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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
25/03/2008 |
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Data da última atualização: |
09/04/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
AZEVEDO, V. C. R. |
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Título: |
Desenvolvimento e aplicações de microssatélites, análise de cpDNA e modelagem computacional para estudos da estrutura e dinâmica genética de maçaranduba - Manilkara huberi (Ducke) Chev. Sapotaceae. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
2007. |
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Páginas: |
201 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Biologia Molecular) - Departamento de Biologia Celular, Universidade de Brasília, Brasília, DF. Orientador: Dário Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Conteúdo: |
Marcadores microssatélites têm sido utilizados com grande freqüência como uma ferramenta efetiva para estudos de estrutura genética de populações, fluxo gênico, parentesco e para quantificar os efeitos da fragmentação de habitats e guiar estratégias de conservação. Como parte do Projeto de Dendrogene nosso interesse está centrado na conservação e na definição de estratégias de manejo de árvores madeireiras da floresta amazônica. Este trabalho tem como objetivo estudar a diversidade e a estrutura genética de uma população natural de Manilkara huberi, conhecida como maçaranduba, usando marcadores microssatélites. Aliado a isso, avaliar a variabilidade do cpDNA e por estudo de modelagem avaliar o potencial efeito da exploração na estrutura genética populacional. Esta espécie é intensamente explorada pela indústria madeireira devido à alta densidade de sua madeira. Treze locos microssatélite altamente polimórficos foram desenvolvidos a partir de uma biblioteca genômica enriquecida para repetições de AGrrC. Os níveis de polimorfismo foram avaliados utilizando-se um total de 12 árvores adultas provenientes de uma população natural. Para os estudos de estrutura genética de populações, foram amostradas 481 árvores adultas, 88 regenerantes e 810 descendentes de uma população natural na FLONA Tapajós, P A, Brasil. Todos os indivíduos foram genotipados com sete locos microssatélites altamente polimórficos utilizando detecção florescente. Para adultos, regenerantes e descendentes respectivamente as seguintes estimativas foram obtidas: He = 0,867, 0,840 e 0,811. Os índices de fixação para as três gerações foram significativamente diferentes de zero (1= 0,221, 0,303 e 0,237), porém não estatisticamente diferentes entre si (IC 95%). A divergência genética (() p) entre as três gerações foi baixa para a média dos locos (0,018), mas consistente (IC 95%). A análise de distribuição espacial de genótipos detectou a existência de estruturação genética espacial significativa a uma distância de aproximadamente 450 metros de raio. As análises com marcadores de cpDNA confirmam a presença de estruturação. A taxa de cruzamento multiloco (1m) estimada foi de 0,995, indicando que a espécie é preferencialmente alógama e com fluxo de pólen restrito (49,5 m). Os resultados sugerem padrão de isolamento por distância e que programas de manejo e conservação in situ devem incluir grandes áreas e evitar a fragmentação. As análises genéticas revelaram ainda que para conservação ex situ, sementes devem ser coletadas de pelo menos 188 árvores maternas para que seja preservado um tamanho efetivo de 500. Como a espécie é espacialmente estruturada e de ampla distribuição, a distância mínima entre as árvores deve ser de 500 m. Os resultados obtidos indicam que a estrutura genética desta espécie está associada aos padrões de reprodução e demografia da população. Em análises de modelagem, a M huberi necessitaria de 130 anos para recuperar a sua área basal original, considerando-se as recomendações atuais permitidas por lei, deixando evidente a insustentabilidade dos atuais ciclos de 30 anos recomendados para programas de manejo. Toma-se claro o entendimento crescente da biologia das espécies para uma redefinição de políticas públicas mais eficientes em relação à sustentabilidade da exploração madeireira e ao uso e conservação dos recursos florestais a longo prazo. Estas informações sobre a estrutura genética de M huberi devem ser utilizadas para o planejamento adequado de práticas de manejo sustentável de populações da espécie na Floresta Amazônica