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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
21/11/2012 |
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Data da última atualização: |
08/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MARRACCINI, P.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H. J. O.; ELBELT, S.; VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; SILVA, V. A.; DaMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; LEROY, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. |
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Afiliação: |
PIERRE MARRACCINI, Cenargen, CIRAD; FELIPE VINECKY, Cenargen; GABRIEL S. C. ALVES, Cenargen; HUMBERTO J. O. RAMOS, IAPAR; SONIA ELBELT, Cenargen, CIRAD; NATALIA G. VIEIRA, Cenargen; FERNANDA A. CARNEIRO, Cenargen; PATRICIA S. SUJII, Cenargen; JEAN C. ALEKCEVETCH, Cenargen; VÂNIA A. SILVA, UFV; FÁBIO M. DAMATTA, UFV; MARIA AMELIA GAVA FERRÃO, SAPC; THIERRY LEROY, CIRAD; DAVID POT, CIRAD; LUIZ G. E. VIEIRA, SAPC; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, CNPTIA; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN. |
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Título: |
Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Experimental Botany, Oxford, v. 63, n. 11, p. 4191-4212, 2012. |
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DOI: |
10.1093/jxb/ers103 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to investigate the molecular mechanisms underlying drought acclimation in coffee plants by the identification of candidate genes (CGs) using different approaches. The first approach used the data generated during the Brazilian Coffee expressed sequence tag (EST) project to select 13 CGs by an in silico analysis (electronic northern). The second approach was based on screening macroarrays spotted with plasmid DNA (coffee ESTs) with separate hybridizations using leaf cDNA probes from drought-tolerant and susceptible clones of Coffea canephora var. Conilon, grown under different water regimes. This allowed the isolation of seven additional CGs. The third approach used two-dimensional gel electrophoresis to identify proteins displaying differential accumulation in leaves of drought-tolerant and susceptible clones of C. canephora. Six of them were characterized by MALDI-TOF-MS/MS (matrix-assisted laser desorption-time of flight-tandem mass spectrometry) and the corresponding proteins were identified. Finally, additional CGs were selected from the literature, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) was performed to analyse the expression of all identified CGs. Altogether, >40 genes presenting differential gene expression during drought acclimation were identified, some of them showing different expression profiles between drought-tolerant and susceptible clones. Based on the obtained results, it can be concluded that factors involved a complex network of responses probably involving the abscisic signalling pathway and nitric oxide are major molecular determinants that might explain the better efficiency in controlling stomata closure and transpiration displayed by drought-tolerant clones of C. canephora. MenosThe aim of this study was to investigate the molecular mechanisms underlying drought acclimation in coffee plants by the identification of candidate genes (CGs) using different approaches. The first approach used the data generated during the Brazilian Coffee expressed sequence tag (EST) project to select 13 CGs by an in silico analysis (electronic northern). The second approach was based on screening macroarrays spotted with plasmid DNA (coffee ESTs) with separate hybridizations using leaf cDNA probes from drought-tolerant and susceptible clones of Coffea canephora var. Conilon, grown under different water regimes. This allowed the isolation of seven additional CGs. The third approach used two-dimensional gel electrophoresis to identify proteins displaying differential accumulation in leaves of drought-tolerant and susceptible clones of C. canephora. Six of them were characterized by MALDI-TOF-MS/MS (matrix-assisted laser desorption-time of flight-tandem mass spectrometry) and the corresponding proteins were identified. Finally, additional CGs were selected from the literature, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) was performed to analyse the expression of all identified CGs. Altogether, >40 genes presenting differential gene expression during drought acclimation were identified, some of them showing different expression profiles between drought-tolerant and susceptible clones. Based on the obtained results, it can be concluded that factors involved a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Candidate gene; Differential expression; Drought acclimation; Proteomic; Proteômica; Real time PCR. |
