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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
25/08/2014 |
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Data da última atualização: |
23/05/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HANKE, L. A. F.; BOTELHO, C. S.; BRAZ, F. A. F.; BATISTA, P. H. S.; FLATSCHART, A. V. F.; NODA, R. W.; CARNEIRO, A. A.; CAMPOS, A. C. F.; CAMPOS, S. V. A. |
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Afiliação: |
ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; ANDREA ALMEIDA CARNEIRO, CNPMS. |
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Título: |
FluxTransgenics: a flexible LIMS-based tool for management of plant transformation experimental data. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Methods, v. 10, n. 20, p. 1-9, 2014 |
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DOI: |
10.1186/1746-4811-10-20 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: The production and commercial release of Genetically Modified Organisms (GMOs) are currently the focus of important discussions. In order to guarantee the quality and reliability of their trials, companies and institutions working on this subject mustadopt new approaches on management, organization and recording of laboratory conditions where field studies are performed. Computational systems for management and storage of laboratory data known as Laboratory Information Management Systems (LIMS) are essential tools to achieve this. Results: In this work, we have used the SIGLa system – a workflow based LIMS as a framework to develop the FluxTransgenics system for a GMOs laboratory of Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Maize and Sorghum (Sete Lagoas, MG - Brazil). A workflow representing all stages of the transgenic maize plants generation has been developed and uploaded in FluxTransgenics. This workflow models the activities involved in maize and sorghum transformation using the Agrobacterium tumefaciens method. By uploading this workflow in the SIGLa system we have created Fluxtransgenics, a complete LIMS for managing plant transformation data. Conclusions:FluxTransgenics presents a solution for the management of the data produced by a laboratory of genetically modified plants that is efficient and supports different kinds of information. Its adoption will contribute to guarantee the quality of activities and products in the process of transgenic production and enforce the use of Good Laboratory Practices (GLP).The adoption of the transformation protocol associated to the use of FluxTransgenics has made it possible to increase productivity by at least 300%, increasing the efficiency of the experiments from between 0.5 and 1 percent to about3%. This has been achieved by an increase in the number of experiments performed and a more accurate choice of parameters, all of which have been made possible because it became easier to identify which were the most promising next steps of the experiments. The FluxTransgenics system is available for use by other laboratories, and the workflows that have been developed can be adapted to other contexts. MenosBackground: The production and commercial release of Genetically Modified Organisms (GMOs) are currently the focus of important discussions. In order to guarantee the quality and reliability of their trials, companies and institutions working on this subject mustadopt new approaches on management, organization and recording of laboratory conditions where field studies are performed. Computational systems for management and storage of laboratory data known as Laboratory Information Management Systems (LIMS) are essential tools to achieve this. Results: In this work, we have used the SIGLa system – a workflow based LIMS as a framework to develop the FluxTransgenics system for a GMOs laboratory of Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Maize and Sorghum (Sete Lagoas, MG - Brazil). A workflow representing all stages of the transgenic maize plants generation has been developed and uploaded in FluxTransgenics. This workflow models the activities involved in maize and sorghum transformation using the Agrobacterium tumefaciens method. By uploading this workflow in the SIGLa system we have created Fluxtransgenics, a complete LIMS for managing plant transformation data. Conclusions:FluxTransgenics presents a solution for the management of the data produced by a laboratory of genetically modified plants that is efficient and supports different kinds of information. Its adoption will contribute to guarantee the quality of activities and products in the process of transgen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Sistema de gerenciamento de informação de laboratório; Transformação de planta. |
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Thesagro: |
Genética; Milho; Sorgo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 109 | |
| 3. |  | TEODORO, A. V.; PASSOS, E. M. dos; SILVA, F. G. da; DINIZ, L. E. C.; TALAMINI, V.; PEREIRA, C. A. B.; GUZZO, E. C.; DOLLET, M. Alerta sobre a cigarrinha Haplaxius Crudus (Hemiptera: auchenorrhyncha: cixiidae): vetora do amarelecimento letal do coqueiro. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2019. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 232).| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 4. | | SANTOS, C. T. de J.; CORREIA, Q. C. S.; ARCHIMINIO, R. S.; COSTA, T. S.; RAMOS, S. R. R.; DINIZ, L. E. C. Análise da diversidade e estrutura genética de acessos de coqueiro anão. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 8., 2018, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2018. Editor técnico: Ronaldo Souza Resende. p. 101-105.