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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
19/12/2018 |
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Data da última atualização: |
29/04/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, P. R. A. da; VIDAL, M. S.; SOARES, C. de P.; POLESE, V.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. |
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Afiliação: |
PAULA RENATA ALVES DA SILVA, BOLSISTA EMBRAPA AGROBIOLOGIA; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; CLEITON DE PAULA SOARES, UFRJ; VALÉRIA POLESE, UFRJ; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR,, UFRJ; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFRJ; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB. |
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Título: |
Sugarcane apoplast fluid modulates the global transcriptional profile of the diazotrophic bacteria Paraburkholderia tropica strain Ppe8. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
PLOS ONE, v. 13, n. 12, e0207863, 2018. |
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ISSN: |
1932-6203 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
The stalk apoplast fluid of sugarcane contains different sugars, organic acids and amino acids that may supply the demand for carbohydrates by endophytic bacteria including diazotrophs P. tropica (syn. B. tropica) strain Ppe8, isolated from sugarcane, is part of the bacterial consortium recommended as inoculant to sugarcane. However, little information has been accumulated regarding this plant-bacterium interaction considering that it colonizes internal sugarcane tissues. Here, we made use of the RNA-Seq transcriptomic analysis to study the influence of sugarcane stalk apoplast fluid on Ppe8 gene expression. The bacterium was grown in JMV liquid medium (100 ml), divided equally and then supplemented with 50 ml of fresh JMV medium or 50 ml of apoplast fluid extracted from sugarcane variety RB867515. Total RNA was extracted 2 hours later, the rRNAs were depleted and mRNAs used to construct libraries to sequence the fragments using Ion Torrent technology. The mapping and statistical analysis were carried out with CLC Genomics Workbench software. The RNA-seq data was validated by RT-qPCR using the reference genes fliP1, paaF, and groL. The data analysis showed that 544 genes were repressed and 153 genes were induced in the presence of apoplast fluid. Genes that induce plant defense responses, genes related to chemotaxis and movements were repressed in the presence of apoplast fluid, indicating that strain Ppe8 recognizes the apoplast fluid as a plant component. The expression of genes involved in bacterial metabolism was regulated (up and down), suggesting that the metabolism of strain Ppe8 is modulated by the apoplast fluid. These results suggest that Ppe8 alters its gene expression pattern in the presence of apoplast fluid mainly in order to use compounds present in the fluid as well as to avoid the induction of plant defense mechanisms. This is a pioneer study showing the role played by the sugarcane apoplast fluid on the global modulation of genes in P. tropica strain Ppe8. MenosThe stalk apoplast fluid of sugarcane contains different sugars, organic acids and amino acids that may supply the demand for carbohydrates by endophytic bacteria including diazotrophs P. tropica (syn. B. tropica) strain Ppe8, isolated from sugarcane, is part of the bacterial consortium recommended as inoculant to sugarcane. However, little information has been accumulated regarding this plant-bacterium interaction considering that it colonizes internal sugarcane tissues. Here, we made use of the RNA-Seq transcriptomic analysis to study the influence of sugarcane stalk apoplast fluid on Ppe8 gene expression. The bacterium was grown in JMV liquid medium (100 ml), divided equally and then supplemented with 50 ml of fresh JMV medium or 50 ml of apoplast fluid extracted from sugarcane variety RB867515. Total RNA was extracted 2 hours later, the rRNAs were depleted and mRNAs used to construct libraries to sequence the fragments using Ion Torrent technology. The mapping and statistical analysis were carried out with CLC Genomics Workbench software. The RNA-seq data was validated by RT-qPCR using the reference genes fliP1, paaF, and groL. The data analysis showed that 544 genes were repressed and 153 genes were induced in the presence of apoplast fluid. Genes that induce plant defense responses, genes related to chemotaxis and movements were repressed in the presence of apoplast fluid, indicating that strain Ppe8 recognizes the apoplast fluid as a plant component. The expression of... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bacterial growth; RNA Sequence; Sugarcane variety RB867515; Transcriptomic profile. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
06/10/2010 |
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Data da última atualização: |
09/01/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ZERBINO, S.; SILVA, F. A. C.; PANIZZI, A. R. |
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Afiliação: |
STELLA ZERBINO, CNPSo; FLÁVIA AUGUSTA CLOCLET SILVA, CNPSo; ANTONIO RICARDO PANIZZI, CNPSO. |
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Título: |
