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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
23/10/2015 |
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Data da última atualização: |
25/07/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RIBEIRO, R. A.; MARTINS, T. B.; ORMENO-ORRILLO, E.; DELAMUTA, J. R. M.; ROGEL, M. A.; MARTÍNEZ-ROMERO, E.; HUNGRIA, M. |
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Afiliação: |
RENAN AUGUSTO RIBEIRO, CNPSO; TALITA BUSULINI MARTINS, UEL; ERNESTO ORMENO-ORRILLO, UNIV. NAC. AUTONOMA DE MÉXICO; JAKELINE RENATA MARÇON DELAMUTA, UEL; MARCO ANTONIO ROGEL, UNIV. NAC. AUTONOMA DE MÉXICO; ESPERANZA MARTÍNEZ-ROMERO, UNIV. NAC. AUTONOMA DE MÉXICO; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
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Título: |
Rhizobium ecuadorense sp. nov., an indigenous N2-fixing symbiont of the Ecuadorian common bean (Phaseolus vulgaris L.) genetic pool. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 65, n. 9, p. 3162-3169, Sept. 2015. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
There are two major centres of genetic diversification of common bean (Phaseolus vilgaris L.), the Mesoamerican and the Andean, and the legume is capable of establishing nitrogen-fixing symbioses with several rhizobia; Rhizobium etli seems to be the dominant species in both centres. Another genetic pool of common bean, in Peru and Ecuador, is receiving increasing attention, and studies of microsymbionts from the region can help to increase our knowledge about coevolution of this symbiosis. We have previously reported several putative new lineages from this region and here present data indicating that strains belonging to one of them, PEL4, represent a novel species. Based on 16S rRNA gene sequence phylogeny, PEL4 strains are positioned in the Rhizobium phaseoli/R. etli/Rhizobium leguminosarum clade, but show unique properties in several morphological, physiological and biochemical analyses, as well as in BOX-PCR profiles (,75 % similarity with related species). PEL4 strains also differed from related species based on multilocus sequence analysis of three housekeeping genes (glnII, gyrB and recA). Nucleotide identities of the three concatenated genes between PEL4 strains and related species ranged from 91.8 to 94.2 %, being highest with Rhizobium fabae. DNA?DNA hybridization (,47 % DNA relatedness) and average nucleotide identity values of the whole genomes (,90.2 %) also supported the novel species status. The PEL4 strains were effective in nodulating and fixing N2 with common beans. The data supported the view that PEL4 strains represent a novel species, Rhizobium ecuadorense sp. nov. The type strain is CNPSo 671T (5UMR 1450T 5PIMAMPIRS I 5T 5LMG 27578T ). MenosThere are two major centres of genetic diversification of common bean (Phaseolus vilgaris L.), the Mesoamerican and the Andean, and the legume is capable of establishing nitrogen-fixing symbioses with several rhizobia; Rhizobium etli seems to be the dominant species in both centres. Another genetic pool of common bean, in Peru and Ecuador, is receiving increasing attention, and studies of microsymbionts from the region can help to increase our knowledge about coevolution of this symbiosis. We have previously reported several putative new lineages from this region and here present data indicating that strains belonging to one of them, PEL4, represent a novel species. Based on 16S rRNA gene sequence phylogeny, PEL4 strains are positioned in the Rhizobium phaseoli/R. etli/Rhizobium leguminosarum clade, but show unique properties in several morphological, physiological and biochemical analyses, as well as in BOX-PCR profiles (,75 % similarity with related species). PEL4 strains also differed from related species based on multilocus sequence analysis of three housekeeping genes (glnII, gyrB and recA). Nucleotide identities of the three concatenated genes between PEL4 strains and related species ranged from 91.8 to 94.2 %, being highest with Rhizobium fabae. DNA?DNA hybridization (,47 % DNA relatedness) and average nucleotide identity values of the whole genomes (,90.2 %) also supported the novel species status. The PEL4 strains were effective in nodulating and fixing N2 with comm... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Rizóbio. |
