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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
05/11/2021 |
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Data da última atualização: |
10/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GIGLIOTI, R.; AZEVEDO, B. T.; OLIVEIRA, H. N. DE; KATIKI, L. M.; VERCESI FILHO, A. E.; OLIVEIRA, M. C. de S.; OKINO, C. H. |
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Afiliação: |
RODRIGO GIGLIOTI, IZ; BIANCA TAINÁ AZEVEDO, IZ; HENRIQUE NUNES DE OLIVEIRA, UNESP; LUCIANA MORITA KATIKI, IZ; ANIBAL EUGÊNIO VERCESI FILHO, IZ; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE. |
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Título: |
How long does the mRNA remains stable in untreated whole bovine blood? |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 49, n. 1, p. 789-795, jan. 2021. |
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DOI: |
10.1007/s11033-021-06808-w |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
Background High quality and quantity of messenger RNA (mRNA) are required for accuracy of gene expression studies and other RNA-based downstream applications. Since RNA is considered a labile macromolecular prone to degradation, which may result in falsely altered gene expression patterns, several commercial stabilizing reagents have been developed aiming to keep RNA stable for long period. However, for studies involving large number of experimental samples, the high costs related to these specifc reagents may constitute a barrier. Methods and results In this context the present study was designed aiming to evaluate the stability of mRNA in whole bovine blood collected in EDTA tubes during storage at common fridge (4 °C). Whole blood samples were collected from six Holstein calves and submitted to RNA extraction in each diferent interval: immediately after blood sampling (<2 h), at 1-day post-sampling (dps), 2 dps, 3 dps, 7 dps and 14dps intervals. RNA integrity and purity were evaluated, and RT-qPCR assays were run using seven diferent genes (B2M, ACTB, PPIA, GAPDH, YWHAZ, CD4 and IFN-γ) aiming to evaluate the presence of altered gene transcription during storage. All extracted RNA samples presented high purity, while optimal integrity and unaltered gene expression were observed in whole experimental group up to 3 days of storage. Conclusion Bovine blood RNA remained stable in K3EDTA tubes for 3 days stored at common fridge and can be success-fully and accurately used for gene expression studies. MenosBackground High quality and quantity of messenger RNA (mRNA) are required for accuracy of gene expression studies and other RNA-based downstream applications. Since RNA is considered a labile macromolecular prone to degradation, which may result in falsely altered gene expression patterns, several commercial stabilizing reagents have been developed aiming to keep RNA stable for long period. However, for studies involving large number of experimental samples, the high costs related to these specifc reagents may constitute a barrier. Methods and results In this context the present study was designed aiming to evaluate the stability of mRNA in whole bovine blood collected in EDTA tubes during storage at common fridge (4 °C). Whole blood samples were collected from six Holstein calves and submitted to RNA extraction in each diferent interval: immediately after blood sampling (<2 h), at 1-day post-sampling (dps), 2 dps, 3 dps, 7 dps and 14dps intervals. RNA integrity and purity were evaluated, and RT-qPCR assays were run using seven diferent genes (B2M, ACTB, PPIA, GAPDH, YWHAZ, CD4 and IFN-γ) aiming to evaluate the presence of altered gene transcription during storage. All extracted RNA samples presented high purity, while optimal integrity and unaltered gene expression were observed in whole experimental group up to 3 days of storage. Conclusion Bovine blood RNA remained stable in K3EDTA tubes for 3 days stored at common fridge and can be success-fully and accurately used ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Fridge; RNA integrity; Stability. |
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Thesaurus Nal: |
Cattle; Gene expression; Storage. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 1. |  | JASSE, M. E. C.; OLIVEIRA, S. F. de; RESENDE, F. V.; VIDAL, M. C. Produção de cultivares de alface dos tipos lisa, crespa e americana em sistema agroecológico. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 24, n. 1, jul. 2006. Suplemento 1. Resumo 252. Trabalho apresentado no 46. Congresso Brasileiro de Olericultura, Goiânia, 2006. Publicado também como resumo expandido na Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 24, n. 2, p. 997, jul. 2006. Suplemento 2. CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 2. | | SILVA, G. P. de P.; RESENDE, F. V.; SOUZA, R. B. de; JASSE, M. E. C. Cultivares e adubação de pimentão para cultivo orgânico de inverno no cerrado. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 28, n. 2, p. S2936-S2941, jul. 2010. CD-ROM. Suplemento. Trabalho apresentado no Congresso Brasileiro de Olericultura, 50., 2010, Guarapari. Cinquenta anos contribuindo para a saúde da população brasileira. Trabalho A2886-T4488.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 3. | | JASSE, M. E. C.; SILVA, F. P. dos; SILVA, G. P. de P.; LIMA, J. L.; RESENDE, F. V.; SOUZA, R. B. de. Adubação com compostos de farelos anaeróbicos na produção de feijão vagem orgânico cultivado sobre coberturas vivas de amendoim forrageiro e grama batatais. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 27, n. 2, p. S2287-S2292, ago. 2009. CD-ROM. Suplemento. Trabalho apresentado no 49. Congresso Brasileiro de Olericultura, Águas de Lindóia, SP.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 4. | | FERREIRA, M. S.; BARBOZA, E. A.; JASSE, M. E. C.; MICHEREFF FILHO, M.; GUIMARAES, J. A.; LIZ, R. S. de; RESENDE, F. V.; INOUE NAGATA, A. K. Seleção de produtos para controle de insetos vetores de fitoviroses em cultivo orgânico de tomate. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal, RN. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 5. | | JASSE, M. E. C.; SOUZA, R. B. de; RESENDE, F. V.; GROSSI, A. C.; SILVA, P. S. da; SILVA, G. P. de P.; PERIN, J. E. Efeito residual da adubação com compostos orgânicos enriquecidos em nutrientes e com diferentes graus de decomposição no cultivo da alface em sistema orgânico. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 28, n. 2, p. S2942-S2947, jul. 2010. CD-ROM. Suplemento. Trabalho apresentado no Congresso Brasileiro de Olericultura, 50., 2010, Guarapari. Cinquenta anos contribuindo para a saúde da população brasileira. Trabalho A2886-T4963.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 6. | | MEERT, L.; SOUZA, R. B. de; ALBUQUERQUE, J. O.; PAULA, J. T. de; JASSE, M. E. C.; RESENDE, F. V.; SILVA, G. P. de P. Silva; SOUSA, J. M. M. de. Produção orgânica de cenoura com compostos orgânicos elaborados por leira estática aerada. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 29, n. 2, p. 4402-4407, jul. 2011. CD-ROM. Suplemento. Trabalho apresentado no 51. Congresso Brasileiro de Olericultura, Viçosa, MG.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 7. | | MEERT, L; SOUZA, R. B. de; ALBUQUERQUE, J. O.; PAULA, J. T. de; JASSE, M. E. C.; RESENDE, F. V.; SILVA, G. P. de P.; SOUSA, J. M. M. de. Produção orgânica de cenoura com compostos orgânicos elaborados por leira estática aerada. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 29, n. 2, p. 4402-4407, jul. 2011. CD-ROM. Suplemento. Trabalho apresentado no 51. Congresso Brasileiro de Olericultura, Viçosa, MG.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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