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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
27/04/2011 |
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Data da última atualização: |
29/04/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MARTINS, P. K.; MAFRA, V. S.; KISHI, L. T.; FREITAS-ASTUA, J. |
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Afiliação: |
Polyanna Kelly Martins, APTA; Valéria S. Mafra, APTA; Luciano T. Kishi, APTA; JULIANA DE FREITAS ASTUA, CNPMF. |
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Título: |
Phylogenetic and comparative gene expression analysis of citrus WRKY transcription factor family. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 3, 2011, Ilhéus. Resumos. [S. l.]: Sociedade Brasileira de Genética, 2011. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
pdf 35130 |
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Conteúdo: |
Plants have a variety of active defense mechanisms to protect themselves from pathogen infection. Plant defense response results from the transcriptional activation of a large number of genes upon pathogen infection or treatment with pathogen elicitors. Among them, WRKY proteins are considered important transcriptional regulators in defense signaling, including the activation of SAR (systemic acquired resistance). Several genes regulating plant defense, such as NPR1 and PR (Pathogenesis-related proteins), have W-box elements in their promoters that are specifically recognized by WRKY proteins also required for induction or expression. The defining feature of WRKY transcription factors is their DNA binding domain. The WRKY domain is about 60 residues in length that contains the WRKY signature and also an atypical zinc-finger structure at the C-terminus (Cx4?5Cx22?23HxH or Cx7Cx23HxC). The aim of this work was to identify all potential WRKY transcription factors in citrus, retrieved from the CitEST (Citrus ESTs) database and to construct a phylogenetic tree with orthologs from Arabidopsis thaliana and Oryza sativa. To find ESTs coding for WRKY proteins in citrus we performed a tBLASTn search on the CitEST database. The WRKY domain sequences of seven Arabidopsis WRKY family members each representing one of the WRKY subgroups were used as query sequences. Phylogenetic tree were constructed by the neighbor-joining (NJ) method in MEGA 4. NJ analysis was performed with the Pairwise Deletion option and the Poisson correction. For statistical reliability, bootstrap analysis was conducted with 1,000 replicates to assess statistical support for each node. The primary search resulted in 71 non-redundant hits, of which 9 were removed as they did not contain the conserved WRKY domain signature. The remaining 62 sequences were used to construct the phylogenetic tree; this analysis identified 19 unigenes for the group 1; 6 unigenes for the subgroup 2a, 3 unigenes for the subgroup 2b, 12 unigenes for the subgroup 2c, 13 unigenes for the group 2d, 9 unigenes for subgroup 2e and 7 unigenes for the group 3. To complete the phylogenetic analysis, WRKY sequences from the draft sequencing of the genomes of Citrus clementina and C. sinensis will be included. We are particularly interested in WRKY proteins involved in biotic stress, so the next step will be to evaluate the transcriptional profile of some WRKY genes under different biotic stress conditions. This study will be crucial to select candidates for citrus genetic transformation. MenosPlants have a variety of active defense mechanisms to protect themselves from pathogen infection. Plant defense response results from the transcriptional activation of a large number of genes upon pathogen infection or treatment with pathogen elicitors. Among them, WRKY proteins are considered important transcriptional regulators in defense signaling, including the activation of SAR (systemic acquired resistance). Several genes regulating plant defense, such as NPR1 and PR (Pathogenesis-related proteins), have W-box elements in their promoters that are specifically recognized by WRKY proteins also required for induction or expression. The defining feature of WRKY transcription factors is their DNA binding domain. The WRKY domain is about 60 residues in length that contains the WRKY signature and also an atypical zinc-finger structure at the C-terminus (Cx4?5Cx22?23HxH or Cx7Cx23HxC). The aim of this work was to identify all potential WRKY transcription factors in citrus, retrieved from the CitEST (Citrus ESTs) database and to construct a phylogenetic tree with orthologs from Arabidopsis thaliana and Oryza sativa. To find ESTs coding for WRKY proteins in citrus we performed a tBLASTn search on the CitEST database. The WRKY domain sequences of seven Arabidopsis WRKY family members each representing one of the WRKY subgroups were used as query sequences. Phylogenetic tree were constructed by the neighbor-joining (NJ) method in MEGA 4. NJ analysis was performed with the Pairwise... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
CitEST; SAR; W-box. |
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Thesaurus Nal: |
Citrus; transcription factors. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 34 | |
