BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
Home Bibliotecas Itens selecionados Créditos Ajuda
 






Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br.
Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Territorial.
Data corrente:  17/02/2016
Data da última atualização:  30/11/2020
Autoria:  SALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G.
Afiliação:  JOSÉ AUGUSTO SALIM, Computational Biology Research Group; LUIZ BORRO, Computational Biology Research Group; IVAN MAZONI, CNPTIA; JOSÉ GILBERTO JARDINE, CNPM; GORAN NESIC, CNPTIA.
Título:  Multiple Structures Single Parameter (MSSP): analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins.
Ano de publicação:  2016
Fonte/Imprenta:  Bioinformatics Advance, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, June 2016.
DOI:  https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw082
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Motivation: A graphical representation of physicochemical and structural descriptors attributed to amino acid residues occupying the same topological position in different, structurally aligned proteins can provide a more intuitive way to associate possible functional implications to identified variations in structural characteristics. This could be achieved by observing selected characteristics of amino acids and of their corresponding nano environments, described by the numerical value of matching descriptor. For this purpose, a webbased tool called Multiple Structures Single Parameter (MSSP) was developed and here presented. Results: MSSP produces a 2D plot of a single protein descriptor for a number of structurally aligned protein chains. From a total of 150 protein descriptors available in MSSP, selected out of more than 1500 parameters stored in the STING database, it is possible to create easily readable and highly informative XY-plots, where X-axis contains the amino acid position in the multiple structural alignment, and Yaxis contains the descriptor?s numerical values for each aligned structure. To illustrate one of possible MSSP contributions to the investigation of changes in physicochemical and structural properties of mutants, comparing them to the cognate wild type structure, the oncogenic mutation of M918T in RET Kinase is presented. The comparative analysis of wild type and mutant structures shows great changes in their electrostatic potential. These variati... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Amino acid residues; Bioinformática.
Thesaurus Nal:  Bioinformatics.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPM4670 - 1UPCAP - DD16/002AP2016.002
CNPTIA20769 - 1UPCAP - DD
Voltar






