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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
06/11/2017 |
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Data da última atualização: |
14/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BRITO, A. C.; OLIVEIRA, S. A. S. de; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
A. C. BRITO; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Genome-wide association study for resistance to cassava root rot. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Agricultural Science, p.1 of 18, 2017. |
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DOI: |
10.1017/S0021859617000612 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cassava root rot (CRR) disease associated with a complex of soil pathogens has caused great yield losses in the crop. The objective of the current work was to obtain insights about the genetic architecture of CRR resistance caused by Fusarium (dry root rot ? DRR), Phytophthora (soft root rot ? SRR) and Botryosphaeriaceae (black root rot ? BRR) species, using genome-wide association studies (GWAS). Phenotyping data of 263 accessions (artificial inoculation) and 14 094 single-nucleotide polymorphisms (SNP) (missing data <0·10 and minor allele frequency >0·05) were used. The severity of CRR in peel and pulp was variable among accessions, but the pathogens that caused DRR were more aggressive. Broad-sense heritability (h2g ) was of medium magnitude for all groups of resistances for pathogens, with variation from 0·16 ± 0·019 (Fspp Pulp) to 0·31 ± 0·028 (Fspp Peel). The kinship matrix was used to correct for stratification as well as for clustering the accessions. Overall, this analysis showed that there was no relationship between agronomic traits and resistance to CRR and the four clusters obtained from kinship matrix. The GWAS identified 38 significant SNPs, of which eight and 22 are related to the severity of DRR in the pulp and peel, respectively. The other eight SNPs were associated with SRR-peel (1), SRR-pulp (1), BRR-peel (3) and BRR-pulp (3). Half of the SNPs associated with CRR resistance have functional annotations related to defence and response to pathogen attack as well as general cellular processes. The current study revealed that resistance to CRR is controlled by multiple loci with small effects, and significant SNPs can be used to identify putative genes that control these traits. MenosCassava root rot (CRR) disease associated with a complex of soil pathogens has caused great yield losses in the crop. The objective of the current work was to obtain insights about the genetic architecture of CRR resistance caused by Fusarium (dry root rot ? DRR), Phytophthora (soft root rot ? SRR) and Botryosphaeriaceae (black root rot ? BRR) species, using genome-wide association studies (GWAS). Phenotyping data of 263 accessions (artificial inoculation) and 14 094 single-nucleotide polymorphisms (SNP) (missing data <0·10 and minor allele frequency >0·05) were used. The severity of CRR in peel and pulp was variable among accessions, but the pathogens that caused DRR were more aggressive. Broad-sense heritability (h2g ) was of medium magnitude for all groups of resistances for pathogens, with variation from 0·16 ± 0·019 (Fspp Pulp) to 0·31 ± 0·028 (Fspp Peel). The kinship matrix was used to correct for stratification as well as for clustering the accessions. Overall, this analysis showed that there was no relationship between agronomic traits and resistance to CRR and the four clusters obtained from kinship matrix. The GWAS identified 38 significant SNPs, of which eight and 22 are related to the severity of DRR in the pulp and peel, respectively. The other eight SNPs were associated with SRR-peel (1), SRR-pulp (1), BRR-peel (3) and BRR-pulp (3). Half of the SNPs associated with CRR resistance have functional annotations related to defence and response to pathogen attack as ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Thesaurus Nal: |
Cassava. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 157 | |
