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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
19/04/2018 |
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Data da última atualização: |
14/05/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SHIOTSUKI, L.; CARDOSO, F. F.; ALBUQUERQUE, L. G. |
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Afiliação: |
LUCIANA SHIOTSUKI, CNPASA; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; L. G. ALBUQUERQUE, UNESP, Jaboticabal-SP. |
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Título: |
Method for the estimation of genetic merit of animals with uncertain paternity under Bayesian inference. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 135, n. 2, p. 116-123, 2018. |
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DOI: |
10.1111/jbg.12322 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The use of controlled mating or artificial insemination is impracticable in the case of large herds, mainly because of labour costs and the need to delimit areas during the breeding period. However, the exclusion of information from animals with uncertain paternity reduces genetic progress. The objectives of this study were as follows: (i) propose an iterative empirical Bayesian procedure to implement the hierarchical animal model (ITER); (ii) calculate the posterior probabilities of paternity by the maximum likelihood method following the concepts; (iii) compare an average numerator relationship matrix (ANRM), Bayesian hierarchical (HIER) models and ITER. Records of Nellore animals born between 1984 and 2006 from the zootechnical archive of Agropecuaria Jacarezinho Ltda were used. For data consistency, records of contemporary groups (CGs) with fewer than three animals and animals whose records were 3.5 standard deviations above or below the mean of their CG were eliminated. After editing the data, 62,212 animals in the file and 12,876 animals in pedigree file were maintained, respectively. Spearman and Pearson correlations between the posterior mean of the genetic effects of animals were calculated to compare the ranking of animals for selection. Simulated data were used to confirm the veracity of the model. The correlations between ITER and HIER and between ITER and ANRM were similar evaluating different files, which decreased at the same proportion when only high-ranked animals were evaluated. In conclusion, the model proposed herein is a suitable computational alternative to improve the prediction of breeding values of animals in genetic evaluations using large databases, including animals with uncertain paternity. MenosThe use of controlled mating or artificial insemination is impracticable in the case of large herds, mainly because of labour costs and the need to delimit areas during the breeding period. However, the exclusion of information from animals with uncertain paternity reduces genetic progress. The objectives of this study were as follows: (i) propose an iterative empirical Bayesian procedure to implement the hierarchical animal model (ITER); (ii) calculate the posterior probabilities of paternity by the maximum likelihood method following the concepts; (iii) compare an average numerator relationship matrix (ANRM), Bayesian hierarchical (HIER) models and ITER. Records of Nellore animals born between 1984 and 2006 from the zootechnical archive of Agropecuaria Jacarezinho Ltda were used. For data consistency, records of contemporary groups (CGs) with fewer than three animals and animals whose records were 3.5 standard deviations above or below the mean of their CG were eliminated. After editing the data, 62,212 animals in the file and 12,876 animals in pedigree file were maintained, respectively. Spearman and Pearson correlations between the posterior mean of the genetic effects of animals were calculated to compare the ranking of animals for selection. Simulated data were used to confirm the veracity of the model. The correlations between ITER and HIER and between ITER and ANRM were similar evaluating different files, which decreased at the same proportion when only high-ranked a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Mérito genético; Multiple-sire mating; Uncertain paternity. |
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Thesagro: |
Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Animals; Bayesian theory; Genetic merit; Uncertainty. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02520naa a2200253 a 4500
001 2090740
005 2018-05-14
008 2018 bl --- 0-- u #d
024 7 $a10.1111/jbg.12322$2DOI
100 1 $aSHIOTSUKI, L.
245 $aMethod for the estimation of genetic merit of animals with uncertain paternity under Bayesian inference.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aThe use of controlled mating or artificial insemination is impracticable in the case of large herds, mainly because of labour costs and the need to delimit areas during the breeding period. However, the exclusion of information from animals with uncertain paternity reduces genetic progress. The objectives of this study were as follows: (i) propose an iterative empirical Bayesian procedure to implement the hierarchical animal model (ITER); (ii) calculate the posterior probabilities of paternity by the maximum likelihood method following the concepts; (iii) compare an average numerator relationship matrix (ANRM), Bayesian hierarchical (HIER) models and ITER. Records of Nellore animals born between 1984 and 2006 from the zootechnical archive of Agropecuaria Jacarezinho Ltda were used. For data consistency, records of contemporary groups (CGs) with fewer than three animals and animals whose records were 3.5 standard deviations above or below the mean of their CG were eliminated. After editing the data, 62,212 animals in the file and 12,876 animals in pedigree file were maintained, respectively. Spearman and Pearson correlations between the posterior mean of the genetic effects of animals were calculated to compare the ranking of animals for selection. Simulated data were used to confirm the veracity of the model. The correlations between ITER and HIER and between ITER and ANRM were similar evaluating different files, which decreased at the same proportion when only high-ranked animals were evaluated. In conclusion, the model proposed herein is a suitable computational alternative to improve the prediction of breeding values of animals in genetic evaluations using large databases, including animals with uncertain paternity.
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650 $aUncertainty
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700 1 $aCARDOSO, F. F.
700 1 $aALBUQUERQUE, L. G.
