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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
13/11/2018 |
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Data da última atualização: |
03/01/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OKINO, C. H.; IBELLI, A. M. G.; BRENTANO, L.; ZANELLA, R.; MARQUES, M. G. |
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Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; LIANA BRENTANO, CNPSA; Ricardo Zanella, Universidade de Passo Fundo; MARIANA GROKE MARQUES, CNPSA. |
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Título: |
Evaluation of candidate reference genes for investigation of the uterine tissue and corpus luteum of pigs on day 6 after artificial insemination. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Reproduction Science, v. 198, p. 202-209, 2018. |
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DOI: |
10.1016/j.anireprosci.2018.09.020 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Housekeeping genes (HKG) are genes necessary for the maintenance of basal cellular functions, regardless of the specific roles within a tissue. It, therefore, is expected that these genes will maintain a relatively constant expression profile when there are varying physiological conditions. The identification of tissue specific reference genes is highly important for the normalization of gene expression profiles among different tissues. In this sow study, the objective was to identify stable reference genes in the uterine tissue and corpus luteum (CL), 6 days post-artificial insemination. The stability of ubiquitin (UBB), glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), DNA topoisomerase 2-beta (TOP2B), histone H3 (H3F3A) and hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1) abundances of mRNA were evaluated using the Bestkeeper technique. Briefly, total RNA was extracted for each tissue from 20 gilts (n=20), processed by RT-qPCR and submitted to analysis using the Bestkeeper technique, which allowed for the evaluation of the consistency in abundance of mRNA for the reference genes. For all evaluated genes, the abundance of mRNA was relatively consistent in the uterine tissue, with the greatest abundance being for the GAPDH and TOP2B genes. The analysis of these genes in the CL, however, indicated there was a relatively greater variation of mRNA abundance for the various reference genes. Data suggest that UBB was the reference gene with the most consistent relative abundance of mRNA and that this gene could be used as a reference for corpora lutea analyses of mRNA MenosHousekeeping genes (HKG) are genes necessary for the maintenance of basal cellular functions, regardless of the specific roles within a tissue. It, therefore, is expected that these genes will maintain a relatively constant expression profile when there are varying physiological conditions. The identification of tissue specific reference genes is highly important for the normalization of gene expression profiles among different tissues. In this sow study, the objective was to identify stable reference genes in the uterine tissue and corpus luteum (CL), 6 days post-artificial insemination. The stability of ubiquitin (UBB), glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), DNA topoisomerase 2-beta (TOP2B), histone H3 (H3F3A) and hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1) abundances of mRNA were evaluated using the Bestkeeper technique. Briefly, total RNA was extracted for each tissue from 20 gilts (n=20), processed by RT-qPCR and submitted to analysis using the Bestkeeper technique, which allowed for the evaluation of the consistency in abundance of mRNA for the reference genes. For all evaluated genes, the abundance of mRNA was relatively consistent in the uterine tissue, with the greatest abundance being for the GAPDH and TOP2B genes. The analysis of these genes in the CL, however, indicated there was a relatively greater variation of mRNA abundance for the various reference genes. Data suggest that UBB was the reference gene with the most consistent relative a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
GAPDH; Housekeeping; TOP2B. |
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Thesagro: |
Inseminação; Reprodução Animal; Suíno; Útero. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Sows; Ubiquitin. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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520 $aHousekeeping genes (HKG) are genes necessary for the maintenance of basal cellular functions, regardless of the specific roles within a tissue. It, therefore, is expected that these genes will maintain a relatively constant expression profile when there are varying physiological conditions. The identification of tissue specific reference genes is highly important for the normalization of gene expression profiles among different tissues. In this sow study, the objective was to identify stable reference genes in the uterine tissue and corpus luteum (CL), 6 days post-artificial insemination. The stability of ubiquitin (UBB), glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), DNA topoisomerase 2-beta (TOP2B), histone H3 (H3F3A) and hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase 1 (HPRT1) abundances of mRNA were evaluated using the Bestkeeper technique. Briefly, total RNA was extracted for each tissue from 20 gilts (n=20), processed by RT-qPCR and submitted to analysis using the Bestkeeper technique, which allowed for the evaluation of the consistency in abundance of mRNA for the reference genes. For all evaluated genes, the abundance of mRNA was relatively consistent in the uterine tissue, with the greatest abundance being for the GAPDH and TOP2B genes. The analysis of these genes in the CL, however, indicated there was a relatively greater variation of mRNA abundance for the various reference genes. Data suggest that UBB was the reference gene with the most consistent relative abundance of mRNA and that this gene could be used as a reference for corpora lutea analyses of mRNA
