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Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  26/03/2009
Data da última atualização:  15/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECILIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G.
Afiliação:  ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; LUIZ CÉSAR BORRO; DANIEL ALVARENGA; PABLO LIRA CECÍLIO; THAÍS VITAL PELLIGRINELLI; GORAN NESHICH, CNPTIA.
Título:  Structure descriptors of chameleon sequences.
Ano de publicação:  2008
Fonte/Imprenta:  In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Chile. Program and abstracts... Santiago: Pontificia Universidad Católica de Chile, 2008.
Páginas:  Não paginado.
Idioma:  Inglês
Notas:  RIB 2008.
Conteúdo:  It has been know since the early work by Sander and Kabsch in 1984 that some identical sequence motifs make completely different local (but extented) folds. In that work, Sander and Kabsch showed the existence of a number of pentapeptides, capable of nucleating both alpha helix and beta strand in different sequence and structure constellations. However, the authors had at that time a very limited universe on which to base their conclusions; namely, the size of the PDB at that time (1984) was only 154 protein structure available. In 2008 the number of available structure is 51,079 (May 27th), 47137containing proteins only. Consequenly, the database is 306 times larger and we took full advantage of this fact. In order to analyze chameleon sequences, we established very strict rules and considered only those ones that passed the test of consensus among HSSP and STRIDE definitions for the Secondary Structure Elements. This is a major difference in our approach versus that of Sander and Kabsch. We then created a data mart of sequences and respective structures with variable size and subjected them to analysis of structure descriptors stored in STING_RDB. Results are discussed in terms of the influence that a local 3D environment has on SSE necleation.
Palavras-Chave:  Bioinformática; Proteinas.
Thesaurus Nal:  Bioinformatics; Proteins.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA12691 - 2UPCRA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B. Danos causados pelo serrador em algaroba no Nordeste do Brasil. Boletim de Pesquisa Florestal, Colombo, n. 22/23, p. 87-90, jan./dez. 1991.
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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2.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B. Testes de vigor para avaliação da qualidade fisiológica de sementes de milho. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 95, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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3.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B. Comparação entre diferentes testes de vigor para avaliação da qualidade fisiológica de sementes de algodão. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 95, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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4.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B. Avaliação do potencial fisiológico de sementes de tomate pelo teste de estresse hídrico. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 33, n. 3, p. 653-657, Maio. 1998. Título em inglês: Evaluation of physiological potential of tomato seeds by the hydric stress test.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais.
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5.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B.; KARASAWA, M. Qualidade sanitária e fisiológica de sementes de feijão da região do submédio São Francisco. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 128, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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6.Imagem marcado/desmarcadoFERREIRA, M. G. R.; TORRES, S. B. Efeito de diferentes tamanhos de sementes na germinação e no vigor de plântulas de acacia (Acacia senegal (L.) Willd.) - Fabaceae-Mimosoideae. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 204, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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7.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B.; NASCIMENTO, A. R. P.; KARASAWA, M. Incidência de fungos em sementes de milho e feijão produzidas na região do Médio São Francisco. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 23, p. 288, ago. 1998. Suplemento. Edição dos Resumos do 31 Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Fortaleza, 1998.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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8.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B.; PEIXOTO, A. R.; CARVALHO, I. M. S. Qualidade sanitária e fisiológica de sementes de feijão-macassar (Vigna unguiculata (L.) Walp.) da região do submédio São Francisco. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 129, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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9.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B.; PEIXOTO, A. R.; CARVALHO, I. M. S. Qualidade sanitária e fisiológica de sementes de tomate da região do submédio São Francisco. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 129, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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10.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, P. C. F.; OLIVEIRA, V. R. de; TORRES, S. B. Comportamento de espécies de algaroba em Petrolina, Pernambuco. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 50., 1999, Blumenau. Resumos... Blumenau: SBB, 1999. p. 159.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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11.Imagem marcado/desmarcadoALVES, M. da C. S.; MEDEIROS FILHO, S.; INNECCO, R.; TORRES, S. B. Alelopatia de extratos voláteis na germinação de sementes e no comprimento da raiz de alface. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 11, p. 1083-1086, novembro 2004 Título em inglês: Allelopathy of plant volatile extracts on seed germination and radicle length of lettuce.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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12.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, P. C. F.; OLIVEIRA, V. R. de; NASCIMENTO, C. E. de S.; TORRES, S. B. Diagnóstico da arborização de ruas de Petrolina- PE. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE ARBORIZACAO URBANA, 3., 1990, Curitiba. Anais... Curitiba: FUPEF, 1990. p. 41-53.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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13.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. A. S.; TORRES, S. B.; CARVALHO, I. M. S. Teste de envelhecimento acelerado em sementes de maxixe (Cucumis anguria L.). Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 167, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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14.Imagem marcado/desmarcadoMAIA, S. da S.; SMIDERLE, O. J.; SOUZA, A. das G.; TORRES, S. B. Do storage of Eugenia stipitata seeds affect their germination and efficacy of the tetrazolium viability test? Bioagro, v. 36, n. 1, p.113-120, 2024.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Roraima.
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15.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B.; SILVA, M. A. S.; CARVALHO, I. M. S. Correlação entre testes de vigor em sementes de maxixe (Cucumis anguria L.). Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 96, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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16.Imagem marcado/desmarcadoFIRMINO, J. L.; QUEIROZ, J. B. N. de; ALMEIDA, M. C.; TORRES, S. B. Efeito do desponte e da embebição sobre a germinação e desenvolvimento de plântulas de cajá (Spondias lutea L.). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 47., 1996, Nova Friburgo. Resumos... Nova Friburgo: SBB, 1996. p. 458.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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17.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M. P.; SANTOS, R. K.; PINTO, R. M. S.; TORRES, S. B. Efeitos de diferentes substratos e de gradientes de luminosidade na germinação de sementes de umbu (Spondias tuberosa Arruda) - Anacardiaceae. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 216, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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18.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B.; LIMA, P. C. F.; HAJI, F. N. P. Identificação de insetos serradores em Prosopis spp., em Petrolina- PE. In: ENCONTRO NACIONAL DE FITOSSANITARISTAS, 7.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 16., 1997, Salvador. Resumos... Salvador: SEB: EMBRAPA-CNPMF: EBDA: CEPLAC, 1997. p. 255.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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19.Imagem marcado/desmarcadoTORRES, S. B.; LUCCA FILHO, O. A.; FRANCO, D. F.; SIEWERDT, F. Heterogeneidade em lotes de sementes fiscalizadas de arroz (Oryza sativa L.) cultivar BR IRGA 409. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 30, n. 4, p. 563-567, abr. 1995. Título em inglês: Heterogeneity in lots of fiscalized rice seeds cv. BR IRGA 409.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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20.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M. P.; PINTO, R. M. S.; SANTOS, R. K.; TORRES, S. B. Influência da posição de semeadura na germinação de sementes de umbu (Spondias tuberosa Arruda) - Anacardiaceae. Informativo ABRATES, Curitiba, v. 7, n. 1/2, p. 215, 1997.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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