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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
07/11/2022 |
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Data da última atualização: |
07/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MATOS, M. K. da S.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BEZERRA-NETO, J. P.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; WANG, Y.; LIU, H.; PANDOLFI, V.; AMORIM, L. L. B.; WILLADINO, L.; AMORIM, T. C. do V.; KIDO, E. A.; VIANELLO, R. P.; TIMKO, M. P.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. |
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Afiliação: |
MITALLE KAREN DA SILVA MATOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ANA MARIA BENKO-ISEPPON, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOAO PACIFICO BEZERRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOSE RIBAMAR COSTA FERREIRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; YU WANG, UNIVERSITY OF VIRGINA; HAI LIU, UNIVERSITY OF VIRGINIA; VALESCA PANDOLFI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LIDIANE LINDINALVA BARBOSA AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LILIA WILLADINO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; THIALISSON CAACI DO VALE AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; EDERSON AKIO KIDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; MICHAEL P. TIMKO, UNIVERSITY OF VIRGINIA; ANA CHRISTINA BRASILEIRO-VIDAL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO. |
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Título: |
The WRKY transcription factor family in cowpea: Genomic characterization and transcriptomic profiling under root dehydration. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Gene, v. 823, 146377, May 2022. |
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ISSN: |
0378-1119 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146377 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress response, the data provide a foundation for the targeted modification of specific VuWRKY family members to improve drought tolerance in this important climate-resilient legume in the developing world and beyond. MenosCowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
QPCR; RNA-Seq. |
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Thesagro: |
Seca; Vigna Unguiculata. |
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Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Cowpeas; Drought tolerance; Gene expression. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 40 | |
| 10. |  | MARTINS, E.; MARTINS, V. M. V.; RIET-CORREA, F.; SONCINI, R. A.; PARABONI, S. V. Intoxicação em suínos pela ingestão de sementes de fedegoso (Cassia ocidentalis L.) In: CONGRESSO LATINO DE VETERINARIOS ESPECIALISTAS EM SUINOS, 1., CONGRESSO BRASILEIRO DE VETERINARIOS ESPECIALISTAS EM SUINOS, 2., 1985, Rio de Janeiro. Anais... Concordia : EMBRAPA-CNPSA, 1985. p.146| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 13. | | COELHO, M. R.; VIDAL-TORRADO, P.; MARTINS, V. M.; OTERO PÉREZ, X. L.; MACÍAS VÁZQUEZ, F. Avaliação de cloretos não tamponados como extratores de alumínio associado à matéria orgânica em Espodossolos do estado de São Paulo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia. Solos nos biomas brasileiros: sustentabilidade e mudanças climáticas: anais. [Uberlândia]: SBCS: UFU, ICIAG, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 15. | | PAGNO, G.; POSSAMAI, M. H. P.; MARTINS, E.; MARTINS, V. M. V.; MARIANTE, A. da S. Composição do rebanho de bovinos da raça crioula lageana em seis núcleos de conservação. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.525.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | SOUTO, P. L. G.; MARTINS, V. M. V.; MARTINS, E.; ZERVOUDAKIS, L. K. H.; MCMANUS, C.; RAMOS, A. F. Qualidade seminal de touros adaptados à região temperada do brasil: relação com características morfológicas e condições climáticas. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 80, 2018. Edição especial dos Anais do 5 Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | FONTEQUE, J. H.; TEIXEIRA, W. T.; FONTEQUE, G. V.; MARTINS, E.; MARTINS, V. M. V.; SAITO, M. E.; RAMOS, A. F.; EGITO, A. A. do. Hemograma e fibrinogênio em bezerros da raça crioula lageana e holandesa preta e branca nos primeiros seis meses de vida. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 550 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert. p. 9| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | FONTEQUE, J. H.; TEIXEIRA, W. T.; FONTEQUE, G. V.; MARTINS, E.; MARTINS, V. M. V.; SAITO, M. E.; RAMOS, A. F.; EGITO, A. A. do. Hemograma e fibrinogênio em bezerros da raça Crioula Lageana e holandesa preta e branca nos primeiros seis meses de vida. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). CD-ROM| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | SOUTO, P. L. G.; BARBOSA, E. A.; MARTINS, E.; MARTINS, V. M. V.; HATAMOTO-ZERVOUDAKIS, L. K.; PIMENTEL, C. M. M.; RAMOS, A. F. Influence of season and external morphology on thermal comfort and physiological responses in bulls from two breeds adapted to a subtropical climate. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, v. 22, e2122022021, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | RAMOS, A. F.; ZAGO, F. C.; MARTINS, V. M. V.; MARTINS, E.; TEIXEIRA, H. C. A.; FONTEQUE, J. H.; EGITO, A. A. do. Desenvolvimento ponderal de reprodutores da raça crioula lageana entre um e dois anos de idade. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 550 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert. p. 30| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Registros recuperados : 40 | |
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