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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
10/11/2014 |
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Data da última atualização: |
09/01/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
VIEIRA, F. D. |
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Afiliação: |
FÁBIO DANILO VIEIRA, CNPTIA. |
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Título: |
Modelos baseados em técnicas de mineração de dados para suporte à certificação racial de ovinos. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
2014. |
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Páginas: |
88 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Engenharia Agrícola, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientador: Stanley Robson de Medeiros Oliveira. |
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Conteúdo: |
Resumo: As raças de ovinos localmente adaptadas descendem de animais trazidos durante o período colonial, e durante anos foram submetidas a cruzamentos indiscriminados com raças exóticas. Estas raças de ovinos são consideradas importantes por possuírem características adaptativas às diversas condições ambientais brasileiras. Para evitar a perda deste importante material genético, a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) decidiu incluí-las no seu Programa de Pesquisa em Recursos Genéticos, armazenando-as em seus bancos de germoplasma, sendo que as que possuem maior destaque nacional são as raças Crioula, Morada Nova e Santa Inês. A seleção dos ovinos para compor estes bancos é realizada por meio da avaliação de características morfológicas e produtivas. Entretanto, essa avaliação está sujeita a falhas, pois alguns animais cruzados mantêm características semelhantes àquelas dos animais locais. Desta forma, identificar se os animais depositados nos bancos são ou não pertencentes a uma raça é uma tarefa que exige muita cautela. Em busca de soluções, nos últimos anos houve um aumento significativo no uso de tecnologias que utilizam marcadores moleculares SNP (do inglês Single Nucleotide Polimorphism). No entanto, o grande número de marcadores gerados, que pode chegar a centenas de milhares por animal, torna-se um problema crucial. Para abordar esse problema, o objetivo deste trabalho é desenvolver modelos baseados em técnicas de mineração de dados para selecionar os principais marcadores SNP para as raças Crioula, Morada Nova e Santa Inês. Os dados utilizados neste estudo foram obtidos do Consórcio Internacional de Ovinos e são compostos por 72 animais destas três raças e 49.034 marcadores SNP para cada ovino. O resultado obtido com a conclusão deste trabalho foi um conjunto de modelos preditivos baseados em técnicas de mineração de dados que selecionaram os principais marcadores SNP para identificação das raças estudadas. A partir da intersecção desses modelos identificou-se um subconjunto de 15 marcadores com maior potencial de identificação das raças. Os modelos poderão ser utilizados para certificação das raças de ovinos já depositados nos bancos de germoplasma e de novos animais a serem inclusos, além de subsidiar associações de criadores interessadas em certificar seus animais, bem como o MAPA (Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento) no controle de animais registrados. Os modelos gerados poderão ser estendidos para outras espécies animais de produção. MenosResumo: As raças de ovinos localmente adaptadas descendem de animais trazidos durante o período colonial, e durante anos foram submetidas a cruzamentos indiscriminados com raças exóticas. Estas raças de ovinos são consideradas importantes por possuírem características adaptativas às diversas condições ambientais brasileiras. Para evitar a perda deste importante material genético, a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) decidiu incluí-las no seu Programa de Pesquisa em Recursos Genéticos, armazenando-as em seus bancos de germoplasma, sendo que as que possuem maior destaque nacional são as raças Crioula, Morada Nova e Santa Inês. A seleção dos ovinos para compor estes bancos é realizada por meio da avaliação de características morfológicas e produtivas. Entretanto, essa avaliação está sujeita a falhas, pois alguns animais cruzados mantêm características semelhantes àquelas dos animais locais. Desta forma, identificar se os animais depositados nos bancos são ou não pertencentes a uma raça é uma tarefa que exige muita cautela. Em busca de soluções, nos últimos anos houve um aumento significativo no uso de tecnologias que utilizam marcadores moleculares SNP (do inglês Single Nucleotide Polimorphism). No entanto, o grande número de marcadores gerados, que pode chegar a centenas de milhares por animal, torna-se um problema crucial. Para abordar esse problema, o objetivo deste trabalho é desenvolver modelos baseados em técnicas de mineração de dados para selecionar o... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Aprendizado de máquina; Data mining; Feature selection; Machine learning; Marcadores moleculares; Microarranjo; Mineração de dados; Penalized regression; Polimorfismo de nucleotídeo único; Predictive modeling; Regressão penalizada; Seleção de atributos; Sheep breeding. |
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Thesagro: |
Ovinocultura. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic markers; Microarray technology; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152970/1/VieiraFabioDanilo-M.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Arroz e Feijão. Para informações adicionais entre em contato com cnpaf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
13/05/2022 |
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Data da última atualização: |
29/08/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
SILVA, R. S.; FARIA, J. C.; KNUPP, A. M.; AGUIAR, M. S. de; PEREIRA, H. S.; FERREIRA, A. L.; ZAIDEM, A. L. M.; PINHEIRO, P. V.; MELO, L. C.; SOUZA, T. L. P. O. |
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Afiliação: |
RODRIGO S. SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; JOSIAS CORREA DE FARIA, CNPAF; ADRIANO MOREIRA KNUPP, CNPAF; MARCELO SFEIR DE AGUIAR, CNPAF; HELTON SANTOS PEREIRA, CNPAF; AMANDA L. FERREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; ANTONIA L. M. ZAIDEM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; PATRICIA VALLE PINHEIRO, CNPAF; LEONARDO CUNHA MELO, CNPAF; THIAGO LIVIO PESSOA OLIV DE SOUZA, CNPAF. |
