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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Data corrente:  06/08/2008
Data da última atualização:  05/02/2025
Tipo da produção científica:  Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Autoria:  TOGAWA, R. C.; RIBEIRO, C.; MAZONI, I.; PELLIGRINELLI, T.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G.
Afiliação:  Roberto Coiti Togawa, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Cristina Ribeiro, UFMG; Ivan Mazoni, Embrapa Informação Tecnógica; Thais Vital Pelligrinelli, Embrapa Informação Tecnógica; José Gilberto Jardine, Embrapa Informação Tecnógica; Goran Neshich, Embrapa Informação Tecnógica.
Título:  The table of interface forming residues as the specificity indicator for serine proteases bound to different inhibitors.
Ano de publicação:  2008
Fonte/Imprenta:  In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS & COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2008, Georgia. Las Vegas Nevada: CSREA, 2008, p. 811-817.
Idioma:  Inglês
Notas:  BIOCOMP 2008. WORLDCOMP'08
Conteúdo:  We propose a novel method for defining the exclusive and exhaustive table of serine proteases specificity determining interface forming residues (IFR). The IFR are obtained by "hard body docking" among 73 structurally aligned, sequence wise non redundant, serine protease structures, with 3 inhibitors: ecotine, ovomucoid third domain inhibitor and basic pancreatic trypsin inhibitors. In silico constructed complexes offered a condition for determining which residues are participating, from both enzyme and inhibitor side, in the ensemble of amino acids that upon biding loose contact with a solvent. Our focus is on offering a thorough study on how the specificity is achieved among serine proteases even though they have very little difference in their tertiary structure (specifically if the position of catalytic triad residues is considered). Presented table of serine protease specificity based on IFR position occupation show clear variations among sub families such as: trypsines, chymotrypsines, elastases and thrombines.
Palavras-Chave:  Aminoácidos; Enzyme specificity; Especificidade enzimática; Hard body docking; Interface formando resíduos; Interface forming residues; Proteases de serina.
Thesagro:  Enzima.
Thesaurus Nal:  Enzymes; Serine proteinases.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CENARGEN31661 - 1UPCAA - DD
CNPTIA12116 - 2UPCAA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. P. A.; PRIMAVESI, O. Resposta de dois cultivares de aveia ao nitrogênio, em três frequências de corte e duas épocas de plantio: I. Produção de forragem. Revista de Agricultura, Piracicaba, v. 73, n. 3, p. 277-294, 1998. 277-294
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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2.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. P. de A. Efeitos de nutrientes e corretivos na toxidez de alumínio e manganês em sorgo sacarino [Sorghum bicolor (L.) moench]. 1985. 138 f. Tese (Doutorado em Agronomia) - ESALQ/USP, São Carlos, 1985. Orientador: Prof. Dr. Eurípedes Malavolta.
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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3.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C.; PRIMAVESI, O.; GODOY, R. Manejo de cortes de cultivares de aveia forrageira. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 37., 2000, Vicosa, MG. Resumos... Vicosa : SBZ, 2000. p.104.
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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4.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. P. de A.; GODOY, R. Aveia para forragem e cobertura de solo no Estado de São Paulo. São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2002.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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5.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, O.; PEDREIRA, M. dos S.; PRIMAVESI, A. C. Adequação ambiental das pastagens na pecuária. Visão Agrícola, v.2, n. 3, p. 34-36, 2005.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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6.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. M.; PRIMAVESI, O. M. A. S. P. R. Soil system management in the humid and subhumid tropics. In: UPHOFF, N.; THIES, J. E. Biological approaches to regenerative soil systems. 2 ed. Boca Raton: CRC Press, 2023. Capítulo 4. p. 35-43.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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7.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C.; PRIMAVESI, O.; CANTARELLA, H.; GODOY, R. Resposta da aveia cultivar São Carlos a adubação NPK. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba, SP. Anais... Piracicaba: SBZ, 2001. p.179-181.
