BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, R.; LOBO, F. P. Use of an enrichment analysis strategy to detect potential new drug targets in fungal genomes. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING 2011.

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2.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, E. M. dos; LOBO, F. P. Montagem do genoma de Spathaspora arborariae, uma levedura fermentadora de xilose, para a produção de biocombustíveis. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 171-174.

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3.Imagem marcado/desmarcadoVELLOZO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. A new BLAST-based Gbrowse plugin. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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4.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION: um software paralelizado para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em escala genômica. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 163-166.

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5.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION. Versão 1.0.1. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.

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6.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; LOBO, F. P. Busca computacional por grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em Alphaherpesvirinae. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 167-170.

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7.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. Desenvolvimento de software para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 28-31.

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8.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; RODRIGUES, M. R.; FRANCO, G. M. Expanding enrichment analysis to the evolutionary space: development and validation of Kegg Orthology enrichMent - Online DetectiOn (KOMODO) to detect biased distribution of enzymatic activities in monophyletic taxa. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P0992.

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9.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Positive selection in homologous genes of Alphaherpesviruses. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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10.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; VELLOZO, A. F. Blast.pm. Versão 0.01. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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11.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.

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12.Imagem marcado/desmarcadoAGUIRRE, A. de A. R.; LOBO, F. P.; ANDREOTTI, R. Design of the ATAQ peptide and its evaluation as an immunogen to develop a Rhipicephalus vaccine. Veterinary Parasitology, v. 221, p. 30-38, 2016

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13.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Development of a computational pipeline to detect positive selection. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P1007.

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14.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. R. da; NODA, R. W.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CARNEIRO, N. P. Counting RNAseq reads: which way is better? In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado. Pôster N101.

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15.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, London, v. 16, n. 1, 567, Aug. 2015.

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16.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; LOBO, F. P.; CHUD, T.; SILVA, T. B. R.; MACHADO, M. A. A Catalog of variants in Zebu dairy cattle using next generation sequencing. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 24., 2016, San Diego. [Proceedings...] San Diego: [s.n.], 2016.

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17.Imagem marcado/desmarcadoVAZ, G. J.; CUNHA, L. S.; PIEROZZI JUNIOR, I.; CARNEIRO, S. F. de A. G.; LOBO, F. P. Tema Brasilis. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.

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18.Imagem marcado/desmarcadoAGUIAR, E.; LOBO, F. P.; OLMO, R.; FERREIRA, F.; OLIVEIRA, G.; HULTMAN, K.; JAFARI, N.; CARTHEW, R.; MARQUES, J. Understanding innate immune responses to DNA viruses using the Drosophila melanogaster model. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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19.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; LOBO, F. P.; REGITANO, L. C. de A. Estudo de associação genômica ampla utilizando Random Forest: estudo de caso em bovinos de corte. In: ARBEX, A.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics - TACG: modelos e métodos computacionais em Bioinformática. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 71-99.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.

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20.Imagem marcado/desmarcadoGERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; TEIXEIRA, J.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. Comparative transcriptome analysis of eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado. 1 pôster.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Florestas.