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Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio. |
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Thesaurus Nal: |
Nitrogen fixation. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aThere are two major centres of genetic diversification of common bean (Phaseolus vilgaris L.), the Mesoamerican and the Andean, and the legume is capable of establishing nitrogen-fixing symbioses with several rhizobia; Rhizobium etli seems to be the dominant species in both centres. Another genetic pool of common bean, in Peru and Ecuador, is receiving increasing attention, and studies of microsymbionts from the region can help to increase our knowledge about coevolution of this symbiosis. We have previously reported several putative new lineages from this region and here present data indicating that strains belonging to one of them, PEL4, represent a novel species. Based on 16S rRNA gene sequence phylogeny, PEL4 strains are positioned in the Rhizobium phaseoli/R. etli/Rhizobium leguminosarum clade, but show unique properties in several morphological, physiological and biochemical analyses, as well as in BOX-PCR profiles (,75 % similarity with related species). PEL4 strains also differed from related species based on multilocus sequence analysis of three housekeeping genes (glnII, gyrB and recA). Nucleotide identities of the three concatenated genes between PEL4 strains and related species ranged from 91.8 to 94.2 %, being highest with Rhizobium fabae. DNA?DNA hybridization (,47 % DNA relatedness) and average nucleotide identity values of the whole genomes (,90.2 %) also supported the novel species status. The PEL4 strains were effective in nodulating and fixing N2 with common beans. The data supported the view that PEL4 strains represent a novel species, Rhizobium ecuadorense sp. nov. The type strain is CNPSo 671T (5UMR 1450T 5PIMAMPIRS I 5T 5LMG 27578T ).
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 27 | |
| 1. |  | KASCHUK, G.; ALBERTON, O.; HUNGRIA, M. Três décadas de estudos sobre biomassa microbiana nos ecossistemas brasileiros: lições aprendidas sobre qualidade do solo e indicadores de sustentabilidade. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 4 p. Trab. 1501. 1 CD-ROM. FERTBIO 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | KASCHUK, G.; ALBERTON, O.; HUNGRIA, M. Quantificando os efeitos de diferentes usos agrícolas na biomassa microbiana do solo nos biomas brasileiros. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 4 p. Trab. 437. 1 CD-ROM. FERTBIO 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 9. | | BROWN, G.; HUNGRIA, M.; TORRES, E.; OLIVEIRA, L.; BRANDÃO JUNIOR, O.; ALBERTON, O. A faúna do solo no sistema de semeadura direta: comunidade e função no sistema edáfico. In: HOFFMANN-CAMPO, C .B.; SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2001: microbiologia de solos. Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 11-13. (Embrapa Soja. Documentos, 197).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 10. | | BROWN, G. G.; BRANDÃO JUNIOR, O.; SARIDAKIS, G. P.; BENITO, N. P.; ALBERTON, O.; TORRES, E. Efeito de diferentes preparos do solo na macrofauna edáfica de um latossolo vermelho distroférrico em Londrina, PR. In: WORLD CONGRESS ON CONSERVATION AGRICULTURE = CONGRESSO MUNDIAL SOBRE AGRICULTURA CONSERVACIONISTA, 2., 2003, Foz do Iguaçu. Producing in harmony with nature: [proceedings ...] = Produzindo em harmonia com a natureza: [anais ...]. Ponta Grossa: Federação Brasileira de Plantio Direto na Palha, 2003. v. 2. p. 426-429. II World Congress on Conservation Agriculture, Iguassu Falls, 2003. Extended summary / posters.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | LOUREIRO, M. de F.; KASCHUK, G.; ALBERTON, O.; HUNGRIA, M.; CORREA, F. Diferenças qualitativas na microbiota do solo relacionadas ao manejo do solo e das culturas. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 25.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 9.