| 1. |  | AMORIM, A. M. T.; LEMOS, O. F. de; MONTEIRO, M. M. F.; CARDOSO, K. P. S. Efeito da concentração de sacarose na germinação in vitro de tachi-branco (Sclerolobium paniculatum vogel). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 16., 2012, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | CARDOSO, K. P. S.; LEMOS, O. F. de; AMORIM, A. M. T. Estabelecimento e indução de brotos via meristema da cultivar Kuthiravally de pimenta-do-reino. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 17.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 1., 2013, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2013. 1 CD-ROM. PIBIC 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | CARDOSO, K. P. S.; LEMOS, O. F. de; SANTOS, L. R. R. dos; AMORIM, A. M. T. Multiplicação de gemas em dois subcultivos de micropropagação da cultivar iaçará de pimenteira-do-reino. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 16., 2012, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | AMORIM, A. M. T.; LEMOS, O. F. de; SOUZA, C. B. L. de; LEITE, D. R. R. Influência da quebra de dormência na germinação in vitro de sementes de paricá. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 17.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 1., 2013, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2013. 1 CD-ROM. PIBIC 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 11. | | AMORIM, A. M. de; SANTANA, C. V. da S.; ANGELOTTI, F.; NASCIMENTO, L. C.; PEIXOTO, A. R.; PINHEIRO, G. S.; RODRIGUES, D. R. Germinação de conídios de Oidium sp. sob diferentes temperaturas. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 7.; JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FACEPE/UNIVASF, 1., 2012, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2012. p. 278-281. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 248).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 12. | | AMARAL, F. C. S. do; CARVALHO JUNIOR, W. de; PEREIRA, N. R.; AGLIO, M. L. D.; GONÇALVES, A. O.; LOPES, C. H.; AMORIM, A. M.; TAKAGI, J. S. Zoneamento agroecológico para soja (Glycine max) no município de Bonito (MS). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 14. | | CARDOSO, D.; SÄRKINEN, T.; ALEXANDER, S.; AMORIM, A. M.; BITTRICH, V.; CELIS, M.; DALY, D. C.; FIASCHI, P.; FUNCK, V. A.; GIACOMIN, L. L.; GOLDENBERG, R.; HEIDEN, G. Amazon plant diversity revealed by a taxonomically verified species list. PNAS. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 114, n 40, p. 10695-10700, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 15. | | BHERING, S. B.; CHAGAS, C. da S.; PEREIRA, N. R.; CARVALHO JUNIOR, W. de; ZARONI, M. J.; AMARAL, F. C. S.; GONCALVES, A. O.; AGLIO, M. L. D.; DART, R. de O.; AMORIM, A. M.; LOPES, C. H. L. Mapa do zoneamento agroecológico para abacaxi no município de Bandeirantes. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 16. | | CARVALHO JUNIOR, W. de; BHERING, S. B.; PEREIRA, N. R.; AMARAL, F. C. S. do; CHAGAS, C. da S.; ZARONI, M. J.; GONCALVES, A. O.; AGLIO, M. L. D.; DART, R. de O.; AMORIM, A. M.; LOPES, C. H. L. Mapa do zoneamento agroecológico para abacaxi no município de Maracaju. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 17. | | CHAGAS, C. da S.; PEREIRA, N. R.; BHERING, S. B.; CARVALHO JUNIOR, W. de; ZARONI, M. J.; AMARAL, F. C. S. do; GONCALVES, A. O.; AGLIO, M. L. D.; DART, R. de O.; AMORIM, A. M.; LOPES, C. H. L. Mapa do zoneamento agroecológico para abacaxi no município de Rio Negro. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 18. | | PEREIRA, N. R.; BHERING, S. B.; CARVALHO JUNIOR, W. de; CHAGAS, C. da S.; ZARONI, M. J.; AMARAL, F. C. S. do; GONCALVES, A. O.; AGLIO, M. L. D.; DART, R. de O.; AMORIM, A. M.; LOPES, C. H. L. Mapa do zoneamento agroecológico para abacaxi no município de Terenos. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 19. | | BHERING, S. B.; CHAGAS, C. da S.; PEREIRA, N. R.; CARVALHO JUNIOR, W. de; ZARONI, M. J.; AMARAL, F. C. S. do; GONCALVES, A. O.; AGLIO, M. L. D.; DART, R. de O.; AMORIM, A. M.; LOPES, C. H. L. Mapa do zoneamento agroecológico para banana no município de Bandeirantes. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 20. | | CARVALHO JUNIOR, W. de; BHERING, S. B.; PEREIRA, N. R.; AMARAL, F. C. S. do; CHAGAS, C. da S.; ZARONI, M. J.; GONCALVES, A. O.; AGLIO, M. L. D.; DART, R. de O.; AMORIM, A. M.; LOPES, C. H. L. Mapa do zoneamento agroecológico para banana no município de Maracaju. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010.| Tipo: Monitoramento/Zoneamento |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| Registros recuperados : 157 | |
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