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 7. | | TAMANHO, J. M. S. dos S.; SANTOS, H. S.; CHAGAS, M. I. de A.; AMORM. L. R. B.; TALAMINI, V.; DINIZ, L. E. C. Análise da variabilidade morfológica e genética do fungo Thielaviopsis paradoxa. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFI CA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 4., 2014, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 8. | | SILVA, D. C.; SANTOS, L. B. dos; PINTO, J. A. O.; PEREIRA, K. L. G.; DINIZ, L. E. C.; ARRIGONI BLANK, M. de F. Análise molecular via ISSR de uma população nativa de Eplingiella fruticosa. Revista RG News, Brasília, DF, v. 3, n. 2, 2017. P. 166. Edição Especial dos Anais do 3° Simpósio da Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Aracaju, out. 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 9. | | RAMOS, S. R. R.; LOIOLA, C. M.; ARAGÃO, W. M.; DINIZ, L. E. C.; LINS, P. M. P.; PEREIRA, M. G.; NUNES, A. de O.; RAMOS, H. C. C.; AZEVEDO, C. D. O.; SANTOS, P. H. A. D. Análisis de la distribución de la variabilidad genética en accesiones de cocotero gigante conservados en territorio brasileño. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENETICOS PARA AMERICA LATINA Y EL CARIBE, 9., 2013, El Salvador. Memoria resúmenes. El Salvador, Centa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 10. | | SILVA, D. C.; DINIZ, L. E. C.; BLANK, A. F.; NIZIO, D. A. C.; PINTO, J. A. O.; PEREIRA, K. L. G.; ARRIGONI BLANK, M. F. Assessment of genetic diversity of a native population of Eplingiella fruticosa: a plant with therapeutic potential. Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 3, ago. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 11. | | BRANCHER, T. L.; HAWERROTH, M. C.; HAWERROTH, F. J.; KVITSCHAL, M. V.; DINIZ, L. E. C.; CARLESSO, C. Avaliação do desenvolvimento da coloração e conteúdo de antocianinas na epiderme de frutos dos cultivares Fuji Mishima e Fuji Suprema. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE FRUTICULTURA DE CLIMA TEMPERADO, 16., 2019, Fraiburgo, SC. Anais...Levando conhecimento e tecnologia para a fruticultura. Vol II - Resumos. Fraiburgo, SC: Epagri, 23 a 25 jul. 2019. p. 31. XVI ENFRUTE 2019| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 12. | | FRANCA, V. dos S.; MENESES, J. O.; CUNHA, F. dos S.; DIAS, J. A. R.; CUNHA, A. F. S. da; SANTOS, C. C. M.; ABE, H. A.; PAIXAO, P. E. G.; FARIAS, A. E. N. de O.; SANTOS, T. B. R.; SILVA, I. C. A. da; FREITAS JUNIOR, V. T.; ARAUJO, A. A. de S.; SANTOS, B. L. dos; CARVALHO NETO, A. G. de; COSTA, L. P. da; SANTOS, F. J. dos; CARDOSO, J. C.; DINIZ, L. E. C.; FUJIMOTO, R. Y. Avaliação in vitro de extrato de Terminalia catappa contra o fungo Saprolegnia parasítica. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 9., 2019, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros; Brasília, DF: Embrapa, 2019. Editor Técnico: Ronaldo Souza Resende. p. 15. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | RAMOS, S. R. R.; LEDO, A. da S.; WARWICK, D. R. N.; PASSOS, E. E. M.; MORAES, E. F.; RIBEIRO, F. E.; FONTES, H. R.; NASCIMENTO, J. M. F. do; SOBRAL, L. F.; DINIZ, L. E. C. Banco ativo de germoplasma de coco (Cocos nucifera L.). Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2009. il.; color.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 14. | | SANTOS, A. V. dos; ARRIGONI BLANK, M. de F.; BLANK, A. F.; DINIZ, L. E. C.; FERNANDES, R. M. P. Biochemical profile of callus cultures of Pogostemon cablin (Blanco) Benth. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, v. 107, n. 1, p. 35-43, Oct. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 15. | | SEIXAS, C. D. S.; MAZARO, S. M.; DINIZ, L. E. C.; GODOY, C. V.; MEYER, M. C. Bioinsumos para o manejo de doenças foliares na cultura da soja. In: MEYER, M. C.; BUENO, A. de F.; MAZARO, S. M.; SILVA, J. C. da (ed.). Bioinsumos na cultura da soja. Brasília, DF: Embrapa, 2022. cap. 19. p. 331-343.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 16. | | LEDO, A. da S.; BERND, R. B.; DINIZ, L. E. C. Biotecnologia aplicada. In: FERREIRA, J. M. S.; WARWICK, D. R. N.; SIQUEIRA, L. A. (Ed.). A cultura do coqueiro no Brasil. 3. ed. rev. amp. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 227-238| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | SANTOS, M. S. dos; DINIZ, L. E. C.; FERREIRA, J. M. S.; SANTOS, A. L.; OLIVEIRA, F. A. de; TALAMINI, V. Caracterização da variabilidade genética da coleção de isolados de Thielaviopsis paradoxa. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 2., 2012, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa; Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 18. | | FRAGA, Y. S. B.; SANTOS, D. R. dos; REGO, R.; BRANDÃO, É. C. T. dos A.; DINIZ, L. E. C.; FERNANDES, M. F. Caracterização de bactérias antagonistas com alto potencial de inibição do crescimento de Thielaviopsis paradoxa quanto à presença de genes para síntese de policetídeos e peptídeos não-ribossomais. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 5., 2015, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 280, ref. 255-265. 1 CD-ROM. Editor Técnico: Marcelo Ferreira Fernandes.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 19. | | NUNES, A. de O.; RAMOS, S. R. R.; LOIOLA, C. M.; DINIZ, L. E. C.; PEREIRA, M. G.; AZEVEDO, C. D. de O.; SANTOS, P. H. A. D.; SILVA, R. do C.; SANTOS, E. S. de J. Caracterização molecular de acessos de coqueiro-gigante via marcadores SSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 20. | | AMORIM, J. N. E.; DINIZ, L. E. C.; MUNIZ, A. V. C. da S.; RAMOS, S. R. R.; TAVARES, M. M. F.; LINS, P. M. P.; ARAGAO, W. M. Caracterização preliminar de acessos de coqueiro gigante utilizando-se marcadores microsatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012. Anais. Belém, PA. 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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