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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
01/08/2014 |
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Data da última atualização: |
11/12/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ZULETA, L. F. G.; CUNHA, C. de O.; CARVALHO, F. M. de; CIAPINA, L. P.; SOUZA, R. C; MERCANTE, F. M.; FARIA, S. M. de; BALDANI, J. I.; STRALIOTTO, R.; HUNGRIA, M.; VASCONCELOS, A. T. R. de. |
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Afiliação: |
FABIO MARTINS MERCANTE, CPAO; SERGIO MIANA DE FARIA, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; ROSANGELA STRALIOTTO, CNPAB. |
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Título: |
The complete genome of Burkholderia phenoliruptrix strain BR3459a, a symbiont of Mimosa flocculosa: highlighting the coexistence of symbiotic and pathogenic genes. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 15, n. 1, p. 535, Jun. 2014. |
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DOI: |
10.1186/1471-2164-15-535 |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
BACKGROUND: Burkholderia species play an important ecological role related to xenobiosis, the promotion of plant growth, the biocontrol of agricultural diseases, and symbiotic and non-symbiotic biological nitrogen fixation. Here, we highlight our study as providing the first complete genome of a symbiotic strain of B. phenoliruptrix, BR3459a (=CLA1), which was originally isolated in Brazil from nodules of Mimosa flocculosa and is effective in fixing nitrogen in association with this leguminous species. RESULTS: Genomic comparisons with other pathogenic and non-pathogenic Burkholderia strains grouped B. phenoliruptrix BR3459a with plant-associated beneficial and environmental species, although it shares a high percentage of its gene repertoire with species of the B. cepacia complex (Bcc) and "pseudomallei" group. The genomic analyses showed that the bce genes involved in exopolysaccharide production are clustered together in the same genomic region, constituting part of the Group III cluster of non-pathogenic bacteria. Regarding environmental stresses, we highlight genes that might be relevant in responses to osmotic, heat, cold and general stresses. Furthermore, a number of particularly interesting genes involved in the machinery of the T1SS, T2SS, T3SS, T4ASS and T6SS secretion systems were identified. The xenobiotic properties of strain BR3459a were also investigated, and some enzymes involved in the degradation of styrene, nitrotoluene, dioxin, chlorocyclohexane, chlorobenzene and caprolactam were identified. The genomic analyses also revealed a large number of antibiotic-related genes, the most important of which were correlated with streptomycin and novobiocin. The symbiotic plasmid showed high sequence identity with the symbiotic plasmid of B. phymatum. Additionally, comparative analysis of 545 housekeeping genes among pathogenic and non-pathogenic Burkholderia species strongly supports the definition of a new genus for the second branch, which would include BR3459a. CONCLUSIONS: The analyses of B. phenoliruptrix BR3459a showed key property of fixing nitrogen that together with genes for high tolerance to environmental stresses might explain a successful strategy of symbiosis in the tropics. The strain also harbours interesting sets of genes with biotechnological potential. However, the resemblance of certain genes to those of pathogenic Burkholderia raise concerns about large-scale applications in agriculture or for bioremediation. MenosBACKGROUND: Burkholderia species play an important ecological role related to xenobiosis, the promotion of plant growth, the biocontrol of agricultural diseases, and symbiotic and non-symbiotic biological nitrogen fixation. Here, we highlight our study as providing the first complete genome of a symbiotic strain of B. phenoliruptrix, BR3459a (=CLA1), which was originally isolated in Brazil from nodules of Mimosa flocculosa and is effective in fixing nitrogen in association with this leguminous species. RESULTS: Genomic comparisons with other pathogenic and non-pathogenic Burkholderia strains grouped B. phenoliruptrix BR3459a with plant-associated beneficial and environmental species, although it shares a high percentage of its gene repertoire with species of the B. cepacia complex (Bcc) and "pseudomallei" group. The genomic analyses showed that the bce genes involved in exopolysaccharide production are clustered together in the same genomic region, constituting part of the Group III cluster of non-pathogenic bacteria. Regarding environmental stresses, we highlight genes that might be relevant in responses to osmotic, heat, cold and general stresses. Furthermore, a number of particularly interesting genes involved in the machinery of the T1SS, T2SS, T3SS, T4ASS and T6SS secretion systems were identified. The xenobiotic properties of strain BR3459a were also investigated, and some enzymes involved in the degradation of styrene, nitrotoluene, dioxin, chlorocyclohexane, chlorobe... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Comparative genomics; FBN; Genômica; Nitrogen fixing; Pathogenic Bacteria. |