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 7.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 4., 2002, Rio de Janeiro. Fertbio 2002: agricultura: bases ecológicas para o desenvolvimento social e econômico sustentado. Rio de Janeiro, 2002. p. 172. Guia do congressista e em CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 13. | | BROWN, G. G.; BRANDÃO JUNIOR, O.; ALBERTON, O.; SARIDAKIS, G. P.; BENITO, N. P.; TORRES, E. Soil macroinvertebrate populations in various land management systems in Paraná State, Brazil. In: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON SOIL ZOOLOGY AND ECOLOGY, 14., 2004. Mont Saint Aignan. Abstracts... Mont Saint Aignan: Université de Rouen, 2004. p. 240.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 14. | | KASCHUK, G.; LEFFELAAR, P. A.; GILLER, K. E.; ALBERTON, O.; HUNGRIA, M.; KUYPER, T. W. Responses of legumes to rhizobia and arbuscular mycorrhizal fungi: a meta-analysis of potential photosynthate limitation of symbioses. Soil Biology and Biochemistry, v. 41, n. 1, p. 125-127, jan. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 15. | | BROWN, G. G.; ALBERTON, O.; BRANDÃO JÚNIOR, O.; SARIDAKIS, G. P.; TORRES, E. Scarab beetle-grub holes in various tillage and crop management systems at Embrapa Soybean, Londrina, Brazil. In: INTERNATIONAL TECHNICAL WORKSHOP ON BIOLOGICAL MANAGEMENT OF SOIL ECOSYSTEMS FOR SUSTAINABLE AGRICULTURE, 2002, Londrina. Program, abstracts and related documents. Londrina: Embrapa Soybean: FAO, 2002. p.91. (Embrapa Soja. Documentos, 182). Organizado por George G. Brown, Mariangela Hungria, Lenita Jacob Oliveira, Sally Bunning, Adriana Montañez.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 16. | | GOMZ, S. A.; GAZZONI, D. L.; ALBERTON, O. C.; RUMIATTO, M.; GOMES, V.; SOUZA, D. S. de; STAUT, R. E. Efeito de métodos de aplicação na eficiência de Baculovirus anticarsia sobre a lagarta da soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 9., 1984, Londrina. Resumos... Londrina: SEB, [1984?]. p. 150.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 17. | | BROWN, G. G.; BRANDÃO JÚNIOR, O.; ALBERTON, O.; HUNGRIA, M.; SILVA, S. H. da; TORRES, E.; OLIVEIRA, L. J. Soil management and soil microfauna communities at Embrapa Soybean, Londrina, Brazil. In: INTERNATIONAL TECHNICAL WORKSHOP ON BIOLOGICAL MANAGEMENT OF SOIL ECOSYSTEMS FOR SUSTAINABLE AGRICULTURE, 2002, Londrina. Program, abstracts and related documents. Londrina: Embrapa Soybean: FAO, 2002. p. 84-85. (Embrapa Soja. Documentos, 182). Organizado por George G. Brown, Mariangela Hungria, Lenita Jacob Oliveira, Sally Bunning, Adriana Montañez.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 18. | | BROWN, G. G.; OLIVEIRA, L. J.; NORTON, D.; ALBERTON, O.; BRANDÃO JUNIOR, O.; SARIDAKIS, G. P.; TORRES, E. Quantifying scarab beetle-grub holes and their volume as affected by different tillage and crop management systems. In: INTERNATIONAL SOIL TILLAGE RESEARCH ORGANISATION CONFERENCE, 16., 2003, Brisbane. Soil management for sustainability. Brisbane: Grains Research & Development Corporation: The University of Queensland: Australian Centre for International Agricultural Research, 2003. p. 213-218. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 19. | | BRANDÃO JUNIOR, O.; SARIDAKIS, G. P.; FERREIRA, M. C.; SARIDAKIS, H. O.; ESPÍNDOLA, C. R.; HUNGRIA. M.; ALBERTON, O.; TORRES, E. Avaliação da população e biomassa microbianas em diferentes sistemas de preparo do solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2001, Foz do Iguaçu-PR. Resumos... Foz do Iguaçu: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2001. Trab. MS-076.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 20. | | GOMEZ, S. A.; GAZZONI, D. L.; ALBERTON, O. C.; GOMES, V.; VALENTE, J. B.; RUMIATTO, M.; SOUZA, D. S. de; STAUT, R. E. Efeito de Baculovirus anticarsia sobre a lagarta da soja em aplicação aérea e terrestre, nas condições de Mato Grosso do Sul. Dourados: EMBRAPA-UEPAE Dourados, 1984. 14 p. (EMBRAPA-UEPAE Dourados. Pesquisa em andamento, 18).| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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