012. 1 CD-ROM

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57.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, D. A. A. de; MONTEIRO, J. P.; PINHEIRO, R. R.; MUDADU, M. de A.; ANDRIOLI, A.; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; SIDER, L. H.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. da S. Molecular characterization of circulating strains of small ruminant lentiviruses in Brazil based on complete gag and pol genes. Small Ruminant Research, v. 177, p. 160-166, 2019.

Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.

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58.Imagem marcado/desmarcadoCHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CARVALHEIRO, R.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Strategies for genotype imputation in composite beef cattle BMC Genetics, v. 16, p. 99, 2015. 10 p.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste.

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59.Imagem marcado/desmarcadoBRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; GIGLIOTI, R.; MEIRELLHES, S. L. C.; COUTINHO, L. L.; BENVENUTI, C. L.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; VIEIRA, L. da S.; ZAROS, L. G.; CARRILHO, E.; REGITANO, L. C. de A. Single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with gastrointestinal nematode infection in goats. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 8530-8436, Oct. 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Pecuária Sudeste.

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60.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele-and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 2, p. 1-9, Aug. 2016.

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Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  04/09/2017
Data da última atualização:  21/05/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  KASARAPU, P.; PORTO NETO, L. R.; FORTES, M. R. S.; LEHNERT, S. A.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; GEORGE, A.; REVERTER, A.
Afiliação:  Parthan Kasarapu, Agriculture and Food/CSIRO; Laercio Ribeiro Porto Neto, Agriculture and Food/CSIRO; Marina R. S. Fortes, The University of Queensland; Sigrid A. Lehnert, Agriculture and Food/CSIRO; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Andrew George, Agriculture and Food/CSIRO; Antonio Reverter, Agriculture and Food/CSIRO.
Título:  The Bos taurus-Bos indicus balance in fertility and milk related genes.
Ano de publicação:  2017
Fonte/Imprenta:  PLOS one, v. 12, n. 8, p. 1-20, 2017.
DOI:  https://doi.org/10.1371/journal.pone.0181930
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Numerical approaches to high-density single nucleotide polymorphism (SNP) data are often employed independently to address individual questions. We linked independent approaches in a bioinformatics pipeline for further insight. The pipeline driven by heterozygosity and Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) analyses was applied to characterize Bos taurus and Bos indicus ancestry. We infer a gene co-heterozygosity network that regulates bovine fertility, from data on 18,363 cattle with genotypes for 729,068 SNP. Hierarchical clustering separated populations according to Bos taurus and Bos indicus ancestry. The weights of the first principal component were subjected to Normal mixture modelling allowing the estimation of a gene?s contribution to the Bos taurus-Bos indicus axis. We used deviation from HWE, contribution to Bos indicus content and association to fertility traits to select 1,284 genes. With this set, we developed a co-heterozygosity network where the group of genes annotated as fertility-related had significantly higher Bos indicus content compared to other functional classes of genes, while the group of genes associated with milk production had significantly higher Bos taurus content. The network analysis resulted in capturing novel gene associations of relevance to bovine domestication events. We report transcription factors that are likely to regulate genes associated with cattle domestication and tropical adaptation. Our pipeline can be generalized to any scenarios w... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Hardy-Weinberg equilibrium.
Thesagro:  Bos Indicus; Bos Taurus.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/163369/1/journal.pone.0181930.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CPPSE24100 - 1UPCAP - DDPROCI-2017.00040KAS2017.00168
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