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Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio. |
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Thesaurus Nal: |
Nitrogen fixation. |
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Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 03533naa a2200337 a 4500
001 2001867
005 2014-12-11
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520 $aBACKGROUND: Burkholderia species play an important ecological role related to xenobiosis, the promotion of plant growth, the biocontrol of agricultural diseases, and symbiotic and non-symbiotic biological nitrogen fixation. Here, we highlight our study as providing the first complete genome of a symbiotic strain of B. phenoliruptrix, BR3459a (=CLA1), which was originally isolated in Brazil from nodules of Mimosa flocculosa and is effective in fixing nitrogen in association with this leguminous species. RESULTS: Genomic comparisons with other pathogenic and non-pathogenic Burkholderia strains grouped B. phenoliruptrix BR3459a with plant-associated beneficial and environmental species, although it shares a high percentage of its gene repertoire with species of the B. cepacia complex (Bcc) and "pseudomallei" group. The genomic analyses showed that the bce genes involved in exopolysaccharide production are clustered together in the same genomic region, constituting part of the Group III cluster of non-pathogenic bacteria. Regarding environmental stresses, we highlight genes that might be relevant in responses to osmotic, heat, cold and general stresses. Furthermore, a number of particularly interesting genes involved in the machinery of the T1SS, T2SS, T3SS, T4ASS and T6SS secretion systems were identified. The xenobiotic properties of strain BR3459a were also investigated, and some enzymes involved in the degradation of styrene, nitrotoluene, dioxin, chlorocyclohexane, chlorobenzene and caprolactam were identified. The genomic analyses also revealed a large number of antibiotic-related genes, the most important of which were correlated with streptomycin and novobiocin. The symbiotic plasmid showed high sequence identity with the symbiotic plasmid of B. phymatum. Additionally, comparative analysis of 545 housekeeping genes among pathogenic and non-pathogenic Burkholderia species strongly supports the definition of a new genus for the second branch, which would include BR3459a. CONCLUSIONS: The analyses of B. phenoliruptrix BR3459a showed key property of fixing nitrogen that together with genes for high tolerance to environmental stresses might explain a successful strategy of symbiosis in the tropics. The strain also harbours interesting sets of genes with biotechnological potential. However, the resemblance of certain genes to those of pathogenic Burkholderia raise concerns about large-scale applications in agriculture or for bioremediation.
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Registro original: |
Embrapa Agropecuária Oeste (CPAO) |
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| Registros recuperados : 23 | |
| 1. |  | DIONISIO, A. P.; MOLINA, G.; CARVALHO, D. S. de; SANTOS, R. dos; BICAS, J. L.; PASTORE, G. M. Natural flavourings from biotechnology for foods and beverages. In: BAINES, D.; SEAL, R. (Ed.). Natural food additives, ingredients and flavourings. Cambridge: Woodhead Publishing Limited, 2012. Cap. 11, p. 231-259| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 2. | | MOREIRA, N. H.; BRASIL, O. O.; SILVA, P. C. P.; SANTOS, R. dos S.; TORTORELLA, R. D.; RAMOS, A. F. Diferentes protocolos de indução do estro, durante as estações chuvosa e seca, em ovelhas Santa Inês. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 365. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 3. | | TORTORELLA, R. D.; SANTOS, R. dos; SILVA, P. C. P.; MOREIRA, N. H.; NEVES, J. P.; RAMOS, A. F. Caracterização do ciclo estral de vacas e novilhas curraleiras Pé-Duro. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 626. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 4. | | BARBOSA, E. A.; TEIXEIRA, H. C. A.; SANTOS, R. dos; NASCIMENTO, N. V. do; RAMOS, A. F. Características seminais e testiculares de touros localmente adaptados submetidos a presença e ausência de sombra na Região Centro- Oeste. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 67, 2018. Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | SANTOS, E. F. dos; VENDRUSCULO, L. G.; LOPES, L. B.; SANTOS, R. dos; OLIVEIRA, J. A. de. Classificando alvos de interesse em carcaças bovinas. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS, 4.; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 9., 2020, Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 17.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 6. | | MOREIRA, N. H.; SANTOS, R. dos; SAAVEDRA, C. A. P. B.; SILVA, J. P. da; RAMOS, A. F. Efeito de diferentes tipos de estradiol sobre a liberação de fsh, em ovelhas sincronizadas com cidr®. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | BRASIL, O. O.; MOREIRA, N. H.; SANTOS, R. dos; SOUTO, P. L. G.; BARBOSA, E. A.; RAMOS, A. F. Produção embrionária de ovelhas com diferentes condições corporais, submetidas ou não ao flushing energético. