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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
19/02/2019 |
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Data da última atualização: |
19/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; SOUSA, G. H. M. F.; CESAR, A. S. M.; SIMAS, R. C.; SILVA-VIGNATO, B.; OLIVEIRA, G. B.; ANDRADE, S. C. S.; CAMERON, L. C.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
Mirele D. Poleti, USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Gustavo H. M. F. Souza, MS Applications and Development Laboratory Waters Corporation; Aline S. M. Cesar, USP; Rosineide C. Simas, USP; Bárbara Silva-Vignato, USP; Gabriella B. Oliveira, USP; Sónia C. S. Andrade, USP; Luiz C. Cameron, UNIRIO; Luiz Lehmann Coutinho, USP. |
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Título: |
Longissimus dorsi muscle label-free quantitative proteomic reveals biological mechanisms associated with intramuscular fat deposition. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Proteomics, v. 179, p. 30-41, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.dib.2018.06.004 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The pathways involved in intramuscular fat (IMF) deposition in Longissimus dorsi muscle were investigated using an integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach by High Definition Mass Spectrometry. We quantified 1582 proteins, of which 164 were differentially abundant proteins (DAPs, p < 0.05) between animals with high (H) and low (L) genomic estimated breeding values (GEBV) for IMF content. Ingenuity pathway analysis (IPA) revealed that these DAPs were mainly involved in glycolysis metabolism, actin cytoskeleton signaling, cell-cell adherens junction and pathways for MAPK and insulin. A comparative study between transcriptomic (mRNA) and proteomic data showed 17 differentially expressed genes corresponding to DAPs, of which three genes/proteins did not agree on the direction of the fold change between groups. Moreover, we investigated microRNAs data to explain these differences in fold change direction, being able to unravel two of the three unexpected mRNA/protein relationships. Results demonstrated that changes in protein/mRNA levels of sarcomere organization, intracellular signal transduction and regulation of actin cytoskeleton, are involved in IMF deposition. These findings provide a deeper understanding of the highly complex regulatory mechanisms involved in IMF deposition in cattle and indicate target pathways for future studies. Significance: Intramuscular fat is the amount of fat deposited inside muscle and plays an important role in human health and meat quality attributes, influencing energy metabolism of skeletal muscle, as well as, tenderness, flavor, and juiciness of beef. We performed for the first time the utilization of integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach using High Definition Mass Spectrometry for characterization of the changes in the proteomic profile of the Longissimus dorsi muscle associated with intramuscular fat deposition in cattle. Furthermore, we compared the muscle proteome with the muscle transcriptome (mRNA and microRNAs), obtained by RNA-sequencing, to better understand the relationship between expression of mRNAs and proteins and to unravel essential biological mechanisms involved in bovine skeletal muscle IMF deposition. MenosThe pathways involved in intramuscular fat (IMF) deposition in Longissimus dorsi muscle were investigated using an integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach by High Definition Mass Spectrometry. We quantified 1582 proteins, of which 164 were differentially abundant proteins (DAPs, p < 0.05) between animals with high (H) and low (L) genomic estimated breeding values (GEBV) for IMF content. Ingenuity pathway analysis (IPA) revealed that these DAPs were mainly involved in glycolysis metabolism, actin cytoskeleton signaling, cell-cell adherens junction and pathways for MAPK and insulin. A comparative study between transcriptomic (mRNA) and proteomic data showed 17 differentially expressed genes corresponding to DAPs, of which three genes/proteins did not agree on the direction of the fold change between groups. Moreover, we investigated microRNAs data to explain these differences in fold change direction, being able to unravel two of the three unexpected mRNA/protein relationships. Results demonstrated that changes in protein/mRNA levels of sarcomere organization, intracellular signal transduction and regulation of actin cytoskeleton, are involved in IMF deposition. These findings provide a deeper understanding of the highly complex regulatory mechanisms involved in IMF deposition in cattle and indicate target pathways for future studies. Significance: Intramuscular fat is the amount of fat deposited inside muscle and plays an important role in... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adiposidade; Gordura intramuscular; MRNA. |
