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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
12/05/2022 |
Data da última atualização: |
12/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
Autoria: |
ALMEIDA, D. P. de. |
Afiliação: |
DÊNIA PIRES DE ALMEIDA, UFV. |
Título: |
Clonagem e caracterização de um novo gene putativo de resistência do cafeeiro a Hemileia vastatrix e aplicação na seleção assistida. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
2019. |
Páginas: |
52 f. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. Orientadora: Eveline Teixeira Caixeta, CNPCa. |
Conteúdo: |
A ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo Hemileia vastatrix, é uma das doenças mais preocupantes para a cafeicultura mundial. A alta variabilidade genética desse fungo e, consequentemente, o surgimento de novas raças do patógeno, tem resultado na suplantação da resistência de cultivares lançadas pelos programas de melhoramento genético. Para desenvolver cultivares com resistência durável, é essencial o entendimento dos genes de resistência envolvidos e seus mecanismos moleculares de atuação na resistência. Dessa forma, nesse estudo, foi realizada a clonagem e caracterização molecular de um novo gene (Receptor Like Kinase) presente no Híbrido de Timor (HdT) CIFC 832/2, uma das principais fontes de resistência dos programas de melhoramento. A clonagem foi realizada a partir de screening de uma biblioteca de clones BAC (Bacterial Artificial Chromosomes), usando um gene que foi selecionado de biblioteca subtrativa entre interação compatível e incompatível de Cafeeiro-H. vastatrix. A sequência da BAC selecionada foi analisada, sendo identificado dois genes putativo para resistência do cafeeiro. Por meio de RT-qPCR, um dos genes, denominado de HdT_LRR_RLK2 (Leucine-rich repeat rececptor like kinase), apresentou pico de expressão apenas na interação incompatível, sendo esse considerado um novo gene putativo de resistência do cafeeiro a H. vastatrix. A partir desse gene caracterizado, foi desenvolvido um marcador molecular funcional, o qual foi analisado e validado em um conjunto de clones de cafeeiros diferenciadores de raças de H. vastatrix e, então, usados na seleção assistida (SAM). Na SAM, cafeeiros em diferentes gerações de melhoramento foram analisados com o marcador funcional desenvolvido, além de outros marcadores previamente obtidos e associados a diferentes genes de resistência a H. vastatrix. Foi utilizado marcadores SCAR, CAPS e SSR flanqueando dois locos (genes maiores) de resistência a raças I, II e patótipo 001 de H. vastatrix, previamente localizados em mapa genético, além de marcador funcional originado de outro gene clonado (CC-NBS-LRR) alocado em outra região do mapa genético. Nesse trabalho, também foram usados os marcadores CBD-Sat207 e CBD-Sat235 associados ao gene Ck1 de resistência a Coffee Berry Disease (CBD). Essa doença se encontra presente somente no continente africano, no entanto, o uso dos marcadores permite realizar melhoramento preventivo para essa importante doença. Nas gerações F2, F3 e x Retrocruzamento Suscetível (RCS2) (Híbrido de Timor UFV 443-03 x Catuaí Amarelo IAC 64), as plantas foram genotipadas e fenotipadas com a raça II de H. vastatrix, para validação dos marcadores. As populações F3:4 e RCS3 foram genotipados com os marcadores validados. Foram identificados na F3:4 cafeeiros com o genótipo AABBCCDDEe e no RCS3, genótipo AaBbCcD_E_, sendo que o loco A, B, C e D correspondem aos quatro locos de resistência a H. vastatrix e E ao loco de resistência a CBD. A SAM permitu a identificação e obtenção de piramidação de múltiplos genes de resistência a ferrugem e a CBD. Os genótipos identificados serão usados para avanço de geração e plantados para os testes de campo. O uso das estratégias de SAM e piramidação de genes têm potencial de obtenção de resistência duradoura à doenças, além de reduzir tempo, espaço e custo dos testes de campo, por permitirem o descarte de plantas contendo os alelos recessivos nos diferentes locos. MenosA ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo Hemileia vastatrix, é uma das doenças mais preocupantes para a cafeicultura mundial. A alta variabilidade genética desse fungo e, consequentemente, o surgimento de novas raças do patógeno, tem resultado na suplantação da resistência de cultivares lançadas pelos programas de melhoramento genético. Para desenvolver cultivares com resistência durável, é essencial o entendimento dos genes de resistência envolvidos e seus mecanismos moleculares de atuação na resistência. Dessa forma, nesse estudo, foi realizada