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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
01/03/2011 |
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Data da última atualização: |
04/03/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PRIOLLI, R. H. G.; RAMOS, L. C. S.; POT, D.; MOLLER, M.; GALLO, P. B.; PASTINA, M. M.; GARCIA, A. A. F.; YAMAMOTO, P. Y.; LANNES, S. D.; FERREIRA, L. P.; SCHOLZ, M. B. S.; MAZZAFERA, P.; PEREIRA, L. F. P.; COLOMBO, L. F. P. |
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Afiliação: |
ESALQ/USP; IAC; IAPAR/CIRAD; IAC; IAC; ESALQ/USP; EEALQ/USP; IAC; IAPAR; IAPAR; IAPAR; UNICAMP; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; IAC. |
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Título: |
Construction of a genetic map based on an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora and its usefulness for quality related traits. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for more complete coverage of the coffee genome. MenosGenetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genetic maps. |
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Thesagro: |
Coffea Arábica; Coffea Canephora. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aGenetic maps based on molecular markers have been developed in a large set of plants and this strategy has proven its efficiency towards the identification of tools for marker assisted selection. In the present study, AFLP and SSR markers were used to build a genetic map of an interspecific F2 population between Coffea arabica and Coffea canephora. It was identified 349 AFLP markers and 50 SSR alleles segregating in 90 F2 plants from forty four AFLP combinations and 19 SSR loci. For the map construction, only single dose markers segregating 3:1 in the F2 were considered (248 AFLP markers and 27 SSR alleles, standing for to 68.9% of the polymorphic markers). The genetic map was build and one hundred and sixty nine markers were mapped, corresponding to 155 AFLP markers and 14 SSR loci. Thirty seven linkage groups corresponding to a total map length of 1011 cM were obtained, with an average distance between the markers of 5.98 cM and an average of 4.58 markers per linkage group. Forty-six marker trait associations were found; of which, nineteen were associated with sugar content, eight for caffeine, eight for CGA, one for caffeine and CGA and ten for total production per plant. Only four single markers associations were detected at both years of determinations. The single markers analysis for QTL detection allowed us to obtain previous information of putative QTL association for coffee quality and productivity. Additional markers are being added to this working linkage map for more complete coverage of the coffee genome.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 5. |  | CASTILHOS, R. V.; GRUTZMACHER, A. D.; NAVA, D. E.; LOPES, I. H.; SCHNEIDER, C. A. Seletividade de agrotóxicos utilizados no pessegueiro sobre larvas do predador Chrysoperla externa (Hagen, 1861) (Neuroptera: Chrysopidae). In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 3., 2010, Pelotas. resumos e palestras... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. Anais: Carreira, ética e inovação: o que você está fazendo? Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. Editado por Ivan Rodrigues de Almeida, Leonardo Ferreira Dutra e Jamir Luis Silva da Silva. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | CASTILHOS, R. V.; GRÜTZMACHER, A. D.; NAVA, D. E.; ZOTTI, M. J.; SIQUEIRA, P. R. B. Seletividade de agrotóxicos utilizados em pomares de pêssego a adultos do predador chrysoperla externa (Hagen, 1861) (Neuroptera: Chrysopidae). Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 33, n. 1, p. 73-80, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 8. | | SPAGNOL, D.; GRÜTZMACHER, A. D.; CASTILHOS, R. V.; PASINI, R. A.; ZANTEDESCHI, R.; ROSA, A. P. S. A. da. Compatibilidade de milho transgênico com o parasitoide Trichogramma pretiosum. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, v.16, n.1, p. 43-51, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 9. | | GRUTZMACHER, A. D.; CASTILHOS, R. V.; LOPES, I. H.; PIRES, S. N.; OLIVEIRA, H. B. de; BOTTON, M. Efeito de iscas tóxicas utilizadas no controle de mosca-das-frutas sobre o estágio adulto do predador Chrysoperla externa (Neuroptera: Chrysopidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 25., 2014, Goiânia, GO. Resumos... Goiânia: Embrapa Arroz e Feijão; Universidade Federal de Goiás, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 10. | | SIQUEIRA, P. R. B.; CASTILHOS, R. V.; GRÜTZMACHER, A. D.; NAVA, D. E.; ZOTTI, M. J.; LOPES, I. H. Efeito de Vertimec 18 CE na fecundidade e fertilidade do predador Chrysoperla externa (Hagen, 1861) (Neuroptera: Chrysopidae). In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 11.; MOSTRA CIENTÍFICA, 1., 2009, Pelotas. Anais... Pelotas : Univesidade Federal de Pelotas, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | CASTILHOS, R. V.; GRÜTZMACHER, A. D.; NAVA, D. E.; ZOTTI, M. J.; SIQUEIRA, P. R. B.; SPAGNOL, D. Selectivity of pesticides used in peach orchards on the larval stage of the predator Chrysoperla externa (Hagen) (Neuroptera: Chrysopidae). Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 34, n. 6, p. 3585-3596, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 13. | | CASTILHOS, R. V.; GRUTZMACHER, A. D.; NAVA, D. E.; ZOTTI, M. J.; SIQUEIRA, P. R. B.; LOPES, I. H. Seletividade de agrotóxicos utilizados na cultura do pessegueiro sobre o estágio larval do predador Chrysoperla externa (Hagen, 1861) (Neuroptera: Chrysopidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. resumos... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. | | GRUTZMACHER, A. D.; CASTILHOS, R. V.; NAVA, D. E.; ZOTTI, M. J.; SIQUEIRA, P. R. B.; SPAGNOL, D. Seletividade de fungicidas e herbicidas utilizados na cultura do pessegueiro sobre o estágio larval do predador Chrysoperla externa (Hagen, 1861) (Neuroptera: Chrysopidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. resumos... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 15. | | SIQUEIRA, P. R. B.; CASTILHOS, R. V.; GRÜTZMACHER, A. D.; NAVA, D. E.; ZOTTI, M. J.; SPAGNOL, D. Seletividade de inseticidas registrados no sistema de produção integrada de pêssego a larvas do predador Chrysoperla externa (Hagen, 1861) (Neuroptera: Chrysopidae). In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 18.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 11.; MOSTRA CIENTÍFICA, 1., 2009, Pelotas. Anais... Pelotas : Univesidade Federal de Pelotas, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 16. | | ZOTTI, M. J.; GRÜTZMACHER, A. D.; GRÜTZMACHER, D. D; CASTILHOS, R. V; MARTINS, J. F. da S. Seletividade de inseticidas usados na cultura do milho para ovos e ninfas do predador Doru Lineare (Eschscholtz, 1822) (Dermaptera: Forficulidae). Arquivos do Instituto Biologico, São Paulo, v. 77, n. 1, p. 111-118, jan./mar., 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 17. | | CASTILHOS, R. V.; GRUTZMACHER, A. D.; NAVA, D. E.; ZOTTI, M. J.; FRANTZ, A. P.; ZIMMER, M. Toxicidade de agrotóxicos utilizados na cultura do pessegueiro a adultos do predador Chrysoperla externa (Hagen, 1861) (Neuroptera: chrysopidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. resumos... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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