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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
27/09/2022 |
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Data da última atualização: |
27/09/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, N. dos S.; GONIGLIO, A.; PUENTE, M.; SANTANNA, F. H.; MARONICHE, G.; GARCIA, J.; MOLINA, R.; NIEVAS, S.; VOLPIANO, C. G.; AMBROSINI, A.; PASSAGLIA, L. M. P.; PEDRAZA, R. O.; REIS, V. M.; ZILLI, J. E.; CASSAN, F. |
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Afiliação: |
NATÁLIA DOS SANTOS FERREIRA, UFRRJ; ANAHÍ CONIGLIO, Universidad Nacional de Río Cuarto; MARIANA PUENTE, INTA; FERNANDO HAYASHI SANT'ANNA, PROAD-SUS; GUILLERMO MARONICHE, Universidad Nacional de Mar del Plata; JULIA GARCÍA, INTA; ROMINA MOLINA, UNIVERSIDAD NACIONAL DE RIO CUARTO; SOFIA NIEVAS, UNIVERSIDAD NACIONAL DE RIO CUARTO; CAMILA GAZOLLA VOLPIANO, UFGRS; ADRIANA AMBROSINI, UFRGS; LUCIANE M P PASSAGLIA, UFRGS; RAUL O. PEDRAZA, Universidad Nacional de Tucumán; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; JERRI EDSON ZILLI, CNPAB; FABRICIO CASSAN, Universidad Nacional de Río Cuarto. |
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Título: |
Genome-based reclassification of Azospirillum brasilense Az39 as the type strain of Azospirillum argentinense sp. nov. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 72, n. 8, aug. 2022. |
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ISSN: |
1466-5034 |
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DOI: |
0.1099/ijsem.0.005475 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Strain Az39T of Azospirillum is a diazotrophic plant growth-promoting bacterium isolated in 1982 from the roots of wheat plants growing in Marcos Juárez, Córdoba, Argentina. It produces indole-3-acetic acid in the presence of l-tryptophan as a precursor, grows at 20-38 °C (optimal 38 °C), and the cells are curved or spiral-shaped, with diameters ranging from 0.5-0.9 to 1.8-2.2 µm. They contain C16 : 0, C18 : 0 and C18 : 1 ω7c/ω6c as the main fatty acids. Phylogenetic analysis of its 16S rRNA gene sequence confirmed that this strain belongs to the genus Azospirillum, showing a close relationship with Azospirillum baldaniorum Sp245T, Azospirillum brasilense Sp7T and Azospirillum formosense CC-Nfb-7T. Housekeeping gene analysis revealed that Az39T, together with five strains of the genus (Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036), form a cluster apart from A. baldaniorum Sp245T, A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T. Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) between Az39T and the aforementioned type strains revealed values below 96 %, the circumscription limit for the species delineation (ANI: 95.3, 94.1 and 94.0 %; dDDH: 62.9, 56.3 and 55.6 %). Furthermore, a phylogeny evaluation of the core proteome, including 809 common shared proteins, showed an independent grouping of Az39T, Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036. The G+C content in the genomic DNA of these six strains varied from 68.3 to 68.5 %. Based on the combined phylogenetic, genomic and phenotypic characterization presented here, we consider that strain Az39T, along with strains Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036, are members of a new Azospirillum species, for which the name Azospirillum argentinense sp. nov. is proposed. The type strain is Az39T (=LBPCV39T=BR 148428T=CCCT 22.01T). MenosStrain Az39T of Azospirillum is a diazotrophic plant growth-promoting bacterium isolated in 1982 from the roots of wheat plants growing in Marcos Juárez, Córdoba, Argentina. It produces indole-3-acetic acid in the presence of l-tryptophan as a precursor, grows at 20-38 °C (optimal 38 °C), and the cells are curved or spiral-shaped, with diameters ranging from 0.5-0.9 to 1.8-2.2 µm. They contain C16 : 0, C18 : 0 and C18 : 1 ω7c/ω6c as the main fatty acids. Phylogenetic analysis of its 16S rRNA gene sequence confirmed that this strain belongs to the genus Azospirillum, showing a close relationship with Azospirillum baldaniorum Sp245T, Azospirillum brasilense Sp7T and Azospirillum formosense CC-Nfb-7T. Housekeeping gene analysis revealed that Az39T, together with five strains of the genus (Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036), form a cluster apart from A. baldaniorum Sp245T, A. brasilense Sp7T and A. formosense CC-Nfb-7T. Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) between Az39T and the aforementioned type strains revealed values below 96 %, the circumscription limit for the species delineation (ANI: 95.3, 94.1 and 94.0 %; dDDH: 62.9, 56.3 and 55.6 %). Furthermore, a phylogeny evaluation of the core proteome, including 809 common shared proteins, showed an independent grouping of Az39T, Az19, REC3, BR 11975, MTCC4035 and MTCC4036. The G+C content in the genomic DNA of these six strains varied from 68.3 to 68.5 %. Based on the comb... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Proteome core. |
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Thesaurus Nal: |
Azospirillum; Phylogeny. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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| 1. |  | CARNEIRO, J. da C.; MATOS, M. A. C.; LAMARCA, R. S.; VARANDAS, A.; RODRIGUES, J. A. S.; MACHADO, J. C. Avaliação de características químicas de híbridos isogênicos de sorgo com capim sudão normais e mutantes para o gene BMR. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 2. | | LAMARCA, R. S.; ARAUJO, F. N.; MATOS, R. C.; MATOS, M. A. C.; CARNEIRO, J. da C. Determinação dos ácidos acético, butírico, lático e propiônico em amostras de silagem de capim elefante com glycine wightti verde por HPLC. In: ENCONTRO REGIONAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 26., 2012, Ouro Preto. Anais... São Paulo: Sociedade Brasileira de Química, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 4. | | CARNEIRO, J. da C.; MATOS, M. A. C.; SANTOS, M. D. R.; ROCHA, L. O.; RODRIGUES, S. C.; ARAÚJO, F. M. Avaliação de caracteristicas quimicas de Capim Sudão (Sorghum bicolor cv. Bicolor com Sorghum bicolor, cv.Sudanense ) normais e mutantes para o gene BMR. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 5. | | LAMARCA, R. S.; VARANDAS, A. A.; RAMIRO, T. T.; MATOS, M. A. C.; MATOS, R. C.; CARNEIRO, J. da C.; RODRIGUES, J. A. S. Caracterização química de híbridos de sorgo com capim sudão normal e mutante para o gene BMR por HPLC. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 37., 2014, Natal. O papel da Química no cenário econômico atual: competitividade com responsabilidade. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Química, 2014. Resumo QPN 108.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 6. | | SANTOS, M. D. R.; VITOR, A. de P.; CARNEIRO, J. da C.; PACIULLO, D. S. C.; MATOS, R. C.; MATOS, M. A. C. Desenvolvimento de um método de extração por ultra-som para a determinação de ácidos fenólicos em forrageiras tropicais. In: ENCONTRO NACIONAL DE QUÍMICA ANALÍTICA, 15., 2009, Salvador. Anais... Salvador: SBQA, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | LAMARCA, R. S.; ARAUJO, F. M.; SANTOS, M. D. R.; CARNEIRO, J. da C.; MATOS, M. A. C.; RODRIGUES, J. A. S. Determinação dos ácidos ferúlico e p-cumárico em híbridos de sorgo com capim sudão normal e mutante para o gene BMR por HPLC. In: ENCONTRO NACIONAL DE QUÍMICA ANALÍTICA, 16., 2011, Campos do Jordão. Resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Química, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 8. | | DORNELLAS, R. M.; RESENDE, M. F.; SANTOS, M. D. R.; CARNEIRO, J. da C.; PACIULLO, D. S. C.; MATOS, R. C.; MATOS, M. A. C. Determinação amperométrica em fluxo de glicose estrutural em forrageiras tropicais usando reator enzimático. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 31., 2008, Águas de Lindóia. Anais... Águas de Lindoia: SBQ, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | DORNELLAS, R. M.; RESENDE, M. F.; CASTRO, A. E. F. A.; CARNEIRO, J. da C.; PACIULLO, D. S. C.; MATOS, R. C.; MATOS, M. A. C. Determinação de carboidratos estruturais por HPLC com detecção no UV em forrageiras da espécie Brachiaria Brizantha. In: ENCONTRO NACIONAL DE QUÍMICA ANALÍTICA, 15., 2009, Salvador. Anais... Salvador: SBQA, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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