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Título: |
Development and selection of transgenic advanced lines of carioca seeded common bean with multiple resistance to viruses. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Euphytica, v. 218, n. 6, June 2022. |
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ISSN: |
1573-5060 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10681-022-03017-9 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The most important viruses infecting common bean (Phaseolus vulgaris L.) in Brazil are BCMV, BGMV and CPMMV, the last two transmitted by the whitefly Bemisia tabaci occurring simultaneously and causing severe yield losses. Embrapa has previously developed a genetically modified common bean cultivar carrying the 5.1 transgenic event for resistance to BGMV, which is commercially available. This cultivar also carries the gene I, which confers resistance to BCMV. Recently, sources of natural resistance to CPMMV were identified in common bean cultivars from the carioca market class. So, the objective of the present work was to develop new commercial carioca breeding lines with multiple resistance to viruses (BCMV, BGMV and CPMMV), using conventional breeding and molecular tools. Agronomic performance and virus disease severity (VS) were evaluated in two field trials, allowing the selection of 39 superior progenies out of 477 row-progenies tested. Molecular analyses identified the presence of BCMV and BGMV resistance alleles in individual plants. CPMMV resistance was screened by mechanical inoculation of plants. Five progenies showed resistance to BCMV, BGMV and CPMMV, in addition to upright plant architecture, tolerance to plant lodging and carioca market class grains, presenting therefore potential to be a new transgenic cultivar with multiple virus resistance. Additionally, the resistant progenies may also contribute to reduce virus spread in the field, as they were a less efficient inoculum source of CPMMV as shown by insect transmission assays. MenosThe most important viruses infecting common bean (Phaseolus vulgaris L.) in Brazil are BCMV, BGMV and CPMMV, the last two transmitted by the whitefly Bemisia tabaci occurring simultaneously and causing severe yield losses. Embrapa has previously developed a genetically modified common bean cultivar carrying the 5.1 transgenic event for resistance to BGMV, which is commercially available. This cultivar also carries the gene I, which confers resistance to BCMV. Recently, sources of natural resistance to CPMMV were identified in common bean cultivars from the carioca market class. So, the objective of the present work was to develop new commercial carioca breeding lines with multiple resistance to viruses (BCMV, BGMV and CPMMV), using conventional breeding and molecular tools. Agronomic performance and virus disease severity (VS) were evaluated in two field trials, allowing the selection of 39 superior progenies out of 477 row-progenies tested. Molecular analyses identified the presence of BCMV and BGMV resistance alleles in individual plants. CPMMV resistance was screened by mechanical inoculation of plants. Five progenies showed resistance to BCMV, BGMV and CPMMV, in addition to upright plant architecture, tolerance to plant lodging and carioca market class grains, presenting therefore potential to be a new transgenic cultivar with multiple virus resistance. Additionally, the resistant progenies may also contribute to reduce virus spread in the field, as they were a less effi... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
BCMV; BGMV; CPMMV. |
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Thesagro: |
Bemisia Tabaci; Feijão; Phaseolus Vulgaris; Variedade Resistente; Vírus. |
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Thesaurus NAL: |
Disease resistance; Genetically modified plants. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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001 2142970
005 2022-08-29
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520 $aThe most important viruses infecting common bean (Phaseolus vulgaris L.) in Brazil are BCMV, BGMV and CPMMV, the last two transmitted by the whitefly Bemisia tabaci occurring simultaneously and causing severe yield losses. Embrapa has previously developed a genetically modified common bean cultivar carrying the 5.1 transgenic event for resistance to BGMV, which is commercially available. This cultivar also carries the gene I, which confers resistance to BCMV. Recently, sources of natural resistance to CPMMV were identified in common bean cultivars from the carioca market class. So, the objective of the present work was to develop new commercial carioca breeding lines with multiple resistance to viruses (BCMV, BGMV and CPMMV), using conventional breeding and molecular tools. Agronomic performance and virus disease severity (VS) were evaluated in two field trials, allowing the selection of 39 superior progenies out of 477 row-progenies tested. Molecular analyses identified the presence of BCMV and BGMV resistance alleles in individual plants. CPMMV resistance was screened by mechanical inoculation of plants. Five progenies showed resistance to BCMV, BGMV and CPMMV, in addition to upright plant architecture, tolerance to plant lodging and carioca market class grains, presenting therefore potential to be a new transgenic cultivar with multiple virus resistance. Additionally, the resistant progenies may also contribute to reduce virus spread in the field, as they were a less efficient inoculum source of CPMMV as shown by insect transmission assays.
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653 $aBGMV
653 $aCPMMV
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700 1 $aKNUPP, A. M.
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700 1 $aPEREIRA, H. S.
700 1 $aFERREIRA, A. L.
700 1 $aZAIDEM, A. L. M.
700 1 $aPINHEIRO, P. V.
700 1 $aMELO, L. C.
700 1 $aSOUZA, T. L. P. O.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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