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Thesagro: |
Gordura Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Mass spectrometry; MicroRNA. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 03231naa a2200313 a 4500
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520 $aThe pathways involved in intramuscular fat (IMF) deposition in Longissimus dorsi muscle were investigated using an integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach by High Definition Mass Spectrometry. We quantified 1582 proteins, of which 164 were differentially abundant proteins (DAPs, p < 0.05) between animals with high (H) and low (L) genomic estimated breeding values (GEBV) for IMF content. Ingenuity pathway analysis (IPA) revealed that these DAPs were mainly involved in glycolysis metabolism, actin cytoskeleton signaling, cell-cell adherens junction and pathways for MAPK and insulin. A comparative study between transcriptomic (mRNA) and proteomic data showed 17 differentially expressed genes corresponding to DAPs, of which three genes/proteins did not agree on the direction of the fold change between groups. Moreover, we investigated microRNAs data to explain these differences in fold change direction, being able to unravel two of the three unexpected mRNA/protein relationships. Results demonstrated that changes in protein/mRNA levels of sarcomere organization, intracellular signal transduction and regulation of actin cytoskeleton, are involved in IMF deposition. These findings provide a deeper understanding of the highly complex regulatory mechanisms involved in IMF deposition in cattle and indicate target pathways for future studies. Significance: Intramuscular fat is the amount of fat deposited inside muscle and plays an important role in human health and meat quality attributes, influencing energy metabolism of skeletal muscle, as well as, tenderness, flavor, and juiciness of beef. We performed for the first time the utilization of integrated transcriptome-assisted label-free quantitative proteomic approach using High Definition Mass Spectrometry for characterization of the changes in the proteomic profile of the Longissimus dorsi muscle associated with intramuscular fat deposition in cattle. Furthermore, we compared the muscle proteome with the muscle transcriptome (mRNA and microRNAs), obtained by RNA-sequencing, to better understand the relationship between expression of mRNAs and proteins and to unravel essential biological mechanisms involved in bovine skeletal muscle IMF deposition.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 25 | |
| 1. |  | ALVES, C.; GALON, L.; HOLZ, C. M.; KAIZER, R. R.; WINTER, F. L.; CONCENCO, G.; NONEMACHER, F.; PERIN, G. F. Características fisiológicas de plantas hibernais com potencial fitorremediador sob influência dos herbicidas fomesafen e sulfentrazone. Revista de Ciências Agroveterinárias, v. 18, n. 1, p. 1-12, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 2. | | SANTIN, C. O.; PERIN, G. F.; FORTE, C. T.; FIABANE, R. C.; ANDRES, A.; SILVA, A. F. da; GALON, L. Eficiência e seletividade de herbicidas aplicados em sorgo sacarino. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 3. | | PERIN, G. F.; SCHLOSSER, J. F.; FARIAS, M. S. de; ESTRADA, J. S.; TREICHEL, H.; GALON, L. Emissões de motor agrícola com o uso de diferentes tipos de diesel e concentrações de biodiesel na mistura combustível. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 50, n. 12, p. 1168-1176, dez. 2015. Título em inglês: Emissions of agricultural engine using different diesel types and biodiesel concentrations in the fuel mixture.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | ECKER, S. L.; SILVA, C. da; PERIN, G. F.; GALON, L.; BEHLING, M.; SILVA, A. F. da. Efeito das épocas de semeadura sobre os componentes biológicos de sorgo sacarino. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 5. | | GIACOMINI, J. P.; GALON, L.; MÜLLER, G. L.; BAGNARA, M. A. M.; SILVA, A. F. da; PERIN, G. F. Interference and economic damage level of volunteer corn plants in soybeans. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, v. 19, n. 1, e3283, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | GALON, L.; FRANCESCHETTI, M. B.; BERNARDI, N. D. C.; BRUNETTO, L.; CONCENÇO, G.; MENEGAT, A. D.; SILVA, A. M. L. da; PERIN, G. F. Competitive ability of maize with weed species as a function of the inserted transgenic trait. Revista Caatinga, Mossoró, v. 38, e11990, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 7. | | GALON, L.; SANTIN, C. O.; RADÜNZ, A. L.; ANDRES, A.; CONCENÇO, G.; SILVA, A. F. da; NONEMACHER, F.; PERIN, G. F.; ASPIAZÚ, I. Competitive ability of sweet sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench) cultivars against hairy beggarticks (Bidens pilosa L.). Revista de Ciencias Agrícolas, v. 39, n. 1, p. 70-84, Jan./June 2022. Título em espanhol: Capacidad competitiva de cultivares de sorgo dulce (Sorghum bicolor (L.) Moench) contra papunga (Bidens pilosa L.).| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 8. | | GALON, L.; BAMPI, L.; CAVALETTI, D. C.; BRUNETTO, L.; CONCENÇO, G.; MUNARETO, J. D.; CECHET, E. H. S.; CASTAMANN, A.; BAGNARA, M. A. M.; PERIN, G. F. Competitive outcomes of quinoa genotypes with wild radish and ryegrass at increasing levels of infestation. Technology in Agronomy, v. 5, e014, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | FORTE, C. T.; GALON, L.; BEUTLER, A. N.; BASSO, F. J. M.; NONEMACHER, F.; REICHERT JÚNIOR, F. W.; PERIN, G. F.; TIRONI, S. P. Soil management systems and their effect on the weed seed bank. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 4, p. 435-442, abr. 2018. Título em português: Sistemas de manejo do solo e sua influência no banco de sementes de plantas daninhas.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 10. | | GALON, L.; HOJNOWSKI, É. M.; MÜLLER, G. L.; HABOSKI, D. A.; ZAMBONI, G. E.; CONCENÇO, G.; BIGOLIN, G.; BAMPI, L.; ANDRES, A.; PERIN, G. F. Selectivity and efficacy of terbuthylazine as an alternative herbicide applied alone or in combination for the control of weeds in wheat. Weed Technology, v. 40, n. 1, e5, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | GALON, L.; KUJAWINSKI, R. A.; ZAMBONI, G. E.; ASPIAZÚ, I.; TONIN, R. J.; ONESKO, J. C.; BAGNARA, M. A. M.; CONCENÇO, G.; PERIN, G. F. Selectivity of herbicides applied alone or in tank mixtures at different times of the day in the soybean cultivar DM57i52 IPRO over two growing seasons. Journal of Crop Health, v. 78, n. 1, 2026.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | GALON, L.; CAVALETTI, D. C.; GIACOMINI, J. P.; SILVA, A. F. da; BAGNARA, M. A. M.; TONI, J. R.; BRANDLER, D.; PERIN, G. F. Interference and economic threshold level of transgenic volunteer soybean plants in maize crop. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, v. 21, e1254, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 13. | | GIACOMINI, J. P.; GALON, L.; CAVALETTI, D. C.; HENZ NETO, O. D.; SILVA, A. F. da; SENHORI, V. M.; HABOSKI, D. A.; PERIN, G. F. Interference and level of economic damage of soybean voluntary plants infesting bean. Advances in Weed Science, v. 42, e020240072, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 14. | | FRANCESCHETTI, M. B.; GALON, L.; TOSO, J. O.; MELO, T. S.; MENEGATTI, A. D.; CONCENÇO, G.; BAGNARA, M. A. M.; PERIN, G. F. Morpho-physiological responses of potato cultivars under weed competition. Comunicata Scientiae, V. 15, e4088, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 15. | | GALON, L.; KONZEN, A.; PIAZZETTA, H. VON L.; CONCENÇO, G.; ANDRÉ, M.; BAGNARA, M.; SILVA, A. M. L. DA; PERIN, G. F. Periods of interference of Alexandergrass on morphophysiological and productive characteristics of transgenic soybean. Communications in Plant Science, v. 12, p. 60-66, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 16. | | SILVA, J. D. G. da; GALON, L.; PAWELKIEWICZ, R.; FRANCESCHETTI, M. B.; PORTES, J. C.; ROSSETTO, E. R. de O.; PERIN, G. F.; MÜLLER, C. Physiological and productive traits of soybean with metsulfuron-methyl application at early desiccation. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 51, e02496, 2021. Título em português: Características fisiológicas e produtivas de soja com aplicação de metsulfurommetílico na dessecação precoce.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | THIEL, C. H.; DAVID, F. A. de; GALON, L.; DEUNER, S.; FORTE, C. T.; PERIN, G. F.; DAVID, P. R. de; MOSSI, A. J.; ANDRES, A.; CONCENCO, G. Physiology of weeds in intraspecific competition. Journal of Agricultural Science, v. 10, n. 6, p. 334-340, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 18. | | DAVID, F. A. de; GALON, L.; PERIN, G. F.; CONCENCO, G.; CASTAMANN, A.; FORTE, C. T.; DAVID, P. R. de; MOSSI, A. J.; ANDRES, A.; MOISINHO, I. S. Weed interference in the morphophysiological and nutritional characteristics of erva-mate (Ilex paraguariensis). American Journal of Plant Sciences, v. 9, p. 435-445, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 19. | | GALON, L.; CONCENCO, G.; PERIN, G. F.; SILVA, A. F. da; FORTE, C. T.; DAVID, F. de A.; RADÜZ, L. L.; RADUNZ, A. L.; ANDRES, A.; TIRONI, S. P.; CONCENÇO, S. E. Comparison of experimental methods to assess the competitive ability of weed species. American Journal of Plant Sciences, v. 6, p. 2185-2196, Aug. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 20. | | CONCATO, A. C.; GALON, L.; SUTORILLO, N. T.; TAMAGNO, W. A.; PAULA, M. O. DE; VANIN, A. P.; ALVES, C.; SILVA, J. D. G. DA; CONCENÇO, G.; PERIN, G. F.; KAIZER, R. R. Does the application of herbicides with distinct mechanisms of action change enzymatic activity and grain yield of Clearfield® canola? Australian Journal of Crop Science, v. 16, n. 1, p. 96-105, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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