773 $tJournal of Animal Breeding and Genetics$gv. 135, n. 2, p. 116-123, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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| Registros recuperados : 31 | |
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| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 6. | | SILVA, I. S.; SANTOS, R. G. de B.; NOGUEIRA, E. T.; BARROS, A. P. A.; BIASOTO, A. C. T. Influência do uso de chip de Carvalho Francês na composição físico-química e colorimétrica de vinho tinto da cultivar Syrah. Research, Society and Development, v. 9, n. 12, p. e37491211111, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 9. | | CARVALHO, E. S. S. de; BARROS, A. P. A.; SILVA, G. N. da; SILVA, T. M.; BIASOTO, A. C. T. Teores de compostos fenólicos, antocianinas e capacidade antioxidante de vinhos tintos tropicais elaborados com as uvas Alicante Bouschet, Tempranillo e Touriga Nacional. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 26., 2019, Juazeiro, BA/Petrolina, PE. Fruticultura de precisão: desafios e oportunidades - anais. Petrolina: Embrapa Semiárido: UNIVASF: SBF, 2019. p. 2923-2926.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 12. | | BARROS, A. P. A.; SILVA, A. de S.; SILVA, I. S.; NUNES, G. da S.; CORREA, L. C.; BIASOTO, A. C. T.; DRUZIAN, J. I. Influência da adição de chip de Carvalho francês no perfil de compostos fenólicos do vinho base para espumante Viognier branco. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 16., 2019, Ica, Peru. Desierto: pasión vitivinícola en Latinoamérica. Ica: Asociacion Peruana de Enologos: Organización Internacional de la Viña y del Vino, 2019. p. 191-194.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 13. | | BARROS, E. S. de; NUNES, G. da S.; NASCIMENTO, D. C. do; TORRES, L. H. P. de S.; BARROS, A. P. A.; BIASOTO, A. C. T. Influência da adição de chips de carvalho sobre a qualidade do vinho branco Chenin Blanc. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 16., 2019, Ica, Peru. Desierto: pasión vitivinícola en Latinoamérica. Ica: Asociacion Peruana de Enologos: Organización Internacional de la Viña y del Vino, 2019. p. 216-219.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 14. | | SILVA, I. S.; NOGUEIRA, E. T.; BARROS, A. P. A.; SANTOS, R. G. de B.; SILVA, L. F. da; BIASOTO, A. C. T. Influência do uso de chip de carvalho francês na composição físico-química e colorimétrica de vinho tinto "Syrah". In: ENCONTRO NACIONAL DA AGROINDÚSTRIA, 4., 2018, Bananeiras. Anais... Bananeiras: UFPB: CABA, 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 15. | | BARROS, A. P. A.; SILVA, I. S.; SILVA, A. de S.; SANTOS, R. G. de B.; TORRES, L. H. P. de S.; BIASOTO, A. C. T. Influência do uso de diferentes agentes de colagem na composição físico-química e coloração do vinho branco Chenin Blanc. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS, 26., 2018, Belém, PA. O uso consciente da biodiversidade: perspectivas para o avanço da ciência e tecnologia de alimentos. Belém, PA: SBCTA:UFPA, 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 16. | | SILVA, I. S.; BARROS, A. P. A.; NUNES, G. da S.; TORRES, L. H. P. S.; NASCIMENTO, D. C. do; DAMASCENO, J. C.; BIASOTO, A. C. T. Influência da técnica de termovinificação no conteúdo de compostos fenólicos e na cor dos vinhos tintos tropicais Syrah. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 16., 2019, Ica, Peru. Desierto: pasión vitivinícola en Latinoamérica. Ica: Asociacion Peruana de Enologos: Organización Internacional de la Viña y del Vino, 2019. p. 156-160.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | CATVALHO, E. S. S. de; NUNES, G. da S.; SILVA, T. M. da; NOGUEIRA, F. dos S.; BARROS, A. P. A.; BIASOTO, A. C. T. Influência da correção do pH do mosto e vinho utilizando diferentes ácidos orgânicos sobre a qualidade de vinhos tintos do Vale do Submédio São Francisco. In: JORNADA DE INTEGRAÇÃO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 2., 2017, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2017. P. 203-210. (Embrapa Semiárido. Documentos, 280).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | ARGOLLO, C. B. N. T.; SILVA, I. S.; SANTOS, R. T. dos S. e; BARROS, A. P. A.; RIBEIRO, M. de F.; BIASOTO, A. C. T. Influência de diferentes tipos de clarificantes na coloração e conteúdo de compostos fenólicos do hidromel. . In: SIMPÓSIO LATINO AMERICANO DE CIÊNCIA DE ALIMENTOS , 13., 2019, Campinas. O futuro dos alimentos: Anais... Campinas: Galoá, 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | SILVA, I. S.; BARROS, A. P. A.; SILVA, A. de S.; NOGUEIRA, E. T. da; CORREA, L. C.; BIASOTO, A. C. T. Avaliação da composição fenólica de vinhos brancos "chenin blanc" elaborados com diferentes agentes de colagem. In: ENCONTRO NACIONAL DA AGROINDÚSTRIA, 4., 2018, Bananeiras. Anais... Bananeiras: UFPB: CABA, 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | NETO, L. G. N.; SILVA, I. S.; SILVA, S. F.; BIASOTO, A. C. T.; LIMA, M. S.; ALMEIDA, M. B.; BARROS, A. P. A. Efeito da suplementação nitrogenada durante a fermentação alcoólica de vinhos da cv. Touriga Nacional do Submédio do Vale do São Francisco. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 15.; CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 13., 2015, Bento Gonçalves. Resumos... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho: Associação Brasileira de Enologia, 2015. 1 Pen drive.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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