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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Soja; Embrapa Solos. |
Data corrente: |
28/08/2024 |
Data da última atualização: |
28/08/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BALDANI, J. I.; FERREIRA, N. dos S.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; SOARES, L. H. de B.; ARAUJO, J. L. S. de; DOURADO, F. dos S.; BACH, e.; CAMACHO, N. N.; OLIVEIRA, A. M. de; ALVES, B. J. R.; SILVA, A. L.; ROSSI, C. N.; OLIVEIRA JUNIOR, A. F. de; ZILLI, J. E. |
Afiliação: |
JOSE IVO BALDANI, CNPAB; NATALIA DOS SANTOS FERREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; STEFAN SCHWAB, CNPAB; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; LUIS HENRIQUE DE BARROS SOARES, CPACT; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; FERNANDA DOS SANTOS DOURADO, CNPAB; EVELISE BACH, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE DO SUL; NATALIA NEUTZLING CAMACHO, CNPS; AMANDA MAURA DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; BRUNO JOSE RODRIGUES ALVES, CNPAB; ANDREIA LOVIANE SILVA, CNPAB; CAROLINA NACHI ROSSI, CNPSO; ALBERTO FERNANDES DE OLIVEIRA JUNIOR, CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO; JERRI EDSON ZILLI, CNPAB. |
Título: |
Nitrospirillum viridazoti sp. nov., an efficient nitrogen-fixing species Isolated from grasses. |
Ano de publicação: |
2024 |
Fonte/Imprenta: |
Current Microbiology , v. 81, n. 6, p. 144-166, 2024. |
ISSN: |
1432-0991 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A group of Gram-negative plant-associated diazotrophic bacteria belonging to the genus Nitrospirillum was investigated,including both previously characterized and newly isolated strains from diverse regions and biomes, predominantly in Brazil. Phylogenetic analysis of 16S rRNA and recA genes revealed the formation of a distinct clade consisting of thirteen strains, separate from the formally recognized species N. amazonense (the closest species) and N. iridis. Comprehensive taxonomic analyses using the whole genomes of four strains (BR 11140T=AM 18T=Y-2T=DSM 2788T=ATCC 35120T, BR 11142T=AM 14T=Y-1T=DSM 2787T=ATCC 35119T, BR 11145=CBAmC, and BR 12005) supported the division of these strains into two species: N. amazonense (BR 11142 T and BR 12005) and a newly proposed species (BR 11140 T and BR 11145), distinct from N. iridis. The phylogenomic analysis further confrmed the presence of the new Nitrospirillum species. Additionally, MALDI-TOF MS analysis of whole-cell mass spectra provided further evidence for the diferentiation of the proposed Nitrospirillum species, separate from N. amazonense. Analysis of chemotaxonomy markers (i.e., genes involved in fatty acid synthesis, metabolism and elongation, phospholipid synthesis, and quinone synthesis) revealed that the new species highlights high similarity and evolutionary convergence with other Nitrospirillum species. This new species exhibited nitrogen fxation ability in vitro, it has similar NifHDK protein phylogeny position with the closest species, lacked denitrifcation capability, but possessed the nosZ gene, enabling N2O reduction, distinguishing it from the closest species. Despite being isolated from diverse geographic regions, soil types, and ecological niches, no signifcant phenotypic or physiological diferences were observed between the proposed new species and N. amazonense. Based on these fndings, a new species, Nitrospirillum viridazoti sp. nov., was classifed, with the strain BR 11140T (DSM 2788T, ATCC 35120T) designated as the type strain. MenosA group of Gram-negative plant-associated diazotrophic bacteria belonging to the genus Nitrospirillum was investigated,including both previously characterized and newly isolated strains from diverse regions and biomes, predominantly in Brazil. Phylogenetic analysis of 16S rRNA and recA genes revealed the formation of a distinct clade consisting of thirteen strains, separate from the formally recognized species N. amazonense (the closest species) and N. iridis. Comprehensive taxonomic analyses using the whole genomes of four strains (BR 11140T=AM 18T=Y-2T=DSM 2788T=ATCC 35120T, BR 11142T=AM 14T=Y-1T=DSM 2787T=ATCC 35119T, BR 11145=CBAmC, and BR 12005) supported the division of