a clonagem e caracterização molecular de um novo gene (Receptor Like Kinase) presente no Híbrido de Timor (HdT) CIFC 832/2, uma das principais fontes de resistência dos programas de melhoramento. A clonagem foi realizada a partir de screening de uma biblioteca de clones BAC (Bacterial Artificial Chromosomes), usando um gene que foi selecionado de biblioteca subtrativa entre interação compatível e incompatível de Cafeeiro-H. vastatrix. A sequência da BAC selecionada foi analisada, sendo identificado dois genes putativo para resistência do cafeeiro. Por meio de RT-qPCR, um dos genes, denominado de HdT_LRR_RLK2 (Leucine-rich repeat rececptor like kinase), apresentou pico de expressão apenas na interação incompatível, sendo esse considerado um novo gene putativo de resistência do cafeeiro a H. vastatrix. A partir desse gene caracterizado, foi desenvolvido um marcador molecular funcional, o qual foi analisado e validado em um conjunto ... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Clone; Coffea Arábica; Doença de Planta; Ferrugem; Hemileia Vastatrix; Resistência. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Registros recuperados : 28 | |
5. |  | SANTOS, A.; DEMETRIO, W. C.; SÁTIRO, J. N.; CREMONESI, M. V.; BROWN, G. G. Comunidades de minhocas em áreas de erva-mate (Ilex paraguariensis) sob diferentes manejos de solo. In: REUNIÃO PARANAENSE DE CIÊNCIA DO SOLO, 6., 2019, Ponta Grossa. Trabalhos... Ponta Grossa: UEPG; [Curitiba]: SBCS, Núcleo Estadual Paraná, 2019. 4 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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6. |  | DEMETRIO, W. C.; FONSECA, P. M. DA; DUDAS, R.; ZAGATTO, M. G. R.; FEIJOO, A.; BROWN, G. G. Earthworm species in native and planted forests in Brazil. Zootaxa, v. 5255, n. 1, p. 304-323, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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7. |  | DUDAS, R. T.; SANTOS, A.; SILVA, K. A.; MAIA, L.; DEMETRIO, W. C.; NADOLNY, H.; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Abundância e biomassa de minhocas em experimento de longa duração em Ponta Porã - MS. In: ENCONTRO NACIONAL DE PLANTIO DIRETO NA PALHA, 17., 2020, Dourados. Sistema plantio direto: base para agricultura sustentável: anais. Dourados: Federação Brasileira de Plantio Direto e Irrigação, 2020. p. 32. Evento online. Resumo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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8. |  | DEMETRIO, W. C.; BROWN, G. G.; PUPIN, B.; DUDAS, R. T.; NOVO, R.; MOTTA, A. C. V.; BARTZ, M. L.; BORMA, L. S. Soil macrofauna and water-related functions in patches of regenerating Atlantic Forest in Brazil. Pedobiologia: Journal of Soil Ecology, v. 103, 150944, p. 1-9, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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9. |  | BARRETO, J.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; MAIA, L. dos S.; DEMETRIO, W. C.; HERNANI, L. C.; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Diversidade de minhocas em agroecossistemas e vegetação nativa de cinco áreas monitoradas pela rede de pesquisa SoloVivo. In: WORKSHOP DA REDE DE PESQUISA SOLOVIVO, 2018, Curitiba. Indicadores de qualidade da gestão de áreas com sistema plantio direto: palestras e resumos. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2019. E-book. (Embrapa Solos. Documentos, 212).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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10. |  | BARRETO, J.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; MAIA, L. dos S.; DEMETRIO, W. C.; HERNANI, L. C.; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Diversidade de minhocas em agroecossistemas e vegetação nativa de cinco áreas monitoradas pela rede de pesquisa SoloVivo. In: WORKSHOP DA REDE DE PESQUISA SOLOVIVO, 2018, Curitiba. Indicadores de qualidade da gestão de áreas com sistema plantio direto: palestras e resumos. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2019. E-book. (Embrapa Solos. Documentos, 212).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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11. |  | BARRETO, J.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; MAIA, L. dos S.; DEMETRIO, W. C.; HERNANI, L. C.; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Populações de minhocas, atributos químicos do solo e índice de qualidade participativo (IQP) em áreas monitoradas pela rede de pesquisa SoloVivo. In: WORKSHOP DA REDE DE PESQUISA SOLOVIVO, 2018, Curitiba. Indicadores de qualidade da gestão de áreas com sistema plantio direto: palestras e resumos. