| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
26/03/2009 |
|
Data da última atualização: |
15/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECILIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G. |
|
Afiliação: |
ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; LUIZ CÉSAR BORRO; DANIEL ALVARENGA; PABLO LIRA CECÍLIO; THAÍS VITAL PELLIGRINELLI; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
|
Título: |
Structure descriptors of chameleon sequences. |
|
Ano de publicação: |
2008 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Chile. Program and abstracts... Santiago: Pontificia Universidad Católica de Chile, 2008. |
|
Páginas: |
Não paginado. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
RIB 2008. |
|
Conteúdo: |
It has been know since the early work by Sander and Kabsch in 1984 that some identical sequence motifs make completely different local (but extented) folds. In that work, Sander and Kabsch showed the existence of a number of pentapeptides, capable of nucleating both alpha helix and beta strand in different sequence and structure constellations. However, the authors had at that time a very limited universe on which to base their conclusions; namely, the size of the PDB at that time (1984) was only 154 protein structure available. In 2008 the number of available structure is 51,079 (May 27th), 47137containing proteins only. Consequenly, the database is 306 times larger and we took full advantage of this fact. In order to analyze chameleon sequences, we established very strict rules and considered only those ones that passed the test of consensus among HSSP and STRIDE definitions for the Secondary Structure Elements. This is a major difference in our approach versus that of Sander and Kabsch. We then created a data mart of sequences and respective structures with variable size and subjected them to analysis of structure descriptors stored in STING_RDB. Results are discussed in terms of the influence that a local 3D environment has on SSE necleation. |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Proteinas. |
|
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Proteins. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
Marc: |
LEADER 02073nam a2200265 a 4500
001 1031817
005 2020-01-15
008 2008 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aMANCINI, A. L.
245 $aStructure descriptors of chameleon sequences.$h[electronic resource]
260 $aIn: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Chile. Program and abstracts... Santiago: Pontificia Universidad Católica de Chile$c2008
300 $aNão paginado.
500 $aRIB 2008.
520 $aIt has been know since the early work by Sander and Kabsch in 1984 that some identical sequence motifs make completely different local (but extented) folds. In that work, Sander and Kabsch showed the existence of a number of pentapeptides, capable of nucleating both alpha helix and beta strand in different sequence and structure constellations. However, the authors had at that time a very limited universe on which to base their conclusions; namely, the size of the PDB at that time (1984) was only 154 protein structure available. In 2008 the number of available structure is 51,079 (May 27th), 47137containing proteins only. Consequenly, the database is 306 times larger and we took full advantage of this fact. In order to analyze chameleon sequences, we established very strict rules and considered only those ones that passed the test of consensus among HSSP and STRIDE definitions for the Secondary Structure Elements. This is a major difference in our approach versus that of Sander and Kabsch. We then created a data mart of sequences and respective structures with variable size and subjected them to analysis of structure descriptors stored in STING_RDB. Results are discussed in terms of the influence that a local 3D environment has on SSE necleation.
650 $aBioinformatics
650 $aProteins
653 $aBioinformática
653 $aProteinas
700 1 $aJARDINE, J. G.
700 1 $aMAZONI, I.
700 1 $aBORRO, L. C.
700 1 $aALVARENGA, D.
700 1 $aCECILIO, P. L.
700 1 $aPELLIGRINELLI, T. V.
700 1 $aNESHICH, G.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 15 | |
| 2. |  | MARTINS JUNIOR, A. A. F.; MAJARON, V. F.; POLITO, W. L.; BORTOLETTO-SANTOS, R.; RIBEIRO, C. Desenvolvimento de nanocompósitos à base de poliuretana derivada de óleo de mamona e hidrotalcita para liberação controlada de nutrientes. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 16., 2024, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2024. Coordenadores: Cristiane Sanchez Farinas; Daniel Souza Corrêa; Maria Alice Martins; Maria Fernanda Berlingieri Durigan; Paulo Sérgio de Paula Herrmann Júnior 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
|    |
| 3. | | LEMPP, B.; EZEQUIEL, J. M. B.; SANTOS, J. M. dos; DAMIAO FILHO, C. F.; ZIMMER, A. H.; FAVORETTO, V.; MARTINS JUNIOR, A. P.; FIGUEIREDO, L. F. C. de. Observacao da taxa de digestao das celulas de mesofilo de duas cultivares de Panicum maximum Jacq, aguas e seca. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 35., 1998, Botucatu. Anais... Botucatu: SBZ, 1998. v.2. p.269-271. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 4. | | SUDANO, M. J.; PASCHOAL, D. M.; RASCADO, T. da S.; CROCOMO, L. F.; MAGALHÃES, L. C. O.; MARTINS JÚNIOR, A.; MACHADO, R.; LANDIM-ALVARENGA, F. da C. Crucial surviving aspects for vitrified in vitro-produced bovine embryos. Zygote, v. 20, p. 1-8, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|  |
