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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
11/05/2020 |
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Data da última atualização: |
15/07/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARMO, C. D. do; SOUSA, M. B. e; PEREIRA, J. dos S.; CEBALLOS, H.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
CÁTIA DIAS DO CARMO; MASSAINE BANDEIRA E SOUSA; JOCILENE DOS SANTOS PEREIRA; HERNÁN CEBALLOS; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Identification of waxy cassava genotypes using fourier-transform near-infrared spectroscopy. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, 1-13, 2020. |
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ISSN: |
0011-183X |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
High?throughput phenotyping tools that allow the early and accurate evaluation of important agronomic traits have gained space in current breeding programs. The aim of this study was to evaluate the potential of Fourier?transform near?infrared spectroscopy (FT?NIRS) to identify cassava (Manihot esculenta Crantz) clones with waxy starch (i.e., amylose?free) by screening leaves rather than roots, and to validate prediction models for classifying these phenotypes. We analyzed the spectra of 162 waxy and 180 nonwaxy genotypes from five different growing environments. The mean FT?NIRS spectra and principal component analysis (PCA) were used to investigate the potential for grouping the data. For classification, five supervised pattern recognition techniques were tested: Bayesian generalized linear model (BGLM), high?dimensional discriminant analysis (HDDA), partial least squares?discriminant analysis (PLS?DA), parallel random forest (PRANDF), and support vector machines with linear kernel (SVM). The mean spectra and the PCA did not allow discrimination of the genotypes based on starch classification. The SVM and BGLM showed the highest classification accuracy in cross?validation (.86?.87), with higher concordance rates (.88?.83), sensitivity (.87?.85) and specificity (.88). The BGLM and SVM models also obtained better indices in the external validation, with high accuracy (.85) and correct classification of 93% of the waxy genotypes. Thus, performing early selection of root characteristics based on the indirect selection of variables extracted from leaf spectra is a good potential strategy for more efficient breeding of the waxy phenotype. MenosHigh?throughput phenotyping tools that allow the early and accurate evaluation of important agronomic traits have gained space in current breeding programs. The aim of this study was to evaluate the potential of Fourier?transform near?infrared spectroscopy (FT?NIRS) to identify cassava (Manihot esculenta Crantz) clones with waxy starch (i.e., amylose?free) by screening leaves rather than roots, and to validate prediction models for classifying these phenotypes. We analyzed the spectra of 162 waxy and 180 nonwaxy genotypes from five different growing environments. The mean FT?NIRS spectra and principal component analysis (PCA) were used to investigate the potential for grouping the data. For classification, five supervised pattern recognition techniques were tested: Bayesian generalized linear model (BGLM), high?dimensional discriminant analysis (HDDA), partial least squares?discriminant analysis (PLS?DA), parallel random forest (PRANDF), and support vector machines with linear kernel (SVM). The mean spectra and the PCA did not allow discrimination of the genotypes based on starch classification. The SVM and BGLM showed the highest classification accuracy in cross?validation (.86?.87), with higher concordance rates (.88?.83), sensitivity (.87?.85) and specificity (.88). The BGLM and SVM models also obtained better indices in the external validation, with high accuracy (.85) and correct classification of 93% of the waxy genotypes. Thus, performing early selection of root chara... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 26 | |
| 4. |  | SANTANA, M. de B.; RIBEIRO FILHO, M. R.; MARQUES, F. A.; CUNHA, T. J. F.; NASCIMENTO, A. F. do. Variação da composição granulométrica em solos na Ilha de Assunção, Cabrobó - Pernambuco In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 5. | | SANTANA, M. de B.; RIBEIRO FILHO, M. R.; MARQUES, F. A.; CUNHA, T. J. F.; NASCIMENTO, A. F. do. Variação da composição granulométrica em solos na Ilha de Assunção, Cabrobó - Pernambuco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 6. | | CUNHA, T. J. F.; FLORES, C. A.; RIBEIRO FILHO, M. R.; SA, I. B.; BRITO, M.; TAURA, T. A. Zoneamento edáfico da cultura da videira no município de Juazeiro-BA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 36., 2017, Belém, PA. Amazônia e seus solos: peculiaridades e potencialidades. Belém, PA: SBCS, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | CUNHA, T. J. F.; RIBEIRO FILHO, M. R.; SA, I. B.; BRITO, M.; PEREIRA, G. E.; TAURA, T. A. Zoneamento edáfico da cultura da videira no município de Lagoa Grande - PE. In: REUNIÃO NORDESTINA DE CIÊNCIA DO SOLO, 4.; SIMPÓSIO PIAUIENSE DE CIÊNCIA DO SOLO, 1., 2017, Teresina. Uso sustentável do solo e segurança alimentar no nordeste brasileiro - Anais. Teresina: Embrapa Meio-Norte: UFPI: UESPI: IFPI, 2018. Np.