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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
25/02/2010 |
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Data da última atualização: |
29/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo de Divulgação na Mídia |
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Autoria: |
FERREIRA, C. F.; VAN DER LEE, T. A. J.; QUIROS, O.; TE LINTEL, H.; ZAPATER, M.; CARLIER, J.; GOODWIN, S.; GUZMAN, M.; SOUZA JÚNIOR, M.; KEMA, G. H. J. |
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Afiliação: |
CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; Theodoor Angelo Jozef Van Der Lee, PRIN; Olman Quirós, CORBANA; Bas Te Lintel Hekkert, PRIN; Marie Francoise Zapater, CIRAD; Jean Carlier, CIRAD; Stephen B. Goodwin; Mauricio Guzman, CORBANA; Manoel Teixeira Souza Júnior, PRIN; Gert H. J. Kema, PRIN. |
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Título: |
Development of VNTR markers to assess genetic diversity of Mycosphaerella fijiensis, the causal agent of black leaf streak disease in bananas (Musa spp.). |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
UNITED STATES DEPARTMENT OF AGRICULTURAL. Agricultural Research Service. Crop production and pest control research. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Disponível em: <http://www.ars.usda.gov/research/publications/publications.htm?seq_no_115=231337 >. Acesso em: 25 fev. 2010 |
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Conteúdo: |
Mycosphaerella fijiensis, the causal agent of black leaf streak disease of banana, commonly known as Black Sigatoka, is one of the most devastating plant pathogens. Black leaf streak was first discovered in Fiji during the 1960s and the pathogen still actively colonizes new areas where bananas are grown. Using the genome sequence of M. fijiensis isolate CIRAD86 (http://genome.jgi-psf.org/Mycfi1/Mycfi1.home.html), we identified Variable Number of Tandem Repeat (VNTR) markers using a bioinformatics pipeline. The VNTR screening resulted in 1528 candidate VNTR loci of which many were imperfect mono-, di-, or tri-nucleotide repeats. Sixteen VNTR markers were selected based on repeat type, repeat length and the number of units of the repeat. Primers for these 16 VNTR markers were tested on a set of M. fijiensis isolates and five VNTR markers that showed multiple alleles were tested on M. fijiensis field isolates and on progeny of the cross between isolates CIRAD86 and CIRAD 139a. Numbers of alleles identified varied from 2 to 5 per locus. The markers allowed high throughput and robust scoring on agarose gels and proved useful for genetic diversity and population genetic studies using basic molecular instrumentation. We envisage that this set will enable more detailed analyses of the large-scale migration pattern of this important pathogen as well as small-scale effects of fungicide treatments on the population diversity in banana plantations. |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Fungo. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aMycosphaerella fijiensis, the causal agent of black leaf streak disease of banana, commonly known as Black Sigatoka, is one of the most devastating plant pathogens. Black leaf streak was first discovered in Fiji during the 1960s and the pathogen still actively colonizes new areas where bananas are grown. Using the genome sequence of M. fijiensis isolate CIRAD86 (http://genome.jgi-psf.org/Mycfi1/Mycfi1.home.html), we identified Variable Number of Tandem Repeat (VNTR) markers using a bioinformatics pipeline. The VNTR screening resulted in 1528 candidate VNTR loci of which many were imperfect mono-, di-, or tri-nucleotide repeats. Sixteen VNTR markers were selected based on repeat type, repeat length and the number of units of the repeat. Primers for these 16 VNTR markers were tested on a set of M. fijiensis isolates and five VNTR markers that showed multiple alleles were tested on M. fijiensis field isolates and on progeny of the cross between isolates CIRAD86 and CIRAD 139a. Numbers of alleles identified varied from 2 to 5 per locus. The markers allowed high throughput and robust scoring on agarose gels and proved useful for genetic diversity and population genetic studies using basic molecular instrumentation. We envisage that this set will enable more detailed analyses of the large-scale migration pattern of this important pathogen as well as small-scale effects of fungicide treatments on the population diversity in banana plantations.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 16 | |