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 374. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | SANTOS, R. dos; SENA NETTO, S. B. de; TORTORELLA, R. D.; BARBOSA, E. A.; SILVA, P. P.; RAMOS, A. F. Resposta das vacas da raça curraleiro Pé-Duro a dois diferentes protocolos de sincronização e indução da ovulação. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 625. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | SANTOS, R. dos; BRILHANTE, G. C.; TORTORELLA, R. D.; BARBOSA, E. A.; TEIXEIRA, H. C. A.; RAMOS, A. F. Protocolo com nove dias de progesterona para IATF em vacas taurinas adaptadas ao clima tropical. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 43, n. 2, p. 455, abr./jun. 2019. Edição dos resumos do XXIII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal, Gramado, RS, Brasil, 15 a 17 de maio 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | FERNANDES, A. H. B. M.; OLIVEIRA, L. O. F. de; FERNANDES, F. A.; ABREU, U. G. P. de; CRISPIM, S. M. A.; SANTOS, R. dos. Nelore cattle methane emissions in native and cultivated pastures of the Pantanal at the end of the rainy season. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GREENHOUSE GASES IN AGRICULTURE, 2., 2016, Campo Grande, MS. Proceedings... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 416-417. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 216). Coordenador Roberto Giolo de Almeida. II SIGEE. Disponível em: <http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/150907/1/fernandes-nelore.pdf>. Acesso em: 01 dez. 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 12. | | ECKSTEIN, C.; MOUSTACAS, V. S.; LOPES, L. B.; MOL, J. P. da S.; GOMES, S. C.; SANTOS, R. dos; CASTRO, B. G. de; SANTOS, R. L. Differential diagnosis of infectious reproductive diseases in sheep flocks of Mato Grosso State, Brazil. Small Ruminant Research, v. 153, p. 158-162, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 13. | | BARBOSA, E. A.; SANTOS, R. dos; SENNA NETTO, S. B. de; TORTORELLA, R. D.; TEIXEIRA, H. C. A.; RAMOS, A. F. Taxa de gestação em fêmeas curraleiro pé-duro submetidas a diferentes protocolos de iatf. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | SANTOS, R. dos S.; MURUCI, L. N. M.; SANTOS, L. O.; ANTONIASSI, R.; SILVA, J. P. L. da; DAMASO, M. C. T. Characterization of different oil soapstocks and their application in the lipase production by Aspergillus niger under solid state fermentation. Journal of Food and Nutrition Research, v. 2, n. 9, p. 561-566, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| 15. | | BARBOSA, E. A.; SANTOS, R. dos; NETTO, S. B. de S.; TORTORELLA, R. D.; TEIXEIRA, H. C. A.; RAMOS, A. F. Influência do tempo de exposição à progesterona nas características foliculares de fêmeas curraleiro pé-duro submetidas a protocolos de sincronização do estro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | OLIVEIRA, L. O. F. de; FERNANDES, A. H. B. M.; FERNANDES, F. A.; SANTOS, S. A.; CRISPIM, S. M. A.; GARCIA, J. B.; SANTOS, R. dos. Protocolos aplicados nas amostragens para as estimativas de emissão de metano pelos bovinos no Pantanal. Corumbá, MS: Embrapa Pantanal, 2015. 25p. (Embrapa Pantanal. Documentos, 136).| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 17. | | SANTOS, R. dos; OLIVEIRA, J. A. de; LOPES, F.; CASTRO, B. G. de; RODRIGUES, R. O.; NICOLINO, R. R.; LOPES, L. B. Prevalence of anti-Leptospira spp. antibodies in cows in the municipalities of Nova Guarita and Nova Santa Helena, Mato Grosso State, Brazil. Medicina Veterinária, v. 12, n. 4, p. 276-282, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 18. | | SANTOS, R. dos; OLIVEIRA, J. A. de; LOPES, F.; CASTRO, B. G. de; RODRIGUES, R. O.; NICOLINO, R. R.; LOPES, L. B. Prevalência de anticorpos anti-Leptospira spp. em vacas nos municípios de Nova Guarita e Nova Santa Helena, Mato Grosso. In: FARIAS NETO, A. L. de; NASCIMENTO, A. F. do; ROSSONI, A. L.; MAGALHÃES, C. A. de S.; ITUASSU, D. R.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; IKEDA, F. S.; FERNANDES JUNIOR, F.; FARIA, G. R.; ISERNHAGEN, I.; VENDRUSCULO, L. G.; MORALES, M. M.; CARNEVALLI, R. A. (Ed.). Embrapa Agrossilvipastoril: primeiras contribuições para o desenvolvimento de uma agropecuária sustentável. Brasília, DF: Embrapa, 2019. pt. 5, cap. 2, p. 371-374.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 19. | | ANTUNES, L. F. de S.; OLIVEIRA, B. de A. F. de; SOUZA, C. A. dos S. de; FERREIRA, T. dos S.; SANTOS, R. dos S.; CORREIA, M. E. F. Eficiência do gongocomposto na produção de mudas de brócolis. Cadernos de Agroecologia, v. 15, n. 2, 2020. Edição Anais do XI Congresso Brasileiro de Agroecologia, São Cristóvão, Sergipe| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 20. | | SANDRINI, J. G.; BONA, M. de; ZANONI, I. Z.; MATIOLA, A. V.; HEIDEN, G.; GASPER, A. L. de; TREVISAN, R.; FUNEZ, L. A.; SANTOS, R. dos; ELIAS, G. A. Discovering Brazilian cliff vascular flora on basaltic rock outcrops in Serra do Rio do Rastro, Santa Catarina. Biota Neotropica, v. 26, n. 1, 2026.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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