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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
02/12/2013 |
Data da última atualização: |
17/05/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, R. B. da; VALICENTE, F. H. |
Afiliação: |
ROSANE BEZERRA DA SILVA; FERNANDO HERCOS VALICENTE, CNPMS. |
Título: |
Molecular characterization of Bacillus thuringiensis using rep-PCR. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
SpringerPlus, v. 2, p. 641-652, nov. 2013. |
DOI: |
10.1186/2193-1801-2-641 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The genetic divergence of 65 strains of Bacillus thuringiensis (Bt) was determined using Rep-PCR. Based on the repetitive sequences the BOX primer was the most informative with 26 fragments, followed by ERIC (19) and REP (10), generating a total of 55 fragments. The dendogram shows that ten groups were formed when 45% was the average distance of the population: group 1 with 41,5% of the isolates, 33,8% of the isolates were distributed in other groups and 24,6% did not formed distinct group. 53,2% of the isolates from Embrapa are in the group 1, and 29,8% of the isolates are distributed in other groups. Bt strains from USDA and Institute Pasteur showed more variability. |
Palavras-Chave: |
Divergência genética; Sequência repetitiva. |
Thesagro: |
Bacillus Thuringiensis. |
Thesaurus Nal: |
Repetitive sequences. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01266naa a2200193 a 4500 001 1972598 005 2017-05-17 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1186/2193-1801-2-641$2DOI 100 1 $aSILVA, R. B. da 245 $aMolecular characterization of Bacillus thuringiensis using rep-PCR.$h[electronic resource] 260 $c2013 520 $aThe genetic divergence of 65 strains of Bacillus thuringiensis (Bt) was determined using Rep-PCR. Based on the repetitive sequences the BOX primer was the most informative with 26 fragments, followed by ERIC (19) and REP (10), generating a total of 55 fragments. The dendogram shows that ten groups were formed when 45% was the average distance of the population: group 1 with 41,5% of the isolates, 33,8% of the isolates were distributed in other groups and 24,6% did not formed distinct group. 53,2% of the isolates from Embrapa are in the group 1, and 29,8% of the isolates are distributed in other groups. Bt strains from USDA and Institute Pasteur showed more variability. 650 $aRepetitive sequences 650 $aBacillus Thuringiensis 653 $aDivergência genética 653 $aSequência repetitiva 700 1 $aVALICENTE, F. H. 773 $tSpringerPlus$gv. 2, p. 641-652, nov. 2013.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registros recuperados : 3 | |
1. |  | KOCHKO, A. de; CROUZILLAT, D.; RIGOREAU, M.; LEPELLEY, M.; BELLANGER, L.; L'ANTHOENE, V. M.; VANDECASTEELE, C.; GUYOT, R.; PONCET, V.; TRANCHANT, C.; HAMON, P.; HAMON, S.; COUTURON, E.; DESCOMBES, P.; MOINE, D.; MUELLER, L.; STRICKLER, S. R.; ANDRADE, A.; PEREIRA, L. F. P.; MARRACCINI, P.; GIULIANO, G.; FIORE, A.; PIETRELLA, M.; APREA, G.; MING, R.; WAI, J.; DOMINGUES, D. S.; PASCHOAL, A.; KUHN, G.; KORLACH, J.; CHIN, J.; SANKOFF, D.; ZHENG, C.; ALBERT, V. A. Dihaploid Coffea arabica genome sequencing and assembly. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA, USA. [Annals...]. [s.l], 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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2. |  | MUELLER, L.; STRICKLER, S.; DOMINGUES, D.; PEREIRA, L.; ANDRADE, A.; MARRACCINI, P.; MING, R.; WAI, J.; ALBERT, V.; GIULIANO, G.; FIORE, A.; PIETRELLA, M.; APREA, G.; DESCOMBES, P.; MOINE, D.; GUYOT, R.; PONCET, V.; HAMON, P.; HAMON, S.; TRANCHANT, C.; COUTURON, E.; KOCHKO, A. de; LEPELLEY, M.; BELLANGER, L.; MEROT-L'ANTHOENE, V.; VANDECASTEELE, C.; RIGOREAU, M.; CROUZILLAT, D.; PASCHOAL, A. R.; SANKOFF, D.; ZHENG, C.; KUHN, G.; KORLACH, J.; CHIN, J. Towards a better understanding of the Coffea Arabica genome structure. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCICENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. Proceedings... Udine: Cogito, 2015. p. 42-45Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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3. |  | SALOJÄRVI.; RAMBANI, A.; YU, Z.; GUYOT, R.; STRICKLER, S.; LEPELLEY, M.; WANG, C.; RAJARAMAN, S.; RASTAS, P.; ZHENG, C.; MUÑOZ, D. S.; MEIDANIS, J.; PASCHOAL, A. R.; BAWIN, Y.; KRABBENHOFT, T. J.; WANG, Z. Q.; FLECK, S. J.; AUSSEL, R.; BELLANGER, L.; CHARPAGNE, A.; FOURNIER, C.; KASSAM, M.; LEFEBVRE, G.; MÉTAIRON, S.; MOINE, D.; RIGOREAU, M.; STOLTE, J.; HAMON, P.; COUTURON, E.; TRANCHANT-DUBREUIL, C.; MUKHERJEE, M.; LAN, T.; ENGELHARDT, J.; STADLER, P.; LEMOS, S. M. C. de; SUZUKI, S. I.; SUMIRAT, U.; WAI, C. M.; DAUCHOT, N.; OROZCO-ARIAS, S.; GARAVITO, A.; KIWUKA, C.; MUSOLI, P.; NALUKENGE, A.; GUICHOUX, E.; REINOUT, H.; SMIT, M.; CARRETERO-PAULET, L.; GUERREIRO FILHO, O.; BRAGHINI, M. T.; PADILHA, L.; SERA, G. H.; RUTTINK, T.; HENRY, R.; MARRACCINI, P.; PEER, Y. V. de; ANDRADE, A. C.; DOMINGUES, D.; GIULIANO, G.; MUELLER, L.; PEREIRA, L. F. P.; PLAISANCE, S.; PONCET, V.; ROMBAUTS, S.; SANKOFF, D.; ALBERT, V. A.; CROUZILLAT, D.; KOCHKO, A. de; DESCOMBES, P. The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars. Nature Genetics, v. 56, n. 4, p. 721-731, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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Registros recuperados : 3 | |
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