BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoANDREOTE, A. P. D.; ROSÁRIO, M. F. do; LEDUR, M. C.; JORGE, E. C.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; COUTINHO, L. L. Identification and characterization of microRNAs expressed in chicken skeletal muscle. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 1, p. 1465-1479, 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.

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2.Imagem marcado/desmarcadoBENAVIDES, M. V.; ECHEVARRIA, F. A. M.; SONSTEGARD, T. S.; TASSEL, C. P. V.; GASBARRE, L. C. Validation of genomic regions influencing nematode resistance in a Bos taurus x Bos indicus cross population. In: AMERICAN ASSOCIATION OF VETERINARY PARASITOLOGISTS ANNUAL MEETING, 50., 2005, Minneapolis. Proceedings... Minneapolis: AAVP, 2005. p. 56. Resumo 45.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.

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3.Imagem marcado/desmarcadoBENAVIDES, M. V.; ECHEVARRIA, F. A. M.; SONSTEGARD, T. S.; VAN TESSEL, C. P.; GASBARRE, L. C. Genetic variability of a Bos taurus x Bos indicus cross population and validation of genomic regions influencing nematode resistance. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENETICOS PARA AMERICA LATINA Y EL CARIBE, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resumenes... Montevideo: INIA :Facultad de Agronomía de la Universidad de la República, 2005. p. 105 SIRGEALC. Resumo 305.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.

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4.Imagem marcado/desmarcadoBENAVIDES, M. V.; SONSTEGARD, T. S.; KEMP, S.; MUGAMBI, J. M.; GIBSON, J. P.; BAKER, R. L.; HANOTTE, O.; MARSHALL, K.; VAN TASSELL, C. Identification of novel loci associated with gastrointestinal parasite resistance in a Red Maasai x Dorper backcross population. Plos One, v. 10, n. 4, e0122797, Apr. 2015.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura.

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5.Imagem marcado/desmarcadoBENAVIDES, M. V.; SONSTEGARD, T. S.; VAN TASSELL, C. Genomic regions associated with sheep resistance to gastrointestinal nematodes. Trends in Parasitology, Oxford, v. 32, n. 6, p. 470-480, June 2016.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura.

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6.Imagem marcado/desmarcadoDECKER, J. E.; PIRES, J. C.; CONANT, G. C.; MCKAY, S. D.; HEATON, M. P.; CHEN, K.; COOPER, A.; VIKKI, J.; SEABURY, C. M.; CAETANO, A. R.; JOHNSON, G. D.; BRENNEMAN, R. A.; HANOTTE, O.; EGGERT, L. S.; WIENER, P.; KIM, J.-J.; KIM, K. S.; SONSTEGARD, T. S.; TASSELL, C. P. V.; NEIBERGS, H. L.; MCEWAN, J. C.; BRAUNING, R.; COUTINHO, L. L.; BABAR, M. E.; WILSON, G. A.; MCCLURE, M. C.; ROLF, M. M.; KIM, J. W.; SCHNABEL, R. D.; TAYLOR, J. F. Resolving the evolution of extant and extinct ruminants with hith-throughput phylogenomics. Proceedings of the National Academy of Sciences, v. 106, n. 44, p. 18644-18649, 2009

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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7.Imagem marcado/desmarcadoDECKER, J. E.; PIRES, J. C.; CONANT, G. C.; MCKAY, S. D.; HEATON, M. P.; VILKKI, J.; CHEN, K.; COOPER, A.; SEABURY, C. M.; CAETANO, A. R.; JOHNSON, G. S.; BRENNEMAN, R. A.; HANOTTE, O.; COUTINHO, L. L.; BABAR, M. E.; EGGERT, L. S.; WIENER, P.; KIM, J.-J.; KIM, K. S.; SONSTEGARD, T. S.; TASSELL, C. P. van; NEIBERGS, H. L.; SCHNABEL, R. D.; TAYLOR, J. F. Divergence times and signatures of selection from phylogenomic analysis of Pecoran species. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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8.Imagem marcado/desmarcadoGARCIA, J. F.; CARMO, A. S. DO; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. DE R.; CARVALHEIRO, R.; TASSELL, C. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B. How bioinformatics enables livestock applied sciences in the genomic era. Brazilian Symposium on Bioinformatics - BSB, 2012, Heidelberg. Anais...

