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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
19/05/2017 |
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Data da última atualização: |
05/07/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
CARVALHO, G. A. B. de. |
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Afiliação: |
GESIELE ALMEIDA BARROS DE CARVALHO, UEL. |
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Título: |
Análise transcricional dos genes envolvidos na nodulação e predição in silico de microRNAs em raízes de soja inoculadas com a estirpe CPAC 15 de Bradyrhizobium japonicum. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
2012. |
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Páginas: |
93 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Orientada por Mariangela Hungria. |
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Conteúdo: |
CONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defesa antioxidante. Funções putativas na simbiose de alguns desses genes foram atribuídas pela primeira vez na simbiose soja-Bradyrhizobium. Foi também realizada uma minuciosa predição in silico de miRNAs e seus alvos que, possivelmente, estão envolvidos na regulação da nodulação. Foram identificados nove miRNAs potenciais, bem como seus possíveis genes alvos. Os resultados obtidos permitiram obter um melhor entendimento sobre a regulação da expressão gênica em soja dez dias pós-inoculação, bem como fortaleceram a ideia de que a predição computacional de miRNAs pode auxiliar na compreensão das etapas iniciais da simbiose. O estudo é pioneiro com uma cultivar de soja e estirpe brasileiras. ABSTRACT: Abstract: Biological nitrogen fixation is a process of great importance to the soybean crop, capable of supplying all plant's needs on nitrogen, necessary for the synthesis of biomolecules. However, for nodule formation all steps should be closely coordinated by a series of molecular signals between the plant and bacterium. Therefore, the biological process involves several complex steps, and although it has been studied for several decades, much remains to be understood. This study aimed to analyze the global expression of genes differentially expressed in soybean roots of cultivar Conquista inoculated with Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (=SEMIA 5079), both broadly used in Brazil. In addition, we performed a computationally prediction of new miRNAs that may be involved in regulating the process. To achieve this we used the suppressive subtractive hybridization technique combined with the new generation sequencing and bioinformatics analyses, which resulted in a subtractive library (non-inoculated X inoculated) of soybean roots with 3,210 differentially expressed transcripts. The data were grouped according to the ontology of molecular function and biological process. Next, we analyzed the most active metabolic pathways at this stage of nodulation, and emphasis was given to genes related to the primary metabolism, cell wall modifications and antioxidant defense system. Putative functions were attributed to some of these genes for the first time. We have also performed a detailed in silico prediction of miRNAs and their targets, which are possibly involved in regulation of nodulation. Nine potential miRNAs were identified, as well as the possible target genes. The results obtained have allowed to get a better understanding about the regulation of gene expression in soybean ten days post-inoculation, as well as have reinforced the idea that the computational prediction of miRNAs may help to understand the initial steps of the symbiosis. Moreover, the study is pioneer with a Brazilian soybean cultivar and a Brazilian Bradyrhizobium strain. MenosCONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defes... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Fixação de nitrogênio; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Nitrogen fixation; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 27 | |
| 2. |  | FREITAS, T. C. de; GOMES, G. C.; MOLINA, A. R.; GUARINO, E. de S. G.; ISERHARD, C. A.; BELTRAME, R. Artificial perches increase bird-mediated seed rain in agricultural fallow area in southern Brazil. Web Ecology, v. 22, n. 2, p. 59-74, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
|    |
| 3. | | FREITAS, T. C. de; AMARAL, S. W. do; MIURA, A. K.; SOUSA, L. P. de; GUARINO, E. de S. G. Lista preliminar das espécies com potencial para restauração de formações florestais no bioma Pampa. In: ENCONTRO DE BOTÂNICOS DO RIO GRANDE DO SUL, 16.; ENCONTRO ESTADUAL DE HERBÁRIOS, 8., 2015, Erechim. A botânica na contemporaneidade: anais. Erechim: URI: SBB: UPF, 2015. p. 53. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas. |
