BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, R.; LOBO, F. P. Use of an enrichment analysis strategy to detect potential new drug targets in fungal genomes. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING 2011.

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2.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, E. M. dos; LOBO, F. P. Montagem do genoma de Spathaspora arborariae, uma levedura fermentadora de xilose, para a produção de biocombustíveis. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 171-174.

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3.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; LOBO, F. P. Busca computacional por grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em Alphaherpesvirinae. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 167-170.

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4.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION: um software paralelizado para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em escala genômica. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 163-166.

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5.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION. Versão 1.0.1. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.

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6.Imagem marcado/desmarcadoVELLOZO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. A new BLAST-based Gbrowse plugin. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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7.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. Desenvolvimento de software para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 28-31.

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8.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Development of a computational pipeline to detect positive selection. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P1007.

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9.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; RODRIGUES, M. R.; FRANCO, G. M. Expanding enrichment analysis to the evolutionary space: development and validation of Kegg Orthology enrichMent - Online DetectiOn (KOMODO) to detect biased distribution of enzymatic activities in monophyletic taxa. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P0992.

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10.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Positive selection in homologous genes of Alphaherpesviruses. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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11.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; VELLOZO, A. F. Blast.pm. Versão 0.01. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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12.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.

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13.Imagem marcado/desmarcadoAGUIRRE, A. de A. R.; LOBO, F. P.; ANDREOTTI, R. Design of the ATAQ peptide and its evaluation as an immunogen to develop a Rhipicephalus vaccine. Veterinary Parasitology, v. 221, p. 30-38, 2016

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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14.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. R. da; NODA, R. W.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CARNEIRO, N. P. Counting RNAseq reads: which way is better? In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado. Pôster N101.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo.

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15.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, London, v. 16, n. 1, 567, Aug. 2015.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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16.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, E. de M.; FRANCO, G. R.; STAMBUK, B. J. C. U.; ROSA, C. A.; LOBO, F. P. Draft genome sequencing of the Yeast Spathaspora arborariae sp. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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17.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; LOBO, F. P.; REGITANO, L. C. de A. Estudo de associação genômica ampla utilizando Random Forest: estudo de caso em bovinos de corte. In: ARBEX, A.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics - TACG: modelos e métodos computacionais em Bioinformática. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 71-99.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.

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18.Imagem marcado/desmarcadoAGUIAR, E.; LOBO, F. P.; OLMO, R.; FERREIRA, F.; OLIVEIRA, G.; HULTMAN, K.; JAFARI, N.; CARTHEW, R.; MARQUES, J. Understanding innate immune responses to DNA viruses using the Drosophila melanogaster model. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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19.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, F. C. de P.; VAZ, G. J.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F. Utilização da ferramenta Liferay na construção do portal do Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa - LMB. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 80-82.

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20.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; LOBO, F. P.; CHUD, T.; SILVA, T. B. R.; MACHADO, M. A. A Catalog of variants in Zebu dairy cattle using next generation sequencing. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 24., 2016, San Diego. [Proceedings...] San Diego: [s.n.], 2016.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