Ordenar por: RelevânciaAutorTítuloAnoImprime registros no formato resumido      Imprime registros no formato resumido
Registros recuperados : 16
Primeira ... 1 ... Última
1.Imagem marcado/desmarcadoROMANO, E.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M. Extração e quantificação de DNA de tecidos vegetais. In: BRASILEIRO, A. C. M.; CARNEIRO, V. T. de C. (Ed.). Manual de transformação genética de plantas. 2.ed. rev. e ampl. Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 166-180.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
2.Imagem marcado/desmarcadoTENENTE, R. C. V.; LEAL-BERTIOLI, S.C.de M. Tecnicas bioquimicas e moleculares na diagnose de fitonematoides. Brasilia: Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia, 1999 37p. (Embrapa Recursos Geneticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa, 6)
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroImprime registro no formato completo
3.Imagem marcado/desmarcadoBRUZZI, M.; BERTIOLI, D. J.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; PARENTE, P. M. G. Busca por genes de resistência em germoplasma silvestre de Oryza sp. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 5., 2000, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2000. p. 25.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
4.Imagem marcado/desmarcadoLION, M. B.; GUIMARÃES, P. M.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; BERTIOLI, D. Busca por regiões análogas a genes de resistência em germoplasma de Arachis spp através de técnica de PCR. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 6., 2001, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2001. p. 30. Apresentado também no evento: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 47., 2001, Águas de Lindóia. A genética no século XXI: desafios: anais. [Ribeirão Preto, SP]: Sociedade Brasileira de Genética, 2001.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
5.Imagem marcado/desmarcadoLEAL-BERTIOLI, S. C. de M. L.; GUIMARÃES, P. M.; BERTIOLI, D. J. Targeting and genotyping RGAs in a mapping population of the AA genome of wild Arachis. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 7, p. 179-185, 2007.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
6.Imagem marcado/desmarcadoNEIVA, L. de F.; DIAS, J. G. de O.; TENENTE, R. C. V.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M. Reprodução "in vitro" de fitonematóides do gênero Ditylenchus. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 6., 2001, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2001. p. 112.
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
7.Imagem marcado/desmarcadoVALLS, J. F. M.; GUIMARÃES, P. M.; LEAL BERTIOLI, S. C. de M.; MORETZSOHN, M. de C. Unlocking the genetic diversity in peanut's wild relatives with genomic and genetic tools. In: ANNUAL RESEARCH MEETING, 2008, Bangkok, Tailândia. Project abstracts... [Mexico]: Generation Challenge Programme - CGIAR, 2008. p. 3-1-33.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
8.Imagem marcado/desmarcadoGODOY, I. J.; SANTOS, J. F.; MORETZSOHN, M. de C.; MORAES, A. R. A.; MICHELOTTO, M. D.; BOLONHEZI, D.; NAKAYAMA, F.; FREITAS, R. S. de; BERTIOLI, D. J.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de. 'IAC SEMPRE VERDE': a wild-derived peanut cultivar highly resistant to foliar diseases. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 22, n. 3, 2022. e41252232.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
9.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, E. F. de M. B. do; SANTOS, B. V. dos; MARQUES, L. O. C.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; LEAL BERTIOLI, S. C. de M.; BERTIOLI, D. J.; ARAUJO, A. C. G. The genome structure of Arachis hypogaea (Linnaeus, 1753) and an induced Arachis allotetraploid revealed by molecular cytogenetics. Comparative Cytogenetics, v. 12, n. 1, p. 111-140, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
10.Imagem marcado/desmarcadoBUROW, M. D.; SELVARAJ, M. G.; UPADHYAYA, H.; OZIAS AKINS, P.; GUO, B.; BERTIOLI, D. J.; LEAL BERTIOLI, S. C. de M.; MORETZSOHN, M. de C.; GUIMARÃES, P. M. Genomics of peanut, a major source of oil and protein. In: MOORE, P. H.; MING, R. (Ed.). Genomics of tropical crop plants. New York: Springer Sciences, 2008. (Plant genetics and genomics: crops and models, 1). p. 421-440.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
11.Imagem marcado/desmarcadoBRASILEIRO, A. C. M.; SANTOS, C. M. R.; MORGANTE, C. V.; MARTINS, A. da C. Q.; DA SILVA, F. R.; ARAÚJO, A. C. G. de; BERTIOLI, D. J.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; GUIMARÃES, P. M. Análise in silico da expressão diferencial de genes em Arachis magna sob estresse hídrico. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 19 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 229).
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
12.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, E. F. de M. B. do; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; BERTIOLI, D. J.; CHAVARRO, C.; FREITAS, F. O.; MORETZSOHN, M. de C.; GUIMARAES, P. M.; VALLS, J. F. M.; ARAUJO, A. C. G. de. Brazilian Kayabi Indian accessions of peanut, Arachis hypogaea (Fabales, Fabaceae): origin, diversity and evolution. Genetics and Molecular Biology, v. 43, n. 4, e20190418, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
13.Imagem marcado/desmarcadoMORETZSOHN, M. de C.; SANTOS, J. F. dos; MORAES, A. R. A.; CUSTÓDIO, A. R.; MICHELOTTO, M. D.; MAHRAJAN, N.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; GODOY, I. J.; BERTIOLI, D. J. Marker-assisted introgression of wild chromosome segments conferring resistance to fungal foliar diseases into peanut (Arachis hypogaea L.). Frontiers in Plant Science, v. 14, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
14.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, J. F. dos; MICHELOTTO, M. D.; MORETZSOHN, M. de C.; CUSTÓDIO, A. R.; MORAES, A. R. A. de; GONÇALVES, M. C.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; BERTIOLI, D. J.; GODOY, I. J. de. Avaliação de linhagens de amendoim com resistência ao nematoide das galhas para tolerância a viroses no estado de São Paulo. South American Sciences, v. 3, n. 2, 2022. e22193.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso restrito ao objeto digitalImprime registro no formato completo
15.Imagem marcado/desmarcadoVINSON, C. C.; MOTA, A. P. Z.; OLIVEIRA, T. N.; GUIMARÃES, L. A.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; WILLIAMS, T. C. R.; NEPOMUCENO, A. L.; SARAIVA, M. A. de P.; ARAUJO, A. C. G.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M. Early responses to dehydration in contrasting wild Arachis species. PLoS ONE, v. 13, n. 5, 2018. Article e0198191.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
16.Imagem marcado/desmarcadoSUASSUNA, T. de M. F.; SUASSUNA, N. D.; BOGIANI, J. C.; PERINA, F.; FRAGOSO, D. de B.; SOFIATTI, V.; MEDEIROS, E. P. de; MORETZSOHN, M. de C.; LEAL-BERTIOLI, S. C. de M.; BERTIOLI, D. J.; HEUERT, J.; ASSUNÇÃO, H. F.; COLNAGO, L. A.; GONDIM, T. M. de S.; VASCONCELOS, R. A.; SCHWENGBER, J. E.; BEZERRA, J. R. C. BRS 425: the first runner peanut cultivar related to wild ancestral species. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 19, n. 3, p. 373-377, 2019.
Tipo: Nota Técnica/Nota CientíficaCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Instrumentação; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Visualizar detalhes do registroAcesso ao objeto digitalImprime registro no formato completo
Registros recuperados : 16
Primeira ... 1 ... Última
Expressão de busca inválida. Verifique!!!
  
 

Embrapa
Todos os direitos reservados, conforme Lei n° 9.610
Política de Privacidade
Área Restrita
Embrapa Agricultura Digital
Av. André Tosello, 209 - Barão Geraldo
Caixa Postal 6041- 13083-886 - Campinas, SP
SAC: https://www.embrapa.br/fale-conosco

Valid HTML 4.01 Transitional