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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
20/04/2006 |
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Data da última atualização: |
27/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; CRUZ, S. A. B. da; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; HIGA, R. H. |
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Afiliação: |
GORAN NESIC, CNPTIA; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; FABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; SERGIO APARECIDO BRAGA DA CRUZ, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; JOSE GILBERTO JARDINE, CNPM; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA. |
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Título: |
What makes the active site amino acids so different from the others: defining the structural descriptors specific for activity. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. |
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Páginas: |
p. 149. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Na publicação: Paula Kuser, Michel Yamagishi, Stanley Oliveira, Edgard Santos, Fabio Vieira, Sergio Cruz, Adauto Mancini, Roberto Higa. X-meeting 2005. Presented Posters. |
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Conteúdo: |
We describe in this paper some of the new features available in Diamond STING Suite. Also, we emphasize here the main difference which continues to work in favor of the STING and separates it from the other servers belonging to this category also available on the Internet - the capability to present the largest number of descriptors for the sequence, structure, function, stability and binding in a concise and visually compelling way, as well as the capability to select/focus for/at those residues which satisfy a user defined parameter/descriptor values. This feature allows that some very interesting and important questions can be answered, such as: Is there a set of parameters (protein structure descriptors) which can define UNIQUELY an amino acid ensemble coinciding with the active site of a given protein or coinciding with amino acids identified experimentally as crucial for the folding / stability. We present here an example where by combining selected ranges for a number of structure parameters we have obtained at the end of a Select procedure an ensemble of which coincides with the critical residues identified experimentally as the activity essential residues for number of protein families. The Select procedure used only few parameters and their numerical values/regions to achieve this objective. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Descritores. |
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Thesagro: |
Aminoácido. |
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Thesaurus Nal: |
Amino acids; Bioinformatics. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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500 $aNa publicação: Paula Kuser, Michel Yamagishi, Stanley Oliveira, Edgard Santos, Fabio Vieira, Sergio Cruz, Adauto Mancini, Roberto Higa. X-meeting 2005. Presented Posters.
520 $aWe describe in this paper some of the new features available in Diamond STING Suite. Also, we emphasize here the main difference which continues to work in favor of the STING and separates it from the other servers belonging to this category also available on the Internet - the capability to present the largest number of descriptors for the sequence, structure, function, stability and binding in a concise and visually compelling way, as well as the capability to select/focus for/at those residues which satisfy a user defined parameter/descriptor values. This feature allows that some very interesting and important questions can be answered, such as: Is there a set of parameters (protein structure descriptors) which can define UNIQUELY an amino acid ensemble coinciding with the active site of a given protein or coinciding with amino acids identified experimentally as crucial for the folding / stability. We present here an example where by combining selected ranges for a number of structure parameters we have obtained at the end of a Select procedure an ensemble of which coincides with the critical residues identified experimentally as the activity essential residues for number of protein families. The Select procedure used only few parameters and their numerical values/regions to achieve this objective.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 3. |  | PIO, R.; DALL´ORTO, F. A. C.; BARBOSA, W.; CHAGAS, E. A.; OJIMA, M.; CIA, P. Produção de cultivares de nespereira na região Leste paulista Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 7, p. 1053-1056, jul. 2007 Notas Científicas. Título em inglês: Production of loquat tree cultivars in Eastern São Paulo State.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | DALL'ORTO, F. A. C.; OJIMA, M.; BARBOSA, W.; TOMBOLATO, A. F. C.; RIGITANO, O.; ALVES, S. Cultivo de selecoes de pessegueiros precoses no sistema de pomar compacto com poda drastica. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.19, n.6, p. 719-727, jun. 1984.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | BARBOSA, W.; OJIMA, M.; DALL'ORTO, F. A. C.; MARTINS, F. P.; LOVATE, A. A. Desenvolvimento dos Frutos e das Sementes de Pêssegos Subtropicais de Diferentes Ciclos de Maturação. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.28, n.6, p.701-707,jun.1993| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | DALL'ORTO, F. A. C.; OJIMA, M.; BARBOSA, W.; MARTINS, F. P.; RIGITANO, O. 'Centenária' Nova Seleção de Ameixa Tardia para Clima Ameno. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 24, n.5, p. 579-581, maio 1989| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 7. | | DALL'ORTO, F. A. C.; OJIMA, M.; BARBOSA, W.; MARTINS, F. P.; RIGITANO, O. 'Delicioso Precoce' - Nova Seleção de Pêssego do IAC para as Regiões mais Frias de São Paulo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.24, n.2, p. 233-239, fev.1989| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | OJIMA, M.; DALL'ORTO, F. A. C.; BARBOSA, W.; MARTINS, F. P.; SANTOS, R. R.; RIGITANO, O. Novas cultivares IAC de pêssegos precoces: tipos jóia e doçura. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 22, n. 7, p. 729-732, jul.1987.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 10. | | PIO, R.; DALL´ORTO, F. A. C.; BARBOSA, W.; CHAGAS, E. A.; OJIMA, M.; FELDBERG, N. P. Desempenho produtivo de nespereiras enxertadas em marmeleiro 'Portugal'. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 12, p. 1715-1719, dez. 2007 Título em inglês: Yield performance of loquat trees graf ted on quince cultivar Portugal.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | OJIMA, M.; DALL'ORTO, F. A. C.; RIGITANO, O.; SCARANARI, H. J.; MARTINS, F. P.; TOMBOLATO, A. F. C.; BARBOSA, W. Quatro novas cultivares IAC de pêssegos brancos de caroço solto. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 18, n. 9, p. 1009-1013. set. 1983. Título em inglês: Four new white-flesh and freestone peaches.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | OJIMA, M.; DALL'ORTO, F. A. C.; BARBOSA, W.; TOMBOLATO, A. F. C.; RIGITANO, O.; CASTRO, J. L.; SANTOS, R. R. 'Somel' e 'Rosalina' - Novas nectarinas de polpa amarela. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.19, n.7, p. 845-847, jul. 1984.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | PIO, R.; CHAGAS, E. A.; CAMPO, D. F. A.; BARBOSA, W.; OJIMA, M.; RIGITANO, O.; DEL AGUILA, J. A.; KOTZ, T. E.; ANTUNES, L. E. C. Competición de peras injertadas en diferentes patrones de membrillos en región subtropical. In: CONGRESO NACIONAL DE LA SOCIEDAD URUGUAYA DE HORTIFRUTICULTURA, 11.; CONGRESO PANAMERICANO PROMOCIÓN DEL CONSUMO DE FRUTAS Y HORTALIZAS, 3., 2007, Montevideo. Resumos... Montevideo : Sociedad Uruguaya de Hortifruticultura, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. | | BARBOSA, W.; DALL'ORTO, F. A. C.; OJIMA, M.; SANTOS, R. R. dos; KALIL, G. P. da C.; FAHL, J. I.; CARELLI, M. L. C. O pessegueiro em pomar compacto. IX. Dez anos de produção de cultivares sob poda drástica bienal. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 34, n. 1, p. 69-76, jan. 1999 Título em inglês: The peach meadow orchard system. IX. Yield of cultivars during years on biennial drastic pruning.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | BETTIOL NETO, J. E.; DALL'ORTO, F. A. C.; OJIMA, M.; BARBOSA, W.; CHAGAS, E. A.; PIO, R.; XAVIER, D.; COSTA, F. C. Potencial produtivo de novas seleções de nespereiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: SBF, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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