| 5. | | SUDANO, M. J.; CAIXETA, E. S.; PASCHOAL, D. M.; MARTINS JÚNIOR, A.; MACHADO, R.; BURATINI, J.; LANDIM-ALVARENGA, F. D. C. Cryotolerance and global gene-expression patterns of Bos taurus indicus and Bos taurus taurus in vitroand in vivo-produced blastocysts. Reproduction, Fertility and Development, v. 26, p. 1129-1141,2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 6. | | SUDANO, M. J.; CRESPILHO, A. M.; FERNANDES, C. B.; MARTINS JUNIOR, A.; PAPA, F. O.; RODRIGUES, J.; MACHADO, R.; LANDIM-ALVARENGA, F. da C. Use of Bayesian Inference to correlate in vitro embryo production and in vivo fertility in zebu bulls. Veterinary Medicine International, v.2011, Article ID 436381, 2011. 6 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 7. | | SUDANO, M. J; PASCHOAL, D. M.; GUASTALI, M. D.; MAZIERO, R. R. D.; CROCOMO, L. F.; MAGALHÃES, L. C. O.; MONTEIRO, B. A.; LIMA NETO, J. F.; MARTINS JÚNIOR, A.; MACHADO, R.; LANDIM ALVARENGA, F. da C. Apoptosis in fresh and vitrified in vitro and in vivo produced bovine embryos. Acta Sicentiae veternariae, v. 39 (Suppl. 1), Porto Alegre 2011| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 8. | | SUDANO, M. J.; PASCHOAL, D. M.; MAZIERO, R. R. D.; RASCADO, T. da S.; GUASTALI, M. D.; CROCOMO, L. F.; MAGALHAES, L. C. O.; MONTEIRO, B. A.; MARTINS JUNIOR, A.; MACHADO, R.; LANDIM-ALVARENGA, F. da C. Melhorando a capacidade de sobrevivência após a criopreservação: uma abordagem embrionária. REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE EMBRIÕES, 27., 2013, Praia do Forte. Anais... Praia do Forte, BA: SBTE, 2013. p. 59-66.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 9. | | LEMPP, B.; EZEQUIEL, J. M. B.; SANTOS, J. M. dos; DAMIAO FILHO, C. F.; ZIMMER, A. H.; FAVORETTO, V.; CATTELAN, J. W.; MARTINS JUNIOR, A. P.; FIGUEIREDO, L. F. C. de. Observação da estrutura girder na taxa de digestão dos tecidos em lâminas de Panicum maximum Jacq cv. Aruana e Vencedor. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 34., 1997, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: SBZ, 1997. p. 15-17. Título em inglês: Observation of girder structure on digestion ratios of leaf blades tissues of Panicum maximum Jacq. cv. Aruana and Vencedor.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 10. | | CANCIAN, R.; MACELAI, M.; TAVARES, G.; VALENTE, R. S.; CAIXETA, E. S.; MARTINS JUNIOR, A.; MACHADO, R.; BURATINI, J.; MESQUITA, F. S.; LANDIM-ALVARENGA, F. C.; SUDANO, M. J. Global gene expression pattern of bos indicus and bos taurus vitrified embryos. In: 41st Annual Conference of the International Embryo Transfer Society. Reproduction, Fertility and Development, v. 27, p. 117, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 11. | | LEMPP, B.; EZEQUIEL, J. M. B.; DANTOS, J. M. dos; ZIMMER, A. H.; FAVORETTO, V.; DAMIAO, F. C. F.; CATTELAN, J. W.; FIGUEIREDO, L. F. C.; MARTINS JUNIOR, A. P. Qualitative parameters of two cultivare of Panicum maximum, Jacq. under grazing. In: INTERNATIONAL GRASSLAND CONGRESS, 18., 1997, Winnipeg, Saskatoon. Proceedings... [S.l.: s.n., 1997?]. p. 17-57 / 17-58. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 12. | | SUDANO, M. J.; PASCHOAL, D. M.; MAZIERO, R. R. D.; RASCADO, T. S.; GUASTALI, M. D.; CROCOMO, L. F.; MAGALHÃES, L. C. O.; MONTEIRO, B. A.; MARTINS JUNIOR, A.; MACHADO, R.; LANDIM-ALVARENGA, F. D. C. Improving posteryopreservation survival capacity: an embryo approach. In: 27th Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE). Animal Reproduction, v.10, n.3, p.368, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 13. | | SUDANO, M. J.; PASCHOAL, D. M.; CAIXETA, E. S.; SANTOS, V. G.; TATA, A.; FERREIRA, C. R.; MARTINS JUNIOR, A.; MACHADO, R.; EBERLIN, M. N.; BURATINI JUNIOR, J.; LANDIM-ALVARENGA, F. Cryotolerance of Bos taurus indicus and Bos taurus taurus in vitro and in vivo produced embryos. In: 26th Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE). Animal Reproduction, v. 9, n. 3, p. 677, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 14. | | SUDANO, M. J.; CAIXETA, E. S.; PASCHOAL, D. M.; RASCADO, T. S.; CROCOMO, L. F.; MAZIERO, R. R.; MAGALHÃES, L. C. O.; GUASTALI, M. D.; VERGARA, L. E.; MONTEIRO, B. A.; MARTINS JUNIOR, A.; MACHADO, R.; BURATINI, J.; LANDIN-ALVARENGA, F. C. Global gene expression patterns of fresh and vitrified in vitro-produced bovine blastocysts. In: Reproduction, Fertility and Development, p. 187, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 15. | | SUDANO, M. J.; PASCHOAL, D. M.; CAIXETA, E. S.; MAZIERO, R. R. D.; GUASTALI, M. D.; CROCOMO, L. F.; RASCADO, T. S.; MAGALHÃES, L. C. O.; MONTEIRO, B. A.; MARTINS JÚNIOR, A.; MACHADO, R.; BURATINI, J.; LANDIM-ALVARENGA, F. D. C. Effect of high fetal calf serum concentration in the gene expression pattern of in vitro produced bovine embryos. Reproduction, Fertility and Development, v. 26, p. 155, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| Registros recuperados : 15 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
