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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
08/11/2024 |
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Data da última atualização: |
08/11/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARVALHO, I. C. B.; CARVALHO, A. M. S.; WENDLAND, A.; ROSSATO, M. |
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Afiliação: |
IAN C. BISPO CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALICE MARIA SILVA CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ADRIANE WENDLAND FERREIRA, CNPAF; MAURICIO ROSSATO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
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Título: |
Colorimetric LAMP assay for detection of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in cassava through genomics: a new approach to an old problem. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Disease, v. 108, n. 10, p. 2993-3000, Oct. 2024. |
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ISSN: |
1943-7692 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1094/PDIS-08-23-1507-RE |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial blight caused by Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) is considered the main bacterial disease that affects cassava, causing significant losses when not properly managed. In the present study, a fast, sensitive, and easy-to-apply method to detect Xpm via colorimetric loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was developed. To ensure the use of a unique-to-the-target pathovar core region for primer design, 74 complete genomic sequences of Xpm together with different bacterial species and pathovars were used for comparative genomics. A total of 42 unique genes were used to design 27 LAMP primer sets, from which nine primers were synthesized, and only one (Xpm_Lp1 primer set) showed sufficient efficiency in preliminary tests. The sensitivity, assessed by a serial dilution of the type strain (IBSBF 278) DNA, yielded high sensitivity, detecting up to 100 fg. The LAMP primers showed high specificity, did not cross-react with other bacterial species or other pathovars tested, and amplified only the Xpm isolates. Tests confirmed the high efficiency of the protocol using infected or inoculated macerated cassava leaves without the need for additional sample treatment. The LAMP test developed in this study was able to detect Xpm in a fast, simple, and sensitive way, and it can be used to monitor the disease under laboratory and field conditions. |
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Palavras-Chave: |
Bacterial blight; Xanthomonas phaseoli pv manihotis. |
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Thesagro: |
Mandioca; Xanthomonas Phaseoli. |
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Thesaurus Nal: |
Bacterial diseases of plants; Cassava; Comparative genomic hybridization; Genomics; Loop-mediated isothermal amplification. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
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650 $aBacterial diseases of plants
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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| 2. |  | CORDEIRO, L. A. M.; KLUTHCOUSKI, J.; SILVA, J. R.; ROJAS, D. C.; OMOTE, H. de S. G.; MORO, E.; SILVA, P. C. G.; TIRITAN, C. S.; LONGEN, A. Integração Lavoura-Pecuária em Solos Arenosos: estudo de caso da Fazenda Campina no Oeste Paulista. Planaltina, DF : Embrapa Cerrados, 2020. 127 p. (Embrapa Cerrados. Documentos, 357).| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 3. | | BARIONI JUNIOR, W.; MACHADO, C. G. DE C. F.; PARANHOS, N. E.; OMOTE, H. de S. G.; GUIMARAES, E. da S.; BERNARDI, A. C. de C.; VINHOLIS, M. de M. B.; TONATO, F. Experiência da Embrapa Pecuária Sudeste na identificação eletrônica de animais por rádio frequência. In: BASSOI, L. H.; BERNARDI, A. C. de C.; VAZ, C. M. P.; PIRES, J. L. F.; GEBLER, L.; JORGE, L. A. de C.; INAMASU, R. Y. (ed.). Agricultura de Precisão - um novo olhar na era digital. São Carlos, SP: Editora Cubo, 2024. cap. 73. p. 673-684.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 4. | | FANTATTO, R. R.; DOMINGUES, L. F.; FEITOSA, K. A.; GONÇALVES, T. C.; BRANDAO, H. de M.; SILVA, L. P. da; OMOTE, H. de S. G.; JACOB, R. G.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. Avaliação de formulações a base de substâncias isoladas e quimicamente modificadas de plantas sobre Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 112| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | FANTATTO, R. R.; DOMINGUES, L. F.; FEITOSA, K. A.; GONÇALVES, T. C.; BRANDAO, H. de M.; SILVA, L. P. da; OMOTE, H. de S. G.; JACOB, R. G.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S. Avaliação de formulações a base de substâncias isoladas e quimicamente modificadas de plantas sobre Rhipicephalus (Boophilus) microplus. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 112| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 6. | | ZIMMER, A. H.; SALTON, J. C.; BALBINOT JUNIOR, A. A.; FRANCHINI, J. C.; PORFIRIO-DA-SILVA, V.; SANTAROSA, E.; BERNARDI, A. C. de C.; GARCIA, A. R.; BUNGENSTAB, D. J.; OMOTE, H. de S. G.; DEBIASI, H.; SOUZA FILHO, H. M. de; PEZZOPANE, J. R. M.; VINHOLIS, M. de M. B.; CARRER, M. J.; GUERREIRO, M. F. Sistemas ILPF e transferência de tecnologia nos estados do Mato Grosso do Sul, Paraná e São Paulo. In: SKORUPA, L. A.; MANZATTO, C. V. (Ed.). Sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta no Brasil: estratégias regionais de transferência de tecnologia, avaliação da adoção e de impactos. Brasília: DF, Embrapa, 2019. p. 234-280| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Florestas; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 7. | | ZIMMER, A. H.; SALTON, J. C.; BALBINOT JUNIOR, A. A.; FRANCHINI, J. C.; SILVA, V. P. da; SANTAROSA, E.; BERNARDI, A. C. de C.; GARCIA, A. R.; BUNGENSTAB, D. J.; OMOTE, H. de S. G.; DEBIASI, H.; SOUZA FILHO, H. M. de; PEZZOPANE, J. R. M.; VINHOLIS, M. de M. B.; CARRER, M. J.; GUERREIRO, M. F. Sistemas ILPF e transferência de tecnologia nos estados do Mato Grosso do Sul, Paraná e São Paulo. In: SKORUPA, L. A.; MANZATTO, C. V. (Ed.). Sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta no Brasil: estratégias regionais de transferência de tecnologia, avaliação da adoção e de impactos. Brasília, DF: Embrapa, 2019. p. 234-280.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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