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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
27/10/2008 |
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Data da última atualização: |
28/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. J. de; DANTAS, J. L. L.; CASTELLEN, M. da S.; MACHADO, M. D. |
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Afiliação: |
Eder Jorge de Oliveira, CNPMF; Jorge Luiz Loyola Dantas, CNPMF; Milene da Silva Castellen, CNPMF; Marlos Dourado Machado, UFRB. |
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Título: |
Identificação de microssatélites para o mamoeiro por meio da exploração do banco de dados de DNA. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 30, n. 3, p. 841-845, set. 2008. |
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ISSN: |
0100-2945 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os marcadores microssatélites são ferramentas úteis em diversas análises genéticas em plantas. No caso do mamoeiro (Carica papya L.), poucos locos de microssatélites foram descritos até o momento. Assim, o objetivo deste trabalho foi explorar a base de dados do GenBank/NCBI (National Center of Biotechnology Information) à procura de microssatélites de mamoeiro, visando a seu futuro uso em estudos genéticos e moleculares aplicados ao melhoramento genético. As sequências foram obtidas no GenBank/NCBI, no formato FASTA, e analisadas para a presença de microssatélites com um mínimo de 20; 7 e 5 repetições dos motivos de mono-, di- e trinucleotídeos, respectivamente, e acima de 4 repetições para tetra- e pentanucleotídeos. Sequências com mais de 90% de similaridade foram consideradas redundantes e, portanto, eliminadas das análises. Foram analisadas 44.591 sequências, das quais 3.180 foram não-redundantes e apresentaram 3.947 microssatélites. Desse total, 3.587 foram classificados como microssatélites perfeitos, 8 imperfeitos, 65 interrompidos, 239 compostos-perfeitos, 8 compstos-imperfeitos e 40 compostos-interrompidos. As repetições de di- e trinucleotídeos representaram 65,7 e 14,4% do total de sequências analisadas, respectivamente. Somente os motivos do tipo AT/TA representaram 44,1% dos microssatélites encontrados. Os motivos mais comuns de tri-, tetra- e pentanucleotídeos foram AAT, AATT e TTTAA, respectivamente. Observou-se que, nas sequências disponíveis, o genoma do mamoeiro apresenta, me média, um microssatélite a cada 5,65 Kb. MenosOs marcadores microssatélites são ferramentas úteis em diversas análises genéticas em plantas. No caso do mamoeiro (Carica papya L.), poucos locos de microssatélites foram descritos até o momento. Assim, o objetivo deste trabalho foi explorar a base de dados do GenBank/NCBI (National Center of Biotechnology Information) à procura de microssatélites de mamoeiro, visando a seu futuro uso em estudos genéticos e moleculares aplicados ao melhoramento genético. As sequências foram obtidas no GenBank/NCBI, no formato FASTA, e analisadas para a presença de microssatélites com um mínimo de 20; 7 e 5 repetições dos motivos de mono-, di- e trinucleotídeos, respectivamente, e acima de 4 repetições para tetra- e pentanucleotídeos. Sequências com mais de 90% de similaridade foram consideradas redundantes e, portanto, eliminadas das análises. Foram analisadas 44.591 sequências, das quais 3.180 foram não-redundantes e apresentaram 3.947 microssatélites. Desse total, 3.587 foram classificados como microssatélites perfeitos, 8 imperfeitos, 65 interrompidos, 239 compostos-perfeitos, 8 compstos-imperfeitos e 40 compostos-interrompidos. As repetições de di- e trinucleotídeos representaram 65,7 e 14,4% do total de sequências analisadas, respectivamente. Somente os motivos do tipo AT/TA representaram 44,1% dos microssatélites encontrados. Os motivos mais comuns de tri-, tetra- e pentanucleotídeos foram AAT, AATT e TTTAA, respectivamente. Observou-se que, nas sequências disponíveis, o genoma do mam... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Carica papaya L; GenBank; SSR. |
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Thesagro: |
Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 12 | |
| 1. |  | MONTEIRO NETTO, M.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; COSENTINO, I. O.; BALARO, M. F. A.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Dinâmica ovariana folicular e luteal em cabras leiteiras induzidas e sincronizadas por programa de luz e d-cloprostenol na contra-estação reprodutiva. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 43, n. 2, p. 552, abr./jun. 2019. Edição dos resumos do XXIII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal, Gramado, RS, Brasil, 15 a 17 de maio 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 2. | | MONTEIRO NETTO, M.; BALARO, M. F. A.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; COSENTINO, I. O.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Indução e sincronização do estro por programa de luz e d-cloprostenol em cabras leiteiras na contra-estação reprodutiva. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 43, n. 2, p. 539, abr./jun. 2019. Edição dos resumos do XXIII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal, Gramado, RS, Brasil, 15 a 17 de maio 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | TREVIZAN, J. T.; PEDROSA, A. C.; BRAIR, V. L.; PRATES, J. F.; BARRETO, C. K.; COSENTINO, I. O.; FONSECA, J. F. da; OLIVEIRA, M. E. F. Gonadotrofinas alternativas para indução do estro sincronizado em cabras: resultados preliminares. Revista Brasileira de Reprodução Animal, Belo Horizonte, v. 41, n. 1, p. 495, jan./mar. 2017. Edição dos anais do XXII Congresso Brasileiro de Reprodução Animal (CBRA), Santos, SP, Brasil, maio 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 4. | | TAIRA, A. R.; BRANDÃO, F. Z.; BRAIR, V. L.; COSENTINO, I. O.; LEAL, F. S. C.; RIBEIRO, A. C. S.; BALARO, M. F. A.; BATISTA, I. I. T. P.; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; FONSECA, J. F. da; UNGERFELD, R. Biostimulation with the ram effect increases the follicle recruitment, ovulatory diameter, and embryo viability rate in superovulated ewes. Theriogenology, v. 181, p. 140-146, Mar. 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | COSENTINO, I. O.; BALARO, M. F. A.; LEAL, F. S. C.; BADE, A. L. C.; CÔRTES, L. R.; ARASHIRO, E. K. N.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Color Doppler ultrasonography for early pregnancy diagnosis in goats. Animal Reproduction, v. 15, p. 1112. 2018. Suplemento 1. Abstract 098. Edição dos Proceedings of the 10th International Ruminant Reproduction Symposium (IRRS), Foz do Iguaçu, PR, Brazil, September 16th to 20th, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | BRAGANÇA, G. M.; BATISTA, R. I. T. P.; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; ALFRADIQUE, V. A. P.; ARASHIRO, E. K. N.; COSENTINO, I. O.; PINTO, P. H. N.; CAMARGO, L. S. de A.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Dose and administration protocol for FSH used for ovarian stimulation affect gene expression in sheep cumulus-oocyte complexes. Reproduction, Fertility and Development, v. 30, n. 9, p. 1234-1244, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | SARAIVA, H. F. R. A.; PINTO, P. H. N.; BRAGANÇA, G. M.; SANTOS, G. B.; RIBEIRO, L. S.; BATISTA, R. I. T. P.; COSENTINO, I. O.; FABJAN, J. M. G. S.; FONSECA, J. F. da; BRANDAO, F. Z. Follicular population on the estimation of the superovulatory response in Santa Ines sheep. Animal Reproduction, v. 13, n. 3, p. 532, Jul./Sept. 2016. Proceedings of the 30th Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE); Foz do Iguaçu, PR, Brazil, August 25th to 27th, 2016, and 32nd Meeting of the European Embryo Transfer Association (AETE); Barcelona, Spain,...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | PINTO, P. H. N.; BALARO, M. F. A.; SARAIVA, H. F. R. de A.; BRAIR, V. L.; ALFRADIQUE, V. A. P.; CÔRTESA, L. R.; COSENTINO, I. O.; SOUZA-FABJANA, J. M. G.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Successive in vivo embryo production in Santa Inês sheep. Animal Production Science, v. 60, n. 4, p. 497-502, Dec. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 9. | | MONTEIRO NETTO, M.; BALARO, M. F. A.; COSENTINO, I. O.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; OLIVEIRA, R. V. de; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; BRANDÃO, F. Z.; FONSECA, J. F. da. Use of two cloprostenol administrations 11.5 days apart efficiently synchronizes oestrus in photostimulated multiparous dairy goats in the non-breeding season. Reproduction in Domestic Animals, v. 55, n. 8, p. 965-973, Aug. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 10. | | TAIRA, A. R.; SANTOS, J. D. R.; COSENTINO, I. O.; BRAIR, V. L.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; PINTO, P. H. N.; SOUZA-FABJAN, J. M. G. de; FONSECA, J. F. da; UNGERFELD, R.; BRANDÃO, J. Z. The use of exogenous progesterone in sheep superovulation protocols influences the percentage of viable embryos. Animal Reproduction, v. 17, n. 3, 2020. Edição dos Abstracts of the 34nd Annual Meeting of the Brazilian Embryo Technology Society (SBTE), 2020 (online).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 11. | | SANTOS, J. D. R.; UNGERFELD, R.; BALARO, M. F. A.; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; COSENTINO, I. O.; BRAIR, V. L.; SOUZA, C. V. de; PINTO, P. H. N.; BADE, A. L. C.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Transcervical vs. laparotomy embryo collection in ewes: The effectiveness and welfare implications of each technique. Theriogenology, v. 153, p. 112-121, Sept. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 12. | | SANTOS, J. D. R.; BATISTA, R. I. T. P.; UNGERFELD, R.; TAIRA, A. R.; ESPÍRITO SANTO, C. G. do; SOUZA-FABJAN, J. M. G.; FERNANDES, D. A. de M.; BALARO, M. F. A.; COSENTINO, I. O.; BRAIR, V. L.; PINTO, P. H. N.; CARVALHO, A. B. da S.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z. Hormonal protocol used for cervical dilation in ewes does not affect morphological embryo quality but reduces recovery rate and temporarily alters gene expression. Veterinary Record, v. 190, n. 5, e1064, Mar. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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