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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
05/10/2011 |
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Data da última atualização: |
06/01/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GHELFI, A.; GAZIOLA, S. A.; CIA, M. C.; CHABREGAS, S. M.; FALCO, M. C.; KUSER-FALCÃO, P. R.; AZEVEDO, R. A. |
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Afiliação: |
A. GHELFI, Universidade Federal do Amazonas; S. A. GAZIOLA, ESALQ/USP; MARIANA CICARELLA CIA, ESALQ/USP; SABRINA M. CHABREGAS, Centro de Tecnologia Canavieira; M. C. FALCO, Centro de Tecnologia Canavieira; PAULA REGINA KUSER-FALCÃO, CNPTIA; R. A. AZEVEDO, ESALQ/USP. |
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Título: |
Cloning, expression, molecular modelling and docking analysis of glutathione transferase from Saccharum officinarum. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Annals of Applied Biology, Cambridge, v. 159, n. 2, p. 267-280, 2011. |
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DOI: |
10.1111/j.1744-7348.2011.00491.x |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Sugarcane yield and quality are affected by a number of biotic and abiotic stresses. In response to such stresses, plants may increase the activities of some enzymes such as glutathione transferase (GST), which are involved in the detoxification of xenobiotics. Thus, a sugarcane GST was modelled and molecular docked using the program LIGIN to investigate the contributions of the active site residues towards the binding of reduced glutathione (GSH) and 1-chloro-2,4-dinitrobenzene (CDNB). As a result, W13 and I119 were identified as key residues for the specificity of sugarcane GSTF1 (SoGSTF1) towards CDNB. To obtain a better understanding of the catalytic specificity of sugarcane GST (SoGSTF1), two mutants were designed, W13L and I119F. Tertiary structure models and the same docking procedure were performed to explain the interactions between sugarcane GSTs with GSH and CDNB. An electron-sharing network for GSH interaction was also proposed. The SoGSTF1 and the mutated gene constructions were cloned and expressed in Escherichia coli and the expressed protein purified. Kinetic analyses revealed different Km values not only for CDNB, but also for GSH. The Km values were 0.2, 1.3 and 0.3 mM for GSH, and 0.9, 1.2 and 0.5 mM for CDNB, for the wild type, W13L mutant and I119F mutant, respectively. The Vmax values were 297.6, 224.5 and 171.8 umol min-1 mg-1 protein for GSH, and 372.3, 170.6 and 160.4 umol min-1 mg-1 protein for CDNB. |
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Palavras-Chave: |
Cana-de-açúcar; Clonagem molecular; Modelagem molecular. |
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Thesagro: |
Saccharum Officinarum. |
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Thesaurus Nal: |
Glutathione transferase; Molecular cloning; Molecular models; Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aSugarcane yield and quality are affected by a number of biotic and abiotic stresses. In response to such stresses, plants may increase the activities of some enzymes such as glutathione transferase (GST), which are involved in the detoxification of xenobiotics. Thus, a sugarcane GST was modelled and molecular docked using the program LIGIN to investigate the contributions of the active site residues towards the binding of reduced glutathione (GSH) and 1-chloro-2,4-dinitrobenzene (CDNB). As a result, W13 and I119 were identified as key residues for the specificity of sugarcane GSTF1 (SoGSTF1) towards CDNB. To obtain a better understanding of the catalytic specificity of sugarcane GST (SoGSTF1), two mutants were designed, W13L and I119F. Tertiary structure models and the same docking procedure were performed to explain the interactions between sugarcane GSTs with GSH and CDNB. An electron-sharing network for GSH interaction was also proposed. The SoGSTF1 and the mutated gene constructions were cloned and expressed in Escherichia coli and the expressed protein purified. Kinetic analyses revealed different Km values not only for CDNB, but also for GSH. The Km values were 0.2, 1.3 and 0.3 mM for GSH, and 0.9, 1.2 and 0.5 mM for CDNB, for the wild type, W13L mutant and I119F mutant, respectively. The Vmax values were 297.6, 224.5 and 171.8 umol min-1 mg-1 protein for GSH, and 372.3, 170.6 and 160.4 umol min-1 mg-1 protein for CDNB.
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700 1 $aAZEVEDO, R. A.
773 $tAnnals of Applied Biology, Cambridge$gv. 159, n. 2, p. 267-280, 2011.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 6. |  | FRANCO, R. A.; REIS, P. R.; ZACARIAS, M. S.; ALTOÉ, B. F.; PEDRO NETO, M. Dinâmica populacional de Oligonychus ilicis (McGregor, 1917) (Acari: Tetranychidae) em cafeeiro e de fitoseídeos associados a ele. COFFEE SCIENCE, Lavras, v.3, n.1, p.38-46, jan./jun. 2008. 38-46| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Local - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 7. | | PEDRO NETO, M.; REIS, P. R.; ZACARIAS, M. S.; SILVA, R. A.; ALCÂNTRA, E. N. Efeito da chuva e do manejo das plantas adventícias na incidência de ácaros predadores (Phytoseeidae) em cafeeiro orgânico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 9. | | PEDRO NETO, M.; SARMENTO, R. A.; OLIVEIRA, W. P. de; PICANÇO, M. C.; ERASMO, E. A. L. Biologia e tabela de vida do ácaro-vermelho Tetranychus bastosi em pinhão-manso. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 4, p. 353-357, abr. 2013. Título em inglês: Biology and life table of the red spider mite Tetranychus bastosi on physic nut.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | SANTOS, A. dos; TEIXEIRA, V. A.; PERES FILHO, O; SERAFIN, M. E.; PEDRO NETO, M.; OLIVEIRA, C. A. de C. Primeiro registro de Tetranychus urticae (Acari: Tetranychidae) em mudas de teca no Brasil. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 34, n. 78, p. 165-167, abr./jun. 2014. Nota científica.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 12. | | SARAIVA, A. S. de; SARMENTO, R. A.; PEDRO NETO, M.; TEODORO, A. V.; ERASMO, E. A. L.; BELCHIOR, D. C. V.; AZEVEDO, E. B. de. Glyphosate sub-lethal toxicity to non-target organisms occurring in Jatropha curcas plantations in Brazil. Experimental & Applied Acarology, Amsterdan, NL, v. 70, n. 2, p. 179-187, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | CRUZ, W. P.; SARMENTO, R. A.; TEODORO, A. V.; ERASMO, E. A. L.; PEDRO NETO, M.; IGNACIO, M.; FERREIRA JUNIOR, D. F. Acarofauna em cultivo de pinhão-manso e plantas espontâneas associadas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 3, p. 319-327, mar. 2012. Título em inglês: Acarofauna in physic nut culture and associated spontaneous weeds.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | DORNELAS, A. S. P.; SARMENTO, R. de A.; PEDRO-NETO, M.; SILVA, D. G. da; SANTOS, G. R. dos; NASCIMENTO, M. O. do; OLIVEIRA, C. A.; SOUZA, D. J. de. Susceptibility of atta sexdens worker ants treated with the immunosuppressant Sandimmun Neoral to Metarhizium anisopliae. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n. 2, p. 133-136, fev. 2017. Notas científicas. Título em português: Suscetibilidade de operárias de Atta sexdens tratadas com o imunossupressor Sandimmun Neoral a Metarhizium anisopliae.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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