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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
30/10/2020 |
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Data da última atualização: |
30/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HAACH, V.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; SCHAEFER, R. |
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Afiliação: |
VANESSA HAACH, UFRGS; DANIELLE GAVA, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; REJANE SCHAEFER, CNPSA. |
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Título: |
Evaluation of two multiplex RT-PCR assays for detection and subtype differentiation of Brazilian swine influenza viruses. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 3, p. 1447-1451, Sep 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s42770-020-00250-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Influenza A virus (IAV) subtypes H1N1, H1N2, and H3N2 are endemic in swine herds in most pork producing countries; however, the viruses circulating in different geographic regions are antigenically and genetically distinct. In this sense, the availability of a rapid diagnostic assay to detect locally adapted IAVs and discriminate the virus subtype in clinical samples from swine is extremely important for monitoring and control of the disease. This study describes the development and validation of a multiplex RT-PCR assay for detection and subtyping of IAV from pigs. The analytical and diagnostic specificity of the assays was 100% (94.3-100.0, CI 95%), and the limit of detection was 10-3 TCID50/mL. A total of 100 samples (IAV isolates and clinical specimens) were tested, and the virus subtype was determined for 80 samples (80%; 71.1-86.7, CI 95%). From these, 50% were H1N1, 22.5% were H1N2, and 7.5% were H3N2. Partial subtyping was determined for 8.75% samples (H1pdmNx and HxN2). Additionally, mixed infections with two virus subtypes (H1N2 + H3N2 and H1N1pdm + H1pdmN2; 2.5%) and reassortant viruses (H1pdmN2, 6.25%; and H1N1hu, 2.5%) were detected by the assay. A rapid detection of the most prevalent IAV subtypes and lineages in swine is provided by the assays developed here, improving the IAV diagnosis in Brazilian laboratories, and contributing to the IAV monitoring. |
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Palavras-Chave: |
Multiplex RT-PCR; RT-PCR multiplex; Subtipagem; Vírus Influenza. |
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Thesagro: |
Diagnostico; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Disease diagnosis; Influenza A virus; Polymerase chain reaction; Swine. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Status |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 1. |  | RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; PIO-RIBEIRO, G.; NICKEL, O. Caracterização molecular parcial do gene da proteína capsidial do Grapevine fanleaf virus. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 32, p. S 129 ago. 2007. Suplemento. Edição dos resumos do XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Maringá, 13 a 17 de agosto de 2007. Resumo 97.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 2. | | RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G. Coat protein gene expression of Grapevine virus B in Escherichia coli and polyclonal antibody production. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S286, 2008. Suplemento. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 3. | | FAJARDO, T. V. M.; RADAELLI, P.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G. Expression of Grapevine leafroll-associated virus 2 coat protein gene in Escherichia coli and polyclonal antibody production. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S286, 2008. Suplemento. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 4. | | RADAELLI, P.; FAJARDO, T, V, M.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G. Production of polyclonal antisera using recombinant coat proteins of grape leafroll-associated virus 2 and Grapevine virus B. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 43, n. 10, p. 1405-1411, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 5. | | RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; NICKEL, O.; EIRAS, M.; PIO-RIBEIRO, G. Production of polyclonal antisera using recombinant coat proteins of Grapevine leafroll-associated virus 2 and Grapevine virus B. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 10, p. 1405-1411, out. 2008. Título em português: Produção de anti-soros policlonais a partir de proteínas capsidiais recombinantes de Grapevine leafroll-associated virus 2 e Grapevine virus B.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; PIO-RIBEIRO, G.; NICKEL, O. Detecção e caracterização molecular do gene da proteína capsidial do Rupestris stem pitting-associated virus. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 32, p. S 130 ago. 2007. 32 Suplemento. Edição dos resumos do XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Maringá, 13 a 17 de agosto de 2007. Resumo 98.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 8. | | RADAELLI, P.; NICKEL, O.; ARAGÃO, F. J. L.; FAJARDO, T. V. M.; SCHONS, J. Diagnóstico biológico e molecular e análise da sequência de nucleotídios do gene de capa protéica de um isolado de apple stem pitting virus. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S239, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; NICKEL, O.; PIO-RIBEIRO, G. Variabilidade do gene da proteína capsidial de três espécies virais que infectam videiras no Brasil. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, n. 5, p. 297-305, out. 2009. 297-305| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 11. | | BALBINOTTE, J.; NICKEL, O.; SILVA, F. N. da; RADAELLI, P.; VANNI, M. F.; FAJARDO, T. V. M. Avaliação de incidência de Peach latent mosaic virus em pessegueiros e nectarineiras das principais regiões produtoras do Rio Grande do Sul. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA UVA E VINHO, 5., ENCONTRO DE PÓS-GRADUANDOS DA EMBRAPA UVA E VINHO, 1., 2007, Bento Gonçalves. Resumos. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2007. p. 31. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 63). Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 12. | | VARELA, A. P. M.; RADAELLI, P.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; NICKEL, O. Detecção e caracterização molecular do gene da proteína capsidial do Grapevine fanleaf virus, isolado RS. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA UVA E VINHO, 5., ENCONTRO DE PÓS-GRADUANDOS DA EMBRAPA UVA E VINHO, 1., 2007, Bento Gonçalves. Resumos. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2007. p. 26. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 63). Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 13. | | RADAELLI, P.; VARELA, A. P. M.; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; KUHN, G. B.; NICKEL, O. Detecção e caracterização molecular do gene da proteína capsidial do Grapevine leafroll-associated virus 2. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA UVA E VINHO, 5., ENCONTRO DE PÓS-GRADUANDOS DA EMBRAPA UVA E VINHO, 1., 2007, Bento Gonçalves. Resumos. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2007. p. 50. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 63). Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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