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2019. E-book. (Embrapa Solos. Documentos, 212).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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12. |  | BARRETO, J.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; MAIA, L. dos S.; DEMETRIO, W. C.; HERNANI, L. C.; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Populações de minhocas, atributos químicos do solo e índice de qualidade participativo (IQP) em áreas monitoradas pela rede de pesquisa SoloVivo. In: WORKSHOP DA REDE DE PESQUISA SOLOVIVO, 2018, Curitiba. Indicadores de qualidade da gestão de áreas com sistema plantio direto: palestras e resumos. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2019. E-book. (Embrapa Solos. Documentos, 212).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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13. |  | SANTOS, E. dos; BROWN, G. G.; CARDOSO, G. B. X.; NADOLNY, H.; PAES, L. S. de O. P.; ASSIS, O. de; FERREIRA, S. de A.; DEMETRIO, W. C. Invertebrados edáficos em diferentes sistemas de uso do solo no Município de Quitandinha, PR. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. Resumo. FERTBIO 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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14. |  | SANTOS, A.; MAIA, L. dos S.; FERREIRA, T.; DEMETRIO, W. C.; NADOLNY, H. S.; RIBEIRO, L. V.; SCHIEDECK, G.; COSTA, F. A. da; BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G. Minhocas como bioindicadoras da qualidade do solo em ecossistemas na Embrapa Clima Temperado. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2019. 37 p. (Embrapa Clima Temperado. Documentos, 482).Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Florestas. |
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15. |  | BARTZ, M. L. C.; BARRETO, J.; SANTOS, A.; DUDAS, R. T.; FERREIRA, T.; MAIA, L. dos S.; DEMETRIO, W. C.; SMOKANIT, M.; TAVARES, A. A.; SCHUSTER, P. A.; HERNANI, L. C.; BROWN, G. G. Earthworm richness in no-tillage farming systems and riparian forests in Southern and Southeastern Brazil. Zootaxa, v. 5255, n. 1, p. 362-376, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Solos. |
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16. |  | FERREIRA, T.; SANTOS, A.; DEMETRIO, W. C.; CARDOSO, G. B. X.; MORAES, R.; ASSIS, O.; NIVA, C. C.; SMOKANIT, M.; KNÓPIK, J.; SAUTTER, K. D.; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Earthworm species in public parks in Curitiba, Paraná, Brazil. Zootaxa, v. 4496, n. 1, p. 535-547, Oct. 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Florestas. |
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17. |  | DEMETRIO, w. c.; SANTOS, A.; FERREIRA, T.; NADOLNY, H.; CARDOSO, G. B. X.; TORRES, J. L. M.; DUDAS, R.; OLIVEIRA, V. de; BARRETO, J. O.; JAMES, S. W.; SILVA, E. da; BROWN, G. G.; BARTZ, M. L. C. Earthworm species in various land use systems in the Campos Gerais region of Lapa, Paraná, Brazil. Zootaxa, v. 4496, n. 1, p. 503-516, Oct. 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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18. |  | BRUZ, L. dos S. M.; SANTOS, A.; DEMETRIO, W. C.; PRIMO, D. de F.; FELICIANO, L. P.; FERNANDES, C. H.; BARTZ, M. L. C.; BERNARDI, A. C. de C.; PEZZOPANE, J. R. M.; BROWN, G. G. Earthworms in various agricultural and forest ecosystems in São Carlos-SP, Brazil. Zootaxa, v. 5255, n. 1, p. 324-335, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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19. |  | SILVA, K. A. da; NICOLA, V. B.; DUDAS, R. T.; DEMETRIO, W. C.; MAIA, L. dos S.; CUNHA, L.; BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G.; PASINI, A.; KILLE, P.; FERREIRA, N. G. C.; OLIVEIRA, C. M. R. de. Pesticides in a case study on no-tillage farming systems and surrounding forest patches in Brazil. Scientific Reports, v. 11, Article number: 9839, 14 p., 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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20. |  | SÁTIRO, J. N. de O.; MOTTA, A. C. V.; DEMETRIO, W. C.; SEGALLA, R. F.; CREMONESI, M. V.; ARAÚJO, E. M.; FALCÃO, N. P. de S.; MARTINS, G. C.; MUNIZ, A. W.; TAUBE, P. S.; REBELLATO, L.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; TEIXEIRA, W. G.; NEVES, E. G.; LIMA, H. P.; SHOCK, M. P.; KILLE, P.; CUNHA, L.; TPI NETWORK; BROWN, G. G. Micronutrient availability in amazonian dark earths and adjacent soils. Geoderma, v. 395, Art. 115072, Aug. 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas; Embrapa Solos. |
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