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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
15/03/2021 |
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Data da última atualização: |
10/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BOARI, A. de J.; QUADROS, A. F. F.; KAUFFMANN, C. M.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; CORDOVIL, G. A.; GAVINHO, B. E. S.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
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Afiliação: |
ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; AYANE F. F. QUADROS, UFRA; CATERYNNE M. KAUFFMANN, UFRA; KÉSSIA F. C. PANTOJA, Univesidade Estadual de São Paulo; RUI ALBERTO GOMES JUNIOR, CPATU; FRANCISCO RODRIGUES FREIRE FILHO, CPATU; RAIMUNDO PARENTE DE OLIVEIRA, CPATU; GABRIELE A. CORDOVIL, UFRA; BRENDA E. S. GAVINHO, UFRA; ELLIOT W. KITAJIMA, ESALQ/USP; ROSANA BLAWID, Universidade Federal Rural de Pernambuco; TATSUYA NAGATA, UNB. |
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Título: |
Near-complete genome sequence of cowpea severe mosaic virusin South America and reduced yardlong bean production dueto the viral infection. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 46, n. 4, p. 487-491, Aug. 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s40858-021-00420-w |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% in the total number of grains, regardless of the yardlong bean cultivar evaluated. The reduction of total weight of the grains by CpSMV infection was dependent on the cultivar and was higher in cv. De metro (66.2%) than in cv. Slin (38.9%). MenosThe sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Feijão; Genoma; Vigna Unguiculata; Vírus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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| Registros recuperados : 21 | |
| 6. |  | MADAIL, J. C. M.; BELARMINO, L. C.; BINI, D. A. Análise econômica-financeira do investimento na produção de pêssego (Prunus pérsica (L) Batsch) na região de Pelotas, RS. Jornal da Fruta, Lages, v. 18, n. 228, p. 2, junho, 2010.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 13. | | MADAIL, J. C. M.; LEITE, D. L.; BINI, D. A.; SIMA, L. F. Análise econômica da produção de cebola em um sistema de transição do processo tradicional para o orgânico no município de São José do Norte-RS. Cadernos de Agroecologia, Porto Alegre, RS, v. 6, n. 2, dez. 2011. Trabalho apresentado no CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 7., 2011, Fortaleza, CE.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. | | BELARMINO, L. C.; MADAIL, J. C. M.; BINI, D. A.; ALONSO, C. A.; BELARMINO, A. J. Análise econômica da produção irrigada de pêssego indústria em Pelotas-RS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM. Resumo expandido.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 15. | | ALONSO, C. A.; MADAIL, J. C. M.; BELARMINO, L. C.; BINI, D. A. Análise econômico-financeira do sistema de produção de mirtilo (Vaccinium spp.) recomendado pela pesquisa. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 3., 2010, Pelotas. resumos e palestras... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. Anais: Carreira, ética e inovação: o que você está fazendo? Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. Editado por Ivan Rodrigues de Almeida, Leonardo Ferreira Dutra e Jamir Luis Silva da Silva. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 16. | | BELARMINO, L. C.; MARTINS, F. M.; MADAIL, J. C. M.; BINI, D. A.; ALONSO, C. A.; BELARMINO, A. J. Identificação de oportunidades de inovação em arranjos produtivos locais pelo método de multicritérios de apoio à decisão. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 3., 2010, Pelotas. resumos e palestras... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. Anais: Carreira, ética e inovação: o que você está fazendo? Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. Editado por Ivan Rodrigues de Almeida, Leonardo Ferreira Dutra e Jamir Luis Silva da Silva. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 17. | | BINI, D. A.; MADAIL, J. C. M.; BELARMINO, L. C.; ALONSO, C. A.; BELARMINO, A. J.; SIMA, L. F. Impactos ambientais da produção orgânica de morango em relação ao cultivo convencional. In: MOSTRA DE TRABALHOS DE TECNOLOGIA AMBIENTAL, 3., 2010, Pelotas. Livro de resumos: anais... Pelotas: Instituto Federal Sul-Riograndense - IFSul, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 18. | | MADAIL, J. C. M.; BELARMINO, L. C.; BINI, D. A.; ALONSO, C.; BELARMINO, A. J.; SIMA, L. F. Impactos ambientais e socioeconômicos causados pelo início da produção de tabaco em propriedades familiares com persicultura de Pelotas-RS. In: MOSTRA DE TRABALHOS DE TECNOLOGIA AMBIENTAL, 3., 2010, Pelotas. Livro de resumos: anais... Pelotas: Instituto Federal Sul-Riograndense - IFSul, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 19. | | MADAIL, J. C. M.; BELARMINO, L. C.; ALONSO, C. A.; BINI, D. A.; SIMA, L. F.; BELARMINO, A. J. Impactos ambientais e socioeconômicos do sistema de produção de morango em ambiente protegido, no município de Turuçu-RS. In: MOSTRA DE TRABALHOS DE TECNOLOGIA AMBIENTAL, 3., 2010, Pelotas. Livro de resumos: anais... Pelotas: Instituto Federal Sul-Riograndense - IFSul, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 20. | | BELARMINO, L. C.; MADAIL, J. C. M.; LIMA FILHO, J. R. de; ALONSO, C. A.; BINI, D. A. Custo de produção, rentabilidade e viabilidade econômica de maçã gala em empresas de Fraiburgo-SC. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM. Resumo expandido.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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