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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, A. P.; DIAS, P. F.; GASPARINI, K. A. C.; CAMPELLO, E. F. C.; SILVA, J. N.; RESENDE, A. S. Modelos agroflorestais implantados no projeto Replanta Guandu. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS, 7., 22 a 26 de junho de 2009, Luziânia, Goiás. [ Anais...]Goiânia: Sociedade Brasileira de Sistemas Agroflorestais, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoDOMINGUES, R.; GASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; REIS, D. R. L.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Differential expression of CXCL10 in peripheral blood of resistant and susceptible cattle to tick infestation. In: CONGRESSO BRASILEIRO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Genética, 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, A. A.; AZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, K.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; PANETTO, B. R.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Quantitative trait loci affecting lactose and total solids on chromosome 6 in Brazilian Gir dairy cattle. Genetics and Molecular Research, v. 10, n. 4, p. 3817-3827, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
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4.Imagem marcado/desmarcadoGASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; AZEVEDO, A. L. S.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. Mapeamento fino de QTL associado a resistência ao carrapato bovino no cromossomo 2. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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5.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; GASPARINI, K.; PINTO, I. S. B.; SANTIAGO, L. C.; BERNARDO, K. B.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S. Molecular characterization of Brazilian dairy gyr using microsatellite markers. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society fo Animal Science, 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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6.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; GASPARINI, K.; PINTO, I. S. B.; SANTIAGO, L. C.; BERNARDO, K.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S. Molecular characterization of Brazilian dairy gyr using microsatellite markers. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society fo Animal Science, 2010. 4 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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7.Imagem marcado/desmarcadoDOMINGUES, R.; SOUZA, L. S.; MACHADO, M. A.; CAMPOS, A. L.; AZEVEDO, A. L. S.; MENDONÇA, P. R. F.; VIEIRA, T. R.; GASPARINI, K.; AUAD, A. M. Identificação de marcadores moleculares para taxonomia de espécies de cigarrinhas (Mahanarva sp.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2008. 1 p. 1 CD.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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8.Imagem marcado/desmarcadoGASPARINI, K.; CESTARO, L. S.; BERNARDO, K. B.; PINTO, I. S. B.; STEINBERG, R. S.; DOMINGUES, R.; PALLA, P. C.; CARVALHO, M. R. S.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D. Avaliação da diversidade genética em rebanhos da raça Guzerá por meio de dados moleculares. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Aguas de Lindoia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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9.Imagem marcado/desmarcadoPINTO, I. S. B.; GASPARINI, K.; CESTARO, L. S.; DOMINGUES, R.; AZEVEDO, A. L. S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; EUCLYDES, R. F.; MACHADO, M. A. (ed.). Certificação genealógica em animais do Programa Nacional de Melhoramento de Gir Leiteiro por meio de exames de DNA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Aguas de Lindoia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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10.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, A. A.; AZEVEDO, A. L. S.; VERNEQUE, R. da S.; GASPARINI, K.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SILVA, M. V. G. B.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; MACHADO, M. A. Quantitative trait loci affecting milk production traits on bovine chromosome 6 in zebuine Gyr breed. Journal of Dairy Science, v. 94, n. 2, p. 971-980, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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11.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; PEIXOTO, M. G. C. D.; PIRES, M. de F. A.; REGITANO, L. C. de A.; SILVA, M. V. G. B.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A. Fine mapping of quantitative trait loci for tick resistance on BTA5. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ANIMAL GENETICS, 32., 2010, Edinburgh. Proceedings... Edinburgh: International Society for Animal Genetics, 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, L. A.; CESTARO, L. S.; GASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; CALDI, J. F. B.; AZEVEDO, A. L. S.; CARVALHO, M. R. S.; EGITO, A. A. do; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D. Diferenciação genética na metapopulação da raça Guzerá criada no estado de Minas Gerais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoPEIXOTO, M. G. C. D.; SANTIAGO, L. C.; STEINBERG, R. S.; GASPARINI, K.; REIS, D. R. de L.; DOMINGUES, R.; EGITO, A. A. do; CARVALHO, M. R. S.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; AZEVEDO, A. L. S. Genetic differentiation of Guzerat (Bos Indicus) metapopulation in Minas Gerais state, Brazil. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society fo Animal Science, 2010. 3 p.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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14.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, E.; AZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, K.; REIS, D. R. de L.; PRATA, M. C. de A.; FURLONG, J.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; FONSECA, L. M. G.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. Anotação de genes relacionados à resistência aos ecto e endoparasitos em bovinos de leite. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 17., 2012, São Luis. Parasitologia veterinária, bem estar e produção animal: anais. São Luis: Colégio Brasileiro de Parasitologia Veterinária, 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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15.Imagem marcado/desmarcadoBERNARDO, K. B.; GASPARINI, K.; AZEVEDO, A. L. S.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SILVA, M. V. G. B.; PIRES, M. de F. A.; REGITANO, L. C. de A.; PRATA, M. C. de A.; FURLONG, J.; MACHADO, M. A. Mapeamento fino para a detecção de QTL nos cromossomos bovinos 2, 5, 10 e 11. In: CASTRO, C. R. T. de; MACHADO, M. A.; GOMES, F. T. Programa Institucional de Iniciação Científica da Embrapa Gado de Leite: produção científica resultante da capacitação de acadêmicos pelo corpo técnico da Unidade no período de 07/2009 a 06/2010. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. p. 99-103.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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16.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, E.; AZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, K.; REIS, D. R. de L.; PRATA, M. C. de A.; FURLONG, J.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; FONSECA, L. M. G.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. Estudo de associação global para identificação de genes relacionados à resistência aos carrapatos e aos nematóides gastrintestinais em bovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 17., 2012, São Luis. Parasitologia veterinária, bem estar e produção animal: anais. São Luis: Colégio Brasileiro de Parasitologia Veterinária, 2012. p. 172.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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17.Imagem marcado/desmarcadoMACHADO, M. A.; AZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, K.; BERNARDO, K. B.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SILVA, M. V. G. B.; PRATA, M. C. de A.; FURLONG, J.; PIRES, M. de F. A.; REGITANO, L. C. de A.; VERNEQUE, R. da S. Fine-mapping of BTA 10 and BTA 11 for tick resistance in Gyr x Holstein cross. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society fo Animal Science, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, A. L. S.; GOMES, A. L.; GASPARINI, K.; CAMPOS, A. L.; DOMINGUES, R.; VIEIRA, T. R.; MENDONÇA, P. R. F.; GUIMARÃES, S. E. F.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; REGITANO, L. C. A.; MACHADO, M. A. Identificação de novos alelos microssatélites na raça Gir. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2008. p. 228.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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19.Imagem marcado/desmarcadoAZEVEDO, A. L. S.; GOMEZ, A. L.; GASPARINI, K.; CAMPOS, A. L.; DOMINGUES, R.; VIEIRA, T. R.; MENDONÇA, P. R. F.; GUIMARÃES, S. E. F.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; REGITANO, L. C. de A.; MACHADO, M. A. Identificação de novos alelos microssatélites na raça Gir. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 228.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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20.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, E.; AZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, K.; REIS, D. R. de L.; PRATA, M. C. de A.; FURLONG, J.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; ANDRADE, L. G.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. Genome wide association study to identify loci for resistance to gastrointestinal nematodes in cattle. In: SÃO PAULO ADVANCED SCHOOL OF SCIENCE, 1., 2011, São Carlos, SP. Advances in the knowledge of parasite resistance of ruminant hosts and parasites: proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Southeastern Region Animal Husbandry, 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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