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 1. |  | CHAVES, S. S. de F.; FERNANDES, P. C. C.; FREITAS, D. R. de. Integração lavoura-pecuária-floresta-análise e síntese do conhecimento por meio de meta-análise. In: SEMINÁRIO CIENTÍFICO DA UFRA, 7.; SEMINÁRIO [DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA] DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 13.; SEMINÁRIO DE PESQUISA DA UFRA, 1., 2009, Belém, PA. Pesquisa e desenvolvimento tecnológico na formação do jovem cientista: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | CHAVES, S. S. de F.; SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C.; FREITAS, D. R. de; BARBOSA, C. V.; SILVA, J. S. P. L. da. Avaliação de pastagens em pequenas propriedades produtoras de leite em assentamentos rurais no Sudeste do Estado do Pará. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 45., 2008, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2008. p. 1-3.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | CHAVES, S. S. de F.; FERNANDES, P. C. C.; FREITAS, D. R. de; ALVES, L. W. R.; SILVA, A. V.; SILVEIRA FILHO, A.; VELOSO, C. A. C. Sistemas de integração lavoura-pecuária-floresta: meta-análise dos resultados no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 26., 2009, Gramado. Agricultura forte: alimento, energia e meio ambiente. Gramado: CONFAEAB: SARGS, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | CHAVES, S, S, de F.; FREITAS, D. R. de; SILVA, I. M. da; GARCIA, W. S.; SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C. Comportamento do consumidor de leite de Belém (PA). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 19., 2009, Águas de Lindóia. Visão estratégica de cadeias do agronegócio: anais. Pirassununga: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2009. Não paginado. ZOOTEC 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | FERNANDES, P. C. C.; FREITAS, D. R. de; CHAVES, S. S. de F.; SILVA, A. V.; ALVES, L. W. R.; SILVEIRA FILHO, A. Consolidação das pesquisas em integração lavoura-pecuária-floresta no Brasil. In: WORKSHOP INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA-FLORESTA NA EMBRAPA, 2009, Brasília, DF. Resumos e palestras apresentados. Brasília, DF: Embrapa, 2009. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | FERNANDES, P. C. C.; FREITAS, D. R. de; CHAVES, S. S. de F.; SILVA, A. V.; ALVES, L. W. R.; SILVEIRA FILHO, A. Consolidação das pesquisas em integração lavoura-pecuária-floresta no Brasil. In: WORKSHOP INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA-FLORESTA EM RONDÔNIA, 1., 2010, Porto Velho. Resumos expandidos... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2010. p. 30-35. (Embrapa Rondônia. Documentos, 141) Editado por Vicente de Paulo Campos Godinho, Marley Marico Utumi, Rodrigo Luis Brogin, Paulo Campos Christo Fernandes, Daniela Maciel Pinto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Rondônia. |
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| 7. | | CHAVES, S. S. de F.; FREITAS, D. R. de; SANTANA, A. C. de; SILVA, I. M. da; SILVA, A. V.; GARCIA, W. S.; FERNANDES, P. C. C. Hábitos do consumidor de leite belenese. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 19., 2009, Águas de Lindóia. Visão estratégica de cadeias do agronegócio: anais. Pirassununga: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2009. Não paginado. ZOOTEC 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 8. | | CHAVES, S. S. de F.; FERNANDES, P. C. C.; FREITAS, D. R. de; SILVA, A. V.; ALVES, L. W. R.; SILVEIRA FILHO, A.; VELOSO, C. A. C. Meta-análise em sistemas de integração agropecuários. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 26., 2009, Gramado. Agricultura forte: alimento, energia e meio ambiente. Gramado: CONFAEAB: SARGS, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 9. | | SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C.; TOURINHO, M. M.; FREITAS, D. R. de; PEIXOTO, T. C. da S.; MELO, W. de O. Estrutura familiar na pecuária leiteira em assentamentos rurais no sudeste paraense - bem-estar. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: Unesp: SBZ, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 10. | | SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C.; PEIXOTO, T. C. da S.; FREITAS, D. R. de; RIBEIRO, P. J.; RIBEIRO, V. C. dos A. Estrutura familiar na pecuária leiteira em assentamentos rurais no sudeste paraense diante da nova legislação: capacidade de adequação à instrução normativa 51. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: Unesp: SBZ, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 11. | | FREITAS, D. R. DE; MOTA, M. do S. C. de S.; CARMO, D. DAS G. DO; PICANÇO, M. M.; LOPES, M. C.; PANCIERI, G. P.; MESQUITA, A. L. M.; GONDIM, R. S.; PICANÇO, M. C. Control decision-making systems for Anacampsis phytomiella in cashew orchards as a function of insecticide spray method and irrigation use. Agricultural and Forest Entomology, p. 1-10, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 12. | | FERREIRA, R. N.; SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C.; FREITAS, D. R. de; PAULINO, R. M.; RIBEIRO, V. C. dos A. e S.; SILVA, W. M. da; MACEDO, P. J. R.; OLIVEIRA, E. J. do N. Produção de leite na pecuária familiar, em função do número de vacas ordenhas, períodos do ano e contagem de células somáticas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUALIDADE DO LEITE, 2., 2006, Goiânia. Anais... Goiânia: FUNAPE, 2006. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 13. | | CHAVES, S. S. de F.; FREITAS, D. R. de; SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C.; MELO, W. de O.; BARBOSA, F. I.; SILVA, J. S. L. P. da. Levantamento da infestação de plantas daninhas em pequenas propriedades produtoras de leite em assentamentos rurais no Sudeste do Estado do Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 19., 2009, Águas de Lindóia. Visão estratégica de cadeias do agronegócio: anais. Pirassununga: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2009. Não paginado. ZOOTEC 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 14. | | FERREIRA, R. N.; SILVA, A. V.; FERNANDES, P. C. C.; ARAÚJO, C. V. de; FREITAS, D. R. de; PAULINO, R. M.; RIBEIRO, C. C. dos A. e S.; SILVA, W. M. da; MACEDO, P. J. R.; OLIVEIRA, E. J. do N. Contagem de células somáticas influenciando a composição química do leite nos assentamentos rurais Palmares I e II. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUALIDADE DO LEITE, 2., 2006, Goiânia. Anais... Goiânia: FUNAPE, 2006. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 15. | | MULLER, A. G.; OLIVEIRA, A. D. de; ANTONINI, J. C. dos A.; SILVA, F. A. M. da; ALVES, M. E. B.; MALAQUIAS, J. V.; XAVIER, K. dos S.; BORETES, A. G. de S.; SILVA, L. R. M. S.; FREITAS, D. R. de. Determinação dos coeficientes de extinção e de eficiência de uso da radiação interceptada para a soja BRS 7482 RR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 22., 2023, Natal. A agrometeorologia e a agropecuária: adaptação às mudanças climáticas: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2023. p. 618-628.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| Registros recuperados : 15 | |
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