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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
13/12/2007 |
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Data da última atualização: |
09/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. J. de; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. de F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. de P.; MORAES, M. C. de; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P.; VIEIRA, M. L. C. |
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Afiliação: |
Eder Jorge de Oliveira, CNPMF; Antonio Augusto Franco Garcia, ESALQ; Carla de Freitas Munhoz, ESALQ; Gabriel Rodriguez Alves Margarido, ESALQ; Luciano Consoli, CNPT; Frederico de Pina Matta, UFES; Michel Choairy de Moraes, Canavialis; Maria Imaculada Zucchi, IAC; Maria Helena Peleginelli Fungaro, UEL; Maria Lucia Carneiro Vieira, ESALQ. |
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Título: |
Integração de mapas genético-moleculares de maracujá-amarelo. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. São Lourenço:[s.n.], 2007. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A dificuldade de obtenção de linhas puras para a formação de populações tradicionais de mapeamento, dificulta a construção de mapas de ligação em espécies auto-imcompatíveis, como o maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa). Nesses casos, emprega-se uma população F1 e apenas marcas segregantes para um ou outro genitor (tipo 1:1), permitindo a construção de mapas individuais. Esta estratégia é denominada 2-way pseudo-testcross (Grattapaglia & Sederoff, 1994). Contudo, é possível promover a integração desses mapas com marcas biparentais, com segregações do tipo: 3:1 e 1:2:1 e 1:1:1:1. O objetivo desse estudo foi a construção de um mapa integrado de maracujá-amarelo combinando diferentes tipos de segregações usando-se marcadores AFLP (Amplified Fragement Lenght Polymophism) e microssatélites (SSR-Simple Sequence Repeats), por meio de um algoritmo que estima, simultaneamente, a fração de recombinação e a fase de ligação, desconhecida à priori, por se tratar de uma população F1 não-endogâmica. |
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Palavras-Chave: |
Marcadores molecular. |
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Thesagro: |
Fruticultura. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
LEADER 01821nam a2200241 a 4500
001 1654135
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520 $aA dificuldade de obtenção de linhas puras para a formação de populações tradicionais de mapeamento, dificulta a construção de mapas de ligação em espécies auto-imcompatíveis, como o maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa). Nesses casos, emprega-se uma população F1 e apenas marcas segregantes para um ou outro genitor (tipo 1:1), permitindo a construção de mapas individuais. Esta estratégia é denominada 2-way pseudo-testcross (Grattapaglia & Sederoff, 1994). Contudo, é possível promover a integração desses mapas com marcas biparentais, com segregações do tipo: 3:1 e 1:2:1 e 1:1:1:1. O objetivo desse estudo foi a construção de um mapa integrado de maracujá-amarelo combinando diferentes tipos de segregações usando-se marcadores AFLP (Amplified Fragement Lenght Polymophism) e microssatélites (SSR-Simple Sequence Repeats), por meio de um algoritmo que estima, simultaneamente, a fração de recombinação e a fase de ligação, desconhecida à priori, por se tratar de uma população F1 não-endogâmica.
650 $aFruticultura
653 $aMarcadores molecular
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700 1 $aFUNGARO, M. H. P.
700 1 $aVIEIRA, M. L. C.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 24 | |
| 2. |  | FONSECA, P. A. S; ROSSE, I. C.; DEMIRANDA, M.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. S. A new tetra-primer ARMS-PCR for genotyping bovine kappa-casein polymorphisms. Genetics and Molecular Research, v. 12, n. 4, p. 6521-6526, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 3. | | SENA, A. C.; ROSSE, I.; STEINBERG, R.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; FONSECA, C.; CARVALHO, M. R. RNA secondary structure and alternative splicing in the 3-UTR of DGATI gene in the indicine guzerat breed. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | ROSSE, I. C.; STEINBERG, R. S.; SANDES, S. H. C.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; CARVALHO, M. R. S. Investigação e variabilidade genética de polimorfismos no gene da oxitocina bovina em animais da raça Guzerá. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | FONSECA, P. A. S.; ROSSE, I. C.; LAMOUNIER, P. F.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Desenvolvimento de marcadores moleculares no gene regulador do metabolismo de lipídeos na glândula mamária bovina - PPAR gamma. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 6. | | FONSECA, P. A. S.; LAMOUNIER, P. F.; ROSSE, I. C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Polymorphisms in the regulatory regions of genes regulating lipid metabolism in the mammary gland in Guzerat breed (Bos indicus). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: Sociedade Brasileira de Genética, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | CARVALHO, M. R. S.; STEINBERG, R. S.; ROSSE, I. C.; MIRANDA, M. DE; PEIXOTO, M. G. C. D.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S. An INDEL polymorphism in DGAT1 3'UTR correlates with milk production parameters in Brazilian guzerat dairy breed. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ANIMAL GENETICS, 32., 2010, Edinburgh. Proceedings... Edinburgh: International Society for Animal Genetics, 2010. p. 113.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | SOUZA, G. E.; STEINBERG, R. S.; ROSSE, I. C.; FIGUEIREDO, P. O.; PEIXOTO, M. G. C. D.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Variabilidade genética do gene da Prolactina (PRL) na raça Guzerá (Bos indicus). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | ROSSE, I. da C.; STEINBERG, R. da S.; COIMBRA, R. S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; FONSECA, C. G.; CARVALHO, M. R. S. Novel SNPs and INDEL polymorphisms in the 30UTR of DGAT1 gene: in silico analyses and a possible association. Molecular Biological Reproduction, v. 41, n. 7, p. 4555-4563, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 10. | | OLIVEIRA, G.; ROSSE, I.; ASSIS, J.; OLIVEIRA, F.; LEITE, L.; ARAÚJO, F.; SALIM, A.; ZERLOTINI, A.; LOPES, B.; ARBEX, W.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G.; VERNEQUE, R.; MARTINS, M.; COIMBRA, R.; SILVA, M. V.; CARVALHO, M. R. SNPs and INDELs in genes involved in lipid metabolism of mammary gland of Zebu breeds identified by whole genome sequencing. In: ANNUAL INTERNACIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 23.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 14., 2015, Dublin. Posters... [S.l.]: International Society for Computacional Biology, [2015]. Não paginado. ISMB/ECCB 2015. Pôster G28.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 11. | | MATOSINHO, C. G. R.; FONSECA, P. A. de S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; ROSSE, I. C.; LOPES, F. C. F.; ZÓZIMO, T.; VERCESI FILHO, A. E.; BRUNELI, F. A. T.; CARVALHO, M. R. S.; GAMA, M. A. S. da. Phenotypic variation in milk fatty acid composition and its association with stearoyl-CoA desaturase 1 (SCD1) gene polymorphisms in Gir cows. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 140, n. 5, p. 532-548, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 13. | | SANTOS, F. C. dos; PEIXOTO, M. G. C. D.; FONSECA, P. A. de S.; PIRES, M. de F. A.; VENTURA, R. V.; ROSSE, I. da C.; BRUNELI, F. A. T.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Identification of candidate genes for reactivity in Guzerat (Bos indicus) cattle: a genome-wide association study. PLoS ONE, v. 12, n. 1, 2017. 15 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 18. | | FONSECA, P. A. de S.; SANTOS, F. C. dos; ROSSE, I. C.; VENTURA, R. V.; BRUNELI, F. A. T.; PENNA, V. M.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; CARVALHO, M. R. S.; PEIXOTO, M. G. C. D. Retelling the recent evolution of genetic diversity for Guzerá: Inferences from LD decay, runs of homozygosity and Ne over the generations. Livestock Science, v. 193, p. 110-117, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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