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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
08/01/2019 |
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Data da última atualização: |
08/01/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PICCOLI, M. L.; BRITO, L. F.; BRACCINI, J.; BRITO, F. V.; CARDOSO, F. F.; COBUCI, J. A.; SARGOLZAEI, M.; SCHENKEL, F. S. |
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Afiliação: |
Mario L. Piccoli, UFRGS; Luiz F. Brito, University of Guelph; José Braccini, UFRGS; Fernanda V. Brito, GenSys; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; Jaime A. Cobuci, UFRGS; Mehdi Sargolzaei, University of Guelph; Flávio S. Schenkel, University of Guelph. |
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Título: |
A comprehensive comparison between single- and two-step GBLUP methods in a simulated beef cattle population. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Canadian Journal of Animal Science, v. 98, n. 3, p. 565-575, Sept. 2018. |
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DOI: |
dx.doi.org/10.1139/cjas-2017-0176 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The statistical methods used in the genetic evaluations are a key component of the process and can be best compared by using simulated data. The latter is especially true in grazing beef cattle production systems, where the number of proven bulls with highly reliable estimated breeding values is limited to allow for a trustworthy validation of genomic predictions. Therefore, we simulated data for 4980 beef cattle aiming to compare single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP), which simultaneously incorporates pedigree, phenotypic, and genomic data into genomic evaluations, and two-step GBLUP (tsGBLUP) procedures and genomic estimated breeding values (GEBVs) blending methods. The greatest increases in GEBV accuracies compared with the parents? average estimated breeding values (EBVPA) were 0.364 and 0.341 for ssGBLUP and tsGBLUP, respectively. Direct genomic value and GEBV accuracies when using ssGBLUP and tsGBLUP procedures were similar, except for the GEBV accuracies using Hayes? blending method in tsGBLUP. There was no significant or slight bias in genomic predictions from ssGBLUP or tsGBLUP (using VanRaden?s blending method), indicating that these predictions are on the same scale compared with the true breeding values. Overall, genetic evaluations including genomic information resulted in gains in accuracy >100% compared with the EBVPA. In addition, there were no significant differences between the selected animals (10% males and 50% females) by using ssGBLUP or tsGBLUP. MenosThe statistical methods used in the genetic evaluations are a key component of the process and can be best compared by using simulated data. The latter is especially true in grazing beef cattle production systems, where the number of proven bulls with highly reliable estimated breeding values is limited to allow for a trustworthy validation of genomic predictions. Therefore, we simulated data for 4980 beef cattle aiming to compare single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP), which simultaneously incorporates pedigree, phenotypic, and genomic data into genomic evaluations, and two-step GBLUP (tsGBLUP) procedures and genomic estimated breeding values (GEBVs) blending methods. The greatest increases in GEBV accuracies compared with the parents? average estimated breeding values (EBVPA) were 0.364 and 0.341 for ssGBLUP and tsGBLUP, respectively. Direct genomic value and GEBV accuracies when using ssGBLUP and tsGBLUP procedures were similar, except for the GEBV accuracies using Hayes? blending method in tsGBLUP. There was no significant or slight bias in genomic predictions from ssGBLUP or tsGBLUP (using VanRaden?s blending method), indicating that these predictions are on the same scale compared with the true breeding values. Overall, genetic evaluations including genomic information resulted in gains in accuracy >100% compared with the EBVPA. In addition, there were no significant differences between the selected animals (10% males and 50% females) by using ss... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Gado de Corte; Genoma; Melhoramento Genético Animal; Seleção. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02337naa a2200265 a 4500
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520 $aThe statistical methods used in the genetic evaluations are a key component of the process and can be best compared by using simulated data. The latter is especially true in grazing beef cattle production systems, where the number of proven bulls with highly reliable estimated breeding values is limited to allow for a trustworthy validation of genomic predictions. Therefore, we simulated data for 4980 beef cattle aiming to compare single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP), which simultaneously incorporates pedigree, phenotypic, and genomic data into genomic evaluations, and two-step GBLUP (tsGBLUP) procedures and genomic estimated breeding values (GEBVs) blending methods. The greatest increases in GEBV accuracies compared with the parents? average estimated breeding values (EBVPA) were 0.364 and 0.341 for ssGBLUP and tsGBLUP, respectively. Direct genomic value and GEBV accuracies when using ssGBLUP and tsGBLUP procedures were similar, except for the GEBV accuracies using Hayes? blending method in tsGBLUP. There was no significant or slight bias in genomic predictions from ssGBLUP or tsGBLUP (using VanRaden?s blending method), indicating that these predictions are on the same scale compared with the true breeding values. Overall, genetic evaluations including genomic information resulted in gains in accuracy >100% compared with the EBVPA. In addition, there were no significant differences between the selected animals (10% males and 50% females) by using ssGBLUP or tsGBLUP.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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| Registros recuperados : 18 | |
