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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
19/01/2011 |
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Data da última atualização: |
04/06/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de O.; BINNECK, E. |
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Afiliação: |
PAULO R. SILLA, UEL; MARIA ANGÉLICA DE O. CAMARGO-BRUNETTO, UEL; ELISEU BINNECK, CNPSO. |
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Título: |
Using a support vector machine to identify Pre-miRNAs in soybean (Glycine max) introns. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS DESIGN AND APPLICATIONS, 2010, Cairo. Proceedings... [Cairo]: IEEE, 2010. CD-ROM. |
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Páginas: |
P. 1235-1241. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
MicroRNAs (miRNAs) are small Ribonucleic Acid (RNA) molecules ?18?22 nucleotides (nt) in length that regulates gene expression in animals, plants and viruses. Due to its small size and occurrence in different development stages of organisms, the experimental identification of miRNAs becomes difficult, and computational approaches are being developed in order to precede and guide biological experiments. This paper describes our approach based on a Support Vector Machine (SVM) algorithm to identify miRNA?s precursor (pre-miRNA) in soybean (Glycine max) transcript introns, that was developed using a secondary structure predictor of pre-miRNAs sequences to establish the feature set for training, testing and validation phases of SVM algorithm. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
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Thesagro: |
Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Artificial intelligence; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 01421nam a2200193 a 4500
001 1873634
005 2025-06-04
008 2010 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILLA, P. R.
245 $aUsing a support vector machine to identify Pre-miRNAs in soybean (Glycine max) introns.$h[electronic resource]
260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS DESIGN AND APPLICATIONS, 2010, Cairo. Proceedings... [Cairo]: IEEE, 2010. CD-ROM.$c2010
300 $aP. 1235-1241.
520 $aMicroRNAs (miRNAs) are small Ribonucleic Acid (RNA) molecules ?18?22 nucleotides (nt) in length that regulates gene expression in animals, plants and viruses. Due to its small size and occurrence in different development stages of organisms, the experimental identification of miRNAs becomes difficult, and computational approaches are being developed in order to precede and guide biological experiments. This paper describes our approach based on a Support Vector Machine (SVM) algorithm to identify miRNA?s precursor (pre-miRNA) in soybean (Glycine max) transcript introns, that was developed using a secondary structure predictor of pre-miRNAs sequences to establish the feature set for training, testing and validation phases of SVM algorithm.
650 $aArtificial intelligence
650 $aSoybeans
650 $aSoja
653 $aBioinformática
700 1 $aCAMARGO-BRUNETTO, M. A. de O.
700 1 $aBINNECK, E.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 10 | |
| 3. |  | WICKERT, E.; LEMOS, E. G. de M.; PEREIRA, F. M.; MAYER, N. A. Marcadores fAFLP na caracterização de três genótipos de umezeiro selecionados como porta-enxertos para pessegueiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 12, p. 1741-1746, dez. 2007 Título em inglês: fAFLP markers to characterize three mume genotypes selected as rootstocks for peach tree.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | WICKERT, E.; LEMOS, E, G, M.; PEREIRA, F, M.; MAYER, A, N. Mercadores fAFLP na caracterização de três genótipos de umezeiro selecionados como porta-enxertos para pessegueiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 12, p. 1741-1746, dez. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 5. | | SILVA, A. V. C.; SANTOS, A. R. F. dos; GÓIS, I. B.; WICKERT, E.; MUNIZ, E. N.; MANN, R. S.; SILVA JÚNIOR, J. F. da; NARAIN, N. Diversidade genética em mangabeira utilizando marcadores moleculares RAPD. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável. Vitória: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. Biotecnologia. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 6. | | MUNIZ, A. V. C. da S.; SANTOS, A. R. F. dos; WICKERT, E.; SILVA JUNIOR, J. F. da; COSTA, T. S. Divergência genética entre acessos de mangabeira (Hancornia speciosa Gomes). Agrária, Recife, v. 6, n. 4, p. 752-758, out./dez. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 7. | | SILVEIRA, E. L. da; PEREIRA, R. M.; SCAQUITTO, D. C.; PEDRINHO, E. A. N.; VAL-MORAES, S.P.; WICKERT, E.; CARARETO-ALVES, L.M.; LEMOS, E. G. de M. Bacterial diversity of soil under eucalyptus assessed by 16S rDNA sequencing analysis. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 10, p. 1507-1516, out. 2006 Título em português: Diversidade bacteriana de solo sob eucaliptos obtida por seqüenciamento do 16S rDNA.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; FRANCO, D. F.; FAGUNDES, P. R. R.; MORAIS, O. P. de; PEREIRA, J. A.; CORDEIRO, A. C. C.; WICKERT, E.; MOURA NETO, F. P.; SEVERO, A. C. M. Indicação de tipos especiais de arroz para diversificação de cultivo. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. 8 p. (Embrapa Clima Temperado. Circular Técnica, 133).| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Meio-Norte. |
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| 9. | | PEREIRA, J. A.; MORAIS, O. P. de; COLOMBARI FILHO, J. M.; TORGA, P. P.; BASSINELLO, P. Z.; CAMARA, J. A. da S.; RIBEIRO, V. Q.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; CORDEIRO, A. C. C.; CAMPOS, G. W. de; WICKERT, E.; AMORIM NETO, S. 'BRS 902': cultivar de arroz vermelho para o mercado brasileiro. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2015. 6 p. (Embrapa Meio-Norte. Comunicado técnico, 236)| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 10. | | MARSCHALEK, R.; SOUZA, N. M. de; TERRES, L. R.; SANGOI, L.; OLIVEIRA, D. G. de; STÜRMER, F. W.; COLOMBARI FILHO, J. M.; SCHEUERMANN, K. K.; VALE, M. L. C. do; ANDRADE, A. de; PEREIRA, A.; WICKERT, E.; SILVA, D. L.; REBELO, A. M.; FACCHINELLO, P. H. K.; MAGALHÃES JUNIOR, A. M. de; VERDI, R.; HICKEL, E. R.; NOLDIN, J. A.; TRABAQUINI, K.; ROZZETTO, D. S. SCSBRS126 Dueto: irrigated rice variety resilient to cold and heat at reproductive stage. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 23, n. 3, e45492335, 2023. Cultivar release.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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