| |
|
|
| Registros recuperados : 241 | |
| 61. |  | CAMPOS, C. C. B.; SOUSA, T. F.; SILVA, I. J. da; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Diversidade de clusters gênicos biossintéticos em Streptomyces sp. Mad39, isolado com potencial para biocontrole de patógenos de cadeias agrícolas regionais. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 7.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
|   |
| 62. | | CAMPOS, C. C. B.; SOUSA, T. F.; SILVA, I. J. da; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Diversidade de clusters gênicos biossintéticos em Streptomyces sp. MAD39, isolado com potencial para biocontrole de patógenos de cadeias agrícolas regionais. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 7.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
|  |
| 63. | | CHAGAS, S. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Cazymes, peptidases e lipases secretadas do fungo fitopatogênico Pseusopestalotiopsis gilvanii (CPAA222): uma abordagem genômica. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 6.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 64. | | CHAGAS, S. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Cazymes, peptidases e lipases secretadas do fungo fitopatogênico Pseusopestalotiopsis gilvanii (CPAA222): uma abordagem genômica. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 6.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
| |
| 67. | | SILVA, J. M. da; ROMANIUC, A. R.; CAETANO, A. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Java Merging Copy Number Variants (JM-CNV): a new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. Não paginado. PAG 2015. Pôster P1170.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 71. | | YAMAGISHI, M. E. B.; MARTINS, N. F.; NESHICH, G.; CAI, W.; SHAO, X.; BEAUTRAIT, A.; MAIGRET, B. A fast surface-matching procedure for protein-ligand docking. Journal of Molecular Modeling, v. 12, n. 6, p. 965-972, Sept. 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 72. | | GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; TEIXEIRA, J.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. Comparative transcriptome analysis of eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado. 1 pôster.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Florestas. |
| |
| 73. | | VIEIRA, F. D.; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. Databases & data integration text mining & information extraction. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 74. | | VIEIRA, F. D.; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. Databases & data integration text mining & information extraction. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 76. | | SOUZA, R. P.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A.; LOPES, E. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Identificação de clusters gênicos biossintéticos relacionados a produção de antibióticos em pool bacteriano isolado de sedimentos de rios amazônicos. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 8.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 77. | | SOUZA, R. P.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A.; LOPES, E. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da. Identificação de clusters gênicos biossintéticos relacionados a produção de antibióticos em pool bacteriano isolado de sedimentos de rios amazônicos. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 8.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
| |
| 78. | | FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. Identification of folding essential residues by looking at an extensive DB of the structure descriptors in Diamond STING. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 13., 2005, Detroit. Program... Detroit: ISCB, 2005. p. 71. Na publicação: Paula Kuser; Michel Yamagishi; Adauto Mancini; Roberto Higa; Goran Neshich. ISMB 2005. Poster A-47.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
| 79. | | CASTRO, G. dos S.; SOUSA, T.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; GARRETT, R.; SOMAN, L.; KOOLEN, H. Identification of new peptaibols in the strain of Trichoderma amazonicum MMSRG 38A isolated from açaí fruit. In: BRAZILIAN CONFERENCE ON NATURAL PRODUCT (BCNP), 9.; MEETING ON MICROMOLECULAR EVOLUTION, SYSTEMATICS AND ECOLOGY (RESEM), 35., 2023, Salvador. Proceedings [...]. Campinas: Galoá, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
| |
| Registros recuperados : 241 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
15/01/2016 |
|
Data da última atualização: |
21/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SILVA, J. M. da; ROMANIUC, A. R.; CAETANO, A. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. |
|
Afiliação: |
JOAQUIM MANOEL DA SILVA, Unemat; ALAN ROBERTO ROMANIUC, CNPTIA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA. |
|
Título: |
Java Merging Copy Number Variants (JM-CNV): a new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR). |
|
Ano de publicação: |
2015 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. |
|
Páginas: |
Não paginado. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
PAG 2015. Pôster P1170. |
|
Conteúdo: |
CNVs (Copy Number Variations) are defined as copy number variations of DNA fragments typically larger than one kilobase (Kb), but less than five megabases (Mb). They represent a genomic disequilibrium that alters the ploidy in a specific locus within an individual, which may also be observed with varying frequencies within a population. An initial study estimated that 12% of the human genome shows this type of structural variation. Reliable tools have been developed to detect CNVs from molecular data produced with three main platforms: Comparative Genomic Hybridization (CGH) arrays, Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotyping arrays, and DNA Next-Generation Sequencing (NGS). However, processes for merging overlapping CNVs into a meaningful set of discrete Copy Number Variable Regions (CNVRs) need improvement, particularly when several CNV patterns co-exist within the same genomic locus. Available algorithms frequently merge noncontiguous CNVRs or fragment large CNVRs into multiple regions. A new web-based software (Java Merging Copy Number Variants: JM-CNV) was developed to address the aforementioned issues. |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Copy Number Variations. |
|
Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Computer software. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/137048/1/Java-Silva-PAG.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01918nam a2200229 a 4500
001 2034001
005 2020-01-21
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, J. M. da
245 $aJava Merging Copy Number Variants (JM-CNV)$ba new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR).$h[electronic resource]
260 $aIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015.$c2015
300 $aNão paginado.
500 $aPAG 2015. Pôster P1170.
520 $aCNVs (Copy Number Variations) are defined as copy number variations of DNA fragments typically larger than one kilobase (Kb), but less than five megabases (Mb). They represent a genomic disequilibrium that alters the ploidy in a specific locus within an individual, which may also be observed with varying frequencies within a population. An initial study estimated that 12% of the human genome shows this type of structural variation. Reliable tools have been developed to detect CNVs from molecular data produced with three main platforms: Comparative Genomic Hybridization (CGH) arrays, Single Nucleotide Polymorphism (SNP) genotyping arrays, and DNA Next-Generation Sequencing (NGS). However, processes for merging overlapping CNVs into a meaningful set of discrete Copy Number Variable Regions (CNVRs) need improvement, particularly when several CNV patterns co-exist within the same genomic locus. Available algorithms frequently merge noncontiguous CNVRs or fragment large CNVRs into multiple regions. A new web-based software (Java Merging Copy Number Variants: JM-CNV) was developed to address the aforementioned issues.
650 $aBioinformatics
650 $aComputer software
653 $aBioinformática
653 $aCopy Number Variations
700 1 $aROMANIUC, A. R.
700 1 $aCAETANO, A. R.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