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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8.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, O.; PRIMAVESI, A. C.; CORRÊA, L. de A. Surface applied limestone on intensively managed tropical grass pastures. In: WORLD CONFERENCE ON ANIMAL PRODUCTION, 9., 2003, Porto Alegre. Proceedings... Porto Alegre: SBZ: WAAP: ALPA: UFRGS , 2003. p.112. Session Grassland and forage crops.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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9.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, O.; PRIMAVESI, A. C.; REGITANO, L. C. de A. Surface applied limestone on intensively managed tropical grass pastures. In: WORLD CONFERENCE ON ANIMAL PRODUCTION, 9.; REUNIÃO LATINO AMERICANA DE PRODUÇÃO ANIMAL, 18., 2003, Porto Alegre. Proceedings... Porto Alegre: SBZ: WAAP: ALPA: UFRGS, 2003. p.112.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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10.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, O.; PRIMAVESI, A. C.; CORRÊA, L. de A. Distribuição radicular de braquiária afetada pela intensidade de manejo em diferentes solos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 39., 2002, Recife, PE. Anais... Recife: Ed. dos Editores, 2002. 4f. 1 CD-ROM.
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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11.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. P. de A.; MALAVOLTA, E. Estudos sobre a nutrição mineral do maracujá amarelo. VI. Efeito dos macronutrientes no desenvolvimento e composição mineral das plantas. Anais da ESALQ, Piracicaba, v. 37, p. 609-630, 1980.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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12.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. P. de A.; MALAVOLTA, E. Estudos sobre a nutrição mineral do maracujá amarelo. VII. Efeito dos micronutrientes no desenvolvimento e composição mineral das plantas. Anais da ESALQ, Piracicaba, v. 37, p. 537-553, 1980.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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13.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. P. de A.; MALAVOLTA, E. Estudos sobre a nutrição mineral do maracujá amarelo. VIII. Extração de nutrientes e exigências nutricionais para o desenvolvimento vegetativo. Anais da ESALQ, Piracicaba, v. 37, p. 603-607, 1980.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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14.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C.; PRIMAVESI, O.; CANTARELLA, H.; GODOY, R. Produção de forragem de aveia influenciada pela adubação e manejo. Revista de Agricultura, Piracicaba, v.78, n.1, p.1-13, 2003
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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15.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. A.; PRIMAVESI, O.; CANTARELLA, H.; GODOY, R. Recomendação de adubação de aveia em Latossolo vermelho-amarelo em dois sistemas de plantio. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2003. (Embrapa Pecuária Sudeste. Comunicado técnico, 42).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
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16.Imagem marcado/desmarcadoRASSINI, J. B.; PRIMAVESI, A. C. P. de A. Irrigação de aveia (Avena byzantina) na região sudeste do Brasil. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 23., 2003, Gramado, RS. Anais... Gramado: UFRGS, 2003.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C.; PRIMAVESI, O.; CANTARELLA, H.; GODOY, R. Influência da adubação na produção de forragem de aveia. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 39., 2002, Recife, PE. Anais... Recife: SBZ: Ed. dos Editores, 2002. 4f. 1 CD-ROM.
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18.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, O.; PRIMAVESI, A. C.; CAMARGO, A. C. de. Conhecimento e controle, no uso de corretivos e fertilizantes, para manejo sustentável de sistemas intensivos de produção de leite de bovinos a pasto. Revista Agricultura, Piracicaba, SP, v.74, n.2, p.249-265, 1999.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
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19.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, O. M. A. S. P. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A. Atividade biológica ampliando a capacidade de troca aniônica em oxissolos. In: REUNIAO BRASILEIRA FERTILIDADES DO SOLO E NUTRICAO DE PLANTAS, 23., REUNIAO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 7.; SIMPOSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 5.; REUNIAO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 2., 1998, Caxambu. Anais... Caxambu: FERTBIO, 1998. P.164.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoPRIMAVESI, A. C. P. de A.; RODRIGUES, A. de A.; GODOY, R. Aveia forrageira: características agronômicas e utilização na alimentação de bovinos. In: SEMANA DO ESTUDANTE, 14., 2000, São Carlos, SP. Anais...São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2000. p.87-105. Resumo expandido.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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