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

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9.Imagem marcado/desmarcadoGASPARIN, G.; MIYATA, M.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; FURLONG, J.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapping of quatitative trait loci controlling tick [Riphicephalus (Boophilus) microplus] resistance on bovine chromosomes 5, 7 and 14. Animal Genetics, Oxford, v. 38, p. 453-459, 2007.

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10.Imagem marcado/desmarcadoGASPARIN, G.; MIYATA, M.; COUTINHO, M. L.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; FURLONG, J.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapping of quantitative trait loci controlling tick Riphicephalus ( Boophilus) microplus] resistance on bovine chromosomes 5, 7, and 14. Animal Genetics, v. 38, p. 453-459, 2007.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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11.Imagem marcado/desmarcadoKIM, E. S.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GASBARRE, L. C.; TASSEL, C. P. V. Genome-wide scan of gastrointestinal nematode resistance in closed Angus population selected for minimized influence of MHC. PLoS One, v. 10, n. 3, 2015. 18 p.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

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12.Imagem marcado/desmarcadoKIM, E. S.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GASBARRE, L. C.; VAN TASSELL, C. P. Identification of quantitative trait loci affecting gastrointestinal parasite resistance in an experimental Angus population. Animal Genetics, 2013. Dec 5. doi: 10.1111/age.12101

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13.Imagem marcado/desmarcadoLIU G. E.; HOU, Y. L.; ZHU, B.; CARDONE, M. F.; JIANG, L.; CELLAMARE, A.; MITRA, A.; ALEXANDER, L. J.; COUTINHO. L. L.; DELL'AQUILA, M. E.; GASBARRE, L. C.; LACALANDRA, G.; LI, R. W.; MATUKUMALLI, L. K.; NONNEMAN, D.; REGITANO, L. C. de A.; SMITH, T. P; SONG, J. Z.; SONSTEGARD, T. S.; Van TASSELL, C. P.; VENTURA, M.; EICHLER, E. E.; McDANELD, T. G.; KEELE, J. W. Analysis of copy number variations among diverse cattle breeds. Genome Research, v. 20, n. 5, p. 693-703, 2010

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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14.Imagem marcado/desmarcadoLIU, G. E.; LI, R. W.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSELL, C. P. Characterization of a novel microdeletion polymorphism on BTA5 in cattle. Animal Genetics v. 39 p. 655-658

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15.Imagem marcado/desmarcadoMCCLURE, M. C.; SONSTEGARD, T. S.; WIGGANS, G.; EENENNAAM, A. L. V.; WEBER, K. L.; PENEDO, C. T.; BERRY, D. P.; FLYNN, J.; GARCIA, J. F.; CARMO, A. S.; REGITANO, L. C. A.; SOUZA, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; COFFEY, M.; MOORE, K.; BOSCHER, M. Y.; GENESTOUT, L.; MAZZA, R.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; MACHADO, M. A.; SIMPSON, B.; MCEWAN, J. C.; CROMIE, A.; COUTINHO, L. L.; KUEHN, L. A.; KEELE, J. W.; PIPER, E. K.; COOK, J.; MARQUES, E.; TASSELL, C. P. V. Imputation of microsatellite alleles from dense SNP genotypes for parentage verification across multiple bos taurus and bos indicus breeds. In: Annual International Plant and Animal Genome Conference, 21., 2013, San Diego. Abstracts...

