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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  17/07/2023
Data da última atualização:  22/08/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F.
Afiliação:  RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MATEUS GUIMARÃES DOS SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa.
Título:  Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle.
Ano de publicação:  2023
Fonte/Imprenta:  Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023.
DOI:  https://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Genome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-co... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Associação genômica.
Thesagro:  Bovino; Embrião Animal; Gado Gir; Genética Animal.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL26049 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoGONELA, A.; LEMOS, E. G. M.; RODRIGUES, T. de J. D.; PATERNIANI, M. L. S. Reação enzimática ao estresse salino durante a germinação de estilosantes . Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 1, p. 93-95, jan. 2004 Notas Científicas. Título em inglês: Enzymatic reaction to saline stress during stylosanthes germination.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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2.Imagem marcado/desmarcadoELIAS, H. T.; VIDIGAL, M. C. G.; GONELA, A.; VOGT, G. A. Variabilidade genética em germoplasma tradicional de feijão-preto em Santa Catarina. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 10, p. 1443-1449, out. 2007 Título em inglês: Genetic variability in traditional germplasm of common black beans in Santa Catarina State, Brazil.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSILLA, P. R.; PASSIANOTTO, A. L. L.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. O.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C.; BINNECK, E. Algoritmo computacional para determinar o perfil mínimo de marcadores moleculares que discriminam um conjunto de cultivares. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 133-135. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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4.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS, W. J.; COSTA, R. B. da; RESENDE, M. D. V. de; GONÇALVES, P. de S.; GONELA, A. Avaliação genética de procedências e progênies de erva-mate nativa (Ilex paraguariensis St. Hil.) no Estado de Mato Grosso do Sul. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil. [Búzios]: SBMP, 2011. 1CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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5.Imagem marcado/desmarcadoCARDOZO JUNIOR, E. L.; DONADUZZI, C. M.; FERRARESE-FILHO, O.; FRIEDRICH, J. C.; GONELA, A.; STURION, J. A. Quantitative genetic analysis of methylxanthines and phenolic compounds in mate progenies. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 45, n. 2, p. 171-177, fev. 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais.
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6.Imagem marcado/desmarcadoFRIEDRICH, J. C.; CARDOZO JUNIOR, E. L.; GONELA, A.; CASSOL, G. H.; KVISTCHAL, M. V.; STURION, J. A. Variabilidade genética dos teores de compostos fenólicos em um germoplasma de erva-mate cultivado no Brasil. In: CONGRESO SUDAMERICANO DE LA YERBA MATE, 5., 2011, Posadas. Actas. Posadas: Instituto Nacional de la Yerba Mate, 2011. p. 40. 1 CD-ROM. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSTURION, J. A.; FRIEDRICH, J. C.; GONELA, A.; CARDOZO JUNIOR, E. L.; KVISTCHAL, M. V.; CASSOL, G. H. Divergência genética entre progênies de erva-mate com base em dados fitoquímicos. In: CONGRESO SUDAMERICANO DE LA YERBA MATE, 5., 2011, Posadas. Actas. Posadas: Instituto Nacional de la Yerba Mate, 2011. p. 40. 1 CD-ROM. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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8.Imagem marcado/desmarcadoFRIEDRICH, J. C.; GONELA, A.; VIDIGAL, M. C. G.; VIDIGAL FILHO, P. S.; CARDOZO JUNIOR, E. L.; KVISTCHAL, M. V.; STURION, J. A. Análise da variação genética entre progênies de Ilex paraguariensis St. Hil. utilizando marcadores RAPD. In: CONGRESO SUDAMERICANO DE LA YERBA MATE, 5., 2011, Posadas. Actas. Posadas: Instituto Nacional de la Yerba Mate, 2011. p. 41. 1 CD-ROM. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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9.Imagem marcado/desmarcadoGONELA, A.; LARA, M. A. C.; SANTOS, S. A.; SERENO, J. R. B.; PELLEGRIN, A. O.; MAURO, R. A.; CONTEL, E. P. B. Caracterizacao genetica de uma populacao de porco Monteiro com emprego de quatro marcadores microssatelites. El Arca, v.1, n.5, p.119. 2002.
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal.
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10.Imagem marcado/desmarcadoPASSIANOTTO, A. L. de L.; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação do sistema de genotipagem molecular de cultivares de soja via sequenciador automático com marcadores microssatélites. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 209-213. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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11.Imagem marcado/desmarcadoPASSIANOTTO, A. L. de L.; LOPES, V. S.; RINCÃO, M. P.; NEPOMUCENO, A. L.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação do sistema de genotipagem molecular com marcadores microssatélites de cultivares de soja via sequenciador automático. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia. Charles Darwin: a origem das espécies: o livro que transformou a humanidade. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p.138.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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12.Imagem marcado/desmarcadoPASSIANOTTO, A. L. de L.; SILLA, P. R.; MARIN, S. R. R.; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C. Determinação de perfis genéticos de cultivares de soja desenvolvidos pela Embrapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... [Curitiba]: UFPR, 2010. p. 166.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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13.Imagem marcado/desmarcadoDARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; PARMEZAN, T. R.; KUWAHARA, M. K.; CARVALHO, M. C. C. G. de; GONELA, A.; SOARES, R. M.; ALMEIDA, A. M. R.; GODOY, C. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Evaluation of virulence of Phakopsora pachyrhizi monourediniais isolates collected in Brazil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: SBF, 2014. 1 CD-ROM. CBFITO 2014.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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14.Imagem marcado/desmarcadoDARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; CASTANHO, F. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; CARVALHO, M. C. da C. G. de; GODOY, C. V.; CARVALHO, S. de; GONELA, A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Characterization of genetic diversity and pathogenicity of Phakopsora pachyrhizi mono-uredinial isolates collected in Brazil. European Journal of Plant Pathology, v. 156, p. 355-372, 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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15.Imagem marcado/desmarcadoDARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; PARMEZAN, T. R.; LOPES-CAITAR, V. S.; AOYAGI, L. N.; CARVALHO, M. C. C. G. de; GODOY, C. V.; GONELA, A.; SOARES, R. M.; ALMEIDA, A. M. R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Molecular diversity of monouredinial Phakopsora pachyrhizi isolates collected in Brazil. In: WORKSHOP ON BIOTIC AND ABIOTIC STRESS TOLERANCE IN PLANTS, 2013, Ilhéus. The challenge for the 21st century: book of abstracts. [Brasília]: Embrapa: International Advanced Biology Consortium, 2013. p. 56.
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