| 3. |  | CARVALHO, C. E. G.; CARVALHO, C. E. G.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O.; SANCHES, C. C.; FORNER, O.; SANCHES, S. C.; MELO, P. R.; GOMES, J. S. Desenvolvimento de Corynebacterium pseudotuberculosis mutante como amostra vacinal contra Linfadenite Caseosa. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 8., 2012, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2012. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 198).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | CARVALHO, C. E. G.; CARVALHO, C. E. G.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O.; SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; ELISEI, C.; SANCHES, C. C.; FORNER, O.; SANCHES, S. C.; MELO, P. R. Desenvolvimento e avaliação de nova formulação vacinal contra Linfadenite Caseosa. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | GONÇALVES, A. N. D.; SANTOS, L. R. dos; SOARES, C. O.; CARVALHO, C. E. G.; ROSINHA, G. M. S. Avaliação de antígenos recombinantes de Corynebacterium pseudotuberculosis em teste sorológico para linfadenite caseosa em caprinos e ovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | CARVALHO, C. E. G.; FRAGOSO, S. P.; FORNER, O.; BASTOS, R.; SOARES, C. O.; ROSINHA, G. M. S. Identificação de genes imunodominantes por imunovarredura de biblioteca de expressão gênica de Corynebacterium Pseudotuberculosis. In: Congresso Brasileiro de Medicina Veterinária, 40, 2013, Salvador. Resumos... Salvador: SMVBA, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | ROSINHA, G. M. S.; MELO, P. R. de; SANTOS, L. R. dos; CARVALHO, C. E. G.; ALVARENGA, L. C. O.; ANDRADE, G. B.; SOARES, C. O. Avaliação da virulência de isolados de Corynebacterium pseudotuberculosis em camundongos BALB/c. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2018. 24 p. (Embrapa Gado de Corte. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 42). Título em inglês: Evaluation of virulence of Corynebacterium pseudotuberculosis isolates in BALB/c mice.| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | SILVA, C. S.; SOARES, C. O.; SANTOS, I. R.; CARVALHO C. E. G; ROSINHA, G. M. S.; ALVARENGA, I. C. O. Avaliação da resposta imune e níveis de proteção induzidos em camundongos por vacinas recombinantes contendo genes do operon fag de Corynebacterium pseudotuberculosis. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | SANCHES, C. C.; SOARES, C. O.; SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; ELISEI, C.; ROSINHA, G. M. S.; CARVALHO, C. E. G. Avaliação do efeito protetor de uma cepa mutante vacinal de Brucella abortus contra a Brucelose Bovina. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | GOMES, J. da S.; CARVALHO, C. E. G.; SANCHES, S. C.; VERBISCK, N. V.; SANTOS, L. R. dos; ROSINHA, G. M. S. Desenvolvimento e avaliação de novas formulações vacinais contra Corynebacterium pseudotuberculosis. In: Congresso Brasileiro de Medicina Veterinária, 40, 2013, Salvador. Resumos... Salvador: SMVBA, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | SANCHES, S. C.; SOARES, C. O.; SANTOS, L. R. dos; VERBISCK, N. V.; GOMES, J. S.; MELO, P. R.; CARVALHO, C. E. G.; ROSINHA, G. M. S. Construção e avaliação humoral de uma vacina de DNA contra Corynebacterium pseudotuberculosis causadora da Linfadenite caseosa. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 8., 2012, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2012. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 198).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | SANCHES, S. C.; CARVALHO, C. E. G.; FRAGOSO, S. P.; SANTOS, L. R. dos; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O. Formulação e avaliação da proteção e resposta humoral de uma vacina de DNA contra linfadenite caseosa. In: Congresso Brasileiro de Medicina Veterinária, 40, 2013, Salvador. Resumos... Salvador: SMVBA, 2013. 3 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 15. | | SANCHES, S. C.; ROSINHA, G. M. S.; CARVALHO, C. E. G.; SANCHES, C. C.; GONÇALVES, A. N. D.; SOARES, C. O. Polimorfismo de único nucleotídeo na região E211K DO GENE prnp bovino relacionado com EEB atípica. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 16. | | CARVALHO, C. E. G.; ROSINHA, G. M. S.; SANCHES, C. C.; ELISEI, C.; GONÇALVES, A. N. D.; SANCHES, S. C.; ARAUJO, F. R.; FEIJO, G. L. D.; SOARES, C. O. Polimorfismos no gene da proteína príon em quatro raças bovinas criadas no Brasil. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 17. | | ALVARENGA, L. C. O.; SOARES, C. O.; SANTOS, l. R; COELHO, M. de B.; SILVA, C. S.; GONÇALVES, A. N. D.; CARVALHO, C. E. G.; ROSINHA, G. M. S. Avaliação do gene psec de Corynebacterium pseudotuberculosis como candidato a duas formulações vacinais contra linfadenite caseosa. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | GONÇALVES, A. N. D.; ROSINHA, G. M. S.; REIS, F. A.; SANCHES, C. C.; CARVALHO, C. E. G.; SANCHES, S. C.; ELISEI, C.; ARAUJO, F. R.; SOARES, C. O. Caracterização molecular de polimorfismos no gene que codifica a proteína priônica celular e a suscetibilidade/resistência a scrapie em ovinos do grupamento genético ovelhas pantaneiras. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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