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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
19/05/2017 |
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Data da última atualização: |
05/07/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
CARVALHO, G. A. B. de. |
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Afiliação: |
GESIELE ALMEIDA BARROS DE CARVALHO, UEL. |
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Título: |
Análise transcricional dos genes envolvidos na nodulação e predição in silico de microRNAs em raízes de soja inoculadas com a estirpe CPAC 15 de Bradyrhizobium japonicum. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
2012. |
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Páginas: |
93 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Orientada por Mariangela Hungria. |
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Conteúdo: |
CONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defesa antioxidante. Funções putativas na simbiose de alguns desses genes foram atribuídas pela primeira vez na simbiose soja-Bradyrhizobium. Foi também realizada uma minuciosa predição in silico de miRNAs e seus alvos que, possivelmente, estão envolvidos na regulação da nodulação. Foram identificados nove miRNAs potenciais, bem como seus possíveis genes alvos. Os resultados obtidos permitiram obter um melhor entendimento sobre a regulação da expressão gênica em soja dez dias pós-inoculação, bem como fortaleceram a ideia de que a predição computacional de miRNAs pode auxiliar na compreensão das etapas iniciais da simbiose. O estudo é pioneiro com uma cultivar de soja e estirpe brasileiras. ABSTRACT: Abstract: Biological nitrogen fixation is a process of great importance to the soybean crop, capable of supplying all plant's needs on nitrogen, necessary for the synthesis of biomolecules. However, for nodule formation all steps should be closely coordinated by a series of molecular signals between the plant and bacterium. Therefore, the biological process involves several complex steps, and although it has been studied for several decades, much remains to be understood. This study aimed to analyze the global expression of genes differentially expressed in soybean roots of cultivar Conquista inoculated with Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (=SEMIA 5079), both broadly used in Brazil. In addition, we performed a computationally prediction of new miRNAs that may be involved in regulating the process. To achieve this we used the suppressive subtractive hybridization technique combined with the new generation sequencing and bioinformatics analyses, which resulted in a subtractive library (non-inoculated X inoculated) of soybean roots with 3,210 differentially expressed transcripts. The data were grouped according to the ontology of molecular function and biological process. Next, we analyzed the most active metabolic pathways at this stage of nodulation, and emphasis was given to genes related to the primary metabolism, cell wall modifications and antioxidant defense system. Putative functions were attributed to some of these genes for the first time. We have also performed a detailed in silico prediction of miRNAs and their targets, which are possibly involved in regulation of nodulation. Nine potential miRNAs were identified, as well as the possible target genes. The results obtained have allowed to get a better understanding about the regulation of gene expression in soybean ten days post-inoculation, as well as have reinforced the idea that the computational prediction of miRNAs may help to understand the initial steps of the symbiosis. Moreover, the study is pioneer with a Brazilian soybean cultivar and a Brazilian Bradyrhizobium strain. MenosCONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defes... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Fixação de nitrogênio; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Nitrogen fixation; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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520 $aCONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defesa antioxidante. Funções putativas na simbiose de alguns desses genes foram atribuídas pela primeira vez na simbiose soja-Bradyrhizobium. Foi também realizada uma minuciosa predição in silico de miRNAs e seus alvos que, possivelmente, estão envolvidos na regulação da nodulação. Foram identificados nove miRNAs potenciais, bem como seus possíveis genes alvos. Os resultados obtidos permitiram obter um melhor entendimento sobre a regulação da expressão gênica em soja dez dias pós-inoculação, bem como fortaleceram a ideia de que a predição computacional de miRNAs pode auxiliar na compreensão das etapas iniciais da simbiose. O