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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
13/11/2018 |
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Data da última atualização: |
03/01/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OKINO, C. H.; IBELLI, A. M. G.; BRENTANO, L.; ZANELLA, R.; MARQUES, M. G. |
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Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; LIANA BRENTANO, CNPSA; Ricardo Zanella, Universidade de Passo Fundo; MARIANA GROKE MARQUES, CNPSA. |
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Título: |
Evaluation of candidate reference genes for investigation of the uterine tissue and corpus luteum of pigs on day 6 after artificial insemination. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Reproduction Science, v. 198, p. 202-209, 2018. |
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DOI: |
10.1016/j.anireprosci.2018.09.020 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Housekeeping genes (HKG) are genes necessary for the maintenance of basal cellular functions, regardless of the specific roles within a tissue. It, therefore, is expected that these genes will maintain a relatively constant expression profile when there are varying physiological conditions. The identification of tissue specific reference genes is highly important for the normalization of gene expression profiles among different tissues. In this sow study, the objective was to identify stable reference genes in the uterine tissue and corpus luteum (CL), 6 days post-artificial insemination. The stability of ubiquitin (UBB), glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), DNA topoisomerase 2-beta (TOP2B), histone H3 (H3F3A) and hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1) abundances of mRNA were evaluated using the Bestkeeper technique. Briefly, total RNA was extracted for each tissue from 20 gilts (n=20), processed by RT-qPCR and submitted to analysis using the Bestkeeper technique, which allowed for the evaluation of the consistency in abundance of mRNA for the reference genes. For all evaluated genes, the abundance of mRNA was relatively consistent in the uterine tissue, with the greatest abundance being for the GAPDH and TOP2B genes. The analysis of these genes in the CL, however, indicated there was a relatively greater variation of mRNA abundance for the various reference genes. Data suggest that UBB was the reference gene with the most consistent relative abundance of mRNA and that this gene could be used as a reference for corpora lutea analyses of mRNA MenosHousekeeping genes (HKG) are genes necessary for the maintenance of basal cellular functions, regardless of the specific roles within a tissue. It, therefore, is expected that these genes will maintain a relatively constant expression profile when there are varying physiological conditions. The identification of tissue specific reference genes is highly important for the normalization of gene expression profiles among different tissues. In this sow study, the objective was to identify stable reference genes in the uterine tissue and corpus luteum (CL), 6 days post-artificial insemination. The stability of ubiquitin (UBB), glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), DNA topoisomerase 2-beta (TOP2B), histone H3 (H3F3A) and hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1) abundances of mRNA were evaluated using the Bestkeeper technique. Briefly, total RNA was extracted for each tissue from 20 gilts (n=20), processed by RT-qPCR and submitted to analysis using the Bestkeeper technique, which allowed for the evaluation of the consistency in abundance of mRNA for the reference genes. For all evaluated genes, the abundance of mRNA was relatively consistent in the uterine tissue, with the greatest abundance being for the GAPDH and TOP2B genes. The analysis of these genes in the CL, however, indicated there was a relatively greater variation of mRNA abundance for the various reference genes. Data suggest that UBB was the reference gene with the most consistent relative a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
GAPDH; Housekeeping; TOP2B. |
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Thesagro: |