| 3. |  | FONSECA-BOITEUX, M. E. de N.; PINÕN, M.; RODRIGUEZ, Y.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; ARRUABARRENA, A.; BOITEUX, L. S. Allelic diversity for a genomic segment encompassing a functional marker associated with the Sw-5 locus in wild tomato species and tomato breeding lines. In: SOLANACEAE CONFERENCE, 11., 2014, Arraial D'Ajuda. Book of abstracts. [s.l]: [s. n.], 2014. p. 162 Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 4. | | ARRUABARRENA, A.; RUBIO, L.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; MAESO, D.; SÁNCHEZ-CAMPOS, S.; FONSECA, M. E. de N.; BOITEUX, L. S. First report of Solanum sisymbriifolium and S. americanum as Natural weed hosts of Tomato chlorosis virus (Genus Crinivirus) in South America. Plant disease, Saint Paul, v. 99, n. 6, p. 895, June 2015.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 5. | | ARRUABARRENA, A.; RUBIO, L.; GONZALEZ-ARCOS, M.; MAESO, D.; FONSECA, M. E. de N.; BOITEUX, L. S. First Report of Tomato chlorosis virus Infecting Tomato Crops in Uruguay. Plant Disease, Saint Paul, v. 98, n. 10, p. 1445, Oct. 2014.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 6. | | FONSECA, M. E. N.; DIANESE, E. C.; RESENDE, R. O.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; ARRUABARRENA, A.; BOITEUX, L. S. Functional marker assisted-selection and genetic variability of SW-5bgne in multi-tospovirus resistant Solanum (section Lycopersicon) germplasm accessions using locus-specific primers. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM O THYSANOPTERA AND TOSPOVIRUSES, 10., 2015, Pacific Grove, CA. [Anais...]. [Pacific Grove]: United States Department of Agriculture, National Institute of Food and Agriculture, 2015. p. 106.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 7. | | GONZÁLEZ-ARCOS, M.; ARRUABARRENA, A.; RUBIO, L.; FONSECA, M. E. N.; PEREIRA-CARVALHO, R. de C.; BOITEUX, L. S. Reaction of Solanum (section Lycopersicon) germplasm to Tomato chlorosis virus. In: SOLANACEAE CONFERENCE, 11., 2014, Arraial D'Ajuda. Book of abstracts. [s.l]: [s. n.], 2014. p. 161. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 8. | | GONZÁLEZ-ARCOS, M.; GIORDANO, L. B.; RESENDE, M. M.; FONSECA, M. E. N.; FERRO, D. S. X.; BOITEUX, L. S. Molecular mapping of the recessive resistance to Tomato chlorotic mottle virus (ToCMoV) in Tyking-derived breeding line indicates a coordinated action of two distinct genomic regions. In: SOLANACEAE CONFERENCE, 11., 2014, Arraial D'Ajuda. Book of abstracts. [s.l]: [s. n.], 2014. p. 160. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 11. | | BOITEUX, M. E. de N. F.; BOITEUX, L. S.; LIMA, M. F.; MENDONCA, J. L. de; COSTA, A. F.; FONTES, M. G.; COSTA, H.; GONZÁLEZ-ARCOS, M. First report of tomato chlorosis vírus infecting eggplant and scarlet eggplant in Brazil. Plant disease, v. 100, n. 4, p. 867, April 2016. Na publicação: M. E. N. Fonseca.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 12. | | BOITEUX, L. S.; LIMA, M. F.; FONSECA, M. E. N.; MENDONCA, J. L. de; COSTA, A. F.; SILVA-FILHO, J. G.; FONTES, M. G.; GONZÁLEZ-ARCOS, M. Identification of eight solanum (subgenus Leptostemonum) species as novel natural hosts of tomato chlorosis virus in Brazil. Plant Disease, v. 102, p. 1673, 2018.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 13. | | GONZÁLEZ-ARCOS, M.; FONSECA, M. E. N.; ARRUABARENA, A.; LIMA, M. F.; MICHEREFF FILHO, M.; MORIONES, E.; FERNÁNDEZ-MUÑOZ, R.; BOITEUX, L. S. Identification of genetic sources with attenuated tomato chlorosis virus-induced symptoms in Solanum (section Lycopersicon) germplasm. Euphytica, v. 214, n. 10, p. 1-16, Oct. 2018. Article 178.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 14. | | BOITEUX, L. S.; MENDONCA, J. L. de; FONSECA, M. E. de N.; REIS, A.; VILELA, N. J.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; NASCIMENTO, W. M. Melhoramento de berinjela. In: NICK, C.; BORÉM, A. Melhoramento de hortaliças. Viçosa, MG: UFV, 2016. p. 158-192.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 15. | | GONZÁLEZ-ARCOS, M.; FONSECA, M. E. N.; ZANDONADI, D. B.; PERES, L. E. P.; ARRUABARRENA, A.; FERREIRA, D. S.; KEVEI, Z.; MOHABEB, F.; THOMPSON, A. J.; BOITEUX, L. S. A loss-of-function allele of TAC1-like gene (SITAC1) located on tomato chromosome 10 is a candidate for the Erectoid leaf (Erl) mutation. Euphytica, v. 215, n. 5, p. 1-16, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 16. | | GAIERO, P.; ANDINO, M.; VAIO, M.; VIDAL, R.; ABAD-NJERS, G.; AMARILLO, A.; SILVA, S.; HERNÁNDEZ, N.; RAMOS, S.; STANCOV, V.; MOREIRA, L.; HEIDEN, G.; NICOLAO, R.; TORANZA, C.; CASTILLO, A.; IBÁÑEZ, F.; RODRÍGUEZ, G.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; GALVÁN, G.; SIRI, M. I.; VILARÓ, F.; SPERANZA, P. Identificación de grupos genéticos y distribución de la variabilidad de papas silvestres para su conservación en colecciones núcleo y uso em mejoramiento genético. In: JORNADA MEJORAMIENTO GENÉTICO DE HORTALIZAS: CIENCIA Y TECNOLOGÍA PARA LA PRODUCCION Y EL CONSUMIDOR, 2019, Salto, Uruguay. Trabajos de investigación relacionados al proyecto. [Uruguay]: INIA, 2019. p. 40-43.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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