estudo é pioneiro com uma cultivar de soja e estirpe brasileiras. ABSTRACT: Abstract: Biological nitrogen fixation is a process of great importance to the soybean crop, capable of supplying all plant's needs on nitrogen, necessary for the synthesis of biomolecules. However, for nodule formation all steps should be closely coordinated by a series of molecular signals between the plant and bacterium. Therefore, the biological process involves several complex steps, and although it has been studied for several decades, much remains to be understood. This study aimed to analyze the global expression of genes differentially expressed in soybean roots of cultivar Conquista inoculated with Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (=SEMIA 5079), both broadly used in Brazil. In addition, we performed a computationally prediction of new miRNAs that may be involved in regulating the process. To achieve this we used the suppressive subtractive hybridization technique combined with the new generation sequencing and bioinformatics analyses, which resulted in a subtractive library (non-inoculated X inoculated) of soybean roots with 3,210 differentially expressed transcripts. The data were grouped according to the ontology of molecular function and biological process. Next, we analyzed the most active metabolic pathways at this stage of nodulation, and emphasis was given to genes related to the primary metabolism, cell wall modifications and antioxidant defense system. Putative functions were attributed to some of these genes for the first time. We have also performed a detailed in silico prediction of miRNAs and their targets, which are possibly involved in regulation of nodulation. Nine potential miRNAs were identified, as well as the possible target genes. The results obtained have allowed to get a better understanding about the regulation of gene expression in soybean ten days post-inoculation, as well as have reinforced the idea that the computational prediction of miRNAs may help to understand the initial steps of the symbiosis. Moreover, the study is pioneer with a Brazilian soybean cultivar and a Brazilian Bradyrhizobium strain.
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650 $aSoybeans
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650 $aSoja
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Embrapa Soja (CNPSO) |
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| 4. |  | OLIVIERA NETO, A. M. de; MORAIS, J. A. da S.; RANGEL, J. H. de A.; ALMEIDA, R. D. de; SANTANA NETO, J. A.; VALENÇA, R. L. Comportamento ingestivo de novilhos de corte mantidos em pastagem de Brachaiaria decumbens consorciada com diferentes densidades de Gliricida sepium no período seco. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. r. 4192. artigo 4192pdf.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 5. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; MELO, P. de O.; CASTRO FILHO, E. S.; ARAUJO, H. R. de. Composição centesimal do músculo Logissimus dorsi de cordeiros alimentados com silagem de gliricídia. In: CONGRESSO NORDESTINO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2010, Mossoró. Anais... Mossoró: SNPA, 2010. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 6. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; SA, J. L. de; SA, C. O. de; ARAUJO, H. R. de. Características dos cortes da carcaça de ovinos terminados em confinamento recebendo níveis crescentes de silagem de gliricídia. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científico na zootecnia brasileira: anais. Salvador: SBZ, 2010. 1 CD-ROM. r. 6177.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 7. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; VASCONCELOS, A.; RANGEL, J. H. de A.; SÁ, C. O. de; SÁ, J. L. de; SILVA, A. V. C. da. Desempenho de cordeiros da raça Santa Inês alimentos em sistema de comedouros seletivos com diferentes níveis de concentrado. In: CONGRESSO DE ZOOTECNIA, 19., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Parassununga: Faculdade de Zootencia e Engenharia de Alimentos, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 8. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; VASCONCELOS, A.; RANGEL, J. H. de A.; SA, C. O. de; SA, J. L. de; SILVA, A. V. C. da. Desempenho de cordeiros da raça Santa Inês alimentos em sistemas de comedouros seletivos com diferentes níveis de concentrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 19., 2009, Águas de Lindóia. Visão estratégica de cadeias do agronegócio: anais. Pirassununga: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2009. Não paginado. ZOOTEC 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 9. | | MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; SANTANA NETO, J. A.; SA, C. O. de; SA, J. L. de; AZEVEDO, H. C. Desempenho de cordeiros Santa Inês alimentados com feno de Gliricidia sepium. In: Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 19, supl. 1, p. 131, Oct. 2011. Edición de las Memorias de la 22a. Reunión ALPA, 2011, Montevideo. L100 Poster.