these strains into two species: N. amazonense (BR 11142 T and BR 12005) and a newly proposed species (BR 11140 T and BR 11145), distinct from N. iridis. The phylogenomic analysis further confrmed the presence of the new Nitrospirillum species. Additionally, MALDI-TOF MS analysis of whole-cell mass spectra provided further evidence for the diferentiation of the proposed Nitrospirillum species, separate from N. amazonense. Analysis of chemotaxonomy markers (i.e., genes involved in fatty acid synthesis, metabolism and elongation, phospholipid synthesis, and quinone synthesis) revealed that the new species highlights high similarity and evolutionary convergence with other Nitrospirillum species. This new species exhibited nitrogen fxation ability in vitro, it has similar NifHDK protein phylogeny position wi... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Análise filogenética; Análises taxonômicas; BR 11140; Nitrospirillum viridazoti sp; Phylogenetic analysis; Taxonomic analyses. |
Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio; Gramínea; Taxonomia Vegetal. |
Thesaurus Nal: |
Grasses; Nitrogen fixation. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
LEADER 03286naa a2200433 a 4500 001 2166857 005 2024-08-28 008 2024 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1432-0991 100 1 $aBALDANI, J. I. 245 $aNitrospirillum viridazoti sp. nov., an efficient nitrogen-fixing species Isolated from grasses.$h[electronic resource] 260 $c2024 520 $aA group of Gram-negative plant-associated diazotrophic bacteria belonging to the genus Nitrospirillum was investigated,including both previously characterized and newly isolated strains from diverse regions and biomes, predominantly in Brazil. Phylogenetic analysis of 16S rRNA and recA genes revealed the formation of a distinct clade consisting of thirteen strains, separate from the formally recognized species N. amazonense (the closest species) and N. iridis. Comprehensive taxonomic analyses using the whole genomes of four strains (BR 11140T=AM 18T=Y-2T=DSM 2788T=ATCC 35120T, BR 11142T=AM 14T=Y-1T=DSM 2787T=ATCC 35119T, BR 11145=CBAmC, and BR 12005) supported the division of these strains into two species: N. amazonense (BR 11142 T and BR 12005) and a newly proposed species (BR 11140 T and BR 11145), distinct from N. iridis. The phylogenomic analysis further confrmed the presence of the new Nitrospirillum species. Additionally, MALDI-TOF MS analysis of whole-cell mass spectra provided further evidence for the diferentiation of the proposed Nitrospirillum species, separate from N. amazonense. Analysis of chemotaxonomy markers (i.e., genes involved in fatty acid synthesis, metabolism and elongation, phospholipid synthesis, and quinone synthesis) revealed that the new species highlights high similarity and evolutionary convergence with other Nitrospirillum species. This new species exhibited nitrogen fxation ability in vitro, it has similar NifHDK protein phylogeny position with the closest species, lacked denitrifcation capability, but possessed the nosZ gene, enabling N2O reduction, distinguishing it from the closest species. Despite being isolated from diverse geographic regions, soil types, and ecological niches, no signifcant phenotypic or physiological diferences were observed between the proposed new species and N. amazonense. Based on these fndings, a new species, Nitrospirillum viridazoti sp. nov., was classifed, with the strain BR 11140T (DSM 2788T, ATCC 35120T) designated as the type strain. 650 $aGrasses 650 $aNitrogen fixation 650 $aFixação de Nitrogênio 650 $aGramínea 650 $aTaxonomia Vegetal 653 $aAnálise filogenética 653 $aAnálises taxonômicas 653 $aBR 11140 653 $aNitrospirillum viridazoti sp 653 $aPhylogenetic analysis 653 $aTaxonomic analyses 700 1 $aFERREIRA, N. dos S. 700 1 $aSCHWAB, S. 700 1 $aREIS, V. M. 700 1 $aSOARES, L. H. de B. 700 1 $aARAUJO, J. L. S. de 700 1 $aDOURADO, F. dos S. 700 1 $aBACH, e. 700 1 $aCAMACHO, N. N. 700 1 $aOLIVEIRA, A. M. de 700 1 $aALVES, B. J. R. 700 1 $aSILVA, A. L. 700 1 $aROSSI, C. N. 700 1 $aOLIVEIRA JUNIOR, A. F. de 700 1 $aZILLI, J. E. 773 $tCurrent Microbiology$gv. 81, n. 6, p. 144-166, 2024.