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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
11/10/2016 |
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Data da última atualização: |
03/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PANTALIÃO, G. F.; NARCISO, M.; GUIMARÃES, C.; CASTRO, A.; COLOMBARI, J. M.; BRESEGHELLO, F.; RODRIGUES, L.; VIANELLO, R. P.; BORBA, T. O.; BRONDANI, C. |
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Afiliação: |
GABRIEL FERESIN PANTALIÃO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPAF; CLEBER MORAIS GUIMARAES, CNPAF; ADRIANO PEREIRA DE CASTRO, CNPAF; JOSE MANOEL COLOMBARI FILHO, CNPAF; FLAVIO BRESEGHELLO, CNPAF; LUANA ALVES RODRIGUES, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF. |
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Título: |
Genome wide association study (GWAS) for grain yield in rice cultivated under water deficit. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetica, v. 144, n. 6, p. 651-664, Dez. 2016. |
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DOI: |
10.1007/s10709-016-9932-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The identification of rice drought tolerant materials is crucial for the development of best performing cultivars for the upland cultivation system. This study aimed to identify markers and candidate genes associated with drought tolerance by Genome Wide Association Study analysis, in order to develop tools for use in rice breeding programs. This analysis was made with 175 upland rice accessions (Oryza sativa), evaluated in experiments with and without water restriction, and 150,325 SNPs. Thirteen SNP markers associated with yield under drought conditions were identified. Through stepwise regression analysis, eight SNP markers were selected and validated in silico, and when tested by PCR, two out of the eight SNP markers were able to identify a group of rice genotypes with higher productivity under drought. These results are encouraging for deriving markers for the routine analysis of marker assisted selection. From the drought experiment, including the genes inherited in linkage blocks, 50 genes were identified, from which 30 were annotated, and 10 were previously related to drought and/or abiotic stress tolerance, such as the transcription factors WRKY and Apeta-la2, and protein kinases. |
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Palavras-Chave: |
Genotyping by sequencing; Rice core collection. |
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Thesagro: |
Arroz; Deficiência hídrica; Oryza sativa; Relação água-planta. |
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Thesaurus Nal: |
Plant-water relations; Rice; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 2. |  | MEIRELLES, W. C. L. Informática. In: EMBRAPA. Centro de Nacional de Pesquisa de Milho e Sorgo. Relatório técnico anual do Centro Nacional de Pesquisa de Milho e Sorgo: período 1992-1993. Sete Lagoas, 1994. p. 330.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 4. | | OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; OLIVEIRA, M. C.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; CASTRO, C. S. P. DE; BRITO, M. A. V. P. e; COELHO, E. A.; MEIRELLES, W. C. L. Banco de competências: ferramenta de apoio à decisão de capacitação das coleções de microrganismos da Embrapa. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2015 68 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 194).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; OLIVEIRA, M. C. de; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; CASTRO, C. S. P. DE; BRITO, M. A. V. P. e; COELHO, E. A.; MEIRELLES, W. C. L. Banco de competências: ferramenta de apoio à decisão de capacitação das coleções de microrganismos da Embrapa. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2015. 68 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 194).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | MEIRELLES, W. C. L.; ANDRADE, C. de L. T. de; CARNEIRO, N. P.; RESENDE, A. V. de; OLIVEIRA, A. C. de; COELHO, A. M.; KARAM, D.; CRUZ, I.; VIANA, J. H. M.; GUIMARAES, L. J. M.; COTA, L. V.; GONTIJO NETO, M. M.; ALBUQUERQUE, P. E. P. de; GUIMARAES, P. E. de O.; NODA, R. W.; COSTA, R. V. da. Sistema de Integração e Gerenciamento de Dados Experimentais - SisIndex. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2017. 75 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 213).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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