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| 4. | | GOMES, G. C.; MOLINA, A. R.; GUARINO, E. de S. G.; FREITAS, T. C. de; PERLEBERG, T. D. New records and range extension of Habenaria dutrae Schltr. (Orchidaceae) in southern Rio Grande do Sul, Brazil. Check List, v. 14, n. 6, p. 1083-1087, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 5. | | LUCAS, R. R.; FREITAS, T. C. de; ESPINDOLA, V. S.; GOMES, G. C.; GUARINO, E. de S. G.; SOUSA, L. P. de; MIURA, A. K. Influência do tempo de armazenamento na emergência de Dodonaea viscosa Jacq. (Sapindaceae). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: anais. Vitória: SBB, 2016. 2 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 6. | | RAMOS, M. A.; FUENTE, S. H.; FREITAS, T. C. de; BARBOSA, K. T.; GUARINO, E. de S. G.; REICHERT, A. A.; LAZAROTTO, M.; BELTRAME, R. Exploring the potential of Pittosporum undulatum wood: a comprehensive analysis of the main technological properties. Ciência Florestal, v. 35, e89663, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 7. | | FREITAS, T. C. de; BELTRAME, R.; GOMES, G. C.; MOLINA, A. R.; LAZAROTTO, M.; ISERHARD, C. A.; BORDIN, K. M.; CARVALHO, F. A.; GUARINO, E. de S. G. Effects of Pittosporum undulatum Vent. invasion on forest diversity and structure in Southern Brazil. New Zealand Journal of Botany, 8 Dec. 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | FREITAS, T. C. de; GUARINO, E. de S. G.; GOMES, G. C.; MOLINA, A. R.; REAL, I. M. da L.; BELTRAME, R. The effect of seed ingestion by a native, generalist bird on the germination of worldwide potentially invasive trees species Pittosporum undulatum and Schinus terebinthifolia. Acta Oecologica, v. 108, 103639, 2020. 6 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | TEIXEIRA, A. A. D.; NORONHA, A. H.; FREITAS, T. C. de; CUNHA, H. N.; GUARINO, E. de S. G.; MIURA, A. K. Levantamento de viveiros dos estados de Santa Catarina e Rio Grande do Sul cadastrados no RENASEM/MAPA. Cadernos de Agroecologia, v. 13, n. 1, jul. 2018. Suplemento. Edição dos Anais do 10 Congresso Brasileiro de Agroecologia; 6 Congresso Latino-americano de Agroecologia; 5 Seminário de Agroecologia do Distrito Federal e Entorno, Brasília, DF, set. 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | FREITAS, T. C. de; GUARINO, E. de S. G.; SOUSA, L. P. de; MIURA, A. K.; LUCAS, R. R.; ESPINDOLA, V. S.; RIBEIRO, J. F.; GOMES, G. C. Lista de espécies arborescentes e arbóreas para restauração ecológica de formações florestais no bioma Pampa. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: anais. Vitória: SBB, 2016. 2 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas. |
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| 13. | | FREITAS, T. C. de; GAZZOLA, M. D.; SOARES, M. M.; GUARINO, E. de S. G.; REAL, I. M. da L.; BELTRAME, R. Fitossociologia de fragmento de floresta estacional semidecidual com presença da bioinvasora Pittosporum undulatum Vent. In: SEMANA INTEGRADA UFPEL, 5.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 21., 2019, Pelotas. [Anais]. 4 p. ENPOS.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. | | GUARINO, E. de S. G.; MIURA, A. K.; SOUSA, L. P. de; GOMES, G. C.; FREITAS, T. C. de; MOLINA, A. R. Restauração ecológica para a agricultura familiar. In: WOLFF, L. F.; MEDEIROS, C. A. B. (ed.). Alternativas para a diversificação da agricultura familiar de base ecológica. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2017. p. 17-29. (Embrapa Clima Temperado. Documentos, 443).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 15. | | FREITAS, T. C. de; MOLINA, A. R.; SILVEIRA JUNIOR, A. L. G.; PINHEIRO, S. M.; CUNHA, Henrique Noguez da; GUARINO, E. de S. G. Sistemas agroflorestais como alternativa à adequação ambiental através da ferramenta WebAmbiente no bioma Pampa. Cadernos de Agroecologia, v. 19, n. 1, 2024. Edição dos Anais do XII Congresso Brasileiro de Agroecologia, Rio de Janeiro, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 16. | | LUCAS, R. R.; FREITAS, T. C. de; GOMES, G. C.; GUARINO, E. de S. G.; SOUSA, L. P. de; COSTA, C. J.; MIURA, A. K. Tempo médio de germinação e germinabilidade de sementes de Myrsine coriacea (Sw.) R.Br. ex Roem. & Schult. (Primulaceae) submetidas a diferentes tratamentos para superação de dormência. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: anais. Vitória: SBB, 2016. 2 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 17. | | FREITAS, T. C. de; LUCAS, R. R.; GOMES, G. C.; GUARINO, E. de S. G.; SOUSA, L. P. de; MIURA, A. K. Teste de viabilidade de armazenamento para sementes de guaçatunga (Casearia decandra Jacq.). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: anais. Vitória: SBB, 2016. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 18. | | LUCAS, R. R.; GOMES, G. C.; GUARINO, E. de S. G.; FREITAS, T. C. de; AMARAL, S. W. do; SOUSA, L. P. de; MIURA, A. K.; COSTA, C. J. Germinação de sementes de Myrsine coriacea (Primulaceae) submetidas a diferentes tratamentos para superação da dormência. Iheringia, Série Botânica, Porto Alegre, v. 73, n. 2, p. 108-113, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 19. | | GUARINO, E. de S. G.; FREITAS, T. C. de; GOMES, G. C.; MOLINA, A. R.; MIURA, A. K.; HENZEL, A. B. D.; SOUSA, L. P. de; KAISER, M.; SPIERING, V.; SARTORI, C. O. Guia para identificação de mudas de espécies arbóreas indicadas para restauração florestal no Rio Grande do Sul. Brasília, DF: Embrapa, 2023. 168 p.| Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 20. | | FREITAS, T. C. de; GOMES, G. C.; GUARINO, E. de S. G.; MOLINA, A. R.; MEDEIROS, F. S.; SOUZA, L. C. da S.; MIURA, A. K.; SOUSA, L. P. de; CARDOSO, J. H. Effect of the seed maturation stage and pre-germination treatments on emergence of Erythrina crista-galli L. Iheringia, Série Botânica, Porto Alegre, v. 75, e2020007, 2020. 6 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Clima Temperado. |
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