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Registros recuperados : 107 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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10. |  | SAMPAIO FILHO, J. S.; OLIVEIRA, I. C. M.; PASTINA, M. M.; CAMPOS, M. de S.; OLIVEIRA, E. J. de. Genotype x environment interaction in cassava multi-environment trials via analytic factor. PLoS ONE, v. 19, n, 2, e0315370, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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12. |  | CAMPOLINO, M. L.; SANTOS, T. T.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; GUILHEN, J. H. S.; PASTINA, M. M.; COELHO, A. M.; SOUSA, S. M. de. Arquitetura do sistema radicular e diversidade genética microbiana de genótipos de milho e sorgo sob diferentes condições de fertilização fosfatada. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento híbrido.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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13. |  | CAMPOLINO, M. L.; SANTOS, T. T.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; GUILHEN, J. H. S.; PASTINA, M. M.; COELHO, A. M.; SOUSA, S. M. de. Arquitetura do sistema radicular e diversidade genética microbiana de genótipos de milho e sorgo sob diferentes condições de fertilização fosfatada. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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14. |  | HIPOLITO, L. P. T.; ABREU, M. G. de; OLIVEIRA, B. K. F. S.; RIBEIRO, C. A. G.; PASTINA, M. M.; SOUSA, S. M. de. Avaliação do sistema radicular de genótipos de milho em solução nutritiva sob baixo e alto fósforo. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA PIBIC/BIC JÚNIOR, 6., 2014, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2014.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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15. |  | LIVIO, D. F.; DINIZ, M. N.; BARROS, B. A.; SOUZA, V. F. de; PASTINA, M. M.; NODA, R. W.; DAMASCENO, C. M. B. Allelic variation in HCT1 gene expression is associated with lignin content in sorghum. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 6., 2017, Ouro Preto. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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16. |  | HIPOLITO, L. P. T.; ABREU, M. G. de; OLIVEIRA, B. C. F. S.; RIBEIRO, C. A. G.; GUIMARAES, C. T.; PASTINA, M. M.; SOUSA, S. M. de. Caracterização do sistema radicular de genótipos de milho do painel da Embrapa Milho e Sorgo em solução nutritiva visando à eficiência da aquisição de fósforo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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18. |  | ROSA, J. R. B. F.; SILVA, R. R.; PASTINA, M. M.; BARRETO, F. Z.; BALSALOBRE, T. W. A.; SOUZA, A. P.; CARNEIRO, M. S.; GARCIA, A. A. F. Estimation of linkage disequilibrium on a Brazilian collection of sugarcane (Saccharum spp.) genotypes from AFLP, SSR and EST-SSR data. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 54.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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19. |  | CAMPOLINO, M. L.; SANTOS, T. T.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; GUILHEN, J. H. S.; PASTINA, M. M.; COELHO, A. M.; SOUSA, S. M. de. Crop type determines how root system architecture and microbial diversity indices relate in different phosphate fertilization conditions. In: PHOSPHORUS IN SOILS AND PLANTS SYMPOSIUM, 7., 2022, Montevideo. Towards a sustainable phosphorus utilization in agroecosystems: book of abstracts. Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, 2022. p. 31.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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20. |  | CAMPOLINO, M. L.; SANTOS, T. T.; LANA, U. G. de P.; GOMES, E. A.; GUILHEN, J. H. S.; PASTINA, M. M.; COELHO, A. M.; SOUSA, S. M. de. Crop type determines how root system architecture and microbial diversity indices relate in different phosphate fertilization conditions. In: PHOSPHORUS IN SOILS AND PLANTS SYMPOSIUM, 7., 2022, Montevideo. Towards a sustainable phosphorus utilization in agroecosystems: book of abstracts. Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, 2022. p. 31.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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