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | CASTRO FILHO, E. S.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; SANTOS, G. R. de A.; SANTANA NETO, J. A.; ARAUJO, H. R. de. Dry matter yield and bromatological composition of gliricidia in different crop densities. Ciência Rural, Santa Maria, RS, v. 46, n. 6, p. 1038-1043, jun. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 11. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; ARAUJO, H. R. de; CASTRO FILHO, E. S.; MELO, P. de O. Desempenho e rendimento de carcaça de cordeiros Santa Inês terminados em confinamento recebendo silagem de gliricídia em substituição ao concentrado. In: CONGRESSO NORDESTINO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2010, Mossoró. Anais... Mossoró: SNPA, 2010. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 12. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; SA, C. O. de; SA, J. L. de; SANTOS, D. O.; SILVA. A. V. C. da; CASTRO FILHO, E. S. Crescimento ponderal e características de carcaça de ovinos alimentadas com silagem de gliricídia. SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; SA, C. O. de; SA, J. L. de; SANTOS, D. O.; SILVA. A. V. C. da; CASTRO FILHO, E. S. Crescimento ponderal e características de carcaça de ovinos alimentadas com silagem de gliricídia. In: Caderno de cultura do estudante. São Cristóvão: Editora UFS, 2013. v. 8, n. 10, p. 91-97.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
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| 14. | | ALMEIDA, R. D. de; RANGEL, J. H. de A.; SANTANA NETO, J. A.; OLIVEIRA, V. da S.; VALENÇA, R. de L.; FAGUNDES, J. L. Disponibilidade de forragem em sistema silvipastoris consorciados de gliricídia com braquiaria. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 19., 2009, São Cristóvão. Resumos...São Cristóvão: UFS, 2009. 1 CD-ROM. p. 525.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | SANTANA NETO, J. A.; MARTINELE, I.; F. CEDROLA; G. R. A. SANTOS; MUNIZ, E. N.; SOUZA, E. Y. B.; CASTRO FILHO, E. S.; DAGOSTO, M. Efeitos da manipueira sobre as populações de protozoários ciliados do rúmen de ovinos. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE ESPECIALISTAS EN PEQUEÑOS RUMIANTES Y CAMÉLIDOS SUDAMERICANOS, 8., 2013, Campo Grande, MS. Memórias... Campo Grande, MS: UCDB/ALEPRYC´s, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 16. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; SANTOS, G. R. de A.; MACHADO, F. de A. F. de; RANGEL, J. H. de A.; GOMES, L. C. Effect of cassava wastewater on physicochemical characteristics and fatty acids composition of meat from feedlot-finished lambs. Acta Scientiarum. Animal Sciences, Maringá, v. 39, n. 4, p. 377-383, Oct./Dec., 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 17. | | ARAUJO, H. R. de; RANGEL, J. H. de A.; MUNIZ, E. N.; CASTRO FILHO, E. S.; BARIN, L. B.; SANTANA NETO, J. A. Interceptação luminosa e índice de área foliar em pastagem de Digitaria umfolozi em diferentes frequencias de desfolhamento. In: CONGRESSO NORDESTINO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2010, Mossoró. Anais... Mossoró: SNPA, 2010. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 18. | | FARIAS, J. S.; SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; SANTOS, G. R. de A.; RANGEL, J. H. de A.; SOUZA, E. Y. B. Morfometria da carcaça de cordeiros em confinamento e suplementados com manipueira. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 8., 2013, Fortaleza. [Anais...]. [Sobral: Universidade Estadual Vale do Acaraú; Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | ARAUJO, H. R. de; RANGEL, J. H. de A.; MUNIZ, E. N.; CASTRO FILHO, E. S.; BARIN, L. B.; SANTANA NETO, J. A. Avaliação de produção de matéria seca e taxa de crescimento diário da digitaria umfolozi submetido a diferentes freqüências de desfolhamento. In: CONGRESSO NORDESTINO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 6., 2010, Mossoró. Anais... Mossoró: SNPA, 2010. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | SANTANA NETO, J. A.; MUNIZ, E. N.; RANGEL, J. H. de A.; ARAUJO, H. R. de; CASTRO FILHO, E. S.; MELO, P. de O. Avaliação da gliricídia (Gliricidia sepium, (JACQ.) Kunth, Walp) na forma de silagem no confinamento de ovinos. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTERIOS, 1., 2011, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2011. 1 CD-ROM. Artigo em anais.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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