BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
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1.Imagem marcado/desmarcadoTSUKAMOTO FILHO, A. de A.; MACEDO, R. L. G.; VENTURIN, N.; MARAIS, A. R. Aspectos fisiológicos e silviculturais do palmiteiro (Euterpe edulis Martius) plantados em diferentes tipos de consórcios no município de Lavras, Minas Gerais. Cerne, Lavras, v. 7, n. 1, p. 54-68, 2001.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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2.Imagem marcado/desmarcadoTZANETAKIS, I. E.; AKNADIBOSSIAN, V.; ŠPAK, J.; CONSTABLE, F.; HARPER, S. J.; HAMMOND, J.; CANDRESSE, T.; FOLIMONOVA, S. Y.; ASTUA, J. de F.; FUCHS, M.; JELKMANN, W.; MALIOGKA, V. I.; MARAIS, A.; MARTIN, R. R.; MOLLOV, D.; VIDALAKIS, G.; ABOUGHANEM-SABANADZOVIC, N.; RWAHNIH, M. A.; ALABI, O. J.; ALIOTO, D.; ATANDA, H. Y.; BAGI, F.; BARANWAL, V. K.; BARBOSA, C. de J.; BAR-JOSEPH, M.; RIVEREND, L. B. L.; BELIEN, T.; BENÍTEZ-GALEANO, M. J.; BENNYPAUL, H.; BERTACCINI, A.; BESTER, R.; BLOUIN, A. G.; BLYSTAD, D.; BOTERMANS, M.; BOZAN, O.; BRAKTA, A.; BRANS, Y.; BULAJIĆ, A.; CAGLAYAN, K.; CATARA, A.; CHOUEIRI, E.; CIEŚLIŃSKA, M.; COOK, G.; CUI, W.; GRAÇA, J. da; DAVINO, S.; DELMIGLIO, C.; DEWDNEY, M. M.; SERIO, F. D.; DIAZ-LARA, A.; DIGIARO, M.; DJELOUAH, K.; DONG, Y. F.; DONOVAN, N.; DRUCIAREK, T. Z.; DURAN-VILA, N.; ELÇI, E.; ESQUIVEL-FARIÑA, A.; FALL, M. L.; FAN, X. D.; FIGUEROA, J.; FIORE, N.; FOWKES, A. R.; FOX, A.; FRÁNOVÁ, J.; FUCHS, R.; GAAFAR, Y. Z. A.; GARCÍA, M. L.; GHOSH, D.; GIRARDI, E. A.; GLASA, M.; TALQUENCA, S. G.; GRATZ, A.; GRITSENKO, D.; HAJERI, S.; HAJIZADEH, M.; HAMBORG, Z.; HO, T.; HOLEVA, M.; HOLKAR, S. K.; HORNER, M.; HURTADO-GONZALES, O. P.; IPPOLITO, A.; ISAC, V.; IWANAMI, T.; JOFRE-Y-GARFIAS, A. E.; JORDAN, R.; KATIS, N.; KOLONIUK, I.; KONINGS, H.; KRIŽANAC, I.; KRUEGER, R.; KYRYCHENKO, A.; BARBOSA, F. F. L.; LAVAGI-CRADDOCK, I.; LEVY, A.; LICCIARDELLO, G.; LU, Q.; MACFARLANE, S. A.; MARCONE, C.; MAREE, H. J.; MARGARIA, P.; MARTIĆ, A.; MASSART, S.; MATHIOUDAKIS, M. M.; MATIĆ, S.; PLESKO, I. M.; MEEKES, E. T. M.; MEHLE, N.; MELZER, M. J.; MENG, B.; MENZEL, W.; MILJANIĆ, V.; MINAFRA, A.; MINUTOLO, M.; MITRA, A.; MORENO, P.; NAVARRO, L.; NAVARRO, B.; NERVA, L.; OKIĆ, A.; OLMOS, A.; ÖNELGE, N.; OSUNDAHUNSI, B.; PALACIOS, M. F.; PALLAS, V.; PANNO, S.; PEREZ-EGUSQUIZA, Z.; POUDEL-WARD, B.; RADIŠEK, S.; RAMOS-GONZÁLEZ, P. L.; RAMTEKE, P.; RANABHAT, N. B.; RIVAREZ, M. P. S.; RIVAS, F.; ROENHORST, A.; ROY, A.; RUIZ-GARCÍA, A. B.; SABANADZOVIC, S.; ŠAFÁŘOVÁ, D.; SALDARELLI, P.; SALEM, N.; SOLSONA, G. S.; SCHOEN, R.; SHARMA, S. K.; SHILTS, T.; SIERRA-MEJIA, A.; SINGH, S.; SKELTON, A.; ŠKORIĆ, D.; STAINTON, D.; ŠTAJNER, N.; STAROVIĆ, M.; STUCHI, J. F.; SVOBODA, P.; TAHZIMA, R.; TANG, J.; TESSITORI, M.; THERMOZ, J.; THOMPSON, E.; THOMPSON, J.; TREBICKI, P.; TURINA, M.; SERCE, C. U.; UMBLE, J.; VALIUNAS, D.; VARALLYAY, E.; VARMA, A.; VARVERI, C.; VÁSQUEZ-GUTIÉRREZ, U.; VAZQUEZ-IGLESIAS, I.; VEERAKONE, S.; VILLAMOR, D. E.; VIVES, M. C.; VONČINA, D.; WANG, J.; WESTENBERG, M.; WETZEL, T.; WINTER, S.; WRIGHT, G.; WULFF, N. A.; XU, W. X.; YOKOMI, R.; ZHOU, C.; ZIKELI, K.; ZINDOVIĆ, J. Streamlining global germplasm exchange: integrating scientific rigor and common sense to exclude phantom agents from regulation. Plant Disease, v.109, n.4, p.736-755, 2025 0191-2917, Scientific Societies, 2025.

Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.

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1.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A. Aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões usando os descritores estruturais de proteínas da base de dados do software STING para discriminação do sítio catalítico de enzimas. 2015. 216 p. il. Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Engenharia Elétrica e Computação, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientador: Fernando José Von Zuben, Co-orientador: Goran Neshich.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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2.Imagem marcado/desmarcadoOLLERTON, J.; TALIGA, C.; SALIM, J. A.; POELEN, J. H.; DRUCKER, D. P. Incorporating measures of data quality into plant-pollinator databases. Journal of Pollination Ecology, v. 38, n. 10, p. 151-160, 2025.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoBORRO, L. C.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Improving binding affinity prediction by using a rule-based model with physical-chemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. In: CONGRESS OF THE INTERNATIONAL UNION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 23.; ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN SOCIETY FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 44., 2015, Foz do Iguaçu. Biochemistry for a better world: abstracts book. [Foz do Iguaçu]: SBBq, 2015. p. 153. C.047.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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4.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; NESHICH, G. A comparison between internal protein nanoenvironments of α-helices and beta-sheets. Plos One, v. 15, n. 12, p. 1-13, Dec. 2020. Artigo e0244315.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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5.Imagem marcado/desmarcadoDRUCKER, D. P.; SALIM, J. A; POELEN, J.; SOARES, F. M. Collectively working towards plant-pollinator interactions data interoperability and reuse: lessons learned from the WorldFAIR Project. Biodiversity Information Science and Standards, v. 8, e141109, 2024. Presented at SPNHC-TDWG 2024.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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6.Imagem marcado/desmarcadoDRUCKER, D. P.; SOARES, F. M.; POELEN, J.; SALIM, J. A. Machine-actionable metadata in practice: lessons from automating FAIR assessment in plant-pollinator datasets. Biodiversity Information Science and Standards, v. 9, e180280, 2025. Presented at Living Data 2025, Bogotá, Colômbia.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Multiple structure single parameter: analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins. Bioinformatics, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Multiple Structures Single Parameter (MSSP): analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins. Bioinformatics Advance, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, June 2016.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Territorial.
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9.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Study of specific nanoenvironments containing α-helices in all-α and ([α]+[β])+([α]/[β]) proteins. Plos One, v. 13, n. 7, p. 1-25, 2018. Artigo e0200018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Territorial.
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10.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A; MORAES, F. R. de; CORREA, J. L.; BORRO, L. C.; NESHICH, G. Comprehensive analysis of the distinct nano environments characteristics containing the different secondary structure elements: alpha-helices, beta-sheets, and turns. Current Nanomedicine, v. 15, n. 3, p. 267-285, 2025.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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11.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. P.; NESHICH, G. MSSP: a web-based application for analysis of selected parameter from multiple structures in a graphical manner. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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12.Imagem marcado/desmarcadoJARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; MAZONI, I.; MANCINI, A.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Generation of lipase B mutants with increased surface hydrophobicity in order to improve biodiesel catalysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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13.Imagem marcado/desmarcadoYANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; NESHICH, G.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G. RNDS: Rede Neural para Classificar Descritores do Sting. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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14.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; NISHIMURA, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Pathogenic Prion Proteins (PrP) have higher electrostatic potential pattern than normal cellular prion protein in a specific region. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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15.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; NISHIMURA, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Structure function relationship de convoluted to a level of physical chemical descriptors: case study - lysozyme / lactalbumine differences. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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16.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. de; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Size matters: surface hydrophobicity index (SHI) describes the impact of the size of interface area on oligomerization driven by hydrophobic effect. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY; STRUCTURAL BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOPHYSICS MEETING, 8., 2012, Long Beach, California. Abstracts... California: ISMB, 2012. Não paginado. 3Dsig 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Surface hydrophobicity index (SHI): insight into the mechanisms of protein-protein associations. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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18.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; PEREIRA, J. G. C.; SALIM, J. A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Improving predictions of protein-protein interfaces by combining amino acid-specific classifiers based on structural and physicochemical descriptors with their weighted neighbor averages. Plos One, San Francisco, v. 9, n. 1, p. 1-15, Jan. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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19.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; BORRO, L. C.; MANCINI, A.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; NESHICH, G. Comparison between physical chemical and geometrical characteristics of the amino acids present in alpha-helices and beta-sheets. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não pagiando. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; BORRO, L. C.; MANCINI, A.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. P.; NESHICH, G. Computational analysis of the secondary structure elements based on the physical chemical and geometrical descriptors and statistics data. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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