Avanços recentes sobre a interação plantas hospedeiras/percevejo no Uruguai. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. [Anais...]. Natal: Emparn: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. Poster 968. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Piezodorus guildinii e Nezara viridula são as principais espécies associadas a soja no Uruguai. Procurou-se determinar: as plantas hospedeiras alternativas desses percevejos no período de entressafra; o estado fisiológico (desenvolvimento dos ovários/testículos) dos percevejos coletados na entressafra; o efeito das espécies vegetais na biologia de ninfas; e as espécies vegetais que atuam como "barreiras vivas" para impedir ou minimizar a invasão dos percevejos em campos de soja. Com rede de varredura e pano-de-batida foram realizadas amostragens de 24/04/2009 a 28/04/2010, em alfafa, Medicago sativa, trevo roxo, Trifolium pratense, trevo branco, Trifolium repens, cornichão, Lotus corniculatus (Leguminosae), Pittosporum undulatum (Pittosporaceae), ligustro, Ligustrum lucidum (Oleaceae) e Myoporum laetum (Myoporaceae). P. guildinii foi mais abundante (abril a outubro) especialmente em P. undulatum; foi encontrado também em L. lucidum e M. laetum. De outubro a março foi observado em alfafa e de dezembro a abril em trevo roxo. Poucos indivíduos ocorreram em trevo branco (na primavera) e em cornichão (no verão). P. guildinii foi coletado em restos culturais de soja (maio-junho) e sorgo (julho). Todas as fêmeas tiveram os ovários maduros em janeiro, diminuindo em março; a partir de maio nenhuma fêmea apresentou ovários desenvolvidos, voltando a apresentá-los em outubro. A totalidade dos machos coletados de dezembro a maio teve os testículos desenvolvidos, com diminuição em junho, julho (zero), outubro e novembro. Em laboratório, ninfas de P. guildinii alimentadas com frutos de P. undulatum, ligustro, e cornichão não sobreviveram. Em frutos de alfafa e soja as ninfas sobreviveram e tiveram um período de desenvolvimento menor em alfafa (21,5 dias) do que em soja (24,5 dias). A mortalidade das ninfas a partir do terceiro instar foi de 30% para alfalfa, e 0% em soja. No estudo com barreiras vivas, P. guildinii e N. viridula (51 e 35% do total de indivíduos coletados, respectivamente) invadiram a soja na floração (R2). Até o enchimento das vagens (R5) a soja cercada por milho apresentou um número menor (0,7 percevejos/m) do que a soja sem barreira viva (1,0 percevejos/m). MenosPiezodorus guildinii e Nezara viridula são as principais espécies associadas a soja no Uruguai. Procurou-se determinar: as plantas hospedeiras alternativas desses percevejos no período de entressafra; o estado fisiológico (desenvolvimento dos ovários/testículos) dos percevejos coletados na entressafra; o efeito das espécies vegetais na biologia de ninfas; e as espécies vegetais que atuam como "barreiras vivas" para impedir ou minimizar a invasão dos percevejos em campos de soja. Com rede de varredura e pano-de-batida foram realizadas amostragens de 24/04/2009 a 28/04/2010, em alfafa, Medicago sativa, trevo roxo, Trifolium pratense, trevo branco, Trifolium repens, cornichão, Lotus corniculatus (Leguminosae), Pittosporum undulatum (Pittosporaceae), ligustro, Ligustrum lucidum (Oleaceae) e Myoporum laetum (Myoporaceae). P. guildinii foi mais abundante (abril a outubro) especialmente em P. undulatum; foi encontrado também em L. lucidum e M. laetum. De outubro a março foi observado em alfafa e de dezembro a abril em trevo roxo. Poucos indivíduos ocorreram em trevo branco (na primavera) e em cornichão (no verão). P. guildinii foi coletado em restos culturais de soja (maio-junho) e sorgo (julho). Todas as fêmeas tiveram os ovários maduros em janeiro, diminuindo em março; a partir de maio nenhuma fêmea apresentou ovários desenvolvidos, voltando a apresentá-los em outubro. A totalidade dos machos coletados de dezembro a maio teve os testículos desenvolvidos, com diminuição em junho,... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bugs. |
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Thesagro: |
Percevejo; Planta hospedeira; Praga de planta; Soja. |
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Thesaurus NAL: |
Host plants; Plant pests; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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Marc: |
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245 $aAvanços recentes sobre a interação plantas hospedeiras/percevejo no Uruguai.
260 $c2010
520 $aPiezodorus guildinii e Nezara viridula são as principais espécies associadas a soja no Uruguai. Procurou-se determinar: as plantas hospedeiras alternativas desses percevejos no período de entressafra; o estado fisiológico (desenvolvimento dos ovários/testículos) dos percevejos coletados na entressafra; o efeito das espécies vegetais na biologia de ninfas; e as espécies vegetais que atuam como "barreiras vivas" para impedir ou minimizar a invasão dos percevejos em campos de soja. Com rede de varredura e pano-de-batida foram realizadas amostragens de 24/04/2009 a 28/04/2010, em alfafa, Medicago sativa, trevo roxo, Trifolium pratense, trevo branco, Trifolium repens, cornichão, Lotus corniculatus (Leguminosae), Pittosporum undulatum (Pittosporaceae), ligustro, Ligustrum lucidum (Oleaceae) e Myoporum laetum (Myoporaceae). P. guildinii foi mais abundante (abril a outubro) especialmente em P. undulatum; foi encontrado também em L. lucidum e M. laetum. De outubro a março foi observado em alfafa e de dezembro a abril em trevo roxo. Poucos indivíduos ocorreram em trevo branco (na primavera) e em cornichão (no verão). P. guildinii foi coletado em restos culturais de soja (maio-junho) e sorgo (julho). Todas as fêmeas tiveram os ovários maduros em janeiro, diminuindo em março; a partir de maio nenhuma fêmea apresentou ovários desenvolvidos, voltando a apresentá-los em outubro. A totalidade dos machos coletados de dezembro a maio teve os testículos desenvolvidos, com diminuição em junho, julho (zero), outubro e novembro. Em laboratório, ninfas de P. guildinii alimentadas com frutos de P. undulatum, ligustro, e cornichão não sobreviveram. Em frutos de alfafa e soja as ninfas sobreviveram e tiveram um período de desenvolvimento menor em alfafa (21,5 dias) do que em soja (24,5 dias). A mortalidade das ninfas a partir do terceiro instar foi de 30% para alfalfa, e 0% em soja. No estudo com barreiras vivas, P. guildinii e N. viridula (51 e 35% do total de indivíduos coletados, respectivamente) invadiram a soja na floração (R2). Até o enchimento das vagens (R5) a soja cercada por milho apresentou um número menor (0,7 percevejos/m) do que a soja sem barreira viva (1,0 percevejos/m).
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650 $aPlant pests
650 $aSoybeans
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650 $aPlanta hospedeira
650 $aPraga de planta
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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