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16.Imagem marcado/desmarcadoMcCLURE, M. C.; SONSTEGARD, T. S.; WIGGANS, G. R.; EENENNAAM, A. L. V.; WEBER, K. L.; PENEDO, C. T.; BERRY, D. P.; FLYNN, J.; GARCIA, J. F.; CARMO, A. S.; REGITANO, L. C. de A.; ALBUQUERQUE, M.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; COFFEY, M.; MOORE, K.; BOSCHER, M. Y.; GENESTOUT, L.; MAZZA, R.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; SIMPSON, B.; MARQUES, E.; McEWAN, J. C.; CROMIE, A.; COUTINHO, L. L.; KUEHN, L. A.; KEELE, J. W.; PIPER, E. K.; COOK, J.; WILLIAMS, R.; TASSELL, C. P. V. Imputation of microsatellite alleles from dense SNP genotypes for parentage verification across multiple Bos taurus and Bos indicus breeds. Frontiers in Genetics, v. 4, n. 176, 2013. 11 p.

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17.Imagem marcado/desmarcadoMIYATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ. M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Caracterização genética de uma população experimental F2 usando marcadores moleculares no cromossomo 14 ( BTA 14) de bovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA , 51., 2005, Águas de Lindóia. Lindóia: SBG, 2005. p. 364

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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18.Imagem marcado/desmarcadoMIYATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; ROSÁRIO, M. F. do; REGITANO, L. C. de A. Quantitative trait loci (QTL) mapping for growth traits on bovine chromosome 14. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 2, p. 364-369, 2007.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste.

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19.Imagem marcado/desmarcadoMYTATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapeamento de QTLS para peso ao nascimento no cromossomo 14 de bovinos In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A Produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: SBZ, 2005. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.

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20.Imagem marcado/desmarcadoNEVES, H. H.; CARVALHEIRO, R.; O'BRIEN, A. M.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S. do; SCHENKEL, F. S.; SÖLKNER, J.; MCEWAN, J. C.; VAN TASSELL, C. P.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B.; QUEIROZ, S. A.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F. Accuracy of genomic predictions in Bos indicus (Nellore) cattle. Genetics Selection Evolution, v. 46, n. 17, 2014. 13 p. Article n. 17.

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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  16/02/2016
Data da última atualização:  14/03/2016
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  KIM, E. S.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GASBARRE, L. C.; TASSEL, C. P. V.
Afiliação:  Eui-Soo Kim; Tad S. Sonstegard; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; Louis C. Gasbarre; Curtis P. Van Tassell.
Título:  Genome-wide scan of gastrointestinal nematode resistance in closed Angus population selected for minimized influence of MHC.
Ano de publicação:  2015
Fonte/Imprenta:  PLoS One, v. 10, n. 3, 2015.
Páginas:  18 p.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Genetic markers associated with parasite indicator traits are ideal targets for study of marker assisted selection aimed at controlling infections that reduce herd use of anthelminthics. For this study, we collected gastrointestinal (GI) nematode fecal egg count (FEC) data from post-weaning animals of an Angus resource population challenged to a 26 week natural exposure on pasture. In all, data from 487 animals was collected over a 16 year period between 1992 and 2007, most of which were selected for a specific DRB1 allele to reduce the influence of potential allelic variant effects of the MHC locus. A genome-wide association study (GWAS) based on BovineSNP50 genotypes revealed six genomic regions located on bovine Chromosomes 3, 5, 8, 15 and 27; which were significantly associated (-log10 p=4.3) with Box-Cox transformed mean FEC (BC-MFEC). DAVID analysis of the genes within the significant genomic regions suggested a correlation between our results and annotation for genes involved in inflammatory response to infection. Furthermore, ROH and selection signature analyses provided strong evidence that the genomic regions associated BC-MFEC have not been affected by local autozygosity or recent experimental selection. These findings provide useful information for parasite resistance prediction for young grazing cattle and suggest new candidate gene targets for development of disease-modifying therapies or future studies of host response to GI parasite infection.
Thesaurus NAL:  cattle; genetic markers; heritability.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/139139/1/Cnpgl-2015-PlosOne-Genome-wide.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
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CNPGL22363 - 1UPCSP - PPSP 6872SP 6872
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