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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
03/10/2022 |
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Data da última atualização: |
03/10/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
COMIN, H.; CAMPOS, G. S.; DOMINGUES, R.; GASPAR, E. B.; SOLLERO, B. P.; CARDOSO, F. F. |
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Afiliação: |
HELENA B. COMIN, Universidade Federal de Pelotas; G. S. CAMPOS, Universidade Estadual Paulista; ROBERT DOMINGUES, CPPSUL; EMANUELLE BALDO GASPAR, CPPSUL; BRUNA PENA SOLLERO, GPM; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
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Título: |
Genetic parameters and accuracy of traditional and genomic breeding values for resistance to infectious bovine keratoconjunctivitis in Hereford. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 264, 105078, Oct. 2022. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A B S T R A C T The objectives of this research were to estimate genetic parameters using a threshold animal model by traditional (pedigree and phenotype), single-step genomic BLUP (ssGBLUP) and Weighted ssGBLUP (WssGBLUP) methods, and assess the relative increase in accuracy with the addition of genomic information on the estimation of breeding values for the incidence of infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) in Hereford cattle. The data used in this study were obtained from animals belonging to four farms of Delta G breeders association and genetically evaluated by the Delta G breeding program, born between 2015 and 2017, totaling 293,716 individuals in the pedigree data and 1,579 phenotypes for IBK (1 = absence of disease or 2 = presence of disease). The genotypic data, after quality control, retained 37,505 SNP markers and 1,401 samples. A Bayesian framework and a threshold animal model were used to estimate variance components and to predict breeding values. Animals with genotype and phenotype for the traits studied were divided into 3 groups by random and k-means clustering cross-validation strategies. The estimate of direct heritability for resistance to IBK was 0.12 ± 0.01 and 0.10 ± 0.01 through PBLUP and ssGBLUP methods. The mean realized prediction accuracies based on linear regression statistics were 0.36, 0.65 and 0.70, respectively for PBLUP, ssGBLUP and WssGBLUP; therefore, the use of the genomic relationship matrices was superior to the pedigree-based method. When using the WssGBLUP method, there was an additional increase in prediction accuracy when compared to the ssGBLUP method, which was already substantially better than PBLUP. The prediction of breeding values using genomic information by the single-step methods should result in more accurate selection decisions compared to traditional pedigree evaluations and, consequently, genomic selection can be readily applied with moderately high reliability to help reduce the incidence of IBK in Hereford cattle. MenosA B S T R A C T The objectives of this research were to estimate genetic parameters using a threshold animal model by traditional (pedigree and phenotype), single-step genomic BLUP (ssGBLUP) and Weighted ssGBLUP (WssGBLUP) methods, and assess the relative increase in accuracy with the addition of genomic information on the estimation of breeding values for the incidence of infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) in Hereford cattle. The data used in this study were obtained from animals belonging to four farms of Delta G breeders association and genetically evaluated by the Delta G breeding program, born between 2015 and 2017, totaling 293,716 individuals in the pedigree data and 1,579 phenotypes for IBK (1 = absence of disease or 2 = presence of disease). The genotypic data, after quality control, retained 37,505 SNP markers and 1,401 samples. A Bayesian framework and a threshold animal model were used to estimate variance components and to predict breeding values. Animals with genotype and phenotype for the traits studied were divided into 3 groups by random and k-means clustering cross-validation strategies. The estimate of direct heritability for resistance to IBK was 0.12 ± 0.01 and 0.10 ± 0.01 through PBLUP and ssGBLUP methods. The mean realized prediction accuracies based on linear regression statistics were 0.36, 0.65 and 0.70, respectively for PBLUP, ssGBLUP and WssGBLUP; therefore, the use of the genomic relationship matrices was superior to the pedigree-based ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Resistência a doença; Seleção genômica. |
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Thesagro: |
Gado de Corte; Parâmetro Genético. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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005 2022-10-03
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520 $aA B S T R A C T The objectives of this research were to estimate genetic parameters using a threshold animal model by traditional (pedigree and phenotype), single-step genomic BLUP (ssGBLUP) and Weighted ssGBLUP (WssGBLUP) methods, and assess the relative increase in accuracy with the addition of genomic information on the estimation of breeding values for the incidence of infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) in Hereford cattle. The data used in this study were obtained from animals belonging to four farms of Delta G breeders association and genetically evaluated by the Delta G breeding program, born between 2015 and 2017, totaling 293,716 individuals in the pedigree data and 1,579 phenotypes for IBK (1 = absence of disease or 2 = presence of disease). The genotypic data, after quality control, retained 37,505 SNP markers and 1,401 samples. A Bayesian framework and a threshold animal model were used to estimate variance components and to predict breeding values. Animals with genotype and phenotype for the traits studied were divided into 3 groups by random and k-means clustering cross-validation strategies. The estimate of direct heritability for resistance to IBK was 0.12 ± 0.01 and 0.10 ± 0.01 through PBLUP and ssGBLUP methods. The mean realized prediction accuracies based on linear regression statistics were 0.36, 0.65 and 0.70, respectively for PBLUP, ssGBLUP and WssGBLUP; therefore, the use of the genomic relationship matrices was superior to the pedigree-based method. When using the WssGBLUP method, there was an additional increase in prediction accuracy when compared to the ssGBLUP method, which was already substantially better than PBLUP. The prediction of breeding values using genomic information by the single-step methods should result in more accurate selection decisions compared to traditional pedigree evaluations and, consequently, genomic selection can be readily applied with moderately high reliability to help reduce the incidence of IBK in Hereford cattle.