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Thesagro: |
Café; Coffea Canephora; Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Genetics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 03043naa a2200445 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 33 | |
| 1. |  | DALMONTE, M. A. S.; RAMOS, J. K. M.; OSORIO, A. L. A. R.; MADRUGA, C. R. Prevalencia da Babesia spp em equinos no Estado de Mato Grosso do Sul e Uruguay por imunofluorescencia indireta. In: SEMINARIO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINARIA, 11.; SEMINARIO DE PARASITOLOGIA VETERINARIA DOS PAISES DO MERCOSUL, 2.; SIMPOSIO DE CONTROLE INTEGRADO DE PARASITOS DE BOVINOS, 1., 1999, Salvador. Anais... Ilheus: Colegio Brasileiro de Parasitologia Veterinaria, [1999?]. p.205. CNPGC. Resumo-TL-PB-460.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 2. | | RIBEIRO, L. R. R.; OSÓRIO, A. L. A. R.; SCHENK, M. A. M.; ALMEIDA, R. F. C. Avaliação qualitativa e quantitativa da parasitemia por Trypanosoma vivax em ovinos imunossuprimidos e esplenectomizados. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, 4., 2001, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande, MS: Associação Brasileira de Buiatria, 2001. P. 88| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 3. | | BARBOSA JUNIOR, N. S.; MADRUGA, C. R.; OSÓRIO, A. L. A. R.; RIBEIRO, L. R. R.; ALMEIDA, R. F. C. Descrição de surto de tripanossomose bovina por Trypanosoma vivax, com ocorrência de morte perinatal no Pantanal de Aquidauana, MS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BUIATRIA, 4., 2001, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande, MS: Associação Brasileira de Buiatria, 2001. p. 135| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | RUSSI, L. dos S.; ARAUJO, F. R.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. dos S.; RAMOS, C. A. do N.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O. Atualização em tuberculose bovina. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 11 p. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado técnico, 121).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | NASCIMENTO, R. K. do; KUNINARI-NASCIMENTO, R.; SOUZA, I. I. F.; MATIDA, E. T.; OSÓRIO, A. L. A. R.; ARAUJO, F. R.; VERBISCK, N. V. Aplicação de espectrometria de massas MALDI-TOF para a identificação de microrganismos e diagnóstico em sanidade animal. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 8., 2012, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2012. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 198).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | MELO, E. S. P.; SOUZA, I. I. F.; RAMOS, C. A. M.; OSÓRIO, A. L. A. R.; VERBISCK, N. V.; ARAUJO, F. R. Evaluation of the use of recombinant proteins of Mycobacterium bovis as antigens in intradermal tests for diagnosis of bovine tuberculosis. Archivos de Medicina Veterinaria, v. 47, n.3, p. 73-280, Valdivia 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | FARIAS, T. de A.; ARAUJO, F. R.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. dos S. G.; AZAMBUJA, A.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O. Produção e caracterização de MPB70 de Mycobacterium bovis para uso em imunodiagnóstico. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 6 p. (Embrapa Gado de Corte. Comunicado técnico, 119)| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | FIGUEIREDO, A. O.; PELLEGRIN, A. O.; GONÇALVES, V. S. P.; FREITAS, E. B.; MONTEIRO, L. A. R. C.; OLIVEIRA, J. M.; OSÓRIO, A. L. A. R. Prevalência e fatores de risco para a leptospirose em bovinos de Mato Grosso do Sul. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 29, n.5, p. 375-381, maio, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 9. | | CAZOLA, D de O.; JORGE, K. dos S. G.; ZUMÁRRAGA, M. J.; SOUZA-FILHO, A. F.; ARAUJO, F. R.; OSÓRIO, A. L. A. R. Identificação e genotipagem de Mycobacterium bovis em bovinos positivos no teste intradérmico para tuberculose em Mato Grosso do Sul1. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 35, n. 2, 141-147, fevereiro 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | CAZOLA, D. de O.; JORGE, K. dos S. G.; ZUMÁRRAGA, M J.; SOUZA-FILHO, A. F.; ARAUJO, F. R.; OSÓRIO, A. L. A. R. Identificação e genotipagem de Mycobacterium bovis em bovinos positivos no teste intradérmico para tuberculose em Mato Grosso do Sul. Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n.2, p. 41-147, fev. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | RAMOS, C. A. N.; ARAUJO, F. R.; OSÓRIO, A. L. A. R.; MADRUGA, C. R.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O.; ELISEI, C. Transcrição de genes de proteínas de membrana de isolados brasileiros de Anaplasma marginale. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 16, n. 3, p. 152-155, jul./set. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | MELO, E. S. P.; SOUZA, I. I. F.; RAMOS, C. A. N.; OSÓRIO, A. L. A. R.; NASCIMENTO, V. A.; ARAUJO, F. R. Teste intradérmico com proteínas recombinantes de Mycobacterium bovis como antígenos em Cavia porcellus. Pesquisa Veterinária Brasileira, v.34, n. 10, p. 957-962, outubro 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | OSÓRIO, A. L. A. R.; MADRUGA, C. R.; DESQUESNES, M.; SOARES, C. O.; RIBEIRO, L. R. R.; COSTA, S. C. G. da. Trypanosoma (Duttonella) vivax: its biology, epidemiology, pathogenesis, and introduction in the New World - A review. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 103, n. 1, p. 1-13, Feb., 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 15. | | MENESES, I. I. F. de S.; MELO, E. S. P.; RAMOS, C. A. N.; Osório, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; VIDAL, C. E. S.; SILVA, A. S.; SILVA, M. R.; PELLEGRIN, A. O.; ARAUJO, F. R. Avaliação de proteínas recombinantes para detecção de anticorpos contra Mycobacterium bovis por ELISA. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011. P. 32-33.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 16. | | SOUZA, I. I. F.; MELO, E. S. P.; RAMOS, C. A. N.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; VIDAL, C. E. S.; SILVA, A. S.; SILVA, M. R.; PELLEGRIN, A. O.; ARAUJO, F. R. Avaliação de proteínas recombinantes para detecção de anticorpos contra Mycobacterium bovis por ELISA In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 17. | | MELO, E. S. de P.; SOUZA, I. I. F.; RAMOS, C. A. N.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; ROSA, P. M. G.; RUSSI, L. S.; FARIAS, T. A.; ARAUJO, F. R. Avaliação preliminar de proteínas recombinantes de Mycobacterium bovis em teste de tuberculinização intradérmica em cobaios (Cavia porcellus). In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | FARIAS, T. A.; ARAUJO, F. R.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; RAMOS, C. A. N.; SOUZA, I. I. F.; OLIVEIRA, R. H. M. de; AZAMBUJA, A.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O.; ELISEI, C. ELISA based on recombinant MPB70 to detect antibodies to Mycobacterium bovis. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1., 2009, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 19. | | FARIAS, T. A.; ARAUJO, F. R.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; RAMOS, C. N. A.; SOUZA, I. I. F.; AZAMBUJA, A.; SOARES, C. O.; SILVA, M. R.; PELLEGRIN, A. O. ELISA based on recombinant MPB70 and p27 for detection of antibodies against Mycobacterium bovis. Revista de Patologia Tropical, v. 41, n. 2, p. 155-162, abr-jun., 2012. Título em português: ELISA baseado em MPB70 e p27 recombinantes para detecção de anticorpos contra Mycobacterium bovis.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pantanal. |
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| 20. | | SOUZA-FILHO, A. F. de; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. dos S. G.; ARAUJO, F. R.; VIDAL, C. E. S.; ARAÚJO, C. P.; ALBERTTI, L. A. G.; CAZOLA, D. de O.; FERREIRA NETO, J. S.; HEINEMANN, M. B. Genetic profiles of Mycobacterium bovis from a cattle herd in southernmost Brazil. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 37, n. 5, suplemento 2, p. 3719-3726, 2016 Título em português: Perfis genéticos de Mycobacterium bovis em um rebanho bovino no extremo sul do Brasil.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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