Inseminação; Reprodução Animal; Suíno; Útero. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Sows; Ubiquitin. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02483naa a2200301 a 4500 001 2099280 005 2019-01-03 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1016/j.anireprosci.2018.09.020$2DOI 100 1 $aOKINO, C. H. 245 $aEvaluation of candidate reference genes for investigation of the uterine tissue and corpus luteum of pigs on day 6 after artificial insemination.$h[electronic resource] 260 $c2018 520 $aHousekeeping genes (HKG) are genes necessary for the maintenance of basal cellular functions, regardless of the specific roles within a tissue. It, therefore, is expected that these genes will maintain a relatively constant expression profile when there are varying physiological conditions. The identification of tissue specific reference genes is highly important for the normalization of gene expression profiles among different tissues. In this sow study, the objective was to identify stable reference genes in the uterine tissue and corpus luteum (CL), 6 days post-artificial insemination. The stability of ubiquitin (UBB), glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), DNA topoisomerase 2-beta (TOP2B), histone H3 (H3F3A) and hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1) abundances of mRNA were evaluated using the Bestkeeper technique. Briefly, total RNA was extracted for each tissue from 20 gilts (n=20), processed by RT-qPCR and submitted to analysis using the Bestkeeper technique, which allowed for the evaluation of the consistency in abundance of mRNA for the reference genes. For all evaluated genes, the abundance of mRNA was relatively consistent in the uterine tissue, with the greatest abundance being for the GAPDH and TOP2B genes. The analysis of these genes in the CL, however, indicated there was a relatively greater variation of mRNA abundance for the various reference genes. Data suggest that UBB was the reference gene with the most consistent relative abundance of mRNA and that this gene could be used as a reference for corpora lutea analyses of mRNA 650 $aGene expression 650 $aSows 650 $aUbiquitin 650 $aInseminação 650 $aReprodução Animal 650 $aSuíno 650 $aÚtero 653 $aGAPDH 653 $aHousekeeping 653 $aTOP2B 700 1 $aIBELLI, A. M. G. 700 1 $aBRENTANO, L. 700 1 $aZANELLA, R. 700 1 $aMARQUES, M. G. 773 $tAnimal Reproduction Science$gv. 198, p. 202-209, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 4. |  | DIAS, J. C.; ANDRADE, V. J. de; MARTINS, J. A. M.; EMERICK, L. L.; VALE FILHO, V. F. do. Correlações genéticas e fenotípicas entre características reprodutivas e produtivas de touros da raça Nelore. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 1, p. 53-59, jan. 2008 Título em inglês: Genetic and phenotypic correlations among reproductive and productive traits of Nelore bulls.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. |  | SOUSA, M. F. de A.; MARTINS FILHO, R.; MALHADO, C. H. M.; CAMPELO, J. E. G.; MARTINS, J. A. M.; AZEVEDO, D. M. M. R. Fatores ambientais sobre o desenvolvimento ponderal em bovinos da raça Nelore na região Norte e Sub-região Meio-Norte do Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. O avanço científico e tecnológico na produção animal: anais. Jaboticabal: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UNESP, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 7. |  | MARTINS, J. A. C.; HIGUTI, A. Y. H.; PELLEGRIN, A. O.; JULIANO, R. S.; ARAUJO, A. M. de; PELLEGRIN, L. A.; LIESENBERG, V.; RAMOS, A. P. M.; GONÇALVES, W. N.; SANT’ANA, D. A.; PISTORI, H.; MARCATO JUNIOR, J. Assessment of uav-based deep learning for corn crop analysis in midwest Brazil. Agriculture, v. 14, n. 11, p. 1-15, 2024. Online first.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 8. |  | VALE-FILHO, V. R.; EMERICK, L. L.; CAMARGO, L. S. A.; SILVA, M. A.; ANDRADE, V. J.; GONÇALVES, P. E. M.; MARTINS, J. A. M.; LEITE, T. G.; DIAS, J. C.; FOLHADELLA, I. M.; RAMOS, A.; REIS, S. R. Avaliação da integridade das membranas espermáticas por três métodos, em sêmen criopreservado de tourinhos Tabapuã aos dois anos de idade, selecionados pela CAP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 17., 2007, Curitiba. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2007. p. 130.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. |  | SCHWERTNER, D. V.; MARTINS, J. A. K.; MATTER, E.; SILVA, A. J. da; VALENTINI, A. P. F.; ANTONOW, D.; KRÜGER, C. A. M. B.; CARBONERA, R.; SILVA, J. A. G. da. Paramêtros genéticos em caracteres de importância agronômica em girassol. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18., SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 343-349. Editado por Ana Claudia Barneche de Oliveira, Ana Paula Afonso Scheneid da Rosa e Márcia Vizzotto.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. |  | LEITE, T. G.; EMERICK, L. L.; MARTINS, J. A. M.; GONÇALVES, P. E. M.; CAMARGO, L. S. A.; FOLHADELLA, I. M.; FELIPE-SILVA, A. S.; ANDRADE, V. J.; VALE-FILHO, V. R.; SILVA, M. A.; DIAS, J. C.; MACHADO, P. Sêmen criopreservado de tourinhos Tabapuã criados a pasto selecionados pelo CAP aos dois anos de idade e sua relação com defeitos espermáticos após descongelação e testes de termorresistência. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 17., 2007, Curitiba. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2007. p. 207.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 11. |  | SCHWERTNER, D. V.; GAVIRAGHI, F.; VALENTINI, A. P. F.; MARTINS, J. A. K.; WAGNER, J. F.; ANTONOW, D.; MATTER, E.; GARCIA, D. C.; KRÜGER C. A. M. B.; SILVA, J. A. G. da. Desempenho na produção e adaptação de genótipos de girassol em Augusto Pestano. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18., SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 365-371. Editado por Ana Claudia Barneche de Oliveira, Ana Paula Afonso Scheneid da Rosa e Márcia Vizzotto.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. |  | MARTINS, J. A. M.; EMERICK, L. L.; DIAS, J. C.; SOUZA, F. A.; SILVA, M. A.; CORRÊA, G. S. S.; CAMARGO, L. S. A.; VALE-FILHO, V. R.; ANDRADE, V. J.; GRAÇA, D. S.; EMERICK, G. L.; CANGUSSÚ, M. G. Novas observações sobre o teste de termorresistência em sêmen de tourinhos Tabapuã aos dois anos de idade, com alta recuperação pós-criopreservação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 17., 2007, Curitiba. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2007. p. 206.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 13. |  | SCHWERTNER, D. V.; GAVIRAGHI, F.; MARTINS, J. A. K.; VALENTINI, A. P. F.; WAGNER, J. F.; CRESTANI, M.; MATTER, E.; UHDE, L. T.; MAIXENER, A. R.; SILVA, J. A. G. da. Variabilidade genética em genótipos de girassol. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DO GIRASSOL, 18., SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 6., 2009. Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2009. p. 337-342. Editado por Ana Claudia Barneche de Oliveira, Ana Paula Afonso Scheneid da Rosa e Márcia Vizzotto.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. |  | CIPRIANO, A. K. A. L.; GONDIM, D. M. F.; VASCONCELOS, I. M.; MARTINS, J. A. M.; MOURA, A. A.; MORENO, F. B.; MOREIRA, A. C. O. M.; MELO, J. G. M; CARDOSO, J. E.; PAIVA, A. L. S.; OLIVEIRA, J. T. A. Proteomic analysis of responsive stem proteins of resistant and susceptible cashew plants after Lasiodiplodia theobromae infection. Journal of Proteomics, v. 113, p. 90-109, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 15. |  | ALVAREZ FILHO, A.; PIRES FILHO, A. M.; RAMALHO FILHO, A.; MOTHCI, E. P.; FREITAS, F. G. de; ALMEIDA, H. da C.; TOMASI, J. M. G.; WITTERN, K. P.; PESSOA, S. C. P.; SOMMER, S.; FAUSTINO NETO, M.; DINIZ, J. N. N.; CAVADON, A. D.; MOURA, E. M.; SOUZA, J. L. R.; POTTER, R. O.; MARTINS, J. A. Levantamento semidetalhado dos solos de áreas do Ministério da Agricultura no Distrito Federal. Rio de Janeiro: Equipe de Pedologia e Fertilidade do Solo, 1967. 135 p. (Brasil. Equipe de Pedologia e Fertilidade do Solo. Boletim técnico, 8). Acompanha 1 mapa, p&b. Escala 1:25.000. Convênio M.A.-CONTAP-USAID/BRASIL. Projeto de Levantamento de Recursos Naturais (PRO-AG 512-15-120-249).| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 16. |  | EMERICK, L. L.; VALE-FILHO, V. R.; MARTINS, J. A. M.; LEITE, T. G.; GONÇALVES, P. E. M.; ANDRADE, V. J.; CAMARGO, L. S. A.; DIAS, J. C.; CORRÊA, G. S. S.; NOGUEIRA, L. A. G.; FOLHADELLA, I. M.; FELIPE-SILVA, A. S. Testes funcionais de membrana espermática em sêmen criopreservado de tourinhos Tabapuã aos dois anos de idade selecionados pela CAP e índice de prenhez. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 17., 2007, Curitiba. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2007. p. 129.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. |  | GUSMÃO, L.; ANTÃO-SOUSA, S.; FAUSTINO, M.; ABOVICH, M. A.; AGUIRRE, D.; ALGHAFRI, R.; ALVES, C.; AMORIM, A.; ARÉVALO, C.; BALDASSARRI, L.; BARLETTA-CARRILLO, C.; BERARDI, G.; BOBILLO, C.; BORJAS, L.; BRAGANHOLI, D. F.; BREHM, A.; BUILES, J. J.; CAINÉ, L.; CARVALHO, E. F.; CARVALHO, M.; CATELLI, L.; CICARELLI, R. M. B.; CONTRERAS, A.; CORACH, D.; MARCO, F. G. di; DIEDERICHE, M. V.; DOMINGUES, P.; ESPINOZA, M.; FERNANDÉZ, J. M.; GARCÍA, M. G.; GARCÍA, O.; GAVIRIA, A.; GOMES, I.; GRATTAPAGLIA, D.; HENAO, J.; HERNANDEZ, A.; IBARRA, A. A.; LIMA, G.; MANTEROLA, I. M.; MARRERO, C.; MARTINS, J. A.; MENDOZA, L.; MOSQUERA, A.; NASCIMENTO, E. C.; ONOFRI, V.; PANCORBO, M. M.; PESTANO, J. J.; PLAZA, G.; PORTO, M. J.; POSADA, Y. C.; REBELO, M. L.; RIEGO, E.; RODENBUSCH, R.; RODRÍGUEZ, A.; RODRÍGUEZ, A.; SANCHEZ-DIZ, P.; SANTOS, S.; SIMÃO, F.; SIZA FUENTES, L. M.; SUMITA, D.; TOMAS, C.; TOSCANINI, U.; TRINDADE-FILHO, A.; TURCHI, C.; VULLO, C.; YURREBASO, I.; PEREIRA, V.; PINTO, N. X-chromosomal STRs: Metapopulations and mutation rates. Forensic Science International: Genetics, v. 76, 103232, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 17 | |
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