650 $aGado de Corte
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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Biblioteca |
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Origem |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 1. |  | REIS, F. L. F. dos; BROGIN, R. L.; DUARTE, J. P.; GROEFF, A. J. F.; UTUMI, M. M.; GODINHO, V. de P. C. Avaliação de cultivares de soja (Glycine max (L.) Merrill) em diferentes espaçamentos e densidades de plantas. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 1., 2010, Porto Velho. Anais... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2010. p. 48. (Embrapa Rondônia. Documentos, 140).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia; Embrapa Soja. |
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| 2. | | SIQUEIRA, P. R. B.; GONÇALVES, L. L.; DUARTE, J. P.; ROSA, J. S.; COSTA, E. L. S.; FERREIRA, C. D.; MARIOT, M. P.; BARBIERI, R. L. Avaliação do crescimento em progênies de espinheira-santa (Maytenus ilicifolia): acesso 116 ao 137. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 9., 2007, Pelotas. Pesquisa e responsabilidade ambiental: resumos... Pelotas : UFPel: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, 2007. 01 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 3. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; MONTEIRO, P. M. F. O.; KASTER, M.; ASSUNÇÃO, M. S.; SOUZA, P. I. M. BRSGO Caiapônia: extensão de indicação para o Estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 369-370. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; MONTEIRO, P. M. F. O.; KASTER, M.; ASSUNÇÃO, M. S.; SOUZA, P. I. M. BRSGO Caiapônia: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 369-370. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 5. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A. BRS Gralha: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 361-362. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A. BRS Gralha: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 361-362. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 7. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; DIAS, W. P.; SILVA, J. F. V.; HIROMOTO, D. M.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A. BRS Jiripoca: extensão de indicação para o Estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 363-364. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 8. | | ANDRIGHETTO, C.; MATEUS, G. P.; SANTOS, W. dos; MORAES, M. L. T. de; LUPATINI, G. C.; PORFIRIO-DA-SILVA, V.; SEKIYA, B. M. S.; DUARTE, J. P. F.; PINTO, B. V. G.; SILVA, J. R. da. Damage to eucalyptus caused by cattle in integrated crop-livestock-forestry systems with different tree arrangements in western São Paulo State, Brazil. Agroforestry Systems, v. 98, p. 3035-3044, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 9. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; FARIA, L. C.; ROLIM, R. B.; MONTEIRO, P. M. F. O.; NUNES JÚNIOR, J.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A.; SOUZA, P. I. M.; ARANTES, N. E.; NEIVA, L. C. S.; GUIMARÃES, L. B.; SILVA, L. O. BRSGO 204 [Goiânia]: extensão de indicação para o Estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 367-368. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 10. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; FARIA, L. C. de; ROLIM, R. B.; MONTEIRO, P. M. F. O.; NUNES JÚNIOR, J.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A.; SOUZA, P. I. M.; ARANTES, N. E.; NEIVA, L. C. S.; GUIMARÃES, L. B.; SILVA, L. O. BRSGO 204 [Goiânia]: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 367-368. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, Cesar de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 11. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; FARIA, L. C.; ROLIM, R. B.; MONTEIRO, P. M. F. O.; NUNES JÚNIOR, J.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A.; SOUZA, P. I. M.; ARANTES, N. E.; NEIVA, L. C. S.; GUIMARÃES, L. B.; SILVA, L. O. BRSGO 204 [Goiânia]: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 367-368. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, Cesar de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 12. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; MONTEIRO, P. M. F. O.; FARIA, L. C. de; NUNES JUNIOR, J.; ALMEIDA, L. A.; KIIHL, R. A. S.; GUIMARÃES, L. B.; SILVA, L. O.; NEIVA, L. C. S.; VIEIRA, N. E.; ARANTES, N. E.; SOUZA, P. I. M. BRSGO Luziânia: extensão de indicação para o Estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 371-372. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 13. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; MONTEIRO, P. M. F. O.; FARIA, L. C. de; NUNES JÚNIOR, J.; ALMEIDA, L. A.; KIIHL, R. A. S.; GUIMARÃES, L. B.; SILVA, L. O.; NEIVA, L. C. S.; VIEIRA, N. E.; ARANTES, N. E.; SOUZA, P. I. M. BRSGO Luziânia: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 371-372. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, Cesar de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Rondônia. |
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| 14. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; ARANTES, N. E.; ALMEIDA, L. A.; SOUZA, P. I. M.; YORINORI, J. T.; DIAS, W. P.; ALMEIDA, A. M. R. BRS Favorita RR: extensão de indicação para o Estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 359-360. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia; Embrapa Soja. |
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| 15. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; DIAS, W. P.; SILVA, J. F. V.; HIROMOTO, D. M.; KIIHL, R. A. S.; ALMEIDA, L. A. BRS Jiripoca: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 363-364. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 16. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; OLIVEIRA, A. C. B.; KIIHL, R. A. S.; ARANTES, N. E.; ALMEIDA, L. A.; SOUZA, P. I. M.; ASSUNÇÃO, M. S.; PRADO, E. E.; PULCINELLI, C. E. BRS Valiosa RR: extensão de indicação para o Estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 365-366. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 17. | | BROGIN, R. L.; GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; ALVES, J. C.; RIBEIRO, I. A.; REIS, F. L. F.; DUARTE, J. P.; OLIVEIRA, A. C. B. de; KIIHL, R. A. S.; ARANTES, N. E.; ALMEIDA, L. A.; SOUZA, P. I. M.; ASSUNÇÃO, M. S.; PRADO, E. E.; PULCINELLI, C. E. BRS Valiosa RR: extensão de indicação para o estado de Rondônia. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 31., 2010, Brasília, DF. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 365-366. Editores técnicos: Adilson de Oliveira Junior, Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Bôas de Campo Leite, César de Castro, Jussara Flores de Oliveira Arbues, Wellington Cavalcanti.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| Registros recuperados : 17 | |
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| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
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