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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
22/11/2011 |
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Data da última atualização: |
25/07/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOUVEIA, G. V.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
GISELE VENERONI-GOUVEIA, UFSCar/SÃO CARLOS, SP; SARAH LAGUNA MEIRELLES, UNESP/JABOTICABAL; DANIELE A. GROSSI, UNESP/JABOTICABAL; A. C. SANTIAGO, UFSCar/SÃO CARLOS, SP; T. S. SONSTEGARD, USDA, Agricultural Research Service, Beltsville; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; L. K. MATUKUMALLI, USDA, Agricultural Research Service, Beltsville; LUIZ L. COUTINHO, USP-ESALQ; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; HENRIQUE NUNES OLIVEIRA, UNESP/JABOTICABAL; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 43, n. 5, p. 518-524, oct. 2012. |
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DOI: |
10.1111/j.1365-2052.2011.02286.x |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Backfat thickness affects the preservation of the beef carcass after slaughter and confers organoleptic characteristics assessed by the consumer. One of the breeding goals for Canchim, a tropically adapted breed, is to comprehensively increase fat thickness. Our goals were to identify genomic regions associated with backfat in Canchim populations and validate the association of single nucleotide polymorphisms (SNPs) overlapping previously identified QTL regions known to affect fat deposition. Fifteen animals with lower and 15 animals with higher residues for backfat, according to a linear model using the SAS GLM procedure, were selected from a population of 1171 animals and genotyped using the BovineSNP50 BeadChip. Initial analysis revealed more than 100 SNPs that discriminated the tails of phenotypic distribution. One extended region of association included the centromeric region of chromosome (Chr) 14. Because this region overlapped with QTL from previous reports, we developed SNP assays to interrogate two linkage disequilibrium blocks, one in the centromeric region and another in the middle region of Chr 14 to confirm the association. The analysis validated the presence of specific haplotypes affecting fat thickness. |
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Palavras-Chave: |
Fat deposition; Tropically adapted cattle. |
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Thesaurus Nal: |
single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02153naa a2200289 a 4500
001 1906584
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260 $c2012
520 $aBackfat thickness affects the preservation of the beef carcass after slaughter and confers organoleptic characteristics assessed by the consumer. One of the breeding goals for Canchim, a tropically adapted breed, is to comprehensively increase fat thickness. Our goals were to identify genomic regions associated with backfat in Canchim populations and validate the association of single nucleotide polymorphisms (SNPs) overlapping previously identified QTL regions known to affect fat deposition. Fifteen animals with lower and 15 animals with higher residues for backfat, according to a linear model using the SAS GLM procedure, were selected from a population of 1171 animals and genotyped using the BovineSNP50 BeadChip. Initial analysis revealed more than 100 SNPs that discriminated the tails of phenotypic distribution. One extended region of association included the centromeric region of chromosome (Chr) 14. Because this region overlapped with QTL from previous reports, we developed SNP assays to interrogate two linkage disequilibrium blocks, one in the centromeric region and another in the middle region of Chr 14 to confirm the association. The analysis validated the presence of specific haplotypes affecting fat thickness.
650 $asingle nucleotide polymorphism
653 $aFat deposition
653 $aTropically adapted cattle
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700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tAnimal Genetics$gv. 43, n. 5, p. 518-524, oct. 2012.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 18 | |
| 4. |  | LELIS, T. M.; MEIRA, R. O.; OLIVEIRA, W. R. B.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E. Análise de proteínas solúveis totais presentes no endosperma de Elaeis guineensis Jacq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 22.; 9º CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 9., 2019, Juazeiro-Ba. Anais... Juazeiro, BA: UNIVASF, 2019. p. 121| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | NEVES, J. dos S.; LELIS, T. M.; MEIRA, R. O.; SILVA-CARDOSO, I. M. de A.; PEREIRA, J. E. S. Caracterização histoquímica de embriões somáticos de palma de óleo em fase de maturação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 8., 2024, Pirenópolis, GO. Recursos genéticos para a sustentabilidade frente às mudanças climáticas: [resumos]. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2024.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | MEIRA, R. O.; OLIVEIRA, W. R. B.; LELIS, T. M.; FERREIRA, J. C. B.; SILVA-CARDOSO, I. M. de A.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E. Análise quantitativa de Proteínas Solúveis Totais (PST) em explantes de diferentes palmeiras utilizadas na embriogênese somática. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 22.; 9º CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 9., 2019, Juazeiro-Ba. Anais... Juazeiro, BA: UNIVASF, 2019. p. 123| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | SILVA, I. M. de A.; MEIRA, R. O.; LELIS, T. M.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; PEREIRA, J. E. S. Calogênese de tecidos foliares de híbridos de palma de óleo (Elaeis oleifera x E. guineensis) visando a embriogênese somática. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIODIVERSIDADE E BIOTECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 2., 2022, Belém. Anais... Belém, PA: PPG-BIONORTE, 2022.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | NEVES, J. dos S.; NOGUEIRA, G. F.; LELIS, T. M.; MEIRA, R. O.; CARDOSO, I. M. de A. S.; PEREIRA, J. E. S. Monitoramento de agregados celulares em suspensão de palma de óleo (Elaeis spp.) quanto a capacidade de diferenciação de embriões somáticos após seis anos em cultivo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 7., 2022. Multifuncionalidade e Qualidade de Vida: [anais...]. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2022. Na publicação: Jonny Everson Scherwinski-Pereira.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | LELIS, T. M.; SANTOS, I. R.; SILVA-CARDOSO, I. M. A.; SOUZA, A. L. X. de; GOMES, A. C. M. M.; REIS, A. M. dos; PEREIRA, J. E. S. Unraveling the occurrence of hyperhydricity in oil palm somatic embryos during somatic embryogenesis process. Protoplasma, v. 262, p. 191-206, 2025. Na publicação: Angela Mehta; Jonny Everson Scherwinski-Pereira.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 18 | |
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