| 5. |  | OLIVEIRA, D. M.; HAGEN, S. C.; SANTOS, A. C.; MIGLINO, M. A.; ASSIS NETO, A. C. Noninvasive evaluation of respiratory muscles in pre-clinical model of Duchenne Muscular Dystrophy. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 36, n. 4, p. 290-296, abr. 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 7. | | LOBO, R. N. B.; BARBOSA NETO, A. C.; FACO, O.; OLIVEIRA, S. M. P. de. Desempenhos produtivos de cruzamentos de ovinos das raças Santa Inês, Somalis Brasileira, Dorper e Poll Dorset no Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 45., 2008, Lavras. Biotecnologia e sustentabilidade: anais. Brasília, DF: SBZ; Lavras: UFLA, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 9. | | BARBOSA NETO, A. C.; OLIVEIRA, S. M. P. de; FACO, O.; LOBO, R. N. B. Efeitos genéticos aditivos e não-aditivos em características de crescimento, reprodutivas e habilidade materna em ovinos das raças Santa Inês, Somalis Brasileira, Dorper e Poll Dorset. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 39, n. 9, p. 1943-1951, 2010. Título em inglês: Additive and non-additive genetic effects on growth, reproductive and maternal traits in sheep of Santa Ines, Brazilian Somali, Dorper and Poll Dorset breeds.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 10. | | MEDEIROS, J. G. F.; SILVA, B. B. da; ARAÚJO NETO, A. C.; NASCIMENTO, L. C. do. Fungos associados com sementes de flamboyant-mirim (Caesalpinia pulcherrima): incidência, efeito na germinação, transmissão e controle. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 32, n. 71, p. 303-308, jul./set. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 11. | | MARCHESE, A.; MALUF, W. R.; GONÇALVES NETO, A. C.; GONÇALVES, R. J. de S.; GOMES, L. A. A. Seleção de clones de batata-doce resistentes a Meloidogyne incognita raça 1. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 45, n. 9, p. 997-1004, set. 2010 Título em inglês: Selection of sweetpotato clones resistant to Meloidogyne incognita race 1| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | BARBOSA, S. B. P.; PEREIRA, R. G. de A.; SANTORO, K. R.; BATISTA, A. M. V.; RIBEIRO NETO, A. C. Milk yield of cross-bred buffalo under two production systems in the Amazonian region of Brazil. Italian Journal of Animal Science, v. 6, Supl. 2, p. 1071-1074, 2007. Proceedings do VIII World Buffalo Congress, 2007, Caserta.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 14. | | ARIOLI, C. J.; ROSA, J. M. da; BOTTON, M.; SANTOS, J. P. dos; MENEZZES NETO, A. C.; NAVA, D. E. Como combater mosca-das-frutas em pomares domésticos? In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL CIÊNCIA, SAÚDE E TERRITÓRIO, 3., COLÓQUIO DE EDUCAÇÃO PERMANENTE, 2., 2015, Lages. ANAIS... Saúde no ambiente rural e urbano. Lages: Uniplac, 2015. p. 320-325, Artigo 24762.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 15. | | BARBOSA, S. B. P.; PEREIRA, R. G. de A.; SANTORO, K. R.; BATISTA, A. M. V.; RIBEIRO NETO, A. C. Lactation curve of cross-bred buffalo under two production systems in the Amazonian region of Brazil. Italian Journal of Animal Science, v. 6, Supl. 2, p. 1075-1078, 2007. Proceedings do VIII World Buffalo Congress, 2007, Caserta.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 16. | | ANDRADE NETO, A. C. de; SALMAN, A. K. D.; CIPRIANI, H. N.; SOUZA, E. C.; CRUZ, P. G. da. Índice de qualidade do solo sob sistemas de produção pecuária-floresta em Porto Velho, Rondônia. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 14., Porto Velho. Anais [...]. Porto Velho, RO: Embrapa Rondônia, 2024. p. 63-66. (Embrapa Rondônia. Eventos Técnicos, 02).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Florestas; Embrapa Rondônia. |
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| 17. | | GONÇALVES NETO, A. C.; MALUF, W. R.; GOMES, L. A. A.; GONÇALVES, R. J. de S.; SILVA, V. de F.; LASMAR, A. Aptidões de genótipos de batata-doce para consumo humano, produção de etanol e alimentação animal. Pesquisa agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 11, p. 1513-1520, nov. 2011 Título em inglês: Aptitudes of sweet potato genotypes for fresh consumption, ethanol production and animal feed.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 18. | | FEITOSA, L. H. R.; OLIVEIRA NETO, A. C. de; VOGADO, R. F.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; LEITE, L. F. C.; SOUZA, H. A. de. Adubação nitrogenada e Azospirillum brasilense na cultura do milho nas condições edafoclimáticas de Teresina. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 3., 2017, Teresina. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2017. p. 20.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido. |
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| 19. | | SILVA, V. de F.; MALUF, W. R.; CARDOSO, M. das G.; GONÇALVES NETO, A. C.; MACIEL, G. M.; NÍZIO, D. A. C.; SILVA, V. A. Resistência mediada por aleloquímicos de genótipos de tomateiro à mosca-branca e ao ácaro-rajado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 10, p. 1262-1269, out. 2009. Título em inglês: Resistance mediated by alelochemicals of tomato genotypes to the silverleaf whitefl y and to two-spotted spider mites.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 20. | | OLIVEIRA NETO, A. C. de; SILVA, G. S. F.; MONÇÃO FILHO, A. R.; ARAUJO NETO, R. B. de; CARDOSO, M. J.; ANDRADE JUNIOR, A. S. de. Diferentes densidades de B. ruziziensis consorciadas com duas cultivares de diferentes densidades de B. ruziziensis consorciadas com duas cultivares de milho no leste maranhense. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 4., 2018, Teresina, PI. Anais da IV Jornada Científica da Embrapa Meio-Norte. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 32.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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