BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  02/12/2020
Data da última atualização:  02/12/2020
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  DINIZ, W. J. da S.; BANERJEE, P.; MAZZONI, G.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; KADARMIDEEN, H. N.; REGITANO, L. C. de A.
Afiliação:  Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCAR; Priyanka Banerjee, Technical University of Denmark; Gianluca Mazzoni, Technical University of Denmark; Luiz Lehmann Coutinho, USP, ESALq; Aline Silva Mello Cesar, USP, ESALq; Juliana Afonso, UFSCAR; Caio Fernando Gromboni, IFBA; ANA RITA DE ARAUJO NOGUEIRA, CPPSE; Haja N. Kadarmideen, Technical University of Denmark; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título:  Interplay among miR-29 family, mineral metabolism, and gene regulation in Bos indicus muscle.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  Molecular Genetics and Genomics, v. 295, p. 1113-1127, may. 2020.
DOI:  https://doi.org/10.1007/s00438-020-01683-9
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  An interplay between gene expression, mineral concentration, and beef quality traits in Bos indicus muscle has been reported previously under a network approach. However, growing evidence suggested that miRNAs not only modulate gene expression but are also involved with mineral homeostasis. To our knowledge, understanding of the miRNA?gene expression-mineral concentration relationship in mammals is still minimal. Therefore, we carried out a miRNA co-expression and multi-level miRNA?mRNA integration analyses to predict the putative drivers (miRNAs and genes) associated with muscle mineral concentration in Nelore steers. In this study, we identified calcium and iron to be the pivotal minerals associated with miRNAs and gene targets. Furthermore, we identified the miR-29 family (miR-29a, -29b, -29c, -29d-3p, and -29e) as the putative key regulators modulating mineral homeostasis. The miR-29 family targets genes involved with AMPK, insulin, mTOR, and thyroid hormone signaling pathways. Finally, we reported an interplay between miRNAs and minerals acting cooperatively to modulate co-expressed genes and signaling pathways both involved with mineral and energy homeostasis in Nelore muscle. Although we provided some evidence to understand this complex relationship, future work should determine the functional implications of minerals for miRNA levels and their feedback regulation system.
Palavras-Chave:  Co expression; Mineral homeostasis; Regulatory network; Systems biology.
Thesaurus Nal:  Calcium; Iron.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CPPSE25176 - 1UPCAP - DDPROCI-2020.00090DIN2020.00141
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1.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, H.; LOPES, F. M.; SILLA, P. R.; HUNGRIA, M. A database for the taxonomic and phylogenetic identification of the genus Bradyrhizobium using multilocus sequence analysis. BMC Genomics, London, v. 16, 2015. Suppl 5, S10. 11 p. Edição dos Proceedings of the 10th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology (X-Meeting 2014), Belo Horizonte, Oct. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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2.Imagem marcado/desmarcadoBARROS-CARVALHO, G. A.; HUNGRIA, M.; LOPES. F. M.; SLUYS, M. A. V. Mapping is elements in brazilian bradyrhizobium strains used in inoculants and their putative impacts on the symbiosis. In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 180. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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3.Imagem marcado/desmarcadoBARROS-CARVALHO, G.A.; HUNGRIA, M.; LOPES, F. M.; VAN SLUYS, M. A. Brazilian-adapted soybean Bradyrhizobium strains uncover IS elements with potential impact on biological nitrogen fixation. FEMS Microbiology Letters, v. 366, n. 11, fnz046, 2019. 10 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA-SILVA, J.; DOMINGUES, D. S.; MENOTTI, D.; HUNGRIA, M.; LOPES, F. M. Temporal progress of gene expression analysis with RNA-Seq data: a review on the relationship between computational methods. Computational and Structural Biotechnology Journal, v. 21, p. 86–98, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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5.Imagem marcado/desmarcadoPACANHELA, E. F.; RONDINA, A. B. L.; NOGUEIRA, M. A.; HUNGRIA, M.; SAITO, P. T. M.; LOPES, F. M. Análise e Classificação Automática de Nódulos em Raízes de Cultivares de Soja. In: BRAZILIAN E-SCIENCE WORKSHOP (BRESCI), 16., 2022, Niterói. Anais [...]. Porto Alegre: SBC, 2022. p. 41-48.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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6.Imagem marcado/desmarcadoD'ABADIA, A. C. A.; FALEIRO, F. G.; COSTA, A. M.; JUNQUEIRA, N. T. V.; BRAGA, M. F.; LOPES, F. M. Características físicas de frutos de maracujazeiro-doce sob diferentes sistemas de condução. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CERRADOS, 2015, Planaltina, DF. Jovens Talentos 2015: resumos. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2015. (Embrapa Cerrados. Documentos, 328). p. 25
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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7.Imagem marcado/desmarcadoPASCHOAL, A. R.; FERNANDES, E. D. M.; SILVA, J. C.; LOPES, F. M.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. CoffeebEST: an integrated resource for Coffea spp expressed sequence tags. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 10913-10920, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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8.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, C. N. da; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; COSTA, A. M.; LOPES, F. M. Caracterização morfoagronômica e ganhos de seleção em progênies de meio-irmãos de Passiflora maliformis L. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CERRADOS, 2015, Planaltina, DF. Jovens Talentos 2015: resumos. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2015. (Embrapa Cerrados. Documentos, 328). p. 29
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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9.Imagem marcado/desmarcadoITO, E. A.; KATAHIRA, I.; VICENTE, F. F. da R.; PEREIRA, L. F. P.; LOPES, F. M. BASiNET - Biological Sequences NETwork: a case study on coding and non-coding RNAs identification. Nucleic Acids Research, v. 46, n. 16, p. , 2018
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Café.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, C. N. da; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; COSTA, A. M.; LOPES, F. M. Diferencial de seleção em progênies de passiflora maliformis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.
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11.Imagem marcado/desmarcadoDABADIA, A. C. A.; FALEIRO, F. G.; COSTA, A. M.; JUNQUEIRA, N. T. V.; BRAGA, M. F.; LOPES, F. M. Variabilidade genética e características físicas de frutos de matrizes selecionadas de maracujazeiro doce. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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