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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
14/09/2012 |
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Data da última atualização: |
25/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. J. de; RESENDE, M. D. V. de; SANTOS, V. da S.; FERREIRA, C. F.; OLIVEIRA, G. A. F.; SILVA, M. S. da; OLIVEIRA, L. A. de; VILDOSO, C. I. A. |
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Afiliação: |
EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; VANDERLEI DA SILVA SANTOS, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; GILMARA ALVARENGA FACHARDO OLIVEIRA, UFRB; MAIANE SUZARTE DA SILVA, UFRB; LUCIANA ALVES DE OLIVEIRA, CNPMF; CARLOS IVAN AGUILAR VILDOSO, CNPQ. |
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Título: |
Genome-wide selection in cassava. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Euphytica, jun. 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The main objective of this study was to estimate the selection accuracy and to predict the genetic gain in cassava breeding using genomic selection methodologies. We evaluated 358 cassava genotypes for the following traits: shoot weight (SW), fresh root yield (FRY), starch fraction amylose content (AC), dry matter content (DMC), and starch yield (S-Y). Genotyping was performed using 390 single nucleotide polymorphisms (SNPs), which were used as covariates in the random regression-best linear unbiased prediction model for genomic selection. The heritability values detected by markers for the SW, FRY, AC, DMC, and S-Y traits were 0.25, 0.25, 0.03, 0.20, and 0.26, respectively. Because the low heritability detected for AC, this trait was eliminated from further analysis. Using only the most informative SNPs (118, 92, 56, and 97 SNPs for SW, FRY, DMC, and S-Y, respectively) we observed higher selection accuracy which were 0.83, 0.76, 0.67, and 0.77, respectively to SW, FRY, DMC, and S-Y. With these levels of accuracy and considering a selection cycle reduced by half the time, the theoretical gains with genomic selection compared to phenotypic selection for DMC, FRY, and SW would be 39.42 %, 56.90 %, and 73.96 %, espectively. These results indicate that in the cassava, genomic selection can substantially speed up selection cycles, thereby increasing gains per unit time. Although there are high expectations for incorporating this strategy into breeding programs, we still need to validate the model for other traits and evaluate whether the selection accuracy can be improved using more SNPs. MenosThe main objective of this study was to estimate the selection accuracy and to predict the genetic gain in cassava breeding using genomic selection methodologies. We evaluated 358 cassava genotypes for the following traits: shoot weight (SW), fresh root yield (FRY), starch fraction amylose content (AC), dry matter content (DMC), and starch yield (S-Y). Genotyping was performed using 390 single nucleotide polymorphisms (SNPs), which were used as covariates in the random regression-best linear unbiased prediction model for genomic selection. The heritability values detected by markers for the SW, FRY, AC, DMC, and S-Y traits were 0.25, 0.25, 0.03, 0.20, and 0.26, respectively. Because the low heritability detected for AC, this trait was eliminated from further analysis. Using only the most informative SNPs (118, 92, 56, and 97 SNPs for SW, FRY, DMC, and S-Y, respectively) we observed higher selection accuracy which were 0.83, 0.76, 0.67, and 0.77, respectively to SW, FRY, DMC, and S-Y. With these levels of accuracy and considering a selection cycle reduced by half the time, the theoretical gains with genomic selection compared to phenotypic selection for DMC, FRY, and SW would be 39.42 %, 56.90 %, and 73.96 %, espectively. These results indicate that in the cassava, genomic selection can substantially speed up selection cycles, thereby increasing gains per unit time. Although there are high expectations for incorporating this strategy into breeding programs, we still need to v... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Manihot esculenta Crantz. |
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Thesaurus Nal: |
breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 8 | |
| 2. |  | OLIVEIRA, B. M. de; BASSINELLO, P. Z.; NEVES, P. C.; MATSUSHIGE, I.; BRAZACA, S. G. C. Níveis de ferro e zinco e retenção mineral de arroz integral e polido após cozimento. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 43. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Pôster - graduação.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 3. | | NUNES IRMÃO, J.; FIGUEIREDO, M. P. de; PEREIRA, L. G. R.; FERREIRA, J. Q.; RECH, J. L.; OLIVEIRA, B. M. de. Composição química do feno da parte aérea da mandioca em diferentes idades de corte. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 9, n. 1, p. 158-169, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 4. | | BASSINELLO, P. Z.; OLIVEIRA, B. M. de; NEVES, P. C.; MATSUSHIGE, I.; BRAZACA, S. G. C.; CARVALHO, J. L. V. de. Perfil de biodisponibilidade indireta de zinco e ferro de diferentes genótipos de arroz para seleção destinada à biofortificação. In: REUNIÃO DE BIOFORTIFICAÇÃO NO BRASIL, 5., 2015, São Paulo. Anais... Brasília, DF: Embrapa; Rio de Janeiro: Embrapa Agroindústria de Alimentos, 2015. p. 78-81. T 215. Editora técnica: Marília Regini Nutti. Título equivalente: Zinc and iron indirect bioavailability profile of different rice genotypes for biofortification selection.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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| 5. | | BASSINELLO, P. Z.; OLIVEIRA, B. M. de; NEVES, P. C.; MATSUSHIGE, I.; BRAZACA, S. G. C.; CARVALHO, J. L. V. de. Perfil de biodisponibilidade indireta de zinco e ferro de diferentes genótipos de arroz para seleção destinada à biofortificação. In: REUNIÃO DE BIOFORTIFICAÇÃO NO BRASIL, 5., 2015, São Paulo. [Anais]... Brasília, DF: Embrapa; Rio de Janeiro: Embrapa Agroindústria de Alimentos, 2015. p. 78-81. Editora técnica: Marília Regini Nutti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 6. | | BASSINELLO, P. Z.; OLIVEIRA, B. M. de; NEVES, P. C.; MATSUSHIGE, I.; BRAZACA, S. G. C.; CARVALHO, J. L. V. de. Potencial de diferentes genótipos de arroz para fins de biofortificação em ferro e zinco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS, 24.; CONGRESSO DO INSTITUTO NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE FRUTOS TROPICAIS, 4., 2014, Aracaju. Inovação e sustentabilidade em ciência e tecnologia de alimentos: resumos. Aracaju: SBCTA, 2014. p. 343.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 7. | | ABREU, F. R. M.; SIQUEIRA, F. C. de J.; OLIVEIRA, B. M. de; SILVA, M. A. S. da; CARVALHO, M. T. de M. Dinâmica do nitrato, amônio e potencial hidrogeniônico em resposta a diferentes fontes de nitrogênio na cultura do feijoeiro comum irrigado em SPD. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 10., 2011, Goiânia. Anais... Goiânia: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. 1 CD-ROM. CONAFE.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 8. | | BOBOT, T. da E.; FRANKLIN, E.; FERREIRA, D. N. M.; GASNIER, T. R. J.; LOFEGO, A. C.; OLIVEIRA, B. M. de. Mites (Arachnida, Acari) on Citrus sinensis L. Osbeck orange trees in the State of Amazonas, Northern Brazil. Acta Amazonica, v. 41, n. 4, p. 557-566, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 8 | |
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