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 8. | | CUNHA, T. J. F.; FLORES, C. A.; RIBEIRO FILHO, M. R.; SA, I. B.; BRITO, M.; TAURA, T. A. Zoneamento edáfico da cultura da videira no município de Petrolina-PE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 36., 2017, Belém, PA. Amazônia e seus solos: peculiaridades e potencialidades. Belém, PA: SBCS, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 10. | | CUNHA, T. J. F.; RIBEIRO FILHO, M. R.; SA, I. B.; BRITO, M.; GIONGO, V.; TAURA, T. A. Zoning edaphic for grapevines in the municipality of Santa Maria of Boa Vista-PE. In: WORLD CONGRESS OF SOIL SCIENCE, 21., 2018, Rio de Janeiro. Soil science: beyond food and fuel: proceedings. Rio de Janeiro: SBCS, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 11. | | MENDONÇA, C. E. S.; RIBEIRO FILHO, M. R.; GONÇALVES, I. V. C.; SILVA, M. S. L. da; ARAÚJO, J. K. S.; FERREIRA, G. B.; CHAVES, V. C. Avaliação das alterações químicas após 12 anos sob irrigação por gravidade e localizada: II. Em um Argissolo Vermelho-Amarelo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 12. | | MENDONÇA, C. E. S.; RIBEIRO FILHO, M. R.; CAVALCANTI, E. U.; CHAVES, V. C.; FERREIRA, G. B.; SILVA, M. S. L. da; GONÇALVES, I. V. C. Avaliação das alterações químicas após 15 anos sob irrigação por aspersão e localizada: I. Em um Latossolo Vermelho-Amarelo distrófico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 13. | | SOUZA, W. L. da S.; VIEIRA, H. S. E.; SILVA, Y. J. A. B. de; RIBEIRO FILHO, M. R.; CANTALICE, J. R. B.; SILVA, A. B. da. Avaliação de atributos químicos da camada superficial de solos cultivados com uva sob diferentes sistemas de manejo. JORNADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO DA UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO, 7., 2007, Recife.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 14. | | SILVA, G. A. da; CAMÊLO, D. de L.; CORRÊA, M. M.; SOUZA JÚNIOR, V. S. de; RIBEIRO FILHO, M. R.; ARAUJO FILHO, J. C. de. Pedogenesis on coastal tablelands area with low range altimetry in Paraíba state. Revista Caatinga, v. 32, n. 2, p. 458-471, abr./jun. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 15. | | GONÇALVES, I. V. C.; MENDONÇA, C. E. S.; SILVA, M. S. L. da; RIBEIRO FILHO, M. R.; ARAÚJO. J. K. S.; FERREIRA, G. B.; CHAVES, V. C. Estudo do lençol freático após 10 anos sob irrigação localizada: III. Em um Neossolo Quartzarênico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 16. | | ARAÚJO, J. K. S.; MENDONÇA, C. E. S.; RIBEIRO FILHO, M. R.; SILVA, M. S. L. da; GONGALVES, I. V. C.; FERREIRA, G. B.; CHAVES, V. C. Estudo do lençol freático após 12 anos sob irrigação por gravidade e localizada: I. Em um Argissolo Vermelho-Amarelo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 17. | | MENDONÇA, C. E. S.; CAVALCANTI, E. U.; RIBEIRO FILHO, M. R.; FERREIRA, G. B.; CHAVES, V. C.; GONÇALVES, I. V. C.; SILVA, M. S. L. da. Estudo do lençol freático após 15 anos sob irrigação por aspersão e localizada: II. Em Latossolo Vermelho-Amarelo distrófico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 18. | | MASUTTI, M. M.; RIBEIRO FILHO, M. R.; PEREIRA, G. E.; CUNHA, T. J. F.; SANTANA, M. de B.; BARROS, G. M. Influence of soil attributes on 'Petit Verdot' productivity in the São Francisco Valley, Brazil. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON TROPICAL WINES, 5., 2016, Petrolina. Book of abstracts... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 35.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 19. | | CUNHA, T. J. F.; FLORES, C. A.; SA, I. B.; RIBEIRO FILHO, M. R.; MAZUTII, M.; TAURA, T. A.; SANTANA, M. de B.; PEREIRA, G. E. Soil zoning for wine certification of ride region of the sub-medium São Francisco river, Brazil. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON TROPICAL WINES, 5., 2016, Petrolina. Book of abstracts... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 16.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 20. | | SANTANA, M. de B.; RIBEIRO FILHO, M. R.; SOUZA JÚNIOR, V. S.; SCHULZE, S. M. B. B.; CUNHA, T. J. F.; MARCQUES, F. A. Mineralogia e morfologia da fração areia grossa e fina de solos aluviais no Semiárido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 36., 2017, Belém, PA. Amazônia e seus solos: peculiaridades e potencialidades. Belém, PA: SBCS, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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