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1.Imagem marcado/desmarcadoTZANETAKIS, I. E.; AKNADIBOSSIAN, V.; ŠPAK, J.; CONSTABLE, F.; HARPER, S. J.; HAMMOND, J.; CANDRESSE, T.; FOLIMONOVA, S. Y.; ASTUA, J. de F.; FUCHS, M.; JELKMANN, W.; MALIOGKA, V. I.; MARAIS, A.; MARTIN, R. R.; MOLLOV, D.; VIDALAKIS, G.; ABOUGHANEM-SABANADZOVIC, N.; RWAHNIH, M. A.; ALABI, O. J.; ALIOTO, D.; ATANDA, H. Y.; BAGI, F.; BARANWAL, V. K.; BARBOSA, C. de J.; BAR-JOSEPH, M.; RIVEREND, L. B. L.; BELIEN, T.; BENÍTEZ-GALEANO, M. J.; BENNYPAUL, H.; BERTACCINI, A.; BESTER, R.; BLOUIN, A. G.; BLYSTAD, D.; BOTERMANS, M.; BOZAN, O.; BRAKTA, A.; BRANS, Y.; BULAJIĆ, A.; CAGLAYAN, K.; CATARA, A.; CHOUEIRI, E.; CIEŚLIŃSKA, M.; COOK, G.; CUI, W.; GRAÇA, J. da; DAVINO, S.; DELMIGLIO, C.; DEWDNEY, M. M.; SERIO, F. D.; DIAZ-LARA, A.; DIGIARO, M.; DJELOUAH, K.; DONG, Y. F.; DONOVAN, N.; DRUCIAREK, T. Z.; DURAN-VILA, N.; ELÇI, E.; ESQUIVEL-FARIÑA, A.; FALL, M. L.; FAN, X. D.; FIGUEROA, J.; FIORE, N.; FOWKES, A. R.; FOX, A.; FRÁNOVÁ, J.; FUCHS, R.; GAAFAR, Y. Z. A.; GARCÍA, M. L.; GHOSH, D.; GIRARDI, E. A.; GLASA, M.; TALQUENCA, S. G.; GRATZ, A.; GRITSENKO, D.; HAJERI, S.; HAJIZADEH, M.; HAMBORG, Z.; HO, T.; HOLEVA, M.; HOLKAR, S. K.; HORNER, M.; HURTADO-GONZALES, O. P.; IPPOLITO, A.; ISAC, V.; IWANAMI, T.; JOFRE-Y-GARFIAS, A. E.; JORDAN, R.; KATIS, N.; KOLONIUK, I.; KONINGS, H.; KRIŽANAC, I.; KRUEGER, R.; KYRYCHENKO, A.; BARBOSA, F. F. L.; LAVAGI-CRADDOCK, I.; LEVY, A.; LICCIARDELLO, G.; LU, Q.; MACFARLANE, S. A.; MARCONE, C.; MAREE, H. J.; MARGARIA, P.; MARTIĆ, A.; MASSART, S.; MATHIOUDAKIS, M. M.; MATIĆ, S.; PLESKO, I. M.; MEEKES, E. T. M.; MEHLE, N.; MELZER, M. J.; MENG, B.; MENZEL, W.; MILJANIĆ, V.; MINAFRA, A.; MINUTOLO, M.; MITRA, A.; MORENO, P.; NAVARRO, L.; NAVARRO, B.; NERVA, L.; OKIĆ, A.; OLMOS, A.; ÖNELGE, N.; OSUNDAHUNSI, B.; PALACIOS, M. F.; PALLAS, V.; PANNO, S.; PEREZ-EGUSQUIZA, Z.; POUDEL-WARD, B.; RADIŠEK, S.; RAMOS-GONZÁLEZ, P. L.; RAMTEKE, P.; RANABHAT, N. B.; RIVAREZ, M. P. S.; RIVAS, F.; ROENHORST, A.; ROY, A.; RUIZ-GARCÍA, A. B.; SABANADZOVIC, S.; ŠAFÁŘOVÁ, D.; SALDARELLI, P.; SALEM, N.; SOLSONA, G. S.; SCHOEN, R.; SHARMA, S. K.; SHILTS, T.; SIERRA-MEJIA, A.; SINGH, S.; SKELTON, A.; ŠKORIĆ, D.; STAINTON, D.; ŠTAJNER, N.; STAROVIĆ, M.; STUCHI, J. F.; SVOBODA, P.; TAHZIMA, R.; TANG, J.; TESSITORI, M.; THERMOZ, J.; THOMPSON, E.; THOMPSON, J.; TREBICKI, P.; TURINA, M.; SERCE, C. U.; UMBLE, J.; VALIUNAS, D.; VARALLYAY, E.; VARMA, A.; VARVERI, C.; VÁSQUEZ-GUTIÉRREZ, U.; VAZQUEZ-IGLESIAS, I.; VEERAKONE, S.; VILLAMOR, D. E.; VIVES, M. C.; VONČINA, D.; WANG, J.; WESTENBERG, M.; WETZEL, T.; WINTER, S.; WRIGHT, G.; WULFF, N. A.; XU, W. X.; YOKOMI, R.; ZHOU, C.; ZIKELI, K.; ZINDOVIĆ, J. Streamlining global germplasm exchange: integrating scientific rigor and common sense to exclude phantom agents from regulation. Plant Disease, v.109, n.4, p.736-755, 2025 0191-2917, Scientific Societies, 2025.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura.
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