Brasileira. MenosMarcadores microssatélites têm sido utilizados com grande freqüência como uma ferramenta efetiva para estudos de estrutura genética de populações, fluxo gênico, parentesco e para quantificar os efeitos da fragmentação de habitats e guiar estratégias de conservação. Como parte do Projeto de Dendrogene nosso interesse está centrado na conservação e na definição de estratégias de manejo de árvores madeireiras da floresta amazônica. Este trabalho tem como objetivo estudar a diversidade e a estrutura genética de uma população natural de Manilkara huberi, conhecida como maçaranduba, usando marcadores microssatélites. Aliado a isso, avaliar a variabilidade do cpDNA e por estudo de modelagem avaliar o potencial efeito da exploração na estrutura genética populacional. Esta espécie é intensamente explorada pela indústria madeireira devido à alta densidade de sua madeira. Treze locos microssatélite altamente polimórficos foram desenvolvidos a partir de uma biblioteca genômica enriquecida para repetições de AGrrC. Os níveis de polimorfismo foram avaliados utilizando-se um total de 12 árvores adultas provenientes de uma população natural. Para os estudos de estrutura genética de populações, foram amostradas 481 árvores adultas, 88 regenerantes e 810 descendentes de uma população natural na FLONA Tapajós, P A, Brasil. Todos os indivíduos foram genotipados com sete locos microssatélites altamente polimórficos utilizando detecção florescente. Para adultos, regenerantes e descendentes respec... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Estrutrua genética espacial; Fluxo gênico; Sistema de cruzamento. |
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Thesagro: |
Sapotaceae. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aMarcadores microssatélites têm sido utilizados com grande freqüência como uma ferramenta efetiva para estudos de estrutura genética de populações, fluxo gênico, parentesco e para quantificar os efeitos da fragmentação de habitats e guiar estratégias de conservação. Como parte do Projeto de Dendrogene nosso interesse está centrado na conservação e na definição de estratégias de manejo de árvores madeireiras da floresta amazônica. Este trabalho tem como objetivo estudar a diversidade e a estrutura genética de uma população natural de Manilkara huberi, conhecida como maçaranduba, usando marcadores microssatélites. Aliado a isso, avaliar a variabilidade do cpDNA e por estudo de modelagem avaliar o potencial efeito da exploração na estrutura genética populacional. Esta espécie é intensamente explorada pela indústria madeireira devido à alta densidade de sua madeira. Treze locos microssatélite altamente polimórficos foram desenvolvidos a partir de uma biblioteca genômica enriquecida para repetições de AGrrC. Os níveis de polimorfismo foram avaliados utilizando-se um total de 12 árvores adultas provenientes de uma população natural. Para os estudos de estrutura genética de populações, foram amostradas 481 árvores adultas, 88 regenerantes e 810 descendentes de uma população natural na FLONA Tapajós, P A, Brasil. Todos os indivíduos foram genotipados com sete locos microssatélites altamente polimórficos utilizando detecção florescente. Para adultos, regenerantes e descendentes respectivamente as seguintes estimativas foram obtidas: He = 0,867, 0,840 e 0,811. Os índices de fixação para as três gerações foram significativamente diferentes de zero (1= 0,221, 0,303 e 0,237), porém não estatisticamente diferentes entre si (IC 95%). A divergência genética (() p) entre as três gerações foi baixa para a média dos locos (0,018), mas consistente (IC 95%). A análise de distribuição espacial de genótipos detectou a existência de estruturação genética espacial significativa a uma distância de aproximadamente 450 metros de raio. As análises com marcadores de cpDNA confirmam a presença de estruturação. A taxa de cruzamento multiloco (1m) estimada foi de 0,995, indicando que a espécie é preferencialmente alógama e com fluxo de pólen restrito (49,5 m). Os resultados sugerem padrão de isolamento por distância e que programas de manejo e conservação in situ devem incluir grandes áreas e evitar a fragmentação. As análises genéticas revelaram ainda que para conservação ex situ, sementes devem ser coletadas de pelo menos 188 árvores maternas para que seja preservado um tamanho efetivo de 500. Como a espécie é espacialmente estruturada e de ampla distribuição, a distância mínima entre as árvores deve ser de 500 m. Os resultados obtidos indicam que a estrutura genética desta espécie está associada aos padrões de reprodução e demografia da população. Em análises de modelagem, a M huberi necessitaria de 130 anos para recuperar a sua área basal original, considerando-se as recomendações atuais permitidas por lei, deixando evidente a insustentabilidade dos atuais ciclos de 30 anos recomendados para programas de manejo. Toma-se claro o entendimento crescente da biologia das espécies para uma redefinição de políticas públicas mais eficientes em relação à sustentabilidade da exploração madeireira e ao uso e conservação dos recursos florestais a longo prazo. Estas informações sobre a estrutura genética de M huberi devem ser utilizadas para o planejamento adequado de práticas de manejo sustentável de populações da espécie na Floresta Amazônica Brasileira.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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| 2. | | HUG, L. A.; HATZENPICHLER, R.; MORARU, C.; SOARES, A, R.; MEYER, F.; HEYDER, A.; ABDALLAH, R. A.; ABDALRAHEM, A.; ABDULKADIR, N.; ADESIYAN, I. M.; ALTEIO, L.; ANANTHARAMAN, K.; ANDERSON, R.; ANDREI, A-S.; BAEZA, J. A.; BAK, F.; BAKER, B.; BARTHOLOMÄUS, A.; BEJERMAN, N.; BIDDLE, J.; BISSETT, A.; BLAKELEY-RUIZ, J. A.; BLOCK, K.; BOLDT, J.; BONILLA-ROSSO, G.; BORNEMANN, T. L.; BRAUER, V. S.; BRAZELTON, W.; BREMGES, A.; BUELOW, E.; BURCHAM, Z. M.; CANSDALE, A.; CAPORASO, J. G.; CERNAVA, T.; CHATZIGIANNIDOU, I.; COSTA, R.; CURRIE, C. R.; DAEBELER, A.; DE ANDA, V.; DE SANTIAGO, A.; TACCA, L. M. A. de; DEBELIUS, J.; DITTAMI, S. M.; DONG, X.; DŽUNKOVÁ, M.; EDWARDS, A.; EDWARDS, R.; EGBERT, S.; ENGELMANN, J. C.; ESSER, S. P.; ETTEMA, T. J. G.; ETTINGER, C. L.; FABIJAN, A. P.; FERGUSON, R. M. W.; FERRETTI, P.; FOUCAULT, P.; FUHRMAN, J. A.; GADA, A. M.; GEESINK, P.; GERHARDT, I. R.; GESSNER, M. O.; GIOVANNELLI, D.; GITTINS, D.; GLOOR, G. B.; GONZÁLEZ-PECH, R. A.; GOPALAKRISHNAPPA, C.; GREENING, C.; GREGOR, R.; GREGORY, A. C.; GROSSART, H.-P.; GROUSSIN, M.; GUERRERO, B. V.; GUZEL, M.; HAMAMURA, N.; HAMILTON, T. L.; HAMM, J. N.; HART, L.; HASSENRÜCK, C.; HAY, M.; HECHLER, R. M.; HELLWIG, P.; HENSON, M.; HEROLD, M.; HESKETH-BEST, P. J.; HESS, M.; HILLARY, L.; HITCH, T. C.; HIVARKAR, S. S.; HOFF, K. J.; HOM, E. F.; HOU, S.; HUGERTH, L. W.; HWANG, Y.; ILOTT, N.; JAY, Z. J.; JUNGBLUTH, S. P.; KARIMI, E.; KASPAREIT, Y. M.; KEATING, C.; KELLOM, M.; KILEDAL, E. A.; KLARENBERG, I.; KNIGHT, R.; KOECH, A. K.; KOONIN, E. V.; KORMAS, K.; KUJALA, K.; KYRPIDES, N. C.; LA ROSA, S. L.; LACZNY, C. C.; LAHMERS, K.; LAN, X.; LATEEF, A. A.; LAU, S. H.; LEESE, F.; LEZCANO, M. A.; LI, S. S.; LIMA, R. N.; LÜCKER, S.; MAHNERT, A.; MAJIDIAN, S.; MALFERTHEINER, L.; MARSHALL, A.; MEADEN, S.; MEEHAN, C. J.; MEIER, D. V.; MELKONIAN, C.; MENDE, D. R.; MEYER, J. L.; MICHOUD, G.; MIKRYUKOV, V.; MIRAVET-VERDE, S.; MUSCHIOL, J.; NATA’ALA, M. K.; NEUFELD, J. D.; NEUHAUSER, S.; OSUOLALE, O.; OSVATIC, J.; PAPPAS, K. M.; PARKS, D. H.; PARRY, R. H.; PASCOAL, P. V.; PAVLOUDI, C.; PEYTON, B.; PLEWKA, J.; POYET, M.; PRIEST, T.; QUAYE, E. K.; RAMGANESH, S.; RATTEI, T.; RAUSCH, P.; RECH FILHO, E. L.; RINKE, C.; ROBINSON, C.; RODRÍGUEZ-GIJÓN, A.; RODRIGUEZ-R, L. M.; ROHWER, R. R.; ROLOFF, T.; ROTHMAN, J. A.; RÜCKERT, S.; RUFF, S. E.; SAINI, J. S.; SANTIAGO-MARTÍNEZ, M. G.; SANTOFERRARA, L.; SARHAN, M. S.; SAW, J. H.; SBAFFI, T.; SCHÄFER, R. B.; SCHAIBLE, G.; SCHLOTER, M.; SCHMITZ, R. A.; SCHUBERT, C.; SCHWENGERS, O.; SEHNAL, L.; SEKAR, A.; SEKAR, J.; SEYOUM, M. M.; SHAH, M. B.; SHARON, I.; SIEBERS, B.; SIERADZKI, E. T.; SKLIROS, D.; SNOEYENBOS-WEST, O. L.; SORBIE, A.; SPETH, D. R.; SPREHN, C. G.; SRIVASTAVA, P.; STACH, T. L.; STAJICH, J. E.; STARKE, J.; STEEN, A. D.; STÖCKL, R.; STOIKIDOU, T.; STOPNISEK, N.; SUKUMARAN, R.; SURES, B.; SUZUKI, S.; TAMARIT, D.; THIERINGER, P.; TITO, R. Y.; TRIVEDI, C. B.; TRUBL, G.; TRUU, J.; TSIKNIA, M.; UGALDE, J.; VALENTIN-ALVARADO, L. E.; VÁZQUEZ-CAMPOS, X.; VIERHEILIG, J.; MEIJENFELDT, F. A. B. von; WAGNER, M.; WALSH, C. J.; WANG, S.; WANG, Y.; WEGNER, C.-E.; WEIR, T.; WEISS, L. C.; WEISSMAN, J. L.; WICHELS, A.; WILLIAMS, C. L.; WILLIAMS, T. A.; WORDEN, A. Z.; WOYKE, T.; WU, M.; XIU, W.; ZHANG, Y.; ZHU, J.; ZIELS, R. M.; ZWIRZITZ, B.; PROBST, A. J. A roadmap for equitable reuse of public microbiome data. Nature Microbiology, v. 10, p